More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_1693 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_1693  precorrin-4 C11-methyltransferase  100 
 
 
269 aa  542  1e-153  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.301759 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3737  precorrin-4 C11-methyltransferase  77.19 
 
 
275 aa  401  1e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2779  precorrin-4 C11-methyltransferase  70.57 
 
 
284 aa  356  1.9999999999999998e-97  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.25946  normal  0.0736251 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0068  precorrin-4 C11-methyltransferase  69.7 
 
 
293 aa  352  2.9999999999999997e-96  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.658841  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2300  precorrin-4 C11-methyltransferase  68.24 
 
 
273 aa  349  2e-95  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.366203  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2163  precorrin-4 C11-methyltransferase  68.68 
 
 
274 aa  347  2e-94  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.233438 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1024  precorrin-4 C11-methyltransferase  69.14 
 
 
281 aa  341  5.999999999999999e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.249462  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0438  cobalt-precorrin-4 methyltransferase  71.09 
 
 
260 aa  323  1e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0473  precorrin-4 C11-methyltransferase  71.09 
 
 
260 aa  323  1e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1351  precorrin-4 C11-methyltransferase  58.2 
 
 
259 aa  291  6e-78  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3136  precorrin-4 C11-methyltransferase  61.81 
 
 
272 aa  291  8e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.749873 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2087  precorrin-3 methylase  48.45 
 
 
257 aa  230  2e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1013  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.71 
 
 
253 aa  226  3e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0933  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.09 
 
 
260 aa  219  5e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00452437 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0571  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.72 
 
 
272 aa  215  5e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.505536  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0039  precorrin-4 C11-methyltransferase  47.04 
 
 
258 aa  214  9e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0313  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.25 
 
 
251 aa  212  4.9999999999999996e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2198  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.9 
 
 
257 aa  210  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.333099  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1272  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.9 
 
 
251 aa  210  2e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2205  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.9 
 
 
257 aa  209  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1298  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.27 
 
 
261 aa  209  3e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2151  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.9 
 
 
257 aa  209  4e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0163963  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2251  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.9 
 
 
257 aa  209  5e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.476505  normal  0.353064 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1092  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.85 
 
 
254 aa  209  5e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0638  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.12 
 
 
271 aa  208  7e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2364  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.5 
 
 
257 aa  207  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0483  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.25 
 
 
258 aa  207  1e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2129  precorrin-4 C11-methyltransferase  45.98 
 
 
259 aa  207  1e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000738255 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1557  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.7 
 
 
256 aa  205  5e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1294  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.22 
 
 
248 aa  205  8e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.04031 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1236  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.48 
 
 
251 aa  204  9e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3607  precorrin-4 C11-methyltransferase  47.06 
 
 
261 aa  204  1e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1430  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.48 
 
 
251 aa  204  1e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0323621  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2994  precorrin-4 C11-methyltransferase  45.42 
 
 
264 aa  203  2e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1716  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.73 
 
 
253 aa  204  2e-51  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3541  precorrin-4 C11-methyltransferase  47.45 
 
 
261 aa  202  3e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1265  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.12 
 
 
267 aa  202  4e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0614  precorrin-4 C11-methyltransferase  45.67 
 
 
249 aa  202  6e-51  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00328163  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0059  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.14 
 
 
256 aa  201  9.999999999999999e-51  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0473  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.09 
 
 
252 aa  199  3e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2609  precorrin-4 C11-methyltransferase  45.67 
 
 
257 aa  198  7e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0934  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.29 
 
 
254 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.23833  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21210  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.52 
 
 
867 aa  197  1.0000000000000001e-49  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1011  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.29 
 
 
254 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.04114  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1747  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.31 
 
 
254 aa  196  3e-49  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.129763  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0702  precorrin-4 C11-methyltransferase  40.39 
 
 
244 aa  193  3e-48  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0114  precorrin-4 C11-methyltransferase  36.33 
 
 
262 aa  191  1e-47  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.177043  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3650  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.49 
 
 
252 aa  191  1e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.796321  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0962  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.11 
 
 
254 aa  190  2e-47  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.6045  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3231  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.92 
 
 
258 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00900029  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0934  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.46 
 
 
250 aa  188  7e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1342  precorrin-4 C11-methyltransferase  40.47 
 
