More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2523 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_2523  precorrin-4 C11-methyltransferase  100 
 
 
298 aa  583  1.0000000000000001e-165  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0144072  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2705  precorrin-4 C11-methyltransferase  87.66 
 
 
308 aa  459  9.999999999999999e-129  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.309557  hitchhiker  0.000105231 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1314  precorrin-4 C11-methyltransferase  76.63 
 
 
268 aa  403  1e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0144548  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4162  precorrin-4 C11-methyltransferase  73.08 
 
 
958 aa  364  1e-99  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.329616  normal  0.542159 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6035  precorrin-4 C11-methyltransferase  69.88 
 
 
275 aa  360  2e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0640  precorrin-4 C11-methyltransferase  63.1 
 
 
257 aa  287  2e-76  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.194872  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21210  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.59 
 
 
867 aa  221  8e-57  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5858  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  54.04 
 
 
377 aa  221  9.999999999999999e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.097759  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0313  precorrin-4 C11-methyltransferase  40 
 
 
251 aa  219  3e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0620  precorrin-4 C11-methyltransferase protein  48.79 
 
 
271 aa  218  1e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.263132  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1272  precorrin-4 C11-methyltransferase  40.96 
 
 
251 aa  217  2e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1092  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.59 
 
 
254 aa  216  2.9999999999999998e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1177  precorrin-4 C11-methyltransferase  48.8 
 
 
305 aa  216  2.9999999999999998e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1376  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.57 
 
 
252 aa  216  4e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0806  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  49.61 
 
 
273 aa  215  5.9999999999999996e-55  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1294  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.91 
 
 
248 aa  211  7.999999999999999e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.04031 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1716  precorrin-4 C11-methyltransferase  40.73 
 
 
253 aa  210  2e-53  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2609  precorrin-4 C11-methyltransferase  45.1 
 
 
257 aa  210  2e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1265  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.69 
 
 
267 aa  209  6e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1013  precorrin-4 C11-methyltransferase  39.11 
 
 
253 aa  207  1e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0702  precorrin-4 C11-methyltransferase  38.49 
 
 
244 aa  206  5e-52  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0571  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.36 
 
 
272 aa  205  6e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.505536  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0638  precorrin-4 C11-methyltransferase  48.5 
 
 
271 aa  203  2e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4477  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.3 
 
 
610 aa  201  9.999999999999999e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00717843  normal  0.120162 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0614  precorrin-4 C11-methyltransferase  40.8 
 
 
249 aa  200  1.9999999999999998e-50  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00328163  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0483  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.86 
 
 
258 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2357  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.12 
 
 
259 aa  200  1.9999999999999998e-50  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.342045  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0039  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.46 
 
 
258 aa  199  3.9999999999999996e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4344  precorrin-4 C11-methyltransferase  37.5 
 
 
264 aa  199  5e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2994  precorrin-4 C11-methyltransferase  45.42 
 
 
264 aa  199  7e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1557  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.9 
 
 
256 aa  198  9e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1980  precorrin-4 C11-methyltransferase  47.01 
 
 
287 aa  198  9e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1552  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.11 
 
 
283 aa  197  3e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.886587 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0801  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.64 
 
 
266 aa  196  5.000000000000001e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06621  putative precorrin-4 C11-methyltransferase  44.35 
 
 
251 aa  195  7e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3231  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.57 
 
 
258 aa  195  7e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00900029  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1342  precorrin-4 C11-methyltransferase  38.43 
 
 
254 aa  195  9e-49  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1298  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.4 
 
 
261 aa  195  9e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1968  precorrin-4 C11-methyltransferase  38.74 
 
 
261 aa  195  1e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.264672  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1229  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.15 
 
 
264 aa  195  1e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0594011 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2198  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.17 
 
 
257 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.333099  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0050  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.96 
 
 
255 aa  194  2e-48  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2205  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.17 
 
 
257 aa  193  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3541  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.73 
 
 
261 aa  194  2e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2151  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.77 
 
 
257 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0163963  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2251  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.17 
 
 
257 aa  193  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.476505  normal  0.353064 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2521  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.63 
 
 
250 aa  192  5e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.14903 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0962  precorrin-4 C11-methyltransferase  38.21 
 
 
254 aa  192  6e-48  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.6045  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2484  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.63 
 
 
250 aa  192  7e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2364  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.77 
 
 
257 aa  192  7e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2529  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.63 
 
 
250 aa  192  7e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.527305 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3607  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.34 
 
 
261 aa  191  1e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4243  precorrin-4 C11-methyltransferase  36.9 
 
 
257 aa  191  1e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0459  precorrin-4 C11-methyltransferase  35.57 
 
