More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1272 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_1272  precorrin-4 C11-methyltransferase  100 
 
 
251 aa  514  1.0000000000000001e-145  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1376  precorrin-4 C11-methyltransferase  64.8 
 
 
252 aa  332  3e-90  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21210  precorrin-4 C11-methyltransferase  61.45 
 
 
867 aa  318  3.9999999999999996e-86  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1013  precorrin-4 C11-methyltransferase  57.94 
 
 
253 aa  298  4e-80  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0614  precorrin-4 C11-methyltransferase  58.17 
 
 
249 aa  289  4e-77  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00328163  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1716  precorrin-4 C11-methyltransferase  53.39 
 
 
253 aa  287  1e-76  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2151  precorrin-4 C11-methyltransferase  54.84 
 
 
257 aa  287  1e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0163963  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2198  precorrin-4 C11-methyltransferase  54.44 
 
 
257 aa  286  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.333099  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2205  precorrin-4 C11-methyltransferase  54.44 
 
 
257 aa  286  2.9999999999999996e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2251  precorrin-4 C11-methyltransferase  54.44 
 
 
257 aa  285  4e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.476505  normal  0.353064 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1430  precorrin-4 C11-methyltransferase  55.78 
 
 
251 aa  285  5e-76  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0323621  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2364  precorrin-4 C11-methyltransferase  54.03 
 
 
257 aa  284  9e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1236  precorrin-4 C11-methyltransferase  55.38 
 
 
251 aa  283  3.0000000000000004e-75  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1092  precorrin-4 C11-methyltransferase  55.65 
 
 
254 aa  273  1.0000000000000001e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1298  precorrin-4 C11-methyltransferase  54.44 
 
 
261 aa  268  5.9999999999999995e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1342  precorrin-4 C11-methyltransferase  53.78 
 
 
254 aa  266  2e-70  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0934  precorrin-4 C11-methyltransferase  50.81 
 
 
254 aa  263  2e-69  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.23833  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0962  precorrin-4 C11-methyltransferase  50.2 
 
 
254 aa  261  6e-69  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.6045  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1011  precorrin-4 C11-methyltransferase  50 
 
 
254 aa  260  1e-68  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.04114  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0313  precorrin-4 C11-methyltransferase  50 
 
 
251 aa  260  1e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1747  precorrin-4 C11-methyltransferase  49.59 
 
 
254 aa  259  3e-68  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.129763  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1294  precorrin-4 C11-methyltransferase  51.42 
 
 
248 aa  258  8e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.04031 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0059  precorrin-4 C11-methyltransferase  47.81 
 
 
256 aa  254  1.0000000000000001e-66  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0934  precorrin-4 C11-methyltransferase  51.2 
 
 
250 aa  252  4.0000000000000004e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0933  precorrin-4 C11-methyltransferase  47.39 
 
 
260 aa  249  3e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00452437 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3231  precorrin-4 C11-methyltransferase  50.59 
 
 
258 aa  249  4e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00900029  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1557  precorrin-4 C11-methyltransferase  50.99 
 
 
256 aa  246  2e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0483  precorrin-4 C11-methyltransferase  48.43 
 
 
258 aa  245  6e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0039  precorrin-4 C11-methyltransferase  48.03 
 
 
258 aa  241  7.999999999999999e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2711  precorrin-4 C11-methyltransferase  48.39 
 
 
248 aa  240  2e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00379668  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2994  precorrin-4 C11-methyltransferase  47.64 
 
 
264 aa  239  2.9999999999999997e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4477  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.53 
 
 
610 aa  238  5.999999999999999e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00717843  normal  0.120162 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3607  precorrin-4 C11-methyltransferase  47.83 
 
 
261 aa  236  3e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3541  precorrin-4 C11-methyltransferase  47.43 
 
 
261 aa  235  6e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2129  precorrin-4 C11-methyltransferase  48.02 
 
 
259 aa  233  2.0000000000000002e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000738255 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0473  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.77 
 
 
252 aa  233  3e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0702  precorrin-4 C11-methyltransferase  48.79 
 
 
244 aa  232  4.0000000000000004e-60  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0640  precorrin-4 C11-methyltransferase  48.79 
 
 
257 aa  231  6e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.194872  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1288  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.4 
 
 
626 aa  228  8e-59  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3650  precorrin-4 C11-methyltransferase  47.41 
 
 
252 aa  228  1e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.796321  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0050  precorrin-4 C11-methyltransferase  47.79 
 
 
255 aa  226  3e-58  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1314  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.18 
 
 
268 aa  225  5.0000000000000005e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0144548  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1265  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.53 
 
 
267 aa  223  2e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6035  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.31 
 
 
275 aa  223  2e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0571  precorrin-4 C11-methyltransferase  45.31 
 
 
272 aa  222  4e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.505536  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0211  cobalamin biosynthesis protein CbiG/precorrin-4 C11-methyltransferase  44.31 
 
