More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0211 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG0211  cobalamin biosynthesis protein CbiG/precorrin-4 C11-methyltransferase  100 
 
 		 614 aa  1267    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4477  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.58 
 
 		 610 aa  582  1e-164  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00717843  normal  0.120162 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1288  precorrin-4 C11-methyltransferase  47.67 
 
 		 626 aa  546  1e-154  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1014  precorrin-4 C11-methyltransferase  48.07 
 
 		 626 aa  529  1e-149  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1013  precorrin-4 C11-methyltransferase  49.59 
 
 		 253 aa  264  3e-69  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1968  precorrin-4 C11-methyltransferase  47.56 
 
 		 261 aa  238  3e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.264672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2711  precorrin-4 C11-methyltransferase  45.71 
 
 		 248 aa  237  4e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00379668  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1342  precorrin-4 C11-methyltransferase  47.56 
 
 		 254 aa  236  1.0000000000000001e-60  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0313  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.53 
 
 		 251 aa  235  2.0000000000000002e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1236  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.91 
 
 		 251 aa  233  6e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1430  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.91 
 
 		 251 aa  233  1e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0323621  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1887  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.15 
 
 		 262 aa  232  2e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0177135  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1298  precorrin-4 C11-methyltransferase  47.37 
 
 		 261 aa  227  4e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0934  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.9 
 
 		 254 aa  225  2e-57  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.23833  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1376  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.56 
 
 		 252 aa  223  9e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2994  precorrin-4 C11-methyltransferase  45.02 
 
 		 264 aa  222  1.9999999999999999e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1272  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.31 
 
 		 251 aa  222  1.9999999999999999e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1747  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.08 
 
 		 254 aa  222  1.9999999999999999e-56  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.129763  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0039  precorrin-4 C11-methyltransferase  45.6 
 
 		 258 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0483  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.4 
 
 		 258 aa  221  3e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1011  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.08 
 
 		 254 aa  221  3.9999999999999997e-56  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.04114  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1552  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.54 
 
 		 283 aa  221  3.9999999999999997e-56  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.886587 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2129  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.61 
 
 		 259 aa  221  5e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000738255 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21210  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.31 
 
 		 867 aa  216  7e-55  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3231  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.61 
 
 		 258 aa  216  8e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00900029  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0614  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.5 
 
 		 249 aa  216  9.999999999999999e-55  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00328163  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0905  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.5 
 
 		 269 aa  213  7.999999999999999e-54  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3650  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.53 
 
 		 252 aa  212  2e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.796321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0473  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.9 
 
 		 252 aa  212  2e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1229  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.09 
 
 		 264 aa  212  2e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0594011 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0933  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.73 
 
 		 260 aa  211  2e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00452437 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0571  precorrin-4 C11-methyltransferase  45.7 
 
 		 272 aa  211  4e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.505536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04601  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.04 
 
 		 250 aa  210  7e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.909229  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1294  precorrin-4 C11-methyltransferase  45.12 
 
 		 248 aa  209  8e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.04031 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1092  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.9 
 
 		 254 aa  209  8e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0962  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.04 
 
 		 254 aa  208  2e-52  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.6045  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0059  precorrin-4 C11-methyltransferase  40.57 
 
 		 256 aa  209  2e-52  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4344  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.11 
 
 		 264 aa  207  3e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1716  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.68 
 
 		 253 aa  207  4e-52  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0559  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.97 
 
 		 262 aa  207  4e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.628877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2087  precorrin-3 methylase  41.98 
 
 		 257 aa  207  7e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4243  precorrin-4 C11-methyltransferase  40.57 
 
 		 257 aa  206  1e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1557  precorrin-4 C11-methyltransferase  45.78 
 
 		 256 aa  206  1e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3607  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.35 
 
 		 261 aa  204  3e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1718  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.08 
 
 		 598 aa  204  4e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.956767  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1265  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.92 
 
 		 267 aa  203  8e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0638  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.31 
 
 		 271 aa  202  9.999999999999999e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0702  precorrin-4 C11-methyltransferase  40.5 
 
 		 244 aa  202  9.999999999999999e-51  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05141  putative precorrin-4 C11-methyltransferase  41.46 
 
 		 252 aa  202  1.9999999999999998e-50  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.614023  normal  0.388015 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05151  putative precorrin-4 C11-methyltransferase  39.52 
 
 		 251 aa  202  1.9999999999999998e-50  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.190612  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04841  putative precorrin-4 C11-methyltransferase  38.71 
 
 		 251 aa  201  3e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3541  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.95 
 
 		 261 aa  201  3e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06621  putative precorrin-4 C11-methyltransferase  40.41 
 