 
254 aa  187  2e-46  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0640  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.41 
 
 
257 aa  187  2e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.194872  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2711  precorrin-4 C11-methyltransferase  39.68 
 
 
248 aa  187  2e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00379668  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4477  precorrin-4 C11-methyltransferase  38.25 
 
 
610 aa  185  7e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00717843  normal  0.120162 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2374  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.57 
 
 
259 aa  183  3e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1718  precorrin-4 C11-methyltransferase  40.62 
 
 
598 aa  182  4.0000000000000006e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.956767  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2213  precorrin-3 methylase  42.23 
 
 
250 aa  182  6e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.578417  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1968  precorrin-4 C11-methyltransferase  39.13 
 
 
261 aa  181  1e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.264672  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1376  precorrin-4 C11-methyltransferase  38.19 
 
 
252 aa  181  1e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3384  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.53 
 
 
253 aa  180  2e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.215023  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0301  precorrin-4 C11-methyltransferase  40.54 
 
 
260 aa  180  2e-44  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0342995  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1521  precorrin-4 C11-methyltransferase  40.08 
 
 
261 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000101409 
 
 
-
 
NC_002950  PG0211  cobalamin biosynthesis protein CbiG/precorrin-4 C11-methyltransferase  39.92 
 
 
614 aa  179  4e-44  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25920  precorrin-3 methylase  41.83 
 
 
250 aa  179  4e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0297541  normal  0.071417 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3152  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.25 
 
 
253 aa  178  7e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.422575  normal  0.404272 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0801  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.31 
 
 
266 aa  177  2e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1288  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.02 
 
 
626 aa  176  2e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1375  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.7 
 
 
257 aa  177  2e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0286247 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2812  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.27 
 
 
266 aa  176  4e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.55111 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0176  precorrin-4 C11-methyltransferase  40.08 
 
 
258 aa  175  5e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0121511  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3184  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.18 
 
 
259 aa  174  9e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3154  precorrin-4 C11-methyltransferase  39.44 
 
 
249 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.134288  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1014  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.02 
 
 
626 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7180  precorrin-4 C11-methyltransferase  40.87 
 
 
252 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.987588  normal  0.0970048 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0050  precorrin-4 C11-methyltransferase  38.61 
 
 
255 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6025  precorrin-4 C11-methyltransferase  40.87 
 
 
252 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0102106  normal  0.375652 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3020  precorrin-4 C11-methyltransferase  40.08 
 
 
249 aa  172  5e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.157987 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3139  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.32 
 
 
243 aa  172  5e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.103399  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1564  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.62 
 
 
242 aa  171  2e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.253118  normal  0.214845 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1198  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.5 
 
 
242 aa  170  2e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1678  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.5 
 
 
242 aa  170  2e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0635313  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1651  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.5 
 
 
242 aa  170  2e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2357  precorrin-4 C11-methyltransferase  40.39 
 
 
259 aa  170  3e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.342045  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1887  precorrin-4 C11-methyltransferase  36.58 
 
 
262 aa  169  7e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0177135  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1314  precorrin-4 C11-methyltransferase  37.93 
 
 
268 aa  168  1e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0144548  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1596  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.8 
 
 
242 aa  168  1e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.727098  normal  0.416998 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2352  precorrin-4 C11-methyltransferase  39.84 
 
 
250 aa  167  1e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0559  precorrin-4 C11-methyltransferase  38.58 
 
 
262 aa  168  1e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.628877  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1177  precorrin-4 C11-methyltransferase  38.43 
 
 
305 aa  167  2e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4829  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.09 
 
 
242 aa  167  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0449828 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0808  precorrin-4 C11-methyltransferase  40.32 
 
 
254 aa  167  2e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2394  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.15 
 
 
241 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1578  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.39 
 
 
242 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00147705  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1955  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.09 
 
 
241 aa  166  5e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.132176  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2117  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.09 
 
 
241 aa  166  5e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.105353  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1972  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.09 
 
 
241 aa  166  5e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1980  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.24 
 
 
287 aa  165  5.9999999999999996e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3410  precorrin-4 C11-methyltransferase  39.44 
 
 
250 aa  165  8e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.231837 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3515  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.11 
 
 
257 aa  164  1.0000000000000001e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.312418 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>