More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_3260 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_3260  precorrin-4 C11-methyltransferase  100 
 
 		 253 aa  503  1e-141  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.280776 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3152  precorrin-4 C11-methyltransferase  72.4 
 
 		 253 aa  369  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.422575  normal  0.404272 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3515  precorrin-4 C11-methyltransferase  73.2 
 
 		 257 aa  355  2.9999999999999997e-97  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.312418 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3184  precorrin-4 C11-methyltransferase  71.49 
 
 		 259 aa  355  2.9999999999999997e-97  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5685  precorrin-4 C11-methyltransferase  74.7 
 
 		 260 aa  354  5.999999999999999e-97  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0876668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1166  precorrin-4 C11-methyltransferase  73.49 
 
 		 266 aa  354  6.999999999999999e-97  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.647626  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0969  precorrin-4 C11-methyltransferase  73.9 
 
 		 262 aa  354  7.999999999999999e-97  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1039  precorrin-4 C11-methyltransferase  73.09 
 
 		 266 aa  352  2e-96  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0255255 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2374  precorrin-4 C11-methyltransferase  70.68 
 
 		 259 aa  351  7e-96  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7180  precorrin-4 C11-methyltransferase  67.6 
 
 		 252 aa  348  6e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.987588  normal  0.0970048 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3278  precorrin-4 C11-methyltransferase  71.71 
 
 		 253 aa  346  2e-94  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.696559  normal  0.9588 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0808  precorrin-4 C11-methyltransferase  68.4 
 
 		 254 aa  345  3e-94  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3123  precorrin-4 C11-methyltransferase  73.31 
 
 		 258 aa  346  3e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1882  precorrin-4 C11-methyltransferase  71.89 
 
 		 259 aa  345  3e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2446  precorrin-4 C11-methyltransferase  73.71 
 
 		 261 aa  345  4e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.130726  normal  0.124304 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2540  precorrin-4 C11-methyltransferase  71.89 
 
 		 257 aa  344  7e-94  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.789222 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2812  precorrin-4 C11-methyltransferase  70 
 
 		 266 aa  342  2.9999999999999997e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.55111 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2923  precorrin-4 C11-methyltransferase  67.47 
 
 		 264 aa  342  2.9999999999999997e-93  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.680231  normal  0.0185874 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2218  precorrin-4 C11-methyltransferase  69.08 
 
 		 264 aa  338  4e-92  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.352147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1525  precorrin-4 C11-methyltransferase  70.28 
 
 		 260 aa  337  9e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.466887 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2821  precorrin-4 C11-methyltransferase  70.28 
 
 		 260 aa  337  9e-92  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6025  precorrin-4 C11-methyltransferase  68.8 
 
 		 252 aa  337  9.999999999999999e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0102106  normal  0.375652 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2157  precorrin-4 C11-methyltransferase  72.11 
 
 		 280 aa  336  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.107141  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1475  precorrin-4 C11-methyltransferase  69.48 
 
 		 260 aa  335  3.9999999999999995e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.429453  normal  0.609076 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5844  precorrin-4 C11-methyltransferase  68.67 
 
 		 292 aa  334  5.999999999999999e-91  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.903403 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2314  precorrin-4 C11-methyltransferase  71.55 
 
 		 259 aa  330  1e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0491012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0334  precorrin-4 C11-methyltransferase  71.89 
 
 		 261 aa  323  2e-87  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1885  precorrin-4 C11-methyltransferase  57.03 
 
 		 261 aa  284  1.0000000000000001e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.804703  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2635  precorrin-4 C11-methyltransferase  57.2 
 
 		 263 aa  282  3.0000000000000004e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.231618  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1262  precorrin-4 C11-methyltransferase  55.02 
 
 		 252 aa  275  5e-73  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3384  precorrin-4 C11-methyltransferase  58.63 
 
 		 253 aa  275  6e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.215023  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1300  precorrin-4 C11-methyltransferase  54.62 
 
 		 252 aa  273  2.0000000000000002e-72  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1523  precorrin-4 C11-methyltransferase  62.14 
 
 		 280 aa  273  3e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00837984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0564  precorrin-4 C11-methyltransferase  60.58 
 
 		 246 aa  266  2e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.518716  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2501  precorrin-4 C11-methyltransferase  60.17 
 
 		 251 aa  259  3e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.218572 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25920  precorrin-3 methylase  56.57 
 
 		 250 aa  259  3e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0297541  normal  0.071417 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1779  precorrin-4 C11-methyltransferase  58.51 
 
 		 250 aa  258  7e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.592244  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0176  precorrin-4 C11-methyltransferase  56.2 
 
 		 258 aa  257  1e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0121511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2213  precorrin-3 methylase  55.78 
 
 		 250 aa  257  1e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.578417  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5598  Precorrin-4 C(11)-methyltransferase  58.09 
 
 		 247 aa  254  1.0000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.0099157  normal  0.596158 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3139  precorrin-4 C11-methyltransferase  54.92 
 
 		 243 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.103399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1972  precorrin-4 C11-methyltransferase  55.92 
 
 		 241 aa  251  9.000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2117  precorrin-4 C11-methyltransferase  55.92 
 
 		 241 aa  251  9.000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.105353  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1955  precorrin-4 C11-methyltransferase  55.92 
 
 		 241 aa  251  9.000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.132176  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1198  precorrin-4 C11-methyltransferase  56.38 
 
 		 242 aa  249  3e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1678  precorrin-4 C11-methyltransferase  56.38 
 
 		 242 aa  249  3e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0635313  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1651  precorrin-4 C11-methyltransferase  56.38 
 
