More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSp0620 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RSp0620  precorrin-4 C11-methyltransferase protein  100 
 
 		 271 aa  545  1e-154  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.263132  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2357  precorrin-4 C11-methyltransferase  59.84 
 
 		 259 aa  287  1e-76  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.342045  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7180  precorrin-4 C11-methyltransferase  53.01 
 
 		 252 aa  250  2e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.987588  normal  0.0970048 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2540  precorrin-4 C11-methyltransferase  56.63 
 
 		 257 aa  249  3e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.789222 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3152  precorrin-4 C11-methyltransferase  53.41 
 
 		 253 aa  242  5e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.422575  normal  0.404272 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2157  precorrin-4 C11-methyltransferase  53.78 
 
 		 280 aa  237  1e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.107141  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0313  precorrin-4 C11-methyltransferase  47.41 
 
 		 251 aa  236  4e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1525  precorrin-4 C11-methyltransferase  53.85 
 
 		 260 aa  235  5.0000000000000005e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.466887 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2446  precorrin-4 C11-methyltransferase  53.78 
 
 		 261 aa  235  6e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.130726  normal  0.124304 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2821  precorrin-4 C11-methyltransferase  53.49 
 
 		 260 aa  234  8e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6025  precorrin-4 C11-methyltransferase  53.01 
 
 		 252 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0102106  normal  0.375652 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0473  precorrin-4 C11-methyltransferase  49 
 
 		 252 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1475  precorrin-4 C11-methyltransferase  53.1 
 
 		 260 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.429453  normal  0.609076 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5844  precorrin-4 C11-methyltransferase  51.55 
 
 		 292 aa  233  2.0000000000000002e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.903403 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2923  precorrin-4 C11-methyltransferase  51.19 
 
 		 264 aa  231  9e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.680231  normal  0.0185874 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2218  precorrin-4 C11-methyltransferase  53.82 
 
 		 264 aa  230  2e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.352147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0808  precorrin-4 C11-methyltransferase  50.59 
 
 		 254 aa  223  2e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2812  precorrin-4 C11-methyltransferase  52.21 
 
 		 266 aa  223  2e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.55111 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1092  precorrin-4 C11-methyltransferase  47.27 
 
 		 254 aa  223  2e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2117  precorrin-4 C11-methyltransferase  51.45 
 
 		 241 aa  223  3e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.105353  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1955  precorrin-4 C11-methyltransferase  51.45 
 
 		 241 aa  223  3e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.132176  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1972  precorrin-4 C11-methyltransferase  51.45 
 
 		 241 aa  223  3e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3278  precorrin-4 C11-methyltransferase  51.39 
 
 		 253 aa  222  4.9999999999999996e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.696559  normal  0.9588 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1376  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.77 
 
 		 252 aa  221  9.999999999999999e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1375  precorrin-4 C11-methyltransferase  48 
 
 		 257 aa  220  1.9999999999999999e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286247 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2635  precorrin-4 C11-methyltransferase  47.6 
 
 		 263 aa  219  3e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.231618  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0259  precorrin-4 C11-methyltransferase  51.04 
 
 		 241 aa  219  3e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1598  precorrin-4 C11-methyltransferase  51.04 
 
 		 241 aa  219  3e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00151458  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1157  precorrin-4 C11-methyltransferase  51.04 
 
 		 241 aa  219  3e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.917528  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3384  precorrin-4 C11-methyltransferase  49.6 
 
 		 253 aa  219  3e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.215023  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0901  precorrin-4 C11-methyltransferase  51.04 
 
 		 241 aa  219  3e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.324814  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25920  precorrin-3 methylase  49 
 
 		 250 aa  219  5e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0297541  normal  0.071417 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1716  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.76 
 
 		 253 aa  218  7e-56  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2374  precorrin-4 C11-methyltransferase  49.42 
 
 		 259 aa  218  7.999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2213  precorrin-3 methylase  48.21 
 
 		 250 aa  218  7.999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.578417  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2501  precorrin-4 C11-methyltransferase  51.87 
 
 		 251 aa  218  1e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.218572 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0969  precorrin-4 C11-methyltransferase  52.21 
 
 		 262 aa  218  1e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2394  precorrin-4 C11-methyltransferase  49.79 
 
 		 241 aa  217  2e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1298  precorrin-4 C11-methyltransferase  49.2 
 
 		 261 aa  216  2e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2352  precorrin-4 C11-methyltransferase  47.01 
 
 		 250 aa  217  2e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1314  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.97 
 
 		 268 aa  216  2.9999999999999998e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0144548  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3020  precorrin-4 C11-methyltransferase  47.79 
 
 		 249 aa  216  4e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.157987 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1013  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.43 
 
 		 253 aa  215  7e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3410  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.61 
 
 		 250 aa  214  9e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.231837 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4829  precorrin-4 C11-methyltransferase  48.76 
 
 		 242 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0449828 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4589  precorrin-4 C11-methyltransferase  47.43 
 
 		 251 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00000000120449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6035  precorrin-4 C11-methyltransferase  47.58 
 
