More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_0068 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_0068  precorrin-4 C11-methyltransferase  100 
 
 
293 aa  588  1e-167  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.658841  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2163  precorrin-4 C11-methyltransferase  75.09 
 
 
274 aa  394  1e-109  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.233438 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1024  precorrin-4 C11-methyltransferase  77.99 
 
 
281 aa  389  1e-107  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.249462  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2779  precorrin-4 C11-methyltransferase  76.05 
 
 
284 aa  387  1e-106  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.25946  normal  0.0736251 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2300  precorrin-4 C11-methyltransferase  74.12 
 
 
273 aa  379  1e-104  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.366203  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0438  cobalt-precorrin-4 methyltransferase  82.1 
 
 
260 aa  378  1e-104  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0473  precorrin-4 C11-methyltransferase  82.1 
 
 
260 aa  378  1e-104  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3737  precorrin-4 C11-methyltransferase  71.75 
 
 
275 aa  375  1e-103  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1693  precorrin-4 C11-methyltransferase  69.7 
 
 
269 aa  367  1e-100  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.301759 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3136  precorrin-4 C11-methyltransferase  67.45 
 
 
272 aa  321  9.999999999999999e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.749873 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1351  precorrin-4 C11-methyltransferase  62.99 
 
 
259 aa  308  5e-83  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1294  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.22 
 
 
248 aa  229  4e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.04031 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1013  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.91 
 
 
253 aa  224  1e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1557  precorrin-4 C11-methyltransferase  45.35 
 
 
256 aa  223  4e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2087  precorrin-3 methylase  45.98 
 
 
257 aa  222  4.9999999999999996e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1092  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.67 
 
 
254 aa  220  1.9999999999999999e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2994  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.22 
 
 
264 aa  218  1e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2609  precorrin-4 C11-methyltransferase  47.43 
 
 
257 aa  217  2e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0483  precorrin-4 C11-methyltransferase  45.24 
 
 
258 aa  216  2.9999999999999998e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0039  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.65 
 
 
258 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0934  precorrin-4 C11-methyltransferase  42 
 
 
254 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.23833  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1272  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.9 
 
 
251 aa  213  3.9999999999999995e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0571  precorrin-4 C11-methyltransferase  45.38 
 
 
272 aa  212  5.999999999999999e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.505536  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1747  precorrin-4 C11-methyltransferase  42 
 
 
254 aa  211  7.999999999999999e-54  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.129763  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1011  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.5 
 
 
254 aa  210  2e-53  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.04114  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0313  precorrin-4 C11-methyltransferase  39.06 
 
 
251 aa  210  2e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21210  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.79 
 
 
867 aa  210  3e-53  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1298  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.97 
 
 
261 aa  209  6e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0614  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.31 
 
 
249 aa  208  1e-52  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00328163  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3231  precorrin-4 C11-methyltransferase  45.82 
 
 
258 aa  207  2e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00900029  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3541  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.61 
 
 
261 aa  205  6e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1716  precorrin-4 C11-methyltransferase  38.98 
 
 
253 aa  204  1e-51  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3607  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.22 
 
 
261 aa  204  1e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1236  precorrin-4 C11-methyltransferase  40 
 
 
251 aa  204  2e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4477  precorrin-4 C11-methyltransferase  40.46 
 
 
610 aa  203  3e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00717843  normal  0.120162 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0934  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.05 
 
 
250 aa  202  5e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1430  precorrin-4 C11-methyltransferase  40 
 
 
251 aa  202  5e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0323621  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0114  precorrin-4 C11-methyltransferase  36.61 
 
 
262 aa  202  6e-51  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.177043  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1265  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.19 
 
 
267 aa  200  1.9999999999999998e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0933  precorrin-4 C11-methyltransferase  37.25 
 
 
260 aa  200  1.9999999999999998e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00452437 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2198  precorrin-4 C11-methyltransferase  39.45 
 
 
257 aa  199  3.9999999999999996e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.333099  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0638  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.97 
 
 
271 aa  199  3.9999999999999996e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2205  precorrin-4 C11-methyltransferase  39.45 
 
 
257 aa  199  6e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0702  precorrin-4 C11-methyltransferase  36.51 
 
 
244 aa  198  7e-50  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2251  precorrin-4 C11-methyltransferase  39.45 
 
 
257 aa  198  7.999999999999999e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.476505  normal  0.353064 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2151  precorrin-4 C11-methyltransferase  39.06 
 
 
257 aa  197  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0163963  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0962  precorrin-4 C11-methyltransferase  38.15 
 
 
254 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.6045  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2129  precorrin-4 C11-methyltransferase  45.67 
 
 
259 aa  197  1.0000000000000001e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000738255 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1288  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.97 
 
