More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1430 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_1430  precorrin-4 C11-methyltransferase  100 
 
 		 251 aa  510  1e-143  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0323621  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1236  precorrin-4 C11-methyltransferase  99.2 
 
 		 251 aa  506  9.999999999999999e-143  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0614  precorrin-4 C11-methyltransferase  65.46 
 
 		 249 aa  324  7e-88  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00328163  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1013  precorrin-4 C11-methyltransferase  62.9 
 
 		 253 aa  313  1.9999999999999998e-84  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1272  precorrin-4 C11-methyltransferase  55.78 
 
 		 251 aa  285  5e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0313  precorrin-4 C11-methyltransferase  56.45 
 
 		 251 aa  278  5e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0039  precorrin-4 C11-methyltransferase  54.33 
 
 		 258 aa  276  2e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0483  precorrin-4 C11-methyltransferase  53.54 
 
 		 258 aa  275  4e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1298  precorrin-4 C11-methyltransferase  56.91 
 
 		 261 aa  272  4.0000000000000004e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3607  precorrin-4 C11-methyltransferase  53.36 
 
 		 261 aa  268  8e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2994  precorrin-4 C11-methyltransferase  51.18 
 
 		 264 aa  266  2e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3231  precorrin-4 C11-methyltransferase  53.63 
 
 		 258 aa  265  7e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00900029  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1342  precorrin-4 C11-methyltransferase  55.69 
 
 		 254 aa  264  8.999999999999999e-70  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2711  precorrin-4 C11-methyltransferase  49.19 
 
 		 248 aa  264  8.999999999999999e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00379668  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3541  precorrin-4 C11-methyltransferase  53.33 
 
 		 261 aa  264  1e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1376  precorrin-4 C11-methyltransferase  52.42 
 
 		 252 aa  262  4e-69  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1092  precorrin-4 C11-methyltransferase  53.25 
 
 		 254 aa  261  6.999999999999999e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1294  precorrin-4 C11-methyltransferase  51.42 
 
 		 248 aa  259  3e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.04031 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1716  precorrin-4 C11-methyltransferase  52.65 
 
 		 253 aa  259  4e-68  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1011  precorrin-4 C11-methyltransferase  52.02 
 
 		 254 aa  256  3e-67  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.04114  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0934  precorrin-4 C11-methyltransferase  52.02 
 
 		 254 aa  254  7e-67  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.23833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1747  precorrin-4 C11-methyltransferase  51.21 
 
 		 254 aa  252  3e-66  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.129763  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21210  precorrin-4 C11-methyltransferase  47.79 
 
 		 867 aa  244  9e-64  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0059  precorrin-4 C11-methyltransferase  47.39 
 
 		 256 aa  243  1.9999999999999999e-63  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0933  precorrin-4 C11-methyltransferase  47.01 
 
 		 260 aa  243  1.9999999999999999e-63  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00452437 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2205  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.77 
 
 		 257 aa  241  7e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2198  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.77 
 
 		 257 aa  241  7e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.333099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0962  precorrin-4 C11-methyltransferase  50.2 
 
 		 254 aa  241  7.999999999999999e-63  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.6045  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2364  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.77 
 
 		 257 aa  239  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2151  precorrin-4 C11-methyltransferase  45.97 
 
 		 257 aa  239  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0163963  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0934  precorrin-4 C11-methyltransferase  47.18 
 
 		 250 aa  238  6.999999999999999e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2251  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.37 
 
 		 257 aa  238  8e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.476505  normal  0.353064 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0571  precorrin-4 C11-methyltransferase  47.47 
 
 		 272 aa  235  6e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.505536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0702  precorrin-4 C11-methyltransferase  50 
 
 		 244 aa  235  6e-61  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0211  cobalamin biosynthesis protein CbiG/precorrin-4 C11-methyltransferase  46.91 
 
 		 614 aa  233  3e-60  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1288  precorrin-4 C11-methyltransferase  47.13 
 
 		 626 aa  230  1e-59  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0473  precorrin-4 C11-methyltransferase  45.56 
 
 		 252 aa  229  3e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2087  precorrin-3 methylase  47.79 
 
 		 257 aa  228  5e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0638  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.27 
 
 		 271 aa  226  2e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2129  precorrin-4 C11-methyltransferase  47.01 
 
 		 259 aa  223  2e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000738255 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3152  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.95 
 
 		 253 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.422575  normal  0.404272 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1014  precorrin-4 C11-methyltransferase  45.75 
 
 		 626 aa  219  3e-56  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4477  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.67 
 
 		 610 aa  218  8.999999999999998e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00717843  normal  0.120162 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3650  precorrin-4 C11-methyltransferase  45.42 
 
 		 252 aa  217  1e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.796321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1265  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.09 
 
