More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_3231 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_3231  precorrin-4 C11-methyltransferase  100 
 
 
258 aa  510  1e-143  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00900029  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0039  precorrin-4 C11-methyltransferase  71.43 
 
 
258 aa  375  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2994  precorrin-4 C11-methyltransferase  71.43 
 
 
264 aa  371  1e-102  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0483  precorrin-4 C11-methyltransferase  69.6 
 
 
258 aa  362  4e-99  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3607  precorrin-4 C11-methyltransferase  69.53 
 
 
261 aa  348  4e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3541  precorrin-4 C11-methyltransferase  69.92 
 
 
261 aa  346  2e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1236  precorrin-4 C11-methyltransferase  53.63 
 
 
251 aa  273  2.0000000000000002e-72  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1430  precorrin-4 C11-methyltransferase  53.63 
 
 
251 aa  273  3e-72  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0323621  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1342  precorrin-4 C11-methyltransferase  53.15 
 
 
254 aa  267  1e-70  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1294  precorrin-4 C11-methyltransferase  53.78 
 
 
248 aa  267  2e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.04031 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2129  precorrin-4 C11-methyltransferase  55.12 
 
 
259 aa  265  4e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000738255 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0962  precorrin-4 C11-methyltransferase  50.8 
 
 
254 aa  264  1e-69  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.6045  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1013  precorrin-4 C11-methyltransferase  52.19 
 
 
253 aa  262  3e-69  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1092  precorrin-4 C11-methyltransferase  56.35 
 
 
254 aa  262  4e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0313  precorrin-4 C11-methyltransferase  51.6 
 
 
251 aa  261  1e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0614  precorrin-4 C11-methyltransferase  52 
 
 
249 aa  259  2e-68  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00328163  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2711  precorrin-4 C11-methyltransferase  52.8 
 
 
248 aa  258  6e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00379668  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0934  precorrin-4 C11-methyltransferase  51.61 
 
 
254 aa  258  8e-68  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.23833  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1747  precorrin-4 C11-methyltransferase  51.61 
 
 
254 aa  256  2e-67  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.129763  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1298  precorrin-4 C11-methyltransferase  54.18 
 
 
261 aa  256  2e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1272  precorrin-4 C11-methyltransferase  50.59 
 
 
251 aa  257  2e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1716  precorrin-4 C11-methyltransferase  50.8 
 
 
253 aa  252  4.0000000000000004e-66  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1011  precorrin-4 C11-methyltransferase  51.21 
 
 
254 aa  252  4.0000000000000004e-66  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.04114  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1376  precorrin-4 C11-methyltransferase  50.8 
 
 
252 aa  248  5e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21210  precorrin-4 C11-methyltransferase  50.8 
 
 
867 aa  243  1.9999999999999999e-63  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0571  precorrin-4 C11-methyltransferase  54.72 
 
 
272 aa  240  2e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.505536  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0933  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.03 
 
 
260 aa  238  5e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00452437 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2198  precorrin-4 C11-methyltransferase  49.2 
 
 
257 aa  238  5.999999999999999e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.333099  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2205  precorrin-4 C11-methyltransferase  49.2 
 
 
257 aa  238  8e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0059  precorrin-4 C11-methyltransferase  45.85 
 
 
256 aa  237  1e-61  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2151  precorrin-4 C11-methyltransferase  48.4 
 
 
257 aa  236  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0163963  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2364  precorrin-4 C11-methyltransferase  48.8 
 
 
257 aa  236  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2251  precorrin-4 C11-methyltransferase  48.8 
 
 
257 aa  235  5.0000000000000005e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.476505  normal  0.353064 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1265  precorrin-4 C11-methyltransferase  50.99 
 
 
267 aa  234  8e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0638  precorrin-4 C11-methyltransferase  52.96 
 
 
271 aa  232  5e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2609  precorrin-4 C11-methyltransferase  49.21 
 
 
257 aa  231  7.000000000000001e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4477  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.4 
 
 
610 aa  229  4e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00717843  normal  0.120162 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1557  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.84 
 
 
256 aa  226  3e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1288  precorrin-4 C11-methyltransferase  47.41 
 
 
626 aa  225  6e-58  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0934  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.8 
 
 
250 aa  224  8e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0211  cobalamin biosynthesis protein CbiG/precorrin-4 C11-methyltransferase  46.61 
 
 
614 aa  224  1e-57  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0702  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.25 
 
 
244 aa  224  1e-57  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1014  precorrin-4 C11-methyltransferase  49.6 
 
 
626 aa  223  2e-57  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0473  precorrin-4 C11-methyltransferase  47.01 
 
 
252 aa  222  4e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1351  precorrin-4 C11-methyltransferase  47.06 
 
 
259 aa  218  7e-56  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3650  precorrin-4 C11-methyltransferase  50.8 
 
 
252 aa  218  7.999999999999999e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.796321  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0114  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.8 
 
 
262 aa  218  1e-55  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.177043  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6035  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.75 
 
