More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_0801 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_0801  precorrin-4 C11-methyltransferase  100 
 
 
266 aa  540  9.999999999999999e-153  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1177  precorrin-4 C11-methyltransferase  65.37 
 
 
305 aa  323  2e-87  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0559  precorrin-4 C11-methyltransferase  62.02 
 
 
262 aa  301  7.000000000000001e-81  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.628877  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1718  precorrin-4 C11-methyltransferase  56.98 
 
 
598 aa  280  2e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.956767  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1980  precorrin-4 C11-methyltransferase  57.98 
 
 
287 aa  274  1.0000000000000001e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0483  precorrin-4 C11-methyltransferase  48.08 
 
 
258 aa  226  3e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2129  precorrin-4 C11-methyltransferase  49.42 
 
 
259 aa  226  4e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000738255 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0313  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.75 
 
 
251 aa  225  5.0000000000000005e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0039  precorrin-4 C11-methyltransferase  47.49 
 
 
258 aa  224  8e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1747  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.02 
 
 
254 aa  218  1e-55  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.129763  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2994  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.04 
 
 
264 aa  217  2e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0962  precorrin-4 C11-methyltransferase  40.86 
 
 
254 aa  217  2e-55  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.6045  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1013  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.25 
 
 
253 aa  217  2e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1294  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.53 
 
 
248 aa  215  5e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.04031 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0934  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.64 
 
 
254 aa  215  5.9999999999999996e-55  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.23833  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1265  precorrin-4 C11-methyltransferase  45.86 
 
 
267 aa  211  1e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2711  precorrin-4 C11-methyltransferase  45.14 
 
 
248 aa  211  1e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00379668  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1011  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.25 
 
 
254 aa  210  2e-53  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.04114  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2151  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.06 
 
 
257 aa  208  8e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0163963  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2198  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.06 
 
 
257 aa  207  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.333099  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2205  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.06 
 
 
257 aa  207  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2251  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.06 
 
 
257 aa  207  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.476505  normal  0.353064 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0059  precorrin-4 C11-methyltransferase  38.52 
 
 
256 aa  206  3e-52  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0571  precorrin-4 C11-methyltransferase  45.38 
 
 
272 aa  206  4e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.505536  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2364  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.68 
 
 
257 aa  206  4e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1298  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.02 
 
 
261 aa  204  1e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0638  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.94 
 
 
271 aa  204  2e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3607  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.96 
 
 
261 aa  203  2e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3541  precorrin-4 C11-methyltransferase  45.35 
 
 
261 aa  201  7e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0211  cobalamin biosynthesis protein CbiG/precorrin-4 C11-methyltransferase  41.41 
 
 
614 aa  201  9.999999999999999e-51  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3231  precorrin-4 C11-methyltransferase  45.35 
 
 
258 aa  201  9.999999999999999e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00900029  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1092  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.19 
 
 
254 aa  199  3e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21210  precorrin-4 C11-methyltransferase  40.86 
 
 
867 aa  199  3.9999999999999996e-50  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1557  precorrin-4 C11-methyltransferase  40.54 
 
 
256 aa  199  5e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1716  precorrin-4 C11-methyltransferase  40.08 
 
 
253 aa  197  1.0000000000000001e-49  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0640  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.57 
 
 
257 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.194872  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1236  precorrin-4 C11-methyltransferase  40.08 
 
 
251 aa  196  3e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2300  precorrin-4 C11-methyltransferase  45.38 
 
 
273 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.366203  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1272  precorrin-4 C11-methyltransferase  40.08 
 
 
251 aa  196  5.000000000000001e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1430  precorrin-4 C11-methyltransferase  40.08 
 
 
251 aa  196  5.000000000000001e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0323621  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0614  precorrin-4 C11-methyltransferase  40.86 
 
 
249 aa  195  6e-49  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00328163  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0933  precorrin-4 C11-methyltransferase  37.84 
 
 
260 aa  194  9e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00452437 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1968  precorrin-4 C11-methyltransferase  39.69 
 
 
261 aa  193  3e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.264672  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1376  precorrin-4 C11-methyltransferase  40.08 
 
 
252 aa  193  3e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1288  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.91 
 
 
626 aa  191  8e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0934  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.02 
 
 
250 aa  191  9e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1887  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.09 
 
 
262 aa  191  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0177135  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3136  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.87 
 
 
272 aa  190  2e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.749873 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1314  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.08 
 
 
268 aa  190  2e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0144548  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1014  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.87 
 
 
626 aa  189  2.9999999999999997e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4162  precorrin-4 C11-methyltransferase  45.75 
 
