More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0806 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013124  Afer_0806  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  100 
 
 
273 aa  534  1e-151  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0640  precorrin-4 C11-methyltransferase  51.59 
 
 
257 aa  211  7e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.194872  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2994  precorrin-4 C11-methyltransferase  49.03 
 
 
264 aa  204  1e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21210  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.87 
 
 
867 aa  204  1e-51  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6035  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.48 
 
 
275 aa  202  5e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0039  precorrin-4 C11-methyltransferase  47.45 
 
 
258 aa  201  8e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1716  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.52 
 
 
253 aa  199  3e-50  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0483  precorrin-4 C11-methyltransferase  47.66 
 
 
258 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3231  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.51 
 
 
258 aa  195  5.000000000000001e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00900029  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2523  precorrin-4 C11-methyltransferase  49.61 
 
 
298 aa  195  6e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0144072  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0313  precorrin-4 C11-methyltransferase  38.58 
 
 
251 aa  195  7e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0614  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.37 
 
 
249 aa  194  1e-48  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00328163  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2705  precorrin-4 C11-methyltransferase  49.8 
 
 
308 aa  193  2e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.309557  hitchhiker  0.000105231 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1314  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.76 
 
 
268 aa  194  2e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0144548  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1236  precorrin-4 C11-methyltransferase  40.64 
 
 
251 aa  194  2e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1430  precorrin-4 C11-methyltransferase  40.64 
 
 
251 aa  193  3e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0323621  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0962  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.57 
 
 
254 aa  192  5e-48  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.6045  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1272  precorrin-4 C11-methyltransferase  40.32 
 
 
251 aa  191  9e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2711  precorrin-4 C11-methyltransferase  45.02 
 
 
248 aa  189  5.999999999999999e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00379668  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3607  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.27 
 
 
261 aa  188  7e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3541  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.67 
 
 
261 aa  188  1e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1011  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.19 
 
 
254 aa  186  4e-46  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.04114  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4162  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.43 
 
 
958 aa  186  5e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.329616  normal  0.542159 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0571  precorrin-4 C11-methyltransferase  45.28 
 
 
272 aa  186  5e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.505536  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1294  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.06 
 
 
248 aa  184  9e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.04031 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1747  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.02 
 
 
254 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.129763  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1376  precorrin-4 C11-methyltransferase  39.68 
 
 
252 aa  184  1.0000000000000001e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1013  precorrin-4 C11-methyltransferase  36.76 
 
 
253 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0702  precorrin-4 C11-methyltransferase  36.55 
 
 
244 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1288  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.67 
 
 
626 aa  183  3e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0934  precorrin-4 C11-methyltransferase  40.78 
 
 
254 aa  181  8.000000000000001e-45  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.23833  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1014  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.65 
 
 
626 aa  181  1e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1298  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.25 
 
 
261 aa  180  2e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1092  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.19 
 
 
254 aa  180  2e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2151  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.09 
 
 
257 aa  180  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0163963  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2198  precorrin-4 C11-methyltransferase  40.7 
 
 
257 aa  179  5.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.333099  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2205  precorrin-4 C11-methyltransferase  40.7 
 
 
257 aa  178  7e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1342  precorrin-4 C11-methyltransferase  39.45 
 
 
254 aa  178  7e-44  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2364  precorrin-4 C11-methyltransferase  40.31 
 
 
257 aa  177  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0808  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.46 
 
 
254 aa  176  3e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0934  precorrin-4 C11-methyltransferase  42 
 
 
250 aa  176  4e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2251  precorrin-4 C11-methyltransferase  40.31 
 
 
257 aa  175  7e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.476505  normal  0.353064 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2446  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.61 
 
 
261 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.130726  normal  0.124304 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0638  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.4 
 
 
271 aa  174  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4477  precorrin-4 C11-methyltransferase  37.25 
 
 
610 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00717843  normal  0.120162 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3123  precorrin-4 C11-methyltransferase  45.77 
 
 
258 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2484  precorrin-4 C11-methyltransferase  44 
 
 
250 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2529  precorrin-4 C11-methyltransferase  44 
 
 
250 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.527305 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0620  precorrin-4 C11-methyltransferase protein  41.83 
 
 
271 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.263132  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1265  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.3 
 
 
267 aa  173  2.9999999999999996e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1968  precorrin-4 C11-methyltransferase  38.37 
 