 
275 aa  215  5.9999999999999996e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2087  precorrin-3 methylase  45.2 
 
 
257 aa  214  9e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0994  Precorrin-4 C(11)-methyltransferase  46.99 
 
 
299 aa  213  2.9999999999999995e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0510  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  50.41 
 
 
238 aa  212  3.9999999999999995e-54  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12107  precorrin-4 C11-methyltransferase cobM  49.59 
 
 
251 aa  212  5.999999999999999e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.182153  normal  0.885771 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3136  precorrin-4 C11-methyltransferase  49.42 
 
 
272 aa  212  5.999999999999999e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.749873 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0050  precorrin-4 C11-methyltransferase  45.67 
 
 
255 aa  211  1e-53  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2501  precorrin-4 C11-methyltransferase  51.74 
 
 
251 aa  209  2e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.218572 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1853  precorrin-4 C11-methyltransferase  49.78 
 
 
247 aa  208  7e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1872  Precorrin-4 C(11)-methyltransferase  45.08 
 
 
287 aa  206  4e-52  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.222642 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0640  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.61 
 
 
257 aa  204  9e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.194872  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2779  precorrin-4 C11-methyltransferase  45.63 
 
 
284 aa  204  1e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.25946  normal  0.0736251 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2484  precorrin-4 C11-methyltransferase  47.76 
 
 
250 aa  203  2e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2521  precorrin-4 C11-methyltransferase  47.76 
 
 
250 aa  203  2e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.14903 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2529  precorrin-4 C11-methyltransferase  47.76 
 
 
250 aa  203  2e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.527305 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1024  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.61 
 
 
281 aa  203  3e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.249462  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2300  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.03 
 
 
273 aa  202  4e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.366203  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0301  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.12 
 
 
260 aa  202  5e-51  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0342995  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3384  precorrin-4 C11-methyltransferase  45.49 
 
 
253 aa  202  6e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.215023  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1521  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.8 
 
 
261 aa  202  6e-51  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000101409 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2163  precorrin-4 C11-methyltransferase  45.82 
 
 
274 aa  201  9e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.233438 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1885  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.67 
 
 
261 aa  201  9e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.804703  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0801  precorrin-4 C11-methyltransferase  45.35 
 
 
266 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2213  precorrin-3 methylase  47.6 
 
 
250 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.578417  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3211  precorrin-4 C11-methyltransferase  47.93 
 
 
238 aa  201  9.999999999999999e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1779  precorrin-4 C11-methyltransferase  49.17 
 
 
250 aa  200  1.9999999999999998e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.592244  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2635  precorrin-4 C11-methyltransferase  47.84 
 
 
263 aa  199  3e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.231618  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0806  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  46.51 
 
 
273 aa  199  3e-50  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2530  precorrin-4 C11-methyltransferase  45.6 
 
 
250 aa  199  3e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00855327 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1262  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.96 
 
 
252 aa  199  3.9999999999999996e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3139  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.47 
 
 
243 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.103399  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5598  Precorrin-4 C(11)-methyltransferase  49.57 
 
 
247 aa  199  5e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.0099157  normal  0.596158 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1375  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.09 
 
 
257 aa  198  7e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0286247 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1887  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.02 
 
 
262 aa  198  7.999999999999999e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0177135  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1078  hypothetical protein  48.67 
 
 
237 aa  198  9e-50  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0620  precorrin-4 C11-methyltransferase protein  45.63 
 
 
271 aa  196  2.0000000000000003e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.263132  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3103  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.4 
 
 
248 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3737  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.22 
 
 
275 aa  196  2.0000000000000003e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2352  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.4 
 
 
250 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1314  precorrin-4 C11-methyltransferase  40.48 
 
 
268 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0144548  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3410  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.4 
 
 
250 aa  196  3e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.231837 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1564  precorrin-4 C11-methyltransferase  48.15 
 
 
242 aa  196  3e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.253118  normal  0.214845 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25920  precorrin-3 methylase  46.4 
 
 
250 aa  196  3e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0297541  normal  0.071417 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4162  precorrin-4 C11-methyltransferase  45.24 
 
 
958 aa  196  4.0000000000000005e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.329616  normal  0.542159 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1523  precorrin-4 C11-methyltransferase  47.11 
 
 
280 aa  195  5.000000000000001e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00837984  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1300  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.57 
 
 
252 aa  195  6e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3152  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.03 
 
 
253 aa  195  8.000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.422575  normal  0.404272 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1968  precorrin-4 C11-methyltransferase  42 
 
 
261 aa  194  1e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.264672  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3476  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  42.97 
 
 
290 aa  194  1e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0559  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.82 
 
 
262 aa  193  2e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.628877  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5685  precorrin-4 C11-methyltransferase  45.1 
 
 
260 aa  193  3e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0876668  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2446  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.44 
 
 
261 aa  192  4e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.130726  normal  0.124304 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0564  precorrin-4 C11-methyltransferase  48.7 
 
 
246 aa  192  4e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.518716  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>