More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2357 on replicon NC_008010
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008010  Dgeo_2357  precorrin-4 C11-methyltransferase  100 
 
 		 259 aa  513  1.0000000000000001e-145  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.342045  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0620  precorrin-4 C11-methyltransferase protein  59.84 
 
 		 271 aa  288  5.0000000000000004e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.263132  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4344  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.18 
 
 		 264 aa  226  2e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1092  precorrin-4 C11-methyltransferase  50.59 
 
 		 254 aa  226  3e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1013  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.05 
 
 		 253 aa  223  2e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1265  precorrin-4 C11-methyltransferase  52.16 
 
 		 267 aa  223  2e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0313  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.46 
 
 		 251 aa  219  3.9999999999999997e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1968  precorrin-4 C11-methyltransferase  47.81 
 
 		 261 aa  218  7e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.264672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1887  precorrin-4 C11-methyltransferase  48.19 
 
 		 262 aa  217  1e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0177135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1525  precorrin-4 C11-methyltransferase  53.39 
 
 		 260 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.466887 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0638  precorrin-4 C11-methyltransferase  51.34 
 
 		 271 aa  215  5e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4243  precorrin-4 C11-methyltransferase  45.78 
 
 		 257 aa  215  5.9999999999999996e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0934  precorrin-4 C11-methyltransferase  49.8 
 
 		 250 aa  214  9.999999999999999e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1475  precorrin-4 C11-methyltransferase  53.39 
 
 		 260 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.429453  normal  0.609076 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2821  precorrin-4 C11-methyltransferase  53.39 
 
 		 260 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1294  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.8 
 
 		 248 aa  212  4.9999999999999996e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.04031 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0640  precorrin-4 C11-methyltransferase  50.19 
 
 		 257 aa  212  4.9999999999999996e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.194872  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0702  precorrin-4 C11-methyltransferase  40.08 
 
 		 244 aa  211  1e-53  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1229  precorrin-4 C11-methyltransferase  47.79 
 
 		 264 aa  211  1e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0594011 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0905  precorrin-4 C11-methyltransferase  47.01 
 
 		 269 aa  211  1e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25920  precorrin-3 methylase  51.75 
 
 		 250 aa  211  1e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0297541  normal  0.071417 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1552  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.61 
 
 		 283 aa  209  3e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.886587 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2213  precorrin-3 methylase  50.97 
 
 		 250 aa  209  4e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.578417  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6035  precorrin-4 C11-methyltransferase  48 
 
 		 275 aa  208  6e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1342  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.34 
 
 		 254 aa  208  8e-53  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3020  precorrin-4 C11-methyltransferase  49.21 
 
 		 249 aa  207  1e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.157987 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2087  precorrin-3 methylase  45.06 
 
 		 257 aa  207  2e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0571  precorrin-4 C11-methyltransferase  49.24 
 
 		 272 aa  206  3e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.505536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0473  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.19 
 
 		 252 aa  205  7e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1564  precorrin-4 C11-methyltransferase  52.46 
 
 		 242 aa  204  1e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.253118  normal  0.214845 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1272  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.88 
 
 		 251 aa  204  1e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4589  precorrin-4 C11-methyltransferase  49.6 
 
 		 251 aa  203  2e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00000000120449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1288  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.87 
 
 		 626 aa  203  2e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4305  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.18 
 
 		 257 aa  203  2e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.118024 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2540  precorrin-4 C11-methyltransferase  50.99 
 
 		 257 aa  204  2e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.789222 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1014  precorrin-4 C11-methyltransferase  47.08 
 
 		 626 aa  202  3e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1376  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.05 
 
 		 252 aa  203  3e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3152  precorrin-4 C11-methyltransferase  48.22 
 
 		 253 aa  202  5e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.422575  normal  0.404272 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2711  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.03 
 
 		 248 aa  202  6e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00379668  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1716  precorrin-4 C11-methyltransferase  39.37 
 
 		 253 aa  201  8e-51  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2117  precorrin-4 C11-methyltransferase  51.82 
 
 		 241 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.105353  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1955  precorrin-4 C11-methyltransferase  51.82 
 
 		 241 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.132176  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1972  precorrin-4 C11-methyltransferase  51.82 
 
 		 241 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3154  precorrin-4 C11-methyltransferase  48.03 
 
 		 249 aa  199  3e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.134288  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1578  precorrin-4 C11-methyltransferase  50.82 
 
 		 242 aa  198  6e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00147705  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3260  precorrin-4 C11-methyltransferase  47.81 
 
 		 253 aa  198  7.999999999999999e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.280776 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0259  precorrin-4 C11-methyltransferase  51.42 
 
 		 241 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1157  precorrin-4 C11-methyltransferase  51.42 
 
 		 241 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.917528  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1598  precorrin-4 C11-methyltransferase  51.42 
 
 		 241 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00151458  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1747  precorrin-4 C11-methyltransferase  40.55 
 
