More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA2300 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA2300  precorrin-4 C11-methyltransferase  100 
 
 		 273 aa  540  9.999999999999999e-153  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.366203  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0068  precorrin-4 C11-methyltransferase  74.12 
 
 		 293 aa  362  4e-99  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.658841  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1024  precorrin-4 C11-methyltransferase  72.66 
 
 		 281 aa  361  6e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.249462  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2163  precorrin-4 C11-methyltransferase  69.85 
 
 		 274 aa  358  7e-98  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.233438 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2779  precorrin-4 C11-methyltransferase  71.26 
 
 		 284 aa  357  9.999999999999999e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.25946  normal  0.0736251 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3737  precorrin-4 C11-methyltransferase  71.81 
 
 		 275 aa  354  6.999999999999999e-97  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1693  precorrin-4 C11-methyltransferase  68.24 
 
 		 269 aa  349  3e-95  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.301759 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3136  precorrin-4 C11-methyltransferase  69.29 
 
 		 272 aa  328  4e-89  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.749873 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0473  precorrin-4 C11-methyltransferase  71.81 
 
 		 260 aa  326  2.0000000000000001e-88  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0438  cobalt-precorrin-4 methyltransferase  71.81 
 
 		 260 aa  326  2.0000000000000001e-88  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1351  precorrin-4 C11-methyltransferase  62.6 
 
 		 259 aa  295  5e-79  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1013  precorrin-4 C11-methyltransferase  47.83 
 
 		 253 aa  243  1.9999999999999999e-63  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1294  precorrin-4 C11-methyltransferase  49.8 
 
 		 248 aa  242  3.9999999999999997e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.04031 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2087  precorrin-3 methylase  51.38 
 
 		 257 aa  237  2e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1092  precorrin-4 C11-methyltransferase  53.15 
 
 		 254 aa  234  1.0000000000000001e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1557  precorrin-4 C11-methyltransferase  47.67 
 
 		 256 aa  230  2e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0614  precorrin-4 C11-methyltransferase  47.27 
 
 		 249 aa  227  1e-58  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00328163  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1272  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.25 
 
 		 251 aa  226  3e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0039  precorrin-4 C11-methyltransferase  48.81 
 
 		 258 aa  226  4e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0933  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.09 
 
 		 260 aa  226  5.0000000000000005e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00452437 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0059  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.58 
 
 		 256 aa  224  9e-58  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0313  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.75 
 
 		 251 aa  223  2e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21210  precorrin-4 C11-methyltransferase  45.88 
 
 		 867 aa  223  3e-57  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2994  precorrin-4 C11-methyltransferase  49.4 
 
 		 264 aa  222  4.9999999999999996e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0483  precorrin-4 C11-methyltransferase  48.81 
 
 		 258 aa  222  6e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0934  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.08 
 
 		 254 aa  221  9.999999999999999e-57  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.23833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0571  precorrin-4 C11-methyltransferase  48.47 
 
 		 272 aa  221  9.999999999999999e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.505536  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1265  precorrin-4 C11-methyltransferase  50 
 
 		 267 aa  219  5e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0473  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.69 
 
 		 252 aa  218  1e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1747  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.7 
 
 		 254 aa  218  1e-55  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.129763  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2609  precorrin-4 C11-methyltransferase  47.47 
 
 		 257 aa  217  1e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1011  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.69 
 
 		 254 aa  217  1e-55  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.04114  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0962  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.67 
 
 		 254 aa  216  2e-55  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.6045  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1430  precorrin-4 C11-methyltransferase  45.06 
 
 		 251 aa  216  4e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0323621  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1236  precorrin-4 C11-methyltransferase  45.06 
 
 		 251 aa  215  5e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4477  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.35 
 
 		 610 aa  215  7e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00717843  normal  0.120162 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0638  precorrin-4 C11-methyltransferase  47.27 
 
 		 271 aa  213  1.9999999999999998e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1716  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.96 
 
 		 253 aa  213  2.9999999999999995e-54  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1298  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.51 
 
 		 261 aa  212  5.999999999999999e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2213  precorrin-3 methylase  48.82 
 
 		 250 aa  211  7.999999999999999e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.578417  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0702  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.67 
 
 		 244 aa  209  3e-53  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2129  precorrin-4 C11-methyltransferase  48.62 
 
 		 259 aa  210  3e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000738255 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3607  precorrin-4 C11-methyltransferase  47.64 
 
 		 261 aa  208  8e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0640  precorrin-4 C11-methyltransferase  47.27 
 
 		 257 aa  207  1e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.194872  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2711  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.88 
 
 		 248 aa  207  2e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00379668  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25920  precorrin-3 methylase  48.82 
 
