More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1229 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1229  precorrin-4 C11-methyltransferase  100 
 
 
264 aa  528  1e-149  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0594011 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1887  precorrin-4 C11-methyltransferase  62.25 
 
 
262 aa  323  2e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0177135  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1968  precorrin-4 C11-methyltransferase  59.6 
 
 
261 aa  309  2.9999999999999997e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.264672  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4243  precorrin-4 C11-methyltransferase  57.2 
 
 
257 aa  308  4e-83  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4344  precorrin-4 C11-methyltransferase  58.5 
 
 
264 aa  306  2.0000000000000002e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0905  precorrin-4 C11-methyltransferase  58.8 
 
 
269 aa  298  7e-80  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1552  precorrin-4 C11-methyltransferase  56.92 
 
 
283 aa  297  1e-79  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.886587 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4305  precorrin-4 C11-methyltransferase  57.6 
 
 
257 aa  295  4e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.118024 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05231  putative precorrin-4 C11-methyltransferase  48.37 
 
 
251 aa  257  2e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05151  putative precorrin-4 C11-methyltransferase  49.19 
 
 
251 aa  256  2e-67  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.190612  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04841  putative precorrin-4 C11-methyltransferase  49.19 
 
 
251 aa  256  3e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06621  putative precorrin-4 C11-methyltransferase  52.03 
 
 
251 aa  254  1.0000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0459  precorrin-4 C11-methyltransferase  48.39 
 
 
251 aa  249  4e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.20999  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0625  precorrin-4 C11-methyltransferase  53.39 
 
 
253 aa  247  1e-64  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05141  putative precorrin-4 C11-methyltransferase  53.25 
 
 
252 aa  248  1e-64  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.614023  normal  0.388015 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1737  precorrin-4 C11-methyltransferase region  53.82 
 
 
251 aa  246  3e-64  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.489626  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1791  precorrin-4 C11-methyltransferase  52.44 
 
 
250 aa  244  9.999999999999999e-64  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04601  precorrin-4 C11-methyltransferase  48.77 
 
 
250 aa  244  9.999999999999999e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.909229  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4477  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.76 
 
 
610 aa  233  2.0000000000000002e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00717843  normal  0.120162 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1092  precorrin-4 C11-methyltransferase  48.37 
 
 
254 aa  232  5e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2711  precorrin-4 C11-methyltransferase  45.97 
 
 
248 aa  223  2e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00379668  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1014  precorrin-4 C11-methyltransferase  48.37 
 
 
626 aa  223  3e-57  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1288  precorrin-4 C11-methyltransferase  45.93 
 
 
626 aa  222  4e-57  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0313  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.53 
 
 
251 aa  219  3e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0934  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.34 
 
 
250 aa  212  3.9999999999999995e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0211  cobalamin biosynthesis protein CbiG/precorrin-4 C11-methyltransferase  43.09 
 
 
614 aa  212  4.9999999999999996e-54  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0571  precorrin-4 C11-methyltransferase  48.03 
 
 
272 aa  212  4.9999999999999996e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.505536  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2357  precorrin-4 C11-methyltransferase  47.79 
 
 
259 aa  211  1e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.342045  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1578  precorrin-4 C11-methyltransferase  47.26 
 
 
242 aa  209  3e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00147705  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0638  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.25 
 
 
271 aa  209  4e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1265  precorrin-4 C11-methyltransferase  47.83 
 
 
267 aa  209  4e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2087  precorrin-3 methylase  44.31 
 
 
257 aa  207  1e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1596  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.84 
 
 
242 aa  206  2e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.727098  normal  0.416998 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4829  precorrin-4 C11-methyltransferase  47.68 
 
 
242 aa  206  4e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0449828 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1716  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.6 
 
 
253 aa  205  5e-52  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1564  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.22 
 
 
242 aa  205  7e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.253118  normal  0.214845 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2129  precorrin-4 C11-methyltransferase  45.38 
 
 
259 aa  205  7e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000738255 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0059  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.11 
 
 
256 aa  203  2e-51  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1198  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.84 
 
 
242 aa  202  3e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1678  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.84 
 
 
242 aa  202  3e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0635313  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1651  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.84 
 
 
242 aa  202  3e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1972  precorrin-4 C11-methyltransferase  47.26 
 
 
241 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2117  precorrin-4 C11-methyltransferase  47.26 
 
