More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0315 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_0315  precorrin-4 C11-methyltransferase  100 
 
 
256 aa  506  9.999999999999999e-143  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0157  precorrin-4 C11-methyltransferase  67.19 
 
 
253 aa  299  4e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0382  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  65.1 
 
 
257 aa  297  1e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.42795  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17680  precorrin-4 C11-methyltransferase  67.73 
 
 
262 aa  294  1e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00107277  normal  0.918127 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1623  precorrin-4 C11-methyltransferase  65.34 
 
 
249 aa  289  3e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.18665  normal  0.817267 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0352  precorrin-4 C11-methyltransferase  63.6 
 
 
256 aa  285  5e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.385908  normal  0.885711 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3408  precorrin-4 C11-methyltransferase  63.89 
 
 
257 aa  279  4e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2501  precorrin-4 C11-methyltransferase  58.96 
 
 
251 aa  273  2.0000000000000002e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.218572 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2891  precorrin-4 C11-methyltransferase  64 
 
 
261 aa  271  7e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1779  precorrin-4 C11-methyltransferase  59.76 
 
 
250 aa  269  2.9999999999999997e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.592244  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1523  precorrin-4 C11-methyltransferase  59.51 
 
 
280 aa  266  2e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00837984  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0564  precorrin-4 C11-methyltransferase  60.96 
 
 
246 aa  259  2e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.518716  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5598  Precorrin-4 C(11)-methyltransferase  56.35 
 
 
247 aa  258  9e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.0099157  normal  0.596158 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1262  precorrin-4 C11-methyltransferase  53.42 
 
 
252 aa  249  2e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1300  precorrin-4 C11-methyltransferase  52.99 
 
 
252 aa  246  2e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2446  precorrin-4 C11-methyltransferase  55.16 
 
 
261 aa  246  2e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.130726  normal  0.124304 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1885  precorrin-4 C11-methyltransferase  52.14 
 
 
261 aa  245  4.9999999999999997e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.804703  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2157  precorrin-4 C11-methyltransferase  56.1 
 
 
280 aa  244  6.999999999999999e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.107141  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2374  precorrin-4 C11-methyltransferase  52.34 
 
 
259 aa  239  2e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3384  precorrin-4 C11-methyltransferase  50.2 
 
 
253 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.215023  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7180  precorrin-4 C11-methyltransferase  48.81 
 
 
252 aa  238  9e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.987588  normal  0.0970048 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0808  precorrin-4 C11-methyltransferase  51.59 
 
 
254 aa  237  1e-61  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6025  precorrin-4 C11-methyltransferase  50.4 
 
 
252 aa  237  2e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0102106  normal  0.375652 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3260  precorrin-4 C11-methyltransferase  53.85 
 
 
253 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.280776 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2540  precorrin-4 C11-methyltransferase  53.56 
 
 
257 aa  232  4.0000000000000004e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.789222 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5685  precorrin-4 C11-methyltransferase  54.88 
 
 
260 aa  231  8.000000000000001e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0876668  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2812  precorrin-4 C11-methyltransferase  51.19 
 
 
266 aa  231  1e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.55111 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2314  precorrin-4 C11-methyltransferase  55.13 
 
 
259 aa  230  2e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0491012  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2923  precorrin-4 C11-methyltransferase  48.78 
 
 
264 aa  229  5e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.680231  normal  0.0185874 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3152  precorrin-4 C11-methyltransferase  49.21 
 
 
253 aa  228  6e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.422575  normal  0.404272 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1039  precorrin-4 C11-methyltransferase  53.57 
 
 
266 aa  227  1e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0255255 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0969  precorrin-4 C11-methyltransferase  53.17 
 
 
262 aa  227  1e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3278  precorrin-4 C11-methyltransferase  52.78 
 
 
253 aa  228  1e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.696559  normal  0.9588 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3184  precorrin-4 C11-methyltransferase  50.79 
 
 
259 aa  226  2e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5844  precorrin-4 C11-methyltransferase  50.81 
 
 
292 aa  226  3e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.903403 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1166  precorrin-4 C11-methyltransferase  53.17 
 
 
266 aa  226  4e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.647626  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2635  precorrin-4 C11-methyltransferase  48.58 
 
 
263 aa  225  6e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.231618  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0176  precorrin-4 C11-methyltransferase  50.2 
 
 
258 aa  225  6e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0121511  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2179  precorrin-4 C11-methyltransferase  51.95 
 
 
252 aa  223  2e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0645183  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3515  precorrin-4 C11-methyltransferase  49.21 
 
 
257 aa  224  2e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.312418 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2484  precorrin-4 C11-methyltransferase  52.96 
 
 
250 aa  223  2e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2529  precorrin-4 C11-methyltransferase  52.96 
 