 
261 aa  173  2.9999999999999996e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.264672  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06621  putative precorrin-4 C11-methyltransferase  40.08 
 
 
251 aa  173  3.9999999999999995e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0059  precorrin-4 C11-methyltransferase  36.68 
 
 
256 aa  172  3.9999999999999995e-42  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2129  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.64 
 
 
259 aa  172  5.999999999999999e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000738255 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2521  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.6 
 
 
250 aa  171  1e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.14903 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05141  putative precorrin-4 C11-methyltransferase  39.22 
 
 
252 aa  169  4e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.614023  normal  0.388015 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2540  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.53 
 
 
257 aa  169  4e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.789222 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2374  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.02 
 
 
259 aa  169  6e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05231  putative precorrin-4 C11-methyltransferase  33.2 
 
 
251 aa  168  7e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0050  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.91 
 
 
255 aa  168  9e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2923  precorrin-4 C11-methyltransferase  40.94 
 
 
264 aa  167  1e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.680231  normal  0.0185874 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7180  precorrin-4 C11-methyltransferase  40.16 
 
 
252 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.987588  normal  0.0970048 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1791  precorrin-4 C11-methyltransferase  39.13 
 
 
250 aa  166  4e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3184  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.03 
 
 
259 aa  166  4e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0905  precorrin-4 C11-methyltransferase  36.65 
 
 
269 aa  166  4e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0459  precorrin-4 C11-methyltransferase  32.81 
 
 
251 aa  165  8e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.20999  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3152  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.29 
 
 
253 aa  165  8e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.422575  normal  0.404272 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2812  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.52 
 
 
266 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.55111 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1882  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.41 
 
 
259 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04841  putative precorrin-4 C11-methyltransferase  33.2 
 
 
251 aa  164  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04601  precorrin-4 C11-methyltransferase  35.71 
 
 
250 aa  164  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.909229  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5844  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.53 
 
 
292 aa  163  3e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.903403 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0933  precorrin-4 C11-methyltransferase  39.04 
 
 
260 aa  162  5.0000000000000005e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00452437 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0559  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.6 
 
 
262 aa  160  2e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.628877  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3260  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.82 
 
 
253 aa  160  2e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.280776 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1887  precorrin-4 C11-methyltransferase  37.25 
 
 
262 aa  160  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0177135  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0176  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.35 
 
 
258 aa  160  2e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0121511  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05151  putative precorrin-4 C11-methyltransferase  32.81 
 
 
251 aa  160  2e-38  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.190612  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5685  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.05 
 
 
260 aa  160  3e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0876668  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0473  precorrin-4 C11-methyltransferase  40.4 
 
 
252 aa  160  3e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1521  precorrin-4 C11-methyltransferase  37.93 
 
 
261 aa  160  3e-38  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000101409 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2821  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.71 
 
 
260 aa  159  4e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1525  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.36 
 
 
260 aa  159  4e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.466887 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2357  precorrin-4 C11-methyltransferase  39.77 
 
 
259 aa  159  6e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.342045  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1475  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.31 
 
 
260 aa  159  6e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.429453  normal  0.609076 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0969  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.46 
 
 
262 aa  158  7e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1351  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.21 
 
 
259 aa  159  7e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6025  precorrin-4 C11-methyltransferase  40.71 
 
 
252 aa  159  7e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0102106  normal  0.375652 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12107  precorrin-4 C11-methyltransferase cobM  43.6 
 
 
251 aa  158  9e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.182153  normal  0.885771 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1177  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.06 
 
 
305 aa  157  1e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3515  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.06 
 
 
257 aa  157  2e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.312418 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4344  precorrin-4 C11-methyltransferase  33.86 
 
 
264 aa  157  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1737  precorrin-4 C11-methyltransferase region  38.74 
 
 
251 aa  157  2e-37  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.489626  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1166  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.08 
 
 
266 aa  157  2e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.647626  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1039  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.75 
 
 
266 aa  156  3e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0255255 
 
 
-
 
NC_002950  PG0211  cobalamin biosynthesis protein CbiG/precorrin-4 C11-methyltransferase  35.57 
 
 
614 aa  156  4e-37  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1779  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.14 
 
 
250 aa  156  4e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.592244  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3384  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.73 
 
 
253 aa  155  9e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.215023  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5858  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  43.93 
 
 
377 aa  154  1e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.097759  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0157  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.25 
 
 
253 aa  154  1e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>