More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2779 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_2779  precorrin-4 C11-methyltransferase  100 
 
 
284 aa  570  1e-161  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.25946  normal  0.0736251 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1024  precorrin-4 C11-methyltransferase  89.55 
 
 
281 aa  465  9.999999999999999e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.249462  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2163  precorrin-4 C11-methyltransferase  92.19 
 
 
274 aa  461  1e-129  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.233438 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0068  precorrin-4 C11-methyltransferase  76.05 
 
 
293 aa  370  1e-101  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.658841  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3737  precorrin-4 C11-methyltransferase  71.59 
 
 
275 aa  363  2e-99  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2300  precorrin-4 C11-methyltransferase  71.26 
 
 
273 aa  358  4e-98  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.366203  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1693  precorrin-4 C11-methyltransferase  71.88 
 
 
269 aa  356  1.9999999999999998e-97  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.301759 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0473  precorrin-4 C11-methyltransferase  77.99 
 
 
260 aa  352  4e-96  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0438  cobalt-precorrin-4 methyltransferase  77.99 
 
 
260 aa  352  4e-96  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3136  precorrin-4 C11-methyltransferase  66.54 
 
 
272 aa  319  3e-86  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.749873 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1351  precorrin-4 C11-methyltransferase  61.02 
 
 
259 aa  300  2e-80  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1013  precorrin-4 C11-methyltransferase  45.88 
 
 
253 aa  229  3e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1294  precorrin-4 C11-methyltransferase  47.81 
 
 
248 aa  223  3e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.04031 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0571  precorrin-4 C11-methyltransferase  47.53 
 
 
272 aa  220  1.9999999999999999e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.505536  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1557  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.33 
 
 
256 aa  218  7e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1298  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.01 
 
 
261 aa  218  1e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1092  precorrin-4 C11-methyltransferase  48.43 
 
 
254 aa  218  1e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2609  precorrin-4 C11-methyltransferase  47.64 
 
 
257 aa  217  2e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0933  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.15 
 
 
260 aa  216  4e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00452437 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0483  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.88 
 
 
258 aa  215  5.9999999999999996e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0039  precorrin-4 C11-methyltransferase  45.88 
 
 
258 aa  215  8e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3607  precorrin-4 C11-methyltransferase  48.06 
 
 
261 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0638  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.33 
 
 
271 aa  213  2.9999999999999995e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2087  precorrin-3 methylase  45.85 
 
 
257 aa  211  1e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2994  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.61 
 
 
264 aa  210  2e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3541  precorrin-4 C11-methyltransferase  47.67 
 
 
261 aa  210  2e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1236  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.87 
 
 
251 aa  208  8e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1430  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.87 
 
 
251 aa  207  1e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0323621  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3231  precorrin-4 C11-methyltransferase  45.63 
 
 
258 aa  207  2e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00900029  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2129  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.46 
 
 
259 aa  206  3e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000738255 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1272  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.69 
 
 
251 aa  204  1e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0962  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.27 
 
 
254 aa  204  2e-51  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.6045  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21210  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.26 
 
 
867 aa  202  7e-51  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0934  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.29 
 
 
254 aa  201  9.999999999999999e-51  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.23833  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0059  precorrin-4 C11-methyltransferase  40.94 
 
 
256 aa  199  3e-50  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3650  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.48 
 
 
252 aa  199  3.9999999999999996e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.796321  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2198  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.15 
 
 
257 aa  199  5e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.333099  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1747  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.5 
 
 
254 aa  199  5e-50  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.129763  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2205  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.15 
 
 
257 aa  198  6e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1265  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.11 
 
 
267 aa  198  7e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0473  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.31 
 
 
252 aa  198  7.999999999999999e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2711  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.06 
 
 
248 aa  197  1.0000000000000001e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00379668  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2251  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.15 
 
 
257 aa  197  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.476505  normal  0.353064 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2151  precorrin-4 C11-methyltransferase  40.77 
 
 
257 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0163963  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2364  precorrin-4 C11-methyltransferase  40.77 
 
 
257 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4477  precorrin-4 C11-methyltransferase  38.85 
 
 
610 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00717843  normal  0.120162 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1011  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.9 
 
 
254 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.04114  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0211  cobalamin biosynthesis protein CbiG/precorrin-4 C11-methyltransferase  40.31 
 