 
241 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.105353  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1955  precorrin-4 C11-methyltransferase  47.26 
 
 
241 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.132176  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3152  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.94 
 
 
253 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.422575  normal  0.404272 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2394  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.84 
 
 
241 aa  198  6e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1013  precorrin-4 C11-methyltransferase  39.02 
 
 
253 aa  198  6e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1294  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.51 
 
 
248 aa  197  1.0000000000000001e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.04031 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3154  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.55 
 
 
249 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.134288  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3020  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.32 
 
 
249 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.157987 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0962  precorrin-4 C11-methyltransferase  39.18 
 
 
254 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.6045  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0483  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.2 
 
 
258 aa  196  3e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1157  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.41 
 
 
241 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.917528  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0039  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.2 
 
 
258 aa  196  5.000000000000001e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0259  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.41 
 
 
241 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0901  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.41 
 
 
241 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.324814  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1598  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.41 
 
 
241 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00151458  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0614  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.72 
 
 
249 aa  195  6e-49  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00328163  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0176  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.18 
 
 
258 aa  195  7e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0121511  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0933  precorrin-4 C11-methyltransferase  39.27 
 
 
260 aa  194  1e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00452437 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2923  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.53 
 
 
264 aa  194  1e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.680231  normal  0.0185874 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5844  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.36 
 
 
292 aa  193  2e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.903403 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3139  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.88 
 
 
243 aa  193  3e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.103399  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1853  precorrin-4 C11-methyltransferase  50 
 
 
247 aa  192  4e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1525  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.58 
 
 
260 aa  192  6e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.466887 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3103  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.13 
 
 
248 aa  192  6e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1376  precorrin-4 C11-methyltransferase  38.31 
 
 
252 aa  192  7e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1177  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.51 
 
 
305 aa  191  1e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21210  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.57 
 
 
867 aa  191  1e-47  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1475  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.97 
 
 
260 aa  191  1e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.429453  normal  0.609076 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25920  precorrin-3 methylase  44.53 
 
 
250 aa  191  1e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0297541  normal  0.071417 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1980  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.68 
 
 
287 aa  191  1e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1314  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.58 
 
 
268 aa  190  2e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0144548  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2821  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.58 
 
 
260 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0620  precorrin-4 C11-methyltransferase protein  42.29 
 
 
271 aa  189  4e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.263132  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1039  precorrin-4 C11-methyltransferase  45.56 
 
 
266 aa  189  4e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0255255 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1249  precorrin-4 C11-methyltransferase / precorrin-2 C20-methyltransferase  43.75 
 
 
241 aa  189  4e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.230063  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2213  precorrin-3 methylase  44.31 
 
 
250 aa  189  4e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.578417  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3650  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.58 
 
 
252 aa  189  5e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.796321  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1166  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.02 
 
 
266 aa  187  1e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.647626  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0934  precorrin-4 C11-methyltransferase  38.78 
 
 
254 aa  187  1e-46  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.23833  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5685  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.56 
 
 
260 aa  187  2e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0876668  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1272  precorrin-4 C11-methyltransferase  39.68 
 
 
251 aa  187  2e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2540  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.19 
 
 
257 aa  186  2e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.789222 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1747  precorrin-4 C11-methyltransferase  38.78 
 
 
254 aa  186  3e-46  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.129763  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1298  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.68 
 
 
261 aa  186  3e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4589  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.5 
 
 
251 aa  186  3e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00000000120449  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1375  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.7 
 
 
257 aa  186  3e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0286247 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5365  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.33 
 
 
241 aa  186  4e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.973627 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1011  precorrin-4 C11-methyltransferase  38.37 
 
 
254 aa  186  4e-46  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.04114  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0969  precorrin-4 C11-methyltransferase  45.6 
 
 
262 aa  186  5e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0702  precorrin-4 C11-methyltransferase  39.02 
 
 
244 aa  185  6e-46  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1718  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.69 
 
 
598 aa  185  8e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.956767  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3123  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.62 
 
 
258 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6035  precorrin-4 C11-methyltransferase  39.44 
 
 
275 aa  184  1.0000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0808  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.51 
 
 
254 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1882  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.6 
 
 
259 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2994  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.8 
 
 
264 aa  183  3e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0473  precorrin-4 C11-methyltransferase  40.24 
 
 
252 aa  182  3e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0801  precorrin-4 C11-methyltransferase  40.47 
 
 
266 aa  181  1e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>