More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1014 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_1288  precorrin-4 C11-methyltransferase  59.68 
 
 		 626 aa  722    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1014  precorrin-4 C11-methyltransferase  100 
 
 		 626 aa  1271    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4477  precorrin-4 C11-methyltransferase  48.3 
 
 		 610 aa  603  1.0000000000000001e-171  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00717843  normal  0.120162 
 
 
-
 
NC_002950  PG0211  cobalamin biosynthesis protein CbiG/precorrin-4 C11-methyltransferase  48.07 
 
 		 614 aa  538  1e-151  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1013  precorrin-4 C11-methyltransferase  47.6 
 
 		 253 aa  251  3e-65  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0313  precorrin-4 C11-methyltransferase  48.78 
 
 		 251 aa  244  3e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1092  precorrin-4 C11-methyltransferase  53.66 
 
 		 254 aa  244  3.9999999999999997e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2711  precorrin-4 C11-methyltransferase  50.41 
 
 		 248 aa  243  7.999999999999999e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00379668  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1887  precorrin-4 C11-methyltransferase  49.61 
 
 		 262 aa  242  2e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0177135  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1298  precorrin-4 C11-methyltransferase  51.82 
 
 		 261 aa  238  3e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1294  precorrin-4 C11-methyltransferase  49.8 
 
 		 248 aa  235  2.0000000000000002e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.04031 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2129  precorrin-4 C11-methyltransferase  51.39 
 
 		 259 aa  234  3e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000738255 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1968  precorrin-4 C11-methyltransferase  47.41 
 
 		 261 aa  234  4.0000000000000004e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.264672  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2994  precorrin-4 C11-methyltransferase  50.2 
 
 		 264 aa  231  2e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1342  precorrin-4 C11-methyltransferase  47.56 
 
 		 254 aa  229  1e-58  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0483  precorrin-4 C11-methyltransferase  49.4 
 
 		 258 aa  229  1e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1229  precorrin-4 C11-methyltransferase  48.37 
 
 		 264 aa  229  1e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0594011 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1236  precorrin-4 C11-methyltransferase  45.75 
 
 		 251 aa  229  1e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0614  precorrin-4 C11-methyltransferase  47.37 
 
 		 249 aa  228  3e-58  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00328163  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1430  precorrin-4 C11-methyltransferase  45.75 
 
 		 251 aa  227  4e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0323621  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0905  precorrin-4 C11-methyltransferase  46 
 
 		 269 aa  227  5.0000000000000005e-58  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1272  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.18 
 
 		 251 aa  226  1e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0039  precorrin-4 C11-methyltransferase  48.61 
 
 		 258 aa  225  2e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3231  precorrin-4 C11-methyltransferase  49.6 
 
 		 258 aa  224  3e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00900029  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3607  precorrin-4 C11-methyltransferase  49 
 
 		 261 aa  223  9.999999999999999e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4344  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.18 
 
 		 264 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21210  precorrin-4 C11-methyltransferase  46 
 
 		 867 aa  221  3e-56  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4243  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.72 
 
 		 257 aa  218  2e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3541  precorrin-4 C11-methyltransferase  48.61 
 
 		 261 aa  218  4e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1376  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.95 
 
 		 252 aa  217  5e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3650  precorrin-4 C11-methyltransferase  48.78 
 
 		 252 aa  216  7e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.796321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0473  precorrin-4 C11-methyltransferase  47.79 
 
 		 252 aa  216  9.999999999999999e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05151  putative precorrin-4 C11-methyltransferase  42.28 
 
 		 251 aa  216  9.999999999999999e-55  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.190612  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1716  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.53 
 
 		 253 aa  214  2.9999999999999995e-54  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0934  precorrin-4 C11-methyltransferase  45.71 
 
 		 250 aa  214  2.9999999999999995e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1265  precorrin-4 C11-methyltransferase  48.63 
 
 		 267 aa  213  5.999999999999999e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0933  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.05 
 
 		 260 aa  213  7e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00452437 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04841  putative precorrin-4 C11-methyltransferase  41.87 
 
 		 251 aa  212  1e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0702  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.28 
 
 		 244 aa  213  1e-53  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05231  putative precorrin-4 C11-methyltransferase  40.65 
 
 		 251 aa  211  2e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1552  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.37 
 
 		 283 aa  211  2e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.886587 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0571  precorrin-4 C11-methyltransferase  48.31 
 
 		 272 aa  212  2e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.505536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0934  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.49 
 
 		 254 aa  211  3e-53  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.23833  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0059  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.39 
 
 		 256 aa  210  8e-53  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1747  precorrin-4 C11-methyltransferase  45.12 
 
 		 254 aa  209  9e-53  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.129763  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1011  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.49 
 