 		 254 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.129763  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1596  precorrin-4 C11-methyltransferase  51.23 
 
 		 242 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.727098  normal  0.416998 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2394  precorrin-4 C11-methyltransferase  50.82 
 
 		 241 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3139  precorrin-4 C11-methyltransferase  48.77 
 
 		 243 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.103399  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1298  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.84 
 
 		 261 aa  197  1.0000000000000001e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0901  precorrin-4 C11-methyltransferase  51.42 
 
 		 241 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.324814  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4477  precorrin-4 C11-methyltransferase  40.56 
 
 		 610 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00717843  normal  0.120162 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3103  precorrin-4 C11-methyltransferase  47.81 
 
 		 248 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1314  precorrin-4 C11-methyltransferase  45.88 
 
 		 268 aa  196  3e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0144548  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4829  precorrin-4 C11-methyltransferase  50.61 
 
 		 242 aa  196  3e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0449828 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2129  precorrin-4 C11-methyltransferase  45.06 
 
 		 259 aa  196  3e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000738255 
 
 
-
 
NC_002950  PG0211  cobalamin biosynthesis protein CbiG/precorrin-4 C11-methyltransferase  42.17 
 
 		 614 aa  195  5.000000000000001e-49  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1651  precorrin-4 C11-methyltransferase  50.2 
 
 		 242 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1198  precorrin-4 C11-methyltransferase  50.2 
 
 		 242 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1678  precorrin-4 C11-methyltransferase  50.2 
 
 		 242 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0635313  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1011  precorrin-4 C11-methyltransferase  40.48 
 
 		 254 aa  195  6e-49  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.04114  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2994  precorrin-4 C11-methyltransferase  47.01 
 
 		 264 aa  195  7e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5365  precorrin-4 C11-methyltransferase  50.43 
 
 		 241 aa  194  1e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.973627 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2635  precorrin-4 C11-methyltransferase  45.91 
 
 		 263 aa  193  2e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.231618  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7180  precorrin-4 C11-methyltransferase  45.42 
 
 		 252 aa  193  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.987588  normal  0.0970048 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0934  precorrin-4 C11-methyltransferase  40.08 
 
 		 254 aa  193  3e-48  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.23833  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2779  precorrin-4 C11-methyltransferase  47.81 
 
 		 250 aa  192  3e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.545494  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2218  precorrin-4 C11-methyltransferase  47.41 
 
 		 264 aa  192  5e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.352147  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3410  precorrin-4 C11-methyltransferase  45.82 
 
 		 250 aa  191  9e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.231837 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05231  putative precorrin-4 C11-methyltransferase  38.25 
 
 		 251 aa  191  9e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2923  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.22 
 
 		 264 aa  191  9e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.680231  normal  0.0185874 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0614  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.14 
 
 		 249 aa  191  1e-47  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00328163  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0962  precorrin-4 C11-methyltransferase  38.65 
 
 		 254 aa  191  1e-47  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.6045  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2609  precorrin-4 C11-methyltransferase  45.74 
 
 		 257 aa  190  2e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3384  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.88 
 
 		 253 aa  190  2e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.215023  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1882  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.69 
 
 		 259 aa  190  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1430  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.06 
 
 		 251 aa  190  2e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0323621  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1236  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.06 
 
 		 251 aa  190  2e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2352  precorrin-4 C11-methyltransferase  45.28 
 
 		 250 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0459  precorrin-4 C11-methyltransferase  38.25 
 
 		 251 aa  189  2.9999999999999997e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.20999  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1249  precorrin-4 C11-methyltransferase / precorrin-2 C20-methyltransferase  50 
 
 		 241 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.230063  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0808  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.22 
 
 		 254 aa  189  4e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1557  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.97 
 
 		 256 aa  189  5e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1039  precorrin-4 C11-methyltransferase  48.61 
 
 		 266 aa  188  5.999999999999999e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0255255 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0039  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.75 
 
 		 258 aa  188  7e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1375  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.57 
 
 		 257 aa  188  9e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286247 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0483  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.44 
 
 		 258 aa  187  1e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2530  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.22 
 
 		 250 aa  187  1e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00855327 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21210  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.92 
 
 		 867 aa  187  2e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05151  putative precorrin-4 C11-methyltransferase  38.98 
 
 		 251 aa  186  2e-46  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.190612  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1166  precorrin-4 C11-methyltransferase  48.21 
 
 		 266 aa  187  2e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.647626  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0059  precorrin-4 C11-methyltransferase  39.61 
 
 		 256 aa  186  2e-46  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4162  precorrin-4 C11-methyltransferase  47.27 
 
 		 958 aa  186  5e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.329616  normal  0.542159 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2501  precorrin-4 C11-methyltransferase  47.35 
 
 		 251 aa  185  7e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.218572 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3231  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.44 
 
 		 258 aa  185  8e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00900029  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0969  precorrin-4 C11-methyltransferase  48.21 
 
 		 262 aa  184  9e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>