More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1718 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_1718  precorrin-4 C11-methyltransferase  100 
 
 		 598 aa  1206    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.956767  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21210  precorrin-4 C11-methyltransferase  36.45 
 
 		 867 aa  323  6e-87  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1177  precorrin-4 C11-methyltransferase  59.52 
 
 		 305 aa  287  2.9999999999999996e-76  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0801  precorrin-4 C11-methyltransferase  56.98 
 
 		 266 aa  280  5e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0559  precorrin-4 C11-methyltransferase  56.92 
 
 		 262 aa  280  7e-74  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.628877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1980  precorrin-4 C11-methyltransferase  54.8 
 
 		 287 aa  268  2e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2129  precorrin-4 C11-methyltransferase  47.43 
 
 		 259 aa  228  2e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000738255 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3181  precorrin-3 methyltransferase  40.78 
 
 		 655 aa  224  3e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0571  precorrin-4 C11-methyltransferase  50 
 
 		 272 aa  222  9.999999999999999e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.505536  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1265  precorrin-4 C11-methyltransferase  47.84 
 
 		 267 aa  219  1e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1013  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.55 
 
 		 253 aa  218  2e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2711  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.8 
 
 		 248 aa  215  1.9999999999999998e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00379668  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1351  precorrin-4 C11-methyltransferase  48.25 
 
 		 259 aa  213  7.999999999999999e-54  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0217  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  38.73 
 
 		 398 aa  212  2e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0313  precorrin-4 C11-methyltransferase  40.24 
 
 		 251 aa  211  3e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1716  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.8 
 
 		 253 aa  211  4e-53  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2501  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  40.36 
 
 		 427 aa  210  5e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0211  cobalamin biosynthesis protein CbiG/precorrin-4 C11-methyltransferase  43.08 
 
 		 614 aa  209  1e-52  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0638  precorrin-4 C11-methyltransferase  47.08 
 
 		 271 aa  208  3e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0039  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.27 
 
 		 258 aa  207  3e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1557  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.87 
 
 		 256 aa  206  7e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2198  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.35 
 
 		 257 aa  204  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.333099  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2205  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.35 
 
 		 257 aa  204  5e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2151  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.95 
 
 		 257 aa  203  7e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0163963  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2251  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.35 
 
 		 257 aa  203  7e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.476505  normal  0.353064 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1014  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.76 
 
 		 626 aa  202  9.999999999999999e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2364  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.95 
 
 		 257 aa  202  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1092  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.37 
 
 		 254 aa  201  3e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0483  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.23 
 
 		 258 aa  200  5e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1288  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.69 
 
 		 626 aa  200  6e-50  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1298  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.77 
 
 		 261 aa  199  7.999999999999999e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1272  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.94 
 
 		 251 aa  199  1.0000000000000001e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2300  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.92 
 
 		 273 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.366203  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2609  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.75 
 
 		 257 aa  198  2.0000000000000003e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2710  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  39.42 
 
 		 354 aa  199  2.0000000000000003e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.329819  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0640  precorrin-4 C11-methyltransferase  45.2 
 
 		 257 aa  199  2.0000000000000003e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.194872  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1295  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  36.34 
 
 		 368 aa  197  4.0000000000000005e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0452493 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0614  precorrin-4 C11-methyltransferase  40.4 
 
 		 249 aa  197  5.000000000000001e-49  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00328163  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0059  precorrin-4 C11-methyltransferase  36.72 
 
 		 256 aa  197  6e-49  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1294  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.06 
 
 		 248 aa  196  7e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.04031 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2087  precorrin-3 methylase  42.97 
 
 		 257 aa  197  7e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1887  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.53 
 
 		 262 aa  196  1e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0177135  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3541  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.47 
 
 		 261 aa  195  2e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1229  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.69 
 
 		 264 aa  194  3e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0594011 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1968  precorrin-4 C11-methyltransferase  39.6 
 
 		 261 aa  194  4e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.264672  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1024  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.53 
 
 		 281 aa  194  4e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.249462  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3607  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.08 
 
 		 261 aa  194  5e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0934  precorrin-4 C11-methyltransferase  45.06 
 
 		 250 aa  192  1e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0934  precorrin-4 C11-methyltransferase  38.4 
 
 		 254 aa  192  1e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.23833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1299  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  36.32 
 
 		 379 aa  192  1e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0484  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  37.64 
 
 		 351 aa  192  2e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4344  precorrin-4 C11-methyltransferase  39.68 
 
 		 264 aa  191  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3540  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  40.4 
 
 		 347 aa  191  2e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2994  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.6 
 