 
614 aa  195  9e-49  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0313  precorrin-4 C11-methyltransferase  39.68 
 
 
251 aa  195  9e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0614  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.7 
 
 
249 aa  194  1e-48  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00328163  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1716  precorrin-4 C11-methyltransferase  40.55 
 
 
253 aa  194  1e-48  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1288  precorrin-4 C11-methyltransferase  40.84 
 
 
626 aa  192  4e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0702  precorrin-4 C11-methyltransferase  38.89 
 
 
244 aa  191  8e-48  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0114  precorrin-4 C11-methyltransferase  38.19 
 
 
262 aa  191  9e-48  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.177043  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1342  precorrin-4 C11-methyltransferase  38.19 
 
 
254 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1376  precorrin-4 C11-methyltransferase  40.39 
 
 
252 aa  189  5e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1718  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.8 
 
 
598 aa  189  5.999999999999999e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.956767  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0934  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.46 
 
 
250 aa  187  2e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0559  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.09 
 
 
262 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.628877  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0640  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.19 
 
 
257 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.194872  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3139  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.39 
 
 
243 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.103399  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2213  precorrin-3 methylase  42.63 
 
 
250 aa  178  9e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.578417  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25920  precorrin-3 methylase  42.63 
 
 
250 aa  177  1e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0297541  normal  0.071417 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1177  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.37 
 
 
305 aa  177  3e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0801  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.42 
 
 
266 aa  175  7e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1014  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.02 
 
 
626 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3384  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.35 
 
 
253 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.215023  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2357  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.19 
 
 
259 aa  173  2.9999999999999996e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.342045  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0050  precorrin-4 C11-methyltransferase  38.67 
 
 
255 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2635  precorrin-4 C11-methyltransferase  39.53 
 
 
263 aa  173  3.9999999999999995e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.231618  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3260  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.06 
 
 
253 aa  172  5e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.280776 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0176  precorrin-4 C11-methyltransferase  39.68 
 
 
258 aa  171  9e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0121511  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1968  precorrin-4 C11-methyltransferase  36.76 
 
 
261 aa  171  1e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.264672  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04841  putative precorrin-4 C11-methyltransferase  36.86 
 
 
251 aa  171  1e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1564  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.56 
 
 
242 aa  171  1e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.253118  normal  0.214845 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05231  putative precorrin-4 C11-methyltransferase  34.65 
 
 
251 aa  169  4e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05151  putative precorrin-4 C11-methyltransferase  37.25 
 
 
251 aa  168  9e-41  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.190612  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2394  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.98 
 
 
241 aa  168  9e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1375  precorrin-4 C11-methyltransferase  39.46 
 
 
257 aa  168  9e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0286247 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1955  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.39 
 
 
241 aa  167  2e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.132176  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2117  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.39 
 
 
241 aa  167  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.105353  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1596  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.15 
 
 
242 aa  167  2e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.727098  normal  0.416998 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1972  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.39 
 
 
241 aa  167  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2352  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.04 
 
 
250 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1980  precorrin-4 C11-methyltransferase  40.62 
 
 
287 aa  166  2.9999999999999998e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1578  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.74 
 
 
242 aa  166  4e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00147705  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3154  precorrin-4 C11-methyltransferase  39.44 
 
 
249 aa  166  5e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.134288  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0459  precorrin-4 C11-methyltransferase  35.43 
 
 
251 aa  166  5.9999999999999996e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.20999  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3152  precorrin-4 C11-methyltransferase  39.68 
 
 
253 aa  165  8e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.422575  normal  0.404272 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2812  precorrin-4 C11-methyltransferase  40.48 
 
 
266 aa  165  8e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.55111 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0901  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.98 
 
 
241 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.324814  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0259  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.98 
 
 
241 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1157  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.98 
 
 
241 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.917528  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3103  precorrin-4 C11-methyltransferase  37.85 
 
 
248 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2530  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.43 
 
 
250 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00855327 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1598  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.98 
 
 
241 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00151458  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4589  precorrin-4 C11-methyltransferase  39.04 
 
 
251 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00000000120449  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2779  precorrin-4 C11-methyltransferase  39.76 
 
 
250 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.545494  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04601  precorrin-4 C11-methyltransferase  35.6 
 
 
250 aa  164  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.909229  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1651  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.15 
 
 
242 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>