 
251 aa  191  2e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.20999  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1853  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.94 
 
 
247 aa  190  2e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2711  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.8 
 
 
248 aa  190  2.9999999999999997e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00379668  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1887  precorrin-4 C11-methyltransferase  40.71 
 
 
262 aa  189  4e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0177135  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1718  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.9 
 
 
598 aa  189  7e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.956767  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0934  precorrin-4 C11-methyltransferase  38.46 
 
 
254 aa  188  8e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.23833  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05151  putative precorrin-4 C11-methyltransferase  36.11 
 
 
251 aa  188  8e-47  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.190612  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0905  precorrin-4 C11-methyltransferase  37.85 
 
 
269 aa  188  9e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05231  putative precorrin-4 C11-methyltransferase  34.78 
 
 
251 aa  188  1e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1288  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.03 
 
 
626 aa  187  1e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1011  precorrin-4 C11-methyltransferase  38.46 
 
 
254 aa  187  2e-46  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.04114  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0933  precorrin-4 C11-methyltransferase  37.05 
 
 
260 aa  187  2e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00452437 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04601  precorrin-4 C11-methyltransferase  38.21 
 
 
250 aa  186  5e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.909229  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05141  putative precorrin-4 C11-methyltransferase  38.96 
 
 
252 aa  185  6e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.614023  normal  0.388015 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1747  precorrin-4 C11-methyltransferase  38.06 
 
 
254 aa  185  8e-46  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.129763  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04841  putative precorrin-4 C11-methyltransferase  35.32 
 
 
251 aa  184  1.0000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1351  precorrin-4 C11-methyltransferase  45.38 
 
 
259 aa  184  1.0000000000000001e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1791  precorrin-4 C11-methyltransferase  38.96 
 
 
250 aa  184  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0473  precorrin-4 C11-methyltransferase  38.8 
 
 
252 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0559  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.18 
 
 
262 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.628877  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2129  precorrin-4 C11-methyltransferase  40.54 
 
 
259 aa  183  3e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000738255 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3384  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.23 
 
 
253 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.215023  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0808  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.58 
 
 
254 aa  182  7e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1885  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.77 
 
 
261 aa  182  8.000000000000001e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.804703  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1014  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.37 
 
 
626 aa  182  8.000000000000001e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17680  precorrin-4 C11-methyltransferase  45.64 
 
 
262 aa  180  2e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00107277  normal  0.918127 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4305  precorrin-4 C11-methyltransferase  36.9 
 
 
257 aa  180  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.118024 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1236  precorrin-4 C11-methyltransferase  36.69 
 
 
251 aa  180  2.9999999999999997e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2821  precorrin-4 C11-methyltransferase  45.63 
 
 
260 aa  179  4e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1262  precorrin-4 C11-methyltransferase  40.56 
 
 
252 aa  179  4e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1475  precorrin-4 C11-methyltransferase  45.63 
 
 
260 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.429453  normal  0.609076 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1430  precorrin-4 C11-methyltransferase  36.69 
 
 
251 aa  179  4.999999999999999e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0323621  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7180  precorrin-4 C11-methyltransferase  40.08 
 
 
252 aa  178  8e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.987588  normal  0.0970048 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0114  precorrin-4 C11-methyltransferase  34.88 
 
 
262 aa  177  1e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.177043  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0934  precorrin-4 C11-methyltransferase  40.8 
 
 
250 aa  178  1e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0059  precorrin-4 C11-methyltransferase  34.92 
 
 
256 aa  177  2e-43  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1300  precorrin-4 C11-methyltransferase  40.16 
 
 
252 aa  176  3e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12107  precorrin-4 C11-methyltransferase cobM  44.17 
 
 
251 aa  176  3e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.182153  normal  0.885771 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0176  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.91 
 
 
258 aa  176  3e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0121511  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1525  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.84 
 
 
260 aa  176  5e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.466887 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2501  precorrin-4 C11-methyltransferase  45.49 
 
 
251 aa  175  7e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.218572 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1521  precorrin-4 C11-methyltransferase  38.98 
 
 
261 aa  175  9e-43  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000101409 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5844  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.97 
 
 
292 aa  174  1.9999999999999998e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.903403 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2446  precorrin-4 C11-methyltransferase  45 
 
 
261 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.130726  normal  0.124304 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1737  precorrin-4 C11-methyltransferase region  42.51 
 
 
251 aa  173  1.9999999999999998e-42  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.489626  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2540  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.36 
 
 
257 aa  174  1.9999999999999998e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.789222 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2530  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.17 
 
 
250 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00855327 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>