 		 250 aa  206  2e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0297541  normal  0.071417 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3541  precorrin-4 C11-methyltransferase  47.64 
 
 		 261 aa  206  3e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2198  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.27 
 
 		 257 aa  205  7e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.333099  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2205  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.27 
 
 		 257 aa  205  8e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2151  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.27 
 
 		 257 aa  204  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0163963  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2251  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.85 
 
 		 257 aa  204  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.476505  normal  0.353064 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3231  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.03 
 
 		 258 aa  204  1e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00900029  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2364  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.87 
 
 		 257 aa  203  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3650  precorrin-4 C11-methyltransferase  47.83 
 
 		 252 aa  203  2e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.796321  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0211  cobalamin biosynthesis protein CbiG/precorrin-4 C11-methyltransferase  42.32 
 
 		 614 aa  201  8e-51  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1342  precorrin-4 C11-methyltransferase  39.45 
 
 		 254 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1718  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.92 
 
 		 598 aa  199  3e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.956767  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0934  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.27 
 
 		 250 aa  199  3e-50  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0801  precorrin-4 C11-methyltransferase  45.38 
 
 		 266 aa  198  7.999999999999999e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0114  precorrin-4 C11-methyltransferase  39.06 
 
 		 262 aa  198  1.0000000000000001e-49  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.177043  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1376  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.5 
 
 		 252 aa  197  1.0000000000000001e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1014  precorrin-4 C11-methyltransferase  45.1 
 
 		 626 aa  195  6e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1288  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.33 
 
 		 626 aa  195  7e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0559  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.88 
 
 		 262 aa  189  4e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.628877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1177  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.71 
 
 		 305 aa  189  5.999999999999999e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2357  precorrin-4 C11-methyltransferase  45.91 
 
 		 259 aa  188  7e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.342045  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2779  precorrin-4 C11-methyltransferase  45.02 
 
 		 250 aa  186  3e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.545494  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1314  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.06 
 
 		 268 aa  186  3e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0144548  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3139  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.69 
 
 		 243 aa  186  4e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.103399  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3020  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.82 
 
 		 249 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.157987 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4162  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.85 
 
 		 958 aa  183  3e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.329616  normal  0.542159 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2530  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.09 
 
 		 250 aa  182  6e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00855327 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3154  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.03 
 
 		 249 aa  181  1e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.134288  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2352  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.31 
 
 		 250 aa  180  2e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1521  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.02 
 
 		 261 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000101409 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0459  precorrin-4 C11-methyltransferase  37.01 
 
 		 251 aa  179  4e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.20999  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2394  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.12 
 
 		 241 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0050  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.57 
 
 		 255 aa  179  5.999999999999999e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04601  precorrin-4 C11-methyltransferase  40.4 
 
 		 250 aa  178  7e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.909229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3103  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.83 
 
 		 248 aa  178  8e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4589  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.52 
 
 		 251 aa  178  9e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00000000120449  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1596  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.53 
 
 		 242 aa  178  9e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.727098  normal  0.416998 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3410  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.52 
 
 		 250 aa  178  1e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.231837 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1968  precorrin-4 C11-methyltransferase  39.92 
 
 		 261 aa  178  1e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.264672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05231  putative precorrin-4 C11-methyltransferase  37.4 
 
 		 251 aa  177  1e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3384  precorrin-4 C11-methyltransferase  45.67 
 
 		 253 aa  177  2e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.215023  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1887  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.43 
 
 		 262 aa  177  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0177135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0176  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.46 
 
 		 258 aa  177  2e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0121511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1578  precorrin-4 C11-methyltransferase  45.71 
 
 		 242 aa  177  2e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00147705  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0905  precorrin-4 C11-methyltransferase  39.69 
 
 		 269 aa  176  3e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6035  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.27 
 
 		 275 aa  176  4e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12107  precorrin-4 C11-methyltransferase cobM  45.06 
 
 		 251 aa  176  5e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.182153  normal  0.885771 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1198  precorrin-4 C11-methyltransferase  45.87 
 
 		 242 aa  176  5e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1678  precorrin-4 C11-methyltransferase  45.87 
 
 		 242 aa  176  5e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0635313  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1564  precorrin-4 C11-methyltransferase  45.45 
 
 		 242 aa  175  6e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.253118  normal  0.214845 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2635  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.9 
 
 		 263 aa  175  6e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.231618  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1651  precorrin-4 C11-methyltransferase  45.87 
 
 		 242 aa  175  6e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1375  precorrin-4 C11-methyltransferase  40.31 
 
 		 257 aa  175  7e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286247 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05151  putative precorrin-4 C11-methyltransferase  37.65 
 
 		 251 aa  175  9e-43  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.190612  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3152  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.25 
 
 		 253 aa  174  9.999999999999999e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.422575  normal  0.404272 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>