More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2540 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_2540  precorrin-4 C11-methyltransferase  100 
 
 		 257 aa  511  1e-144  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.789222 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2821  precorrin-4 C11-methyltransferase  84.11 
 
 		 260 aa  417  1e-116  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1525  precorrin-4 C11-methyltransferase  83.72 
 
 		 260 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.466887 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1475  precorrin-4 C11-methyltransferase  83.72 
 
 		 260 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.429453  normal  0.609076 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5844  precorrin-4 C11-methyltransferase  78.6 
 
 		 292 aa  396  1e-109  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.903403 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2218  precorrin-4 C11-methyltransferase  80.32 
 
 		 264 aa  388  1e-107  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.352147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3152  precorrin-4 C11-methyltransferase  76.59 
 
 		 253 aa  374  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.422575  normal  0.404272 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2923  precorrin-4 C11-methyltransferase  75.1 
 
 		 264 aa  375  1e-103  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.680231  normal  0.0185874 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5685  precorrin-4 C11-methyltransferase  73.33 
 
 		 260 aa  347  9e-95  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0876668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2446  precorrin-4 C11-methyltransferase  73.41 
 
 		 261 aa  347  1e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.130726  normal  0.124304 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3260  precorrin-4 C11-methyltransferase  71.89 
 
 		 253 aa  341  9e-93  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.280776 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1882  precorrin-4 C11-methyltransferase  71.2 
 
 		 259 aa  340  1e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3184  precorrin-4 C11-methyltransferase  71.08 
 
 		 259 aa  339  2.9999999999999998e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0334  precorrin-4 C11-methyltransferase  78.12 
 
 		 261 aa  339  2.9999999999999998e-92  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3123  precorrin-4 C11-methyltransferase  72.73 
 
 		 258 aa  338  7e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2374  precorrin-4 C11-methyltransferase  71.08 
 
 		 259 aa  337  9.999999999999999e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0969  precorrin-4 C11-methyltransferase  71.83 
 
 		 262 aa  335  2.9999999999999997e-91  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2157  precorrin-4 C11-methyltransferase  71.43 
 
 		 280 aa  335  3.9999999999999995e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.107141  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1039  precorrin-4 C11-methyltransferase  71.94 
 
 		 266 aa  333  1e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0255255 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1166  precorrin-4 C11-methyltransferase  71.94 
 
 		 266 aa  333  1e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.647626  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7180  precorrin-4 C11-methyltransferase  68.27 
 
 		 252 aa  330  1e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.987588  normal  0.0970048 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3515  precorrin-4 C11-methyltransferase  66.54 
 
 		 257 aa  322  3e-87  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.312418 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0808  precorrin-4 C11-methyltransferase  66.27 
 
 		 254 aa  320  1.9999999999999998e-86  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6025  precorrin-4 C11-methyltransferase  67.07 
 
 		 252 aa  315  5e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0102106  normal  0.375652 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3278  precorrin-4 C11-methyltransferase  68.77 
 
 		 253 aa  315  5e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.696559  normal  0.9588 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2812  precorrin-4 C11-methyltransferase  67.07 
 
 		 266 aa  311  7.999999999999999e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.55111 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2314  precorrin-4 C11-methyltransferase  70.29 
 
 		 259 aa  308  5e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0491012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1523  precorrin-4 C11-methyltransferase  64.73 
 
 		 280 aa  288  4e-77  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00837984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1779  precorrin-4 C11-methyltransferase  62.24 
 
 		 250 aa  277  1e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.592244  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2501  precorrin-4 C11-methyltransferase  60.98 
 
 		 251 aa  274  8e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.218572 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3384  precorrin-4 C11-methyltransferase  60.64 
 
 		 253 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.215023  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1885  precorrin-4 C11-methyltransferase  57.08 
 
 		 261 aa  271  7e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.804703  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25920  precorrin-3 methylase  59.36 
 
 		 250 aa  268  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0297541  normal  0.071417 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5598  Precorrin-4 C(11)-methyltransferase  62.24 
 
 		 247 aa  267  1e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.0099157  normal  0.596158 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2635  precorrin-4 C11-methyltransferase  54.37 
 
 		 263 aa  266  2e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.231618  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1262  precorrin-4 C11-methyltransferase  56.67 
 
 		 252 aa  266  2e-70  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0564  precorrin-4 C11-methyltransferase  61.83 
 
 		 246 aa  266  2.9999999999999995e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.518716  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1300  precorrin-4 C11-methyltransferase  56.25 
 
 		 252 aa  263  1e-69  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1972  precorrin-4 C11-methyltransferase  60.74 
 
 		 241 aa  264  1e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2117  precorrin-4 C11-methyltransferase  60.74 
 
 		 241 aa  264  1e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.105353  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2179  precorrin-4 C11-methyltransferase  61 
 
 		 252 aa  264  1e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0645183  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1955  precorrin-4 C11-methyltransferase  60.74 
 
 		 241 aa  264  1e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.132176  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1651  precorrin-4 C11-methyltransferase  60.82 
 
 		 242 aa  263  2e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1198  precorrin-4 C11-methyltransferase  60.82 
 
 		 242 aa  263  2e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1678  precorrin-4 C11-methyltransferase  60.82 
 
 		 242 aa  263  2e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0635313  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4829  precorrin-4 C11-methyltransferase  60.41 
 
 		 242 aa  261  6e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0449828 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2394  precorrin-4 C11-methyltransferase  60.33 
 