 		 254 aa  209  1e-52  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.04114  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2087  precorrin-3 methylase  42.68 
 
 		 257 aa  209  1e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0459  precorrin-4 C11-methyltransferase  40.24 
 
 		 251 aa  208  2e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.20999  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2357  precorrin-4 C11-methyltransferase  47.08 
 
 		 259 aa  208  3e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.342045  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04601  precorrin-4 C11-methyltransferase  40.16 
 
 		 250 aa  207  3e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.909229  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2609  precorrin-4 C11-methyltransferase  49 
 
 		 257 aa  207  5e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0962  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.31 
 
 		 254 aa  207  6e-52  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.6045  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1557  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.59 
 
 		 256 aa  206  1e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4305  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.13 
 
 		 257 aa  205  2e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.118024 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1718  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.76 
 
 		 598 aa  203  8e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.956767  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0640  precorrin-4 C11-methyltransferase  47.43 
 
 		 257 aa  202  9.999999999999999e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.194872  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0638  precorrin-4 C11-methyltransferase  47.06 
 
 		 271 aa  202  1.9999999999999998e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0050  precorrin-4 C11-methyltransferase  47.84 
 
 		 255 aa  200  6e-50  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0620  precorrin-4 C11-methyltransferase protein  47.18 
 
 		 271 aa  199  2.0000000000000003e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.263132  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1853  precorrin-4 C11-methyltransferase  48.73 
 
 		 247 aa  198  3e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05141  putative precorrin-4 C11-methyltransferase  41.43 
 
 		 252 aa  197  4.0000000000000005e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.614023  normal  0.388015 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6035  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.5 
 
 		 275 aa  197  6e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1980  precorrin-4 C11-methyltransferase  40 
 
 		 287 aa  197  7e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0559  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.59 
 
 		 262 aa  196  1e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.628877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1791  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.2 
 
 		 250 aa  195  2e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1177  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.86 
 
 		 305 aa  195  2e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06621  putative precorrin-4 C11-methyltransferase  44.53 
 
 		 251 aa  194  4e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2300  precorrin-4 C11-methyltransferase  45.1 
 
 		 273 aa  192  2e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.366203  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3152  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.72 
 
 		 253 aa  192  2e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.422575  normal  0.404272 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1314  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.4 
 
 		 268 aa  191  2e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0144548  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25920  precorrin-3 methylase  44.72 
 
 		 250 aa  192  2e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0297541  normal  0.071417 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2151  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.34 
 
 		 257 aa  192  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0163963  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2213  precorrin-3 methylase  44.62 
 
 		 250 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.578417  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0801  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.48 
 
 		 266 aa  191  5e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3136  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.44 
 
 		 272 aa  190  7e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.749873 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2198  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.94 
 
 		 257 aa  189  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.333099  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2205  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.94 
 
 		 257 aa  189  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1264  precorrin-3B C17-methyltransferase  30.98 
 
 		 778 aa  188  3e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2364  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.53 
 
 		 257 aa  187  5e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0806  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  43.65 
 
 		 273 aa  186  1.0000000000000001e-45  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2251  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.53 
 
 		 257 aa  186  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.476505  normal  0.353064 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2635  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.73 
 
 		 263 aa  184  4.0000000000000006e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.231618  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2779  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.68 
 
 		 250 aa  183  1e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.545494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4162  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.92 
 
 		 958 aa  183  1e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.329616  normal  0.542159 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0572  precorrin-3B C17-methyltransferase  30.74 
 
 		 800 aa  182  2e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3139  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.59 
 
 		 243 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.103399  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3103  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.34 
 
 		 248 aa  181  4.999999999999999e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0808  precorrin-4 C11-methyltransferase  40.87 
 
 		 254 aa  180  9e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3384  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.6 
 
 		 253 aa  179  1e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.215023  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0694  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  41.53 
 
 		 247 aa  179  1e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.210241  hitchhiker  0.0000263723 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2530  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.46 
 
 		 250 aa  179  1e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00855327 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1078  hypothetical protein  43.88 
 
 		 237 aa  178  2e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1737  precorrin-4 C11-methyltransferase region  42.34 
 
 		 251 aa  178  3e-43  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.489626  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4589  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.53 
 
 		 251 aa  177  5e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00000000120449  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5365  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.92 
 
 		 241 aa  177  7e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.973627 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0625  precorrin-4 C11-methyltransferase  42 
 
 		 253 aa  176  9.999999999999999e-43  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1249  precorrin-4 C11-methyltransferase / precorrin-2 C20-methyltransferase  44.92 
 
 		 241 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.230063  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2446  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.58 
 
 		 261 aa  176  9.999999999999999e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.130726  normal  0.124304 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1578  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.88 
 
 		 242 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00147705  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1596  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.88 
 
 		 242 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.727098  normal  0.416998 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>