More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0157 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_0157  precorrin-4 C11-methyltransferase  100 
 
 		 253 aa  492  9.999999999999999e-139  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17680  precorrin-4 C11-methyltransferase  70.8 
 
 		 262 aa  311  5.999999999999999e-84  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00107277  normal  0.918127 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0315  precorrin-4 C11-methyltransferase  67.19 
 
 		 256 aa  300  1e-80  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1779  precorrin-4 C11-methyltransferase  66.4 
 
 		 250 aa  297  1e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.592244  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1623  precorrin-4 C11-methyltransferase  68.4 
 
 		 249 aa  296  3e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.18665  normal  0.817267 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0382  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  67.74 
 
 		 257 aa  288  5.0000000000000004e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.42795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0352  precorrin-4 C11-methyltransferase  67.6 
 
 		 256 aa  287  1e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.385908  normal  0.885711 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0564  precorrin-4 C11-methyltransferase  66 
 
 		 246 aa  284  8e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.518716  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3408  precorrin-4 C11-methyltransferase  66.93 
 
 		 257 aa  280  1e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5598  Precorrin-4 C(11)-methyltransferase  61.35 
 
 		 247 aa  279  3e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.0099157  normal  0.596158 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1523  precorrin-4 C11-methyltransferase  63.71 
 
 		 280 aa  276  3e-73  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00837984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2891  precorrin-4 C11-methyltransferase  65.34 
 
 		 261 aa  275  4e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2501  precorrin-4 C11-methyltransferase  61.6 
 
 		 251 aa  271  8.000000000000001e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.218572 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0969  precorrin-4 C11-methyltransferase  61.6 
 
 		 262 aa  259  2e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5685  precorrin-4 C11-methyltransferase  60.4 
 
 		 260 aa  259  3e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0876668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1166  precorrin-4 C11-methyltransferase  60.4 
 
 		 266 aa  258  6e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.647626  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1039  precorrin-4 C11-methyltransferase  62.88 
 
 		 266 aa  258  6e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0255255 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2923  precorrin-4 C11-methyltransferase  54.4 
 
 		 264 aa  256  2e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.680231  normal  0.0185874 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0808  precorrin-4 C11-methyltransferase  58.08 
 
 		 254 aa  251  8.000000000000001e-66  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3123  precorrin-4 C11-methyltransferase  58 
 
 		 258 aa  247  1e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3152  precorrin-4 C11-methyltransferase  54 
 
 		 253 aa  246  3e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.422575  normal  0.404272 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2157  precorrin-4 C11-methyltransferase  59.76 
 
 		 280 aa  245  4e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.107141  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1882  precorrin-4 C11-methyltransferase  57.2 
 
 		 259 aa  245  4e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7180  precorrin-4 C11-methyltransferase  52.87 
 
 		 252 aa  242  3.9999999999999997e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.987588  normal  0.0970048 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2218  precorrin-4 C11-methyltransferase  54 
 
 		 264 aa  242  5e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.352147  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2374  precorrin-4 C11-methyltransferase  53.49 
 
 		