More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1980 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_1980  precorrin-4 C11-methyltransferase  100 
 
 
287 aa  580  1e-164  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1177  precorrin-4 C11-methyltransferase  68.67 
 
 
305 aa  320  1.9999999999999998e-86  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0559  precorrin-4 C11-methyltransferase  65.06 
 
 
262 aa  299  4e-80  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.628877  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0801  precorrin-4 C11-methyltransferase  57.98 
 
 
266 aa  275  8e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1718  precorrin-4 C11-methyltransferase  54.8 
 
 
598 aa  268  5e-71  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.956767  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2129  precorrin-4 C11-methyltransferase  49.6 
 
 
259 aa  245  6.999999999999999e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000738255 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1013  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.06 
 
 
253 aa  219  3.9999999999999997e-56  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1298  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.51 
 
 
261 aa  218  8.999999999999998e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1092  precorrin-4 C11-methyltransferase  45.6 
 
 
254 aa  217  2e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1288  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.05 
 
 
626 aa  212  7e-54  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0571  precorrin-4 C11-methyltransferase  45.08 
 
 
272 aa  208  7e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.505536  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2711  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.35 
 
 
248 aa  206  3e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00379668  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0211  cobalamin biosynthesis protein CbiG/precorrin-4 C11-methyltransferase  40.89 
 
 
614 aa  205  6e-52  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4477  precorrin-4 C11-methyltransferase  38.4 
 
 
610 aa  204  1e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00717843  normal  0.120162 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0313  precorrin-4 C11-methyltransferase  38.87 
 
 
251 aa  204  1e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0483  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.25 
 
 
258 aa  204  2e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0614  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.82 
 
 
249 aa  203  3e-51  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00328163  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1272  precorrin-4 C11-methyltransferase  39.04 
 
 
251 aa  202  7e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1294  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.91 
 
 
248 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.04031 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2994  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.82 
 
 
264 aa  200  3e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1968  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.7 
 
 
261 aa  199  3e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.264672  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6035  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.31 
 
 
275 aa  200  3e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0039  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.73 
 
 
258 aa  198  7.999999999999999e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1229  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.68 
 
 
264 aa  197  1.0000000000000001e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0594011 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0640  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.4 
 
 
257 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.194872  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1014  precorrin-4 C11-methyltransferase  40 
 
 
626 aa  196  2.0000000000000003e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2151  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.03 
 
 
257 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0163963  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2205  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.03 
 
 
257 aa  196  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0620  precorrin-4 C11-methyltransferase protein  44.58 
 
 
271 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.263132  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2198  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.03 
 
 
257 aa  196  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.333099  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0059  precorrin-4 C11-methyltransferase  40.08 
 
 
256 aa  196  5.000000000000001e-49  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2364  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.63 
 
 
257 aa  194  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1265  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.02 
 
 
267 aa  193  3e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4162  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.07 
 
 
958 aa  193  3e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.329616  normal  0.542159 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3607  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.43 
 
 
261 aa  192  4e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21210  precorrin-4 C11-methyltransferase  40.24 
 
 
867 aa  192  4e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2251  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.63 
 
 
257 aa  192  7e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.476505  normal  0.353064 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3231  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.25 
 
 
258 aa  191  8e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00900029  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2523  precorrin-4 C11-methyltransferase  47.01 
 
 
298 aa  191  9e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0144072  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0638  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.69 
 
 
271 aa  191  9e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1887  precorrin-4 C11-methyltransferase  40.16 
 
 
262 aa  190  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0177135  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2705  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.77 
 
 
308 aa  190  2e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.309557  hitchhiker  0.000105231 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04841  putative precorrin-4 C11-methyltransferase  36.99 
 
 
251 aa  190  2.9999999999999997e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05151  putative precorrin-4 C11-methyltransferase  37.4 
 
 
251 aa  189  2.9999999999999997e-47  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.190612  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1314  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.62 
 
 
268 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0144548  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3541  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.52 
 
 
261 aa  188  9e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05231  putative precorrin-4 C11-methyltransferase  35.37 
 
 
251 aa  188  1e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3650  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.4 
 
 
252 aa  187  1e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.796321  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2357  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.48 
 
 
259 aa  188  1e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.342045  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1376  precorrin-4 C11-methyltransferase  39.29 
 
 
252 aa  188  1e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0905  precorrin-4 C11-methyltransferase  38.08 
 
 
269 aa  187  2e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0459  precorrin-4 C11-methyltransferase  36.84 
 
 
251 aa  187  2e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.20999  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0702  precorrin-4 C11-methyltransferase  35.86 
 
 
244 aa  187  2e-46  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0934  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.86 
 