 		 241 aa  261  6e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1249  precorrin-4 C11-methyltransferase / precorrin-2 C20-methyltransferase  58.7 
 
 		 241 aa  260  2e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.230063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2213  precorrin-3 methylase  57.6 
 
 		 250 aa  259  2e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.578417  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1157  precorrin-4 C11-methyltransferase  59.92 
 
 		 241 aa  259  4e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.917528  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0901  precorrin-4 C11-methyltransferase  59.92 
 
 		 241 aa  259  4e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.324814  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0259  precorrin-4 C11-methyltransferase  59.92 
 
 		 241 aa  259  4e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1564  precorrin-4 C11-methyltransferase  58.3 
 
 		 242 aa  258  4e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.253118  normal  0.214845 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1598  precorrin-4 C11-methyltransferase  59.92 
 
 		 241 aa  259  4e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00151458  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5365  precorrin-4 C11-methyltransferase  58.7 
 
 		 241 aa  258  5.0000000000000005e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.973627 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3139  precorrin-4 C11-methyltransferase  57.2 
 
 		 243 aa  258  7e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.103399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1578  precorrin-4 C11-methyltransferase  60 
 
 		 242 aa  258  7e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00147705  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1596  precorrin-4 C11-methyltransferase  60.41 
 
 		 242 aa  258  8e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.727098  normal  0.416998 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0620  precorrin-4 C11-methyltransferase protein  56.63 
 
 		 271 aa  256  2e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.263132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0176  precorrin-4 C11-methyltransferase  55.78 
 
 		 258 aa  254  7e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0121511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3020  precorrin-4 C11-methyltransferase  55.56 
 
 		 249 aa  251  8.000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.157987 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3154  precorrin-4 C11-methyltransferase  54.98 
 
 		 249 aa  249  3e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.134288  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3103  precorrin-4 C11-methyltransferase  54.58 
 
 		 248 aa  247  1e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2484  precorrin-4 C11-methyltransferase  54.8 
 
 		 250 aa  239  2e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2529  precorrin-4 C11-methyltransferase  54.8 
 
 		 250 aa  239  2e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.527305 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2779  precorrin-4 C11-methyltransferase  55.51 
 
 		 250 aa  238  5e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.545494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2521  precorrin-4 C11-methyltransferase  54.4 
 
 		 250 aa  238  8e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.14903 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4589  precorrin-4 C11-methyltransferase  54 
 
 		 251 aa  237  1e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00000000120449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0157  precorrin-4 C11-methyltransferase  56 
 
 		 253 aa  236  3e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2352  precorrin-4 C11-methyltransferase  53.6 
 
 		 250 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2477  precorrin-4 C11-methyltransferase  54.92 
 
 		 259 aa  234  1.0000000000000001e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.143154  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3410  precorrin-4 C11-methyltransferase  53.39 
 
 		 250 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.231837 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2530  precorrin-4 C11-methyltransferase  53.78 
 
 		 250 aa  233  3e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00855327 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12107  precorrin-4 C11-methyltransferase cobM  54.96 
 
 		 251 aa  231  7.000000000000001e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.182153  normal  0.885771 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17680  precorrin-4 C11-methyltransferase  53.85 
 
 		 262 aa  231  1e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00107277  normal  0.918127 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0315  precorrin-4 C11-methyltransferase  53.56 
 
 		 256 aa  230  2e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1623  precorrin-4 C11-methyltransferase  53.33 
 
 		 249 aa  229  5e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.18665  normal  0.817267 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2891  precorrin-4 C11-methyltransferase  52.46 
 
 		 261 aa  221  9.999999999999999e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0382  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  50.4 
 
 		 257 aa  217  2e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.42795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2087  precorrin-3 methylase  44.58 
 
 		 257 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0473  precorrin-4 C11-methyltransferase  47.39 
 
 		 252 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3408  precorrin-4 C11-methyltransferase  49.8 
 
 		 257 aa  210  2e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2357  precorrin-4 C11-methyltransferase  50.99 
 
 		 259 aa  209  3e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.342045  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1375  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.3 
 
 		 257 aa  208  8e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286247 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0352  precorrin-4 C11-methyltransferase  49.6 
 
 		 256 aa  207  1e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.385908  normal  0.885711 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0313  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.74 
 
 		 251 aa  206  3e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21210  precorrin-4 C11-methyltransferase  45.35 
 
 		 867 aa  205  5e-52  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4243  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.57 
 
 		 257 aa  205  6e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1236  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.17 
 
 		 251 aa  201  9.999999999999999e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1430  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.17 
 
 		 251 aa  199  3e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0323621  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1716  precorrin-4 C11-methyltransferase  40.16 
 
 		 253 aa  197  1.0000000000000001e-49  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1853  precorrin-4 C11-methyltransferase  51.03 
 
 		 247 aa  197  2.0000000000000003e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4344  precorrin-4 C11-methyltransferase  40 
 
 		 264 aa  196  4.0000000000000005e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1013  precorrin-4 C11-methyltransferase  40.32 
 
 		 253 aa  195  6e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1272  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.34 
 
 		 251 aa  195  7e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3650  precorrin-4 C11-methyltransferase  45.88 
 
 		 252 aa  194  9e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.796321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1342  precorrin-4 C11-methyltransferase  38.71 
 
 		 254 aa  194  1e-48  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1294  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.35 
 
 		 248 aa  193  2e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.04031 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1229  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.19 
 
 		 264 aa  193  3e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0594011 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4305  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.97 
 
 		 257 aa  192  5e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.118024 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>