 		 275 aa  214  1.9999999999999998e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1596  precorrin-4 C11-methyltransferase  48.56 
 
 		 242 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.727098  normal  0.416998 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1779  precorrin-4 C11-methyltransferase  50 
 
 		 250 aa  213  1.9999999999999998e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.592244  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0039  precorrin-4 C11-methyltransferase  47.43 
 
 		 258 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1882  precorrin-4 C11-methyltransferase  51 
 
 		 259 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1578  precorrin-4 C11-methyltransferase  48.15 
 
 		 242 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00147705  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1039  precorrin-4 C11-methyltransferase  51.81 
 
 		 266 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0255255 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1564  precorrin-4 C11-methyltransferase  48.35 
 
 		 242 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.253118  normal  0.214845 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1651  precorrin-4 C11-methyltransferase  48.35 
 
 		 242 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5685  precorrin-4 C11-methyltransferase  51 
 
 		 260 aa  212  5.999999999999999e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0876668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1198  precorrin-4 C11-methyltransferase  48.35 
 
 		 242 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1678  precorrin-4 C11-methyltransferase  48.35 
 
 		 242 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0635313  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1166  precorrin-4 C11-methyltransferase  51.41 
 
 		 266 aa  212  5.999999999999999e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.647626  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2530  precorrin-4 C11-methyltransferase  47.01 
 
 		 250 aa  211  7e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00855327 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1968  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.82 
 
 		 261 aa  211  1e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.264672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3139  precorrin-4 C11-methyltransferase  48.55 
 
 		 243 aa  211  1e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.103399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1552  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.09 
 
 		 283 aa  211  1e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.886587 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2087  precorrin-3 methylase  43.37 
 
 		 257 aa  210  2e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1853  precorrin-4 C11-methyltransferase  52.7 
 
 		 247 aa  210  2e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2994  precorrin-4 C11-methyltransferase  48.22 
 
 		 264 aa  209  3e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1262  precorrin-4 C11-methyltransferase  47.39 
 
 		 252 aa  210  3e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2521  precorrin-4 C11-methyltransferase  48.36 
 
 		 250 aa  209  4e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.14903 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0702  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.32 
 
 		 244 aa  209  5e-53  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2484  precorrin-4 C11-methyltransferase  48.36 
 
 		 250 aa  209  5e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2529  precorrin-4 C11-methyltransferase  48.36 
 
 		 250 aa  209  5e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.527305 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21210  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.3 
 
 		 867 aa  208  7e-53  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3260  precorrin-4 C11-methyltransferase  48.61 
 
 		 253 aa  208  7e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.280776 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4477  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.31 
 
 		 610 aa  208  9e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00717843  normal  0.120162 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0483  precorrin-4 C11-methyltransferase  48.22 
 
 		 258 aa  208  9e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3103  precorrin-4 C11-methyltransferase  47.6 
 
 		 248 aa  207  1e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1300  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.99 
 
 		 252 aa  206  2e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2523  precorrin-4 C11-methyltransferase  47.21 
 
 		 298 aa  207  2e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0144072  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3515  precorrin-4 C11-methyltransferase  50 
 
 		 257 aa  207  2e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.312418 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1272  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.98 
 
 		 251 aa  207  2e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3154  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.18 
 
 		 249 aa  206  3e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.134288  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2314  precorrin-4 C11-methyltransferase  50.63 
 
 		 259 aa  206  3e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0491012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1885  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.43 
 
 		 261 aa  206  3e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.804703  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3123  precorrin-4 C11-methyltransferase  51 
 
 		 258 aa  206  4e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5598  Precorrin-4 C(11)-methyltransferase  50 
 
 		 247 aa  205  6e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.0099157  normal  0.596158 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2779  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.03 
 
 		 250 aa  205  7e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.545494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4162  precorrin-4 C11-methyltransferase  49.8 
 
 		 958 aa  204  9e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.329616  normal  0.542159 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2705  precorrin-4 C11-methyltransferase  48.98 
 
 		 308 aa  204  1e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.309557  hitchhiker  0.000105231 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0176  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.8 
 
 		 258 aa  204  1e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0121511  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1294  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.35 
 
 		 248 aa  204  1e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.04031 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3184  precorrin-4 C11-methyltransferase  47.79 
 
 		 259 aa  204  1e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0334  precorrin-4 C11-methyltransferase  53.12 
 
 		 261 aa  204  1e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4243  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.91 
 
 		 257 aa  204  2e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0640  precorrin-4 C11-methyltransferase  49.8 
 
 		 257 aa  203  3e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.194872  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1236  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.08 
 
 		 251 aa  202  4e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3650  precorrin-4 C11-methyltransferase  45.45 
 
 		 252 aa  202  4e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.796321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1430  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.08 
 
 		 251 aa  202  6e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0323621  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1523  precorrin-4 C11-methyltransferase  48.96 
 
 		 280 aa  201  9.999999999999999e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00837984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0934  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.58 
 
 		 250 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2891  precorrin-4 C11-methyltransferase  47.5 
 
 		 261 aa  200  3e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>