 
958 aa  189  2.9999999999999997e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.329616  normal  0.542159 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1351  precorrin-4 C11-methyltransferase  45.35 
 
 
259 aa  188  7e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6035  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.74 
 
 
275 aa  188  9e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1342  precorrin-4 C11-methyltransferase  36.82 
 
 
254 aa  187  1e-46  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4477  precorrin-4 C11-methyltransferase  37.89 
 
 
610 aa  187  1e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00717843  normal  0.120162 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0702  precorrin-4 C11-methyltransferase  37.35 
 
 
244 aa  186  3e-46  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2609  precorrin-4 C11-methyltransferase  40.93 
 
 
257 aa  186  3e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1229  precorrin-4 C11-methyltransferase  40.47 
 
 
264 aa  186  4e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0594011 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0905  precorrin-4 C11-methyltransferase  36.64 
 
 
269 aa  182  5.0000000000000004e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1375  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.37 
 
 
257 aa  181  8.000000000000001e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0286247 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1024  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.13 
 
 
281 aa  181  1e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.249462  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0050  precorrin-4 C11-methyltransferase  40.86 
 
 
255 aa  181  1e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0114  precorrin-4 C11-methyltransferase  38.22 
 
 
262 aa  180  2e-44  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.177043  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2523  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.64 
 
 
298 aa  180  2e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0144072  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4344  precorrin-4 C11-methyltransferase  37.84 
 
 
264 aa  180  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2705  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.69 
 
 
308 aa  179  4e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.309557  hitchhiker  0.000105231 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3650  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.19 
 
 
252 aa  178  7e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.796321  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3737  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.45 
 
 
275 aa  177  1e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0176  precorrin-4 C11-methyltransferase  45 
 
 
258 aa  178  1e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0121511  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0620  precorrin-4 C11-methyltransferase protein  41.7 
 
 
271 aa  177  2e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.263132  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1853  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.19 
 
 
247 aa  177  2e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4243  precorrin-4 C11-methyltransferase  37.45 
 
 
257 aa  177  2e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05151  putative precorrin-4 C11-methyltransferase  35.91 
 
 
251 aa  175  6e-43  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.190612  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2087  precorrin-3 methylase  38.52 
 
 
257 aa  175  6e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1693  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.31 
 
 
269 aa  174  9.999999999999999e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.301759 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0459  precorrin-4 C11-methyltransferase  33.98 
 
 
251 aa  174  9.999999999999999e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.20999  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1521  precorrin-4 C11-methyltransferase  40.38 
 
 
261 aa  174  9.999999999999999e-43  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000101409 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04841  putative precorrin-4 C11-methyltransferase  35.14 
 
 
251 aa  174  9.999999999999999e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2779  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.11 
 
 
284 aa  172  5e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.25946  normal  0.0736251 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2357  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.7 
 
 
259 aa  172  5.999999999999999e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.342045  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2163  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.09 
 
 
274 aa  171  1e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.233438 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2635  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.86 
 
 
263 aa  171  1e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.231618  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0473  precorrin-4 C11-methyltransferase  38.85 
 
 
252 aa  170  2e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1078  hypothetical protein  41.07 
 
 
237 aa  169  3e-41  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4305  precorrin-4 C11-methyltransferase  37.84 
 
 
257 aa  169  4e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.118024 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05231  putative precorrin-4 C11-methyltransferase  31.66 
 
 
251 aa  168  9e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3139  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.25 
 
 
243 aa  166  5e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.103399  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3211  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.96 
 
 
238 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0301  precorrin-4 C11-methyltransferase  39.92 
 
 
260 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0342995  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0068  precorrin-4 C11-methyltransferase  40.82 
 
 
293 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.658841  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2530  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.81 
 
 
250 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00855327 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1249  precorrin-4 C11-methyltransferase / precorrin-2 C20-methyltransferase  45.13 
 
 
241 aa  163  3e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.230063  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1596  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.84 
 
 
242 aa  163  3e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.727098  normal  0.416998 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2213  precorrin-3 methylase  45.13 
 
 
250 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.578417  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3020  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.69 
 
 
249 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.157987 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2352  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.92 
 
 
250 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5365  precorrin-4 C11-methyltransferase  45.13 
 
 
241 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.973627 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3103  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.91 
 
 
248 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1552  precorrin-4 C11-methyltransferase  35.57 
 
 
283 aa  162  5.0000000000000005e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.886587 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1578  precorrin-4 C11-methyltransferase  45.29 
 
 
242 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00147705  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>