 		 251 aa  201  5e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1791  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.06 
 
 		 250 aa  200  6e-50  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05231  putative precorrin-4 C11-methyltransferase  38.21 
 
 		 251 aa  200  6e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2609  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.18 
 
 		 257 aa  199  9e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0620  precorrin-4 C11-methyltransferase protein  43.72 
 
 		 271 aa  199  2.0000000000000003e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.263132  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0050  precorrin-4 C11-methyltransferase  44 
 
 		 255 aa  198  2.0000000000000003e-49  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1177  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.35 
 
 		 305 aa  198  3e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0459  precorrin-4 C11-methyltransferase  38.62 
 
 		 251 aa  197  3e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.20999  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0934  precorrin-4 C11-methyltransferase  39.59 
 
 		 250 aa  198  3e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1980  precorrin-4 C11-methyltransferase  40.89 
 
 		 287 aa  197  5.000000000000001e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3384  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.34 
 
 		 253 aa  196  1e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.215023  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2357  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.17 
 
 		 259 aa  195  2e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.342045  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0801  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.41 
 
 		 266 aa  194  4e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4305  precorrin-4 C11-methyltransferase  40.57 
 
 		 257 aa  193  7e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.118024 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2151  precorrin-4 C11-methyltransferase  39.02 
 
 		 257 aa  192  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0163963  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2198  precorrin-4 C11-methyltransferase  39.02 
 
 		 257 aa  191  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.333099  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2205  precorrin-4 C11-methyltransferase  39.02 
 
 		 257 aa  191  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3152  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.37 
 
 		 253 aa  191  4e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.422575  normal  0.404272 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2300  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.32 
 
 		 273 aa  191  5e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.366203  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2251  precorrin-4 C11-methyltransferase  39.02 
 
 		 257 aa  189  9e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.476505  normal  0.353064 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25920  precorrin-3 methylase  42.11 
 
 		 250 aa  190  9e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0297541  normal  0.071417 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2364  precorrin-4 C11-methyltransferase  38.62 
 
 		 257 aa  189  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2635  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.94 
 
 		 263 aa  189  1e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.231618  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2213  precorrin-3 methylase  41.3 
 
 		 250 aa  186  9e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.578417  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1853  precorrin-4 C11-methyltransferase  40.17 
 
 		 247 aa  186  1.0000000000000001e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4162  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.17 
 
 		 958 aa  184  3e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.329616  normal  0.542159 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2779  precorrin-4 C11-methyltransferase  40.31 
 
 		 284 aa  184  6e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.25946  normal  0.0736251 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2157  precorrin-4 C11-methyltransferase  40.96 
 
 		 280 aa  182  2e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.107141  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1885  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.34 
 
 		 261 aa  182  2e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.804703  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3737  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.08 
 
 		 275 aa  182  2e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0625  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.22 
 
 		 253 aa  181  2.9999999999999997e-44  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1375  precorrin-4 C11-methyltransferase  39.27 
 
 		 257 aa  181  4e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286247 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1078  hypothetical protein  40.08 
 
 		 237 aa  180  8e-44  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0640  precorrin-4 C11-methyltransferase  40.73 
 
 		 257 aa  180  9e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.194872  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1262  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.53 
 
 		 252 aa  179  1e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2163  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.5 
 
 		 274 aa  179  1e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.233438 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2374  precorrin-4 C11-methyltransferase  39.68 
 
 		 259 aa  179  2e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5844  precorrin-4 C11-methyltransferase  40.08 
 
 		 292 aa  178  3e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.903403 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1314  precorrin-4 C11-methyltransferase  39.76 
 
 		 268 aa  177  4e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0144548  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2446  precorrin-4 C11-methyltransferase  40.16 
 
 		 261 aa  177  5e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.130726  normal  0.124304 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2314  precorrin-4 C11-methyltransferase  40.09 
 
 		 259 aa  177  5e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0491012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3136  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.46 
 
 		 272 aa  177  5e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.749873 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1039  precorrin-4 C11-methyltransferase  39.68 
 
 		 266 aa  177  6e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0255255 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1475  precorrin-4 C11-methyltransferase  39.27 
 
 		 260 aa  177  6e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.429453  normal  0.609076 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1351  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.29 
 
 		 259 aa  177  6e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1264  precorrin-3B C17-methyltransferase  28.55 
 
 		 778 aa  176  9.999999999999999e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1300  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.13 
 
 		 252 aa  176  9.999999999999999e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2821  precorrin-4 C11-methyltransferase  38.87 
 
 		 260 aa  176  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>