More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_6025 on replicon NC_011366
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011366  Rleg2_6025  precorrin-4 C11-methyltransferase  100 
 
 
252 aa  505  9.999999999999999e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0102106  normal  0.375652 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7180  precorrin-4 C11-methyltransferase  93.65 
 
 
252 aa  478  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.987588  normal  0.0970048 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2812  precorrin-4 C11-methyltransferase  90.08 
 
 
266 aa  448  1e-125  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.55111 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3278  precorrin-4 C11-methyltransferase  75.2 
 
 
253 aa  365  1e-100  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.696559  normal  0.9588 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2374  precorrin-4 C11-methyltransferase  71.49 
 
 
259 aa  363  1e-99  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3152  precorrin-4 C11-methyltransferase  68.13 
 
 
253 aa  355  5.999999999999999e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.422575  normal  0.404272 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3184  precorrin-4 C11-methyltransferase  67.87 
 
 
259 aa  341  5.999999999999999e-93  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5685  precorrin-4 C11-methyltransferase  69.88 
 
 
260 aa  340  9e-93  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0876668  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0969  precorrin-4 C11-methyltransferase  68.92 
 
 
262 aa  341  9e-93  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3260  precorrin-4 C11-methyltransferase  68.8 
 
 
253 aa  337  8e-92  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.280776 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2157  precorrin-4 C11-methyltransferase  70.68 
 
 
280 aa  336  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.107141  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1166  precorrin-4 C11-methyltransferase  68.53 
 
 
266 aa  335  2.9999999999999997e-91  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.647626  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1039  precorrin-4 C11-methyltransferase  67.73 
 
 
266 aa  333  2e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0255255 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3515  precorrin-4 C11-methyltransferase  66.8 
 
 
257 aa  332  2e-90  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.312418 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2446  precorrin-4 C11-methyltransferase  68.27 
 
 
261 aa  330  1e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.130726  normal  0.124304 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3123  precorrin-4 C11-methyltransferase  69.08 
 
 
258 aa  330  1e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0808  precorrin-4 C11-methyltransferase  64.29 
 
 
254 aa  328  6e-89  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2314  precorrin-4 C11-methyltransferase  69.87 
 
 
259 aa  326  3e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0491012  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2540  precorrin-4 C11-methyltransferase  67.07 
 
 
257 aa  319  3e-86  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.789222 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1882  precorrin-4 C11-methyltransferase  65.06 
 
 
259 aa  318  6e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5844  precorrin-4 C11-methyltransferase  66.67 
 
 
292 aa  317  7.999999999999999e-86  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.903403 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2821  precorrin-4 C11-methyltransferase  65.86 
 
 
260 aa  314  8e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1475  precorrin-4 C11-methyltransferase  65.06 
 
 
260 aa  312  2.9999999999999996e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.429453  normal  0.609076 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2218  precorrin-4 C11-methyltransferase  66.4 
 
 
264 aa  312  3.9999999999999997e-84  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.352147  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2923  precorrin-4 C11-methyltransferase  61.6 
 
 
264 aa  311  4.999999999999999e-84  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.680231  normal  0.0185874 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1525  precorrin-4 C11-methyltransferase  65.06 
 
 
260 aa  310  2e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.466887 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0334  precorrin-4 C11-methyltransferase  65.87 
 
 
261 aa  293  3e-78  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1523  precorrin-4 C11-methyltransferase  64.11 
 
 
280 aa  290  2e-77  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00837984  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1885  precorrin-4 C11-methyltransferase  57.77 
 
 
261 aa  279  3e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.804703  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1262  precorrin-4 C11-methyltransferase  56.18 
 
 
252 aa  277  1e-73  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2501  precorrin-4 C11-methyltransferase  60.98 
 
 
251 aa  276  2e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.218572 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0176  precorrin-4 C11-methyltransferase  56.35 
 
 
258 aa  275  5e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0121511  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1300  precorrin-4 C11-methyltransferase  55.78 
 
 
252 aa  274  8e-73  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3384  precorrin-4 C11-methyltransferase  57.03 
 
 
253 aa  271  1e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.215023  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0564  precorrin-4 C11-methyltransferase  59.35 
 
 
246 aa  269  2.9999999999999997e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.518716  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5598  Precorrin-4 C(11)-methyltransferase  58.94 
 
 
247 aa  268  8e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.0099157  normal  0.596158 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1779  precorrin-4 C11-methyltransferase  58.94 
 
 
250 aa  267  1e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.592244  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2635  precorrin-4 C11-methyltransferase  54.4 
 
 
263 aa  256  2e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.231618  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2484  precorrin-4 C11-methyltransferase  56 
 
 
250 aa  246  2e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2529  precorrin-4 C11-methyltransferase  56 
 
 
250 aa  246  2e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.527305 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2179  precorrin-4 C11-methyltransferase  53.66 
 
 
252 aa  245  4e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0645183  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2521  precorrin-4 C11-methyltransferase  55.95 
 
 
250 aa  245  6e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.14903 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0620  precorrin-4 C11-methyltransferase protein  53.01 
 
 
271 aa  244  8e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.263132  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3139  precorrin-4 C11-methyltransferase  54.17 
 
 
243 aa  241  1e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.103399  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12107  precorrin-4 C11-methyltransferase cobM  54.98 
 
 
251 aa  239  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.182153  normal  0.885771 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0157  precorrin-4 C11-methyltransferase  54.1 
 