 		 264 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3737  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.75 
 
 		 275 aa  191  4e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6035  precorrin-4 C11-methyltransferase  40.56 
 
 		 275 aa  189  9e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1747  precorrin-4 C11-methyltransferase  37.85 
 
 		 254 aa  189  2e-46  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.129763  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0905  precorrin-4 C11-methyltransferase  38.31 
 
 		 269 aa  188  2e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2779  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.8 
 
 		 284 aa  187  4e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.25946  normal  0.0736251 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4477  precorrin-4 C11-methyltransferase  38.21 
 
 		 610 aa  186  7e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00717843  normal  0.120162 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3136  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.14 
 
 		 272 aa  186  7e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.749873 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1011  precorrin-4 C11-methyltransferase  38.1 
 
 		 254 aa  185  3e-45  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.04114  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1376  precorrin-4 C11-methyltransferase  38.65 
 
 		 252 aa  184  4.0000000000000006e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1558  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  32.69 
 
 		 357 aa  184  4.0000000000000006e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2357  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.75 
 
 		 259 aa  183  6e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.342045  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2163  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.02 
 
 		 274 aa  183  7e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.233438 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0040  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  36.16 
 
 		 353 aa  183  8.000000000000001e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0933  precorrin-4 C11-methyltransferase  37.45 
 
 		 260 aa  182  1e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00452437 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3231  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.9 
 
 		 258 aa  182  1e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00900029  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1853  precorrin-4 C11-methyltransferase  47.09 
 
 		 247 aa  182  2e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1236  precorrin-4 C11-methyltransferase  37.65 
 
 		 251 aa  182  2e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1693  precorrin-4 C11-methyltransferase  40.62 
 
 		 269 aa  181  2.9999999999999997e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.301759 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0473  precorrin-4 C11-methyltransferase  40.24 
 
 		 252 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1430  precorrin-4 C11-methyltransferase  37.65 
 
 		 251 aa  181  2.9999999999999997e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0323621  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0702  precorrin-4 C11-methyltransferase  37.05 
 
 		 244 aa  181  2.9999999999999997e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3606  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  39.54 
 
 		 347 aa  180  5.999999999999999e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4243  precorrin-4 C11-methyltransferase  37.1 
 
 		 257 aa  180  7e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0962  precorrin-4 C11-methyltransferase  36 
 
 		 254 aa  180  8e-44  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.6045  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2523  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.9 
 
 		 298 aa  180  8e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0144072  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2993  cobalamin biosynthesis protein CbiG, putative  37.05 
 
 		 351 aa  179  1e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05151  putative precorrin-4 C11-methyltransferase  35.32 
 
 		 251 aa  179  1e-43  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.190612  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1342  precorrin-4 C11-methyltransferase  37.11 
 
 		 254 aa  179  2e-43  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1552  precorrin-4 C11-methyltransferase  39.38 
 
 		 283 aa  178  2e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.886587 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04841  putative precorrin-4 C11-methyltransferase  34.92 
 
 		 251 aa  179  2e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0459  precorrin-4 C11-methyltransferase  34.01 
 
 		 251 aa  177  3e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.20999  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4162  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.63 
 
 		 958 aa  177  3e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.329616  normal  0.542159 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1314  precorrin-4 C11-methyltransferase  38.19 
 
 		 268 aa  178  3e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0144548  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2705  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.34 
 
 		 308 aa  177  4e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.309557  hitchhiker  0.000105231 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3211  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.98 
 
 		 238 aa  176  9.999999999999999e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0176  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.97 
 
 		 258 aa  176  9.999999999999999e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0121511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0068  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.08 
 
 		 293 aa  174  3.9999999999999995e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.658841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3384  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.23 
 
 		 253 aa  174  5e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.215023  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0050  precorrin-4 C11-methyltransferase  42 
 
 		 255 aa  173  7.999999999999999e-42  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0114  precorrin-4 C11-methyltransferase  33.33 
 
 		 262 aa  172  1e-41  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.177043  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4305  precorrin-4 C11-methyltransferase  37.5 
 
 		 257 aa  172  1e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.118024 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05231  putative precorrin-4 C11-methyltransferase  32.26 
 
 		 251 aa  172  1e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3650  precorrin-4 C11-methyltransferase  39.13 
 
 		 252 aa  171  4e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.796321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2213  precorrin-3 methylase  43.25 
 
 		 250 aa  170  6e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.578417  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0473  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.66 
 
 		 260 aa  169  1e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0438  cobalt-precorrin-4 methyltransferase  44.66 
 
 		 260 aa  169  1e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>