 		 242 aa  249  4e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2394  precorrin-4 C11-methyltransferase  55.51 
 
 		 241 aa  249  4e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1249  precorrin-4 C11-methyltransferase / precorrin-2 C20-methyltransferase  55.56 
 
 		 241 aa  249  4e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.230063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3103  precorrin-4 C11-methyltransferase  52 
 
 		 248 aa  248  6e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4829  precorrin-4 C11-methyltransferase  55.97 
 
 		 242 aa  248  9e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0449828 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1157  precorrin-4 C11-methyltransferase  55.1 
 
 		 241 aa  247  2e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.917528  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0901  precorrin-4 C11-methyltransferase  55.1 
 
 		 241 aa  247  2e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.324814  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1578  precorrin-4 C11-methyltransferase  55.97 
 
 		 242 aa  246  2e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00147705  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1598  precorrin-4 C11-methyltransferase  55.1 
 
 		 241 aa  247  2e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00151458  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0259  precorrin-4 C11-methyltransferase  55.1 
 
 		 241 aa  247  2e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5365  precorrin-4 C11-methyltransferase  55.14 
 
 		 241 aa  246  3e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.973627 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1596  precorrin-4 C11-methyltransferase  56.38 
 
 		 242 aa  245  4e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.727098  normal  0.416998 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1564  precorrin-4 C11-methyltransferase  54.51 
 
 		 242 aa  241  5e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.253118  normal  0.214845 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2179  precorrin-4 C11-methyltransferase  53.53 
 
 		 252 aa  240  1e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0645183  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3020  precorrin-4 C11-methyltransferase  51.41 
 
 		 249 aa  238  6.999999999999999e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.157987 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3154  precorrin-4 C11-methyltransferase  51 
 
 		 249 aa  237  1e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.134288  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4589  precorrin-4 C11-methyltransferase  52.19 
 
 		 251 aa  237  1e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00000000120449  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2779  precorrin-4 C11-methyltransferase  52.99 
 
 		 250 aa  237  1e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.545494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2352  precorrin-4 C11-methyltransferase  51.39 
 
 		 250 aa  237  1e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0157  precorrin-4 C11-methyltransferase  56.77 
 
 		 253 aa  236  2e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3410  precorrin-4 C11-methyltransferase  51 
 
 		 250 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.231837 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0315  precorrin-4 C11-methyltransferase  53.85 
 
 		 256 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2087  precorrin-3 methylase  46.18 
 
 		 257 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2530  precorrin-4 C11-methyltransferase  51.39 
 
 		 250 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00855327 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2484  precorrin-4 C11-methyltransferase  53.2 
 
 		 250 aa  229  3e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17680  precorrin-4 C11-methyltransferase  52.59 
 
 		 262 aa  229  3e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00107277  normal  0.918127 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2529  precorrin-4 C11-methyltransferase  53.2 
 
 		 250 aa  229  3e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.527305 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0473  precorrin-4 C11-methyltransferase  48.19 
 
 		 252 aa  229  4e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1623  precorrin-4 C11-methyltransferase  52.28 
 
 		 249 aa  227  2e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.18665  normal  0.817267 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2521  precorrin-4 C11-methyltransferase  52.8 
 
 		 250 aa  226  4e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.14903 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1375  precorrin-4 C11-methyltransferase  48.4 
 
 		 257 aa  224  1e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286247 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0313  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.15 
 
 		 251 aa  223  3e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2477  precorrin-4 C11-methyltransferase  50.98 
 
 		 259 aa  221  9.999999999999999e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.143154  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0620  precorrin-4 C11-methyltransferase protein  48.61 
 
 		 271 aa  219  1.9999999999999999e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.263132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12107  precorrin-4 C11-methyltransferase cobM  52.21 
 
 		 251 aa  218  5e-56  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.182153  normal  0.885771 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1013  precorrin-4 C11-methyltransferase  40.56 
 
 		 253 aa  215  5e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3650  precorrin-4 C11-methyltransferase  48.19 
 
 		 252 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.796321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1716  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.34 
 
 		 253 aa  213  2.9999999999999995e-54  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3408  precorrin-4 C11-methyltransferase  49.19 
 
 		 257 aa  213  2.9999999999999995e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0382  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  50.83 
 
 		 257 aa  212  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.42795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1236  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.67 
 
 		 251 aa  210  1e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1430  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.67 
 
 		 251 aa  209  3e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0323621  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4243  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.13 
 
 		 257 aa  209  4e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0638  precorrin-4 C11-methyltransferase  49.42 
 
 		 271 aa  209  4e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2891  precorrin-4 C11-methyltransferase  51.03 
 
 		 261 aa  208  5e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2357  precorrin-4 C11-methyltransferase  47.81 
 
 		 259 aa  207  1e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.342045  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1294  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.18 
 
 		 248 aa  207  2e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.04031 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0934  precorrin-4 C11-methyltransferase  40.65 
 
 		 254 aa  206  3e-52  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.23833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1342  precorrin-4 C11-methyltransferase  39.27 
 
 		 254 aa  206  4e-52  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0352  precorrin-4 C11-methyltransferase  49.6 
 
 		 256 aa  205  5e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.385908  normal  0.885711 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0702  precorrin-4 C11-methyltransferase  38.25 
 
 		 244 aa  205  7e-52  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0933  precorrin-4 C11-methyltransferase  39.6 
 
 		 260 aa  204  8e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00452437 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3541  precorrin-4 C11-methyltransferase  47.24 
 
 		 261 aa  202  4e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2711  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.31 
 
 		 248 aa  202  4e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00379668  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>