 		 267 aa  216  2.9999999999999998e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1557  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.27 
 
 		 256 aa  216  2.9999999999999998e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0050  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.55 
 
 		 255 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1375  precorrin-4 C11-methyltransferase  45.78 
 
 		 257 aa  211  9e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286247 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2501  precorrin-4 C11-methyltransferase  45.64 
 
 		 251 aa  210  2e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.218572 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3184  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.7 
 
 		 259 aa  209  3e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2374  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.52 
 
 		 259 aa  207  9e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0114  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.37 
 
 		 262 aa  207  1e-52  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.177043  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7180  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.94 
 
 		 252 aa  207  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.987588  normal  0.0970048 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0969  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.57 
 
 		 262 aa  207  1e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3278  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.31 
 
 		 253 aa  207  2e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.696559  normal  0.9588 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12107  precorrin-4 C11-methyltransferase cobM  44.77 
 
 		 251 aa  207  2e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.182153  normal  0.885771 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3020  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.72 
 
 		 249 aa  207  2e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.157987 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1853  precorrin-4 C11-methyltransferase  48.95 
 
 		 247 aa  206  2e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3103  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.95 
 
 		 248 aa  206  3e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3154  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.72 
 
 		 249 aa  205  5e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.134288  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2609  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.27 
 
 		 257 aa  205  6e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2300  precorrin-4 C11-methyltransferase  45.24 
 
 		 273 aa  205  7e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.366203  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3136  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.75 
 
 		 272 aa  204  1e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.749873 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5685  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.97 
 
 		 260 aa  203  2e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0876668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1039  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.57 
 
 		 266 aa  203  2e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0255255 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2635  precorrin-4 C11-methyltransferase  45.16 
 
 		 263 aa  202  3e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.231618  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3384  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.18 
 
 		 253 aa  203  3e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.215023  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1166  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.17 
 
 		 266 aa  202  3e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.647626  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3515  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.34 
 
 		 257 aa  203  3e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.312418 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0620  precorrin-4 C11-methyltransferase protein  43.08 
 
 		 271 aa  202  6e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.263132  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0808  precorrin-4 C11-methyltransferase  39.52 
 
 		 254 aa  201  8e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0640  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.91 
 
 		 257 aa  201  9e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.194872  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2923  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.57 
 
 		 264 aa  200  9.999999999999999e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.680231  normal  0.0185874 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4589  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.17 
 
 		 251 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00000000120449  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2446  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.2 
 
 		 261 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.130726  normal  0.124304 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1968  precorrin-4 C11-methyltransferase  39.11 
 
 		 261 aa  199  3e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.264672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5598  Precorrin-4 C(11)-methyltransferase  44.73 
 
 		 247 aa  199  3e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.0099157  normal  0.596158 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2314  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.89 
 
 		 259 aa  199  3e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0491012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2213  precorrin-3 methylase  43.37 
 
 		 250 aa  199  3e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.578417  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1882  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.82 
 
 		 259 aa  199  5e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25920  precorrin-3 methylase  43.37 
 
 		 250 aa  199  5e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0297541  normal  0.071417 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2812  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.2 
 
 		 266 aa  198  7e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.55111 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0627  cobalt-factor II C20-methyltransferase / precorrin-4 C11-methyltransferase  44.96 
 
 		 242 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1351  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.67 
 
 		 259 aa  197  2.0000000000000003e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2779  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.87 
 
 		 284 aa  197  2.0000000000000003e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.25946  normal  0.0736251 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1885  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.78 
 
 		 261 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.804703  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3737  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.65 
 
 		 275 aa  196  2.0000000000000003e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1693  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.65 
 
 		 269 aa  196  3e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.301759 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3260  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.67 
 
 		 253 aa  196  3e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.280776 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04601  precorrin-4 C11-methyltransferase  37.1 
 
 		 250 aa  196  3e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.909229  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1779  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.93 
 
 		 250 aa  194  9e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.592244  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2821  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.77 
 
 		 260 aa  194  1e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1475  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.17 
 
 		 260 aa  194  1e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.429453  normal  0.609076 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1262  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.63 
 
 		 252 aa  194  1e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1525  precorrin-4 C11-methyltransferase  40.96 
 
 		 260 aa  193  2e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.466887 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6025  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.53 
 
 		 252 aa  194  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0102106  normal  0.375652 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2521  precorrin-4 C11-methyltransferase  40.42 
 
 		 250 aa  193  2e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.14903 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3139  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.98 
 
 		 243 aa  193  2e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.103399  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3123  precorrin-4 C11-methyltransferase  40.8 
 
 		 258 aa  193  2e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2218  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.37 
 
 		 264 aa  194  2e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.352147  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>