 
250 aa  187  2e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1747  precorrin-4 C11-methyltransferase  40.16 
 
 
254 aa  186  3e-46  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.129763  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1716  precorrin-4 C11-methyltransferase  38.34 
 
 
253 aa  186  4e-46  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0934  precorrin-4 C11-methyltransferase  39.76 
 
 
254 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.23833  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0962  precorrin-4 C11-methyltransferase  38.55 
 
 
254 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.6045  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4243  precorrin-4 C11-methyltransferase  38.06 
 
 
257 aa  183  3e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4344  precorrin-4 C11-methyltransferase  38.46 
 
 
264 aa  183  3e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1853  precorrin-4 C11-methyltransferase  45.38 
 
 
247 aa  182  5.0000000000000004e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1236  precorrin-4 C11-methyltransferase  36.29 
 
 
251 aa  181  1e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2087  precorrin-3 methylase  38.65 
 
 
257 aa  181  1e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0050  precorrin-4 C11-methyltransferase  45.06 
 
 
255 aa  181  2e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1430  precorrin-4 C11-methyltransferase  36.29 
 
 
251 aa  181  2e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0323621  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1011  precorrin-4 C11-methyltransferase  39.11 
 
 
254 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.04114  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0933  precorrin-4 C11-methyltransferase  37.05 
 
 
260 aa  176  6e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00452437 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4305  precorrin-4 C11-methyltransferase  38.06 
 
 
257 aa  176  6e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.118024 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0176  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.31 
 
 
258 aa  175  8e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0121511  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3737  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.58 
 
 
275 aa  175  9e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1375  precorrin-4 C11-methyltransferase  39.68 
 
 
257 aa  175  9.999999999999999e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0286247 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1342  precorrin-4 C11-methyltransferase  36.25 
 
 
254 aa  174  9.999999999999999e-43  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1024  precorrin-4 C11-methyltransferase  40.89 
 
 
281 aa  174  9.999999999999999e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.249462  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04601  precorrin-4 C11-methyltransferase  37.1 
 
 
250 aa  172  5e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.909229  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05141  putative precorrin-4 C11-methyltransferase  36.55 
 
 
252 aa  172  5e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.614023  normal  0.388015 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3103  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.77 
 
 
248 aa  171  9e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1552  precorrin-4 C11-methyltransferase  38.04 
 
 
283 aa  171  1e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.886587 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2300  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.68 
 
 
273 aa  171  2e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.366203  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3020  precorrin-4 C11-methyltransferase  40.49 
 
 
249 aa  171  2e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.157987 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06621  putative precorrin-4 C11-methyltransferase  39.84 
 
 
251 aa  170  3e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1885  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.13 
 
 
261 aa  169  4e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.804703  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0114  precorrin-4 C11-methyltransferase  36.36 
 
 
262 aa  169  6e-41  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.177043  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2352  precorrin-4 C11-methyltransferase  40.73 
 
 
250 aa  169  6e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3410  precorrin-4 C11-methyltransferase  40.73 
 
 
250 aa  168  8e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.231837 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0473  precorrin-4 C11-methyltransferase  37.2 
 
 
252 aa  168  8e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2530  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.13 
 
 
250 aa  168  1e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00855327 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1791  precorrin-4 C11-methyltransferase  35.63 
 
 
250 aa  168  1e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3136  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.31 
 
 
272 aa  167  2e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.749873 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2635  precorrin-4 C11-methyltransferase  40.55 
 
 
263 aa  166  2.9999999999999998e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.231618  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2779  precorrin-4 C11-methyltransferase  40.62 
 
 
284 aa  166  5.9999999999999996e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.25946  normal  0.0736251 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25920  precorrin-3 methylase  41.13 
 
 
250 aa  165  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0297541  normal  0.071417 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1557  precorrin-4 C11-methyltransferase  36.4 
 
 
256 aa  165  6.9999999999999995e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2213  precorrin-3 methylase  40.32 
 
 
250 aa  165  9e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.578417  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1693  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.24 
 
 
269 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.301759 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1525  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.51 
 
 
260 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.466887 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1596  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.62 
 
 
242 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.727098  normal  0.416998 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2923  precorrin-4 C11-methyltransferase  39.27 
 
 
264 aa  164  2.0000000000000002e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.680231  normal  0.0185874 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2163  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.18 
 
 
274 aa  164  2.0000000000000002e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.233438 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2779  precorrin-4 C11-methyltransferase  40.73 
 
 
250 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.545494  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3384  precorrin-4 C11-methyltransferase  39.76 
 
 
253 aa  163  3e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.215023  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>