 
626 aa  197  2.0000000000000003e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2364  precorrin-4 C11-methyltransferase  39.06 
 
 
257 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0059  precorrin-4 C11-methyltransferase  37.55 
 
 
256 aa  195  7e-49  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1718  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.08 
 
 
598 aa  191  1e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.956767  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2711  precorrin-4 C11-methyltransferase  39.68 
 
 
248 aa  190  2e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00379668  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0473  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.11 
 
 
252 aa  190  2e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0640  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.57 
 
 
257 aa  188  8e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.194872  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1342  precorrin-4 C11-methyltransferase  36.76 
 
 
254 aa  188  9e-47  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1376  precorrin-4 C11-methyltransferase  37.8 
 
 
252 aa  187  2e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3650  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.53 
 
 
252 aa  187  3e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.796321  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1968  precorrin-4 C11-methyltransferase  37.31 
 
 
261 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.264672  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0801  precorrin-4 C11-methyltransferase  40.82 
 
 
266 aa  179  2.9999999999999997e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0211  cobalamin biosynthesis protein CbiG/precorrin-4 C11-methyltransferase  39.92 
 
 
614 aa  179  4e-44  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2213  precorrin-3 methylase  42.35 
 
 
250 aa  177  2e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.578417  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1014  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.41 
 
 
626 aa  177  2e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0905  precorrin-4 C11-methyltransferase  36.58 
 
 
269 aa  175  9e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1521  precorrin-4 C11-methyltransferase  39.61 
 
 
261 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000101409 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2357  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.13 
 
 
259 aa  174  1.9999999999999998e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.342045  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1177  precorrin-4 C11-methyltransferase  40.27 
 
 
305 aa  172  5e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2635  precorrin-4 C11-methyltransferase  38.98 
 
 
263 aa  172  5.999999999999999e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.231618  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3139  precorrin-4 C11-methyltransferase  40.74 
 
 
243 aa  171  1e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.103399  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25920  precorrin-3 methylase  41.18 
 
 
250 aa  171  1e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0297541  normal  0.071417 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3152  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.5 
 
 
253 aa  171  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.422575  normal  0.404272 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0559  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.42 
 
 
262 aa  171  2e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.628877  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1980  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.41 
 
 
287 aa  170  2e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05231  putative precorrin-4 C11-methyltransferase  33.2 
 
 
251 aa  169  6e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0301  precorrin-4 C11-methyltransferase  39.61 
 
 
260 aa  169  7e-41  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0342995  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3154  precorrin-4 C11-methyltransferase  38.49 
 
 
249 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.134288  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1375  precorrin-4 C11-methyltransferase  40.32 
 
 
257 aa  167  2.9999999999999998e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0286247 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0459  precorrin-4 C11-methyltransferase  33.2 
 
 
251 aa  166  4e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.20999  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0050  precorrin-4 C11-methyltransferase  38.28 
 
 
255 aa  166  4e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1853  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.1 
 
 
247 aa  166  5.9999999999999996e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3103  precorrin-4 C11-methyltransferase  37.7 
 
 
248 aa  165  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1564  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.39 
 
 
242 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.253118  normal  0.214845 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2117  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.39 
 
 
241 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.105353  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1955  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.39 
 
 
241 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.132176  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1972  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.39 
 
 
241 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4162  precorrin-4 C11-methyltransferase  39.1 
 
 
958 aa  164  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.329616  normal  0.542159 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04601  precorrin-4 C11-methyltransferase  35.97 
 
 
250 aa  164  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.909229  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3184  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.25 
 
 
259 aa  163  3e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2523  precorrin-4 C11-methyltransferase  39.84 
 
 
298 aa  163  3e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0144072  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2446  precorrin-4 C11-methyltransferase  39.06 
 
 
261 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.130726  normal  0.124304 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2394  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.87 
 
 
241 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12107  precorrin-4 C11-methyltransferase cobM  40.08 
 
 
251 aa  162  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.182153  normal  0.885771 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1314  precorrin-4 C11-methyltransferase  36.72 
 
 
268 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0144548  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04841  putative precorrin-4 C11-methyltransferase  32.94 
 
 
251 aa  162  6e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1598  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.98 
 
 
241 aa  161  1e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00151458  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1157  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.98 
 
 
241 aa  161  1e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.917528  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2705  precorrin-4 C11-methyltransferase  39.44 
 
 
308 aa  161  1e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.309557  hitchhiker  0.000105231 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05151  putative precorrin-4 C11-methyltransferase  33.73 
 
 
251 aa  161  1e-38  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.190612  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0176  precorrin-4 C11-methyltransferase  36.76 
 
 
258 aa  161  1e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0121511  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0259  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.98 
 
 
241 aa  161  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>