 
614 aa  222  4.9999999999999996e-57  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2609  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.25 
 
 
257 aa  221  6e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0638  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.49 
 
 
271 aa  221  9.999999999999999e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1014  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.18 
 
 
626 aa  218  6e-56  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4162  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.98 
 
 
958 aa  218  8.999999999999998e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.329616  normal  0.542159 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2300  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.25 
 
 
273 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.366203  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1968  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.74 
 
 
261 aa  215  5e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.264672  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1351  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.62 
 
 
259 aa  213  1.9999999999999998e-54  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1887  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.15 
 
 
262 aa  211  5.999999999999999e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0177135  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0905  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.87 
 
 
269 aa  209  4e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0620  precorrin-4 C11-methyltransferase protein  44.98 
 
 
271 aa  207  1e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.263132  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1853  precorrin-4 C11-methyltransferase  49.37 
 
 
247 aa  207  1e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3737  precorrin-4 C11-methyltransferase  45.06 
 
 
275 aa  206  2e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05141  putative precorrin-4 C11-methyltransferase  42.4 
 
 
252 aa  206  3e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.614023  normal  0.388015 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2357  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.88 
 
 
259 aa  204  1e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.342045  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1791  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.74 
 
 
250 aa  202  3e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1693  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.9 
 
 
269 aa  202  5e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.301759 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1552  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.57 
 
 
283 aa  201  9e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.886587 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2705  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.8 
 
 
308 aa  200  1.9999999999999998e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.309557  hitchhiker  0.000105231 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2163  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.29 
 
 
274 aa  200  1.9999999999999998e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.233438 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2523  precorrin-4 C11-methyltransferase  40.96 
 
 
298 aa  199  3e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0144072  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06621  putative precorrin-4 C11-methyltransferase  40.49 
 
 
251 aa  199  3e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3136  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.31 
 
 
272 aa  199  3e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.749873 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2087  precorrin-3 methylase  41.37 
 
 
257 aa  198  7e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1024  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.29 
 
 
281 aa  197  1.0000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.249462  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7180  precorrin-4 C11-methyltransferase  40.73 
 
 
252 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.987588  normal  0.0970048 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3211  precorrin-4 C11-methyltransferase  48.33 
 
 
238 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04601  precorrin-4 C11-methyltransferase  37.1 
 
 
250 aa  195  5.000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.909229  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0559  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.53 
 
 
262 aa  194  8.000000000000001e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.628877  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1718  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.94 
 
 
598 aa  194  1e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.956767  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2779  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.69 
 
 
284 aa  194  1e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.25946  normal  0.0736251 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4243  precorrin-4 C11-methyltransferase  39.52 
 
 
257 aa  193  2e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25920  precorrin-3 methylase  41.7 
 
 
250 aa  193  2e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0297541  normal  0.071417 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4344  precorrin-4 C11-methyltransferase  39.2 
 
 
264 aa  192  3e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0114  precorrin-4 C11-methyltransferase  35.86 
 
 
262 aa  192  4e-48  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.177043  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1525  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.74 
 
 
260 aa  192  4e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.466887 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1721  Precorrin-4 C(11)-methyltransferase  45.42 
 
 
240 aa  192  5e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1177  precorrin-4 C11-methyltransferase  40.56 
 
 
305 aa  192  6e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2923  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.94 
 
 
264 aa  191  7e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.680231  normal  0.0185874 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2821  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.74 
 
 
260 aa  191  8e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0806  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  40.32 
 
 
273 aa  191  8e-48  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0510  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  46.86 
 
 
238 aa  191  1e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1475  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.34 
 
 
260 aa  191  1e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.429453  normal  0.609076 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2358  precorrin-4 C11-methyltransferase / cobalt-factor II C20-methyltransferase  43.93 
 
 
243 aa  190  2e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2213  precorrin-3 methylase  40.89 
 
 
250 aa  190  2e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.578417  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1980  precorrin-4 C11-methyltransferase  39.04 
 
 
287 aa  189  4e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1039  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.94 
 
 
266 aa  189  4e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0255255 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0301  precorrin-4 C11-methyltransferase  39.84 
 
 
260 aa  189  4e-47  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0342995  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0801  precorrin-4 C11-methyltransferase  40.08 
 
 
266 aa  188  7e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3152  precorrin-4 C11-methyltransferase  39.52 
 
 
253 aa  188  7e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.422575  normal  0.404272 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5844  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.15 
 
 
292 aa  187  1e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.903403 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1521  precorrin-4 C11-methyltransferase  40.64 
 
 
261 aa  187  1e-46  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000101409 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3020  precorrin-4 C11-methyltransferase  40.49 
 
 
249 aa  187  2e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.157987 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1229  precorrin-4 C11-methyltransferase  39.68 
 
 
264 aa  187  2e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0594011 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1166  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.13 
 
 
266 aa  186  2e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.647626  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>