 
253 aa  239  4e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2477  precorrin-4 C11-methyltransferase  53.17 
 
 
259 aa  238  9e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.143154  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0315  precorrin-4 C11-methyltransferase  50.4 
 
 
256 aa  238  9e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1578  precorrin-4 C11-methyltransferase  52.92 
 
 
242 aa  232  3e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00147705  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1596  precorrin-4 C11-methyltransferase  53.33 
 
 
242 aa  232  4.0000000000000004e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.727098  normal  0.416998 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2394  precorrin-4 C11-methyltransferase  53.33 
 
 
241 aa  232  5e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1623  precorrin-4 C11-methyltransferase  50.81 
 
 
249 aa  232  6e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.18665  normal  0.817267 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1564  precorrin-4 C11-methyltransferase  53.75 
 
 
242 aa  231  6e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.253118  normal  0.214845 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2213  precorrin-3 methylase  51.19 
 
 
250 aa  231  6e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.578417  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0473  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.18 
 
 
252 aa  231  9e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1651  precorrin-4 C11-methyltransferase  52.26 
 
 
242 aa  231  9e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1972  precorrin-4 C11-methyltransferase  52.67 
 
 
241 aa  231  1e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2117  precorrin-4 C11-methyltransferase  52.67 
 
 
241 aa  231  1e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.105353  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4829  precorrin-4 C11-methyltransferase  52.26 
 
 
242 aa  230  1e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0449828 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1955  precorrin-4 C11-methyltransferase  52.67 
 
 
241 aa  231  1e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.132176  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1198  precorrin-4 C11-methyltransferase  52.26 
 
 
242 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2087  precorrin-3 methylase  46.59 
 
 
257 aa  230  1e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25920  precorrin-3 methylase  52.21 
 
 
250 aa  230  1e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0297541  normal  0.071417 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1678  precorrin-4 C11-methyltransferase  52.26 
 
 
242 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0635313  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1249  precorrin-4 C11-methyltransferase / precorrin-2 C20-methyltransferase  52.5 
 
 
241 aa  228  1e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.230063  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1157  precorrin-4 C11-methyltransferase  51.85 
 
 
241 aa  226  2e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.917528  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0901  precorrin-4 C11-methyltransferase  51.85 
 
 
241 aa  226  2e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.324814  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0259  precorrin-4 C11-methyltransferase  51.85 
 
 
241 aa  226  2e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1598  precorrin-4 C11-methyltransferase  51.85 
 
 
241 aa  226  2e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00151458  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3154  precorrin-4 C11-methyltransferase  49.8 
 
 
249 aa  224  7e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.134288  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17680  precorrin-4 C11-methyltransferase  51 
 
 
262 aa  224  1e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00107277  normal  0.918127 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5365  precorrin-4 C11-methyltransferase  51.67 
 
 
241 aa  224  2e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.973627 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3408  precorrin-4 C11-methyltransferase  50.4 
 
 
257 aa  222  4e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2352  precorrin-4 C11-methyltransferase  49 
 
 
250 aa  221  7e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1092  precorrin-4 C11-methyltransferase  48 
 
 
254 aa  221  7e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3020  precorrin-4 C11-methyltransferase  49.4 
 
 
249 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.157987 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1716  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.2 
 
 
253 aa  220  1.9999999999999999e-56  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2779  precorrin-4 C11-methyltransferase  49.4 
 
 
250 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.545494  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2530  precorrin-4 C11-methyltransferase  49 
 
 
250 aa  219  3e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00855327 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3410  precorrin-4 C11-methyltransferase  48.59 
 
 
250 aa  218  1e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.231837 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4589  precorrin-4 C11-methyltransferase  49.4 
 
 
251 aa  217  1e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00000000120449  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0313  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.03 
 
 
251 aa  215  4e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1375  precorrin-4 C11-methyltransferase  47.2 
 
 
257 aa  214  1.9999999999999998e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0286247 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3103  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.99 
 
 
248 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2891  precorrin-4 C11-methyltransferase  50 
 
 
261 aa  212  3.9999999999999995e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0352  precorrin-4 C11-methyltransferase  48.41 
 
 
256 aa  212  4.9999999999999996e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.385908  normal  0.885711 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0382  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  48.4 
 
 
257 aa  211  9e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.42795  normal 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3650  precorrin-4 C11-methyltransferase  45.38 
 
 
252 aa  211  1e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.796321  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1236  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.53 
 
 
251 aa  208  6e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0039  precorrin-4 C11-methyltransferase  45.42 
 
 
258 aa  208  7e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0638  precorrin-4 C11-methyltransferase  49.41 
 
 
271 aa  208  8e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1430  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.53 
 
 
251 aa  207  1e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0323621  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1376  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.34 
 
 
252 aa  206  2e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1853  precorrin-4 C11-methyltransferase  48.8 
 
 
247 aa  206  2e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0933  precorrin-4 C11-methyltransferase  40.08 
 
 
260 aa  205  5e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00452437 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0483  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.61 
 
 
258 aa  204  9e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3607  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.75 
 
 
261 aa  202  3e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1013  precorrin-4 C11-methyltransferase  38.87 
 
 
253 aa  201  8e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0571  precorrin-4 C11-methyltransferase  48.06 
 
 
272 aa  200  1.9999999999999998e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.505536  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1342  precorrin-4 C11-methyltransferase  39.6 
 
 
254 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>