 
250 aa  223  2e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.527305 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1882  precorrin-4 C11-methyltransferase  52.03 
 
 
259 aa  221  6e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2218  precorrin-4 C11-methyltransferase  49.57 
 
 
264 aa  221  9e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.352147  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0473  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.83 
 
 
252 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3123  precorrin-4 C11-methyltransferase  51.19 
 
 
258 aa  218  7e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2521  precorrin-4 C11-methyltransferase  52.17 
 
 
250 aa  218  1e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.14903 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1475  precorrin-4 C11-methyltransferase  50.83 
 
 
260 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.429453  normal  0.609076 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2821  precorrin-4 C11-methyltransferase  50.83 
 
 
260 aa  215  7e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25920  precorrin-3 methylase  49 
 
 
250 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0297541  normal  0.071417 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2087  precorrin-3 methylase  42.47 
 
 
257 aa  212  5.999999999999999e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12107  precorrin-4 C11-methyltransferase cobM  51.6 
 
 
251 aa  211  1e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.182153  normal  0.885771 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3650  precorrin-4 C11-methyltransferase  49.6 
 
 
252 aa  210  2e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.796321  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1525  precorrin-4 C11-methyltransferase  49.79 
 
 
260 aa  210  2e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.466887 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2213  precorrin-3 methylase  48.79 
 
 
250 aa  209  3e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.578417  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3139  precorrin-4 C11-methyltransferase  47.76 
 
 
243 aa  207  1e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.103399  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2477  precorrin-4 C11-methyltransferase  47.79 
 
 
259 aa  203  2e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.143154  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2394  precorrin-4 C11-methyltransferase  48.55 
 
 
241 aa  203  2e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4829  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.91 
 
 
242 aa  203  3e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0449828 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0334  precorrin-4 C11-methyltransferase  49.4 
 
 
261 aa  201  9.999999999999999e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1198  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.91 
 
 
242 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1678  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.91 
 
 
242 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0635313  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1651  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.91 
 
 
242 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5365  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.81 
 
 
241 aa  199  3e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.973627 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1578  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.5 
 
 
242 aa  199  3e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00147705  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1596  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.91 
 
 
242 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.727098  normal  0.416998 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2117  precorrin-4 C11-methyltransferase  47.3 
 
 
241 aa  199  5e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.105353  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1955  precorrin-4 C11-methyltransferase  47.3 
 
 
241 aa  199  5e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.132176  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1972  precorrin-4 C11-methyltransferase  47.3 
 
 
241 aa  199  5e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1249  precorrin-4 C11-methyltransferase / precorrin-2 C20-methyltransferase  46.38 
 
 
241 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.230063  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2530  precorrin-4 C11-methyltransferase  45.42 
 
 
250 aa  196  3e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00855327 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1564  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.81 
 
 
242 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.253118  normal  0.214845 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0901  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.47 
 
 
241 aa  194  1e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.324814  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0259  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.47 
 
 
241 aa  194  1e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1157  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.47 
 
 
241 aa  194  1e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.917528  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1598  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.47 
 
 
241 aa  194  1e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00151458  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3103  precorrin-4 C11-methyltransferase  45.02 
 
 
248 aa  194  2e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0039  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.12 
 
 
258 aa  193  2e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3607  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.56 
 
 
261 aa  190  2e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2779  precorrin-4 C11-methyltransferase  45.63 
 
 
250 aa  190  2e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.545494  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1716  precorrin-4 C11-methyltransferase  40.49 
 
 
253 aa  190  2e-47  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3541  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.96 
 
 
261 aa  190  2e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2198  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.2 
 
 
257 aa  187  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.333099  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3020  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.2 
 
 
249 aa  187  2e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.157987 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0483  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.12 
 
 
258 aa  187  2e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2205  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.2 
 
 
257 aa  187  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3154  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.8 
 
 
249 aa  186  4e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.134288  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2151  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.4 
 
 
257 aa  186  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0163963  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2364  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.8 
 
 
257 aa  185  5e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2352  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.58 
 
 
250 aa  185  8e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0313  precorrin-4 C11-methyltransferase  38.52 
 
 
251 aa  184  9e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0620  precorrin-4 C11-methyltransferase protein  44.07 
 
 
271 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.263132  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3410  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.05 
 
 
250 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.231837 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2251  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.8 
 
 
257 aa  183  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.476505  normal  0.353064 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2994  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.9 
 
 
264 aa  182  4.0000000000000006e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4589  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.55 
 
 
251 aa  181  1e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00000000120449  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21210  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.41 
 
 
867 aa  178  9e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1342  precorrin-4 C11-methyltransferase  35.89 
 
 
254 aa  177  2e-43  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3231  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.04 
 
 
258 aa  176  4e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00900029  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1853  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.44 
 
 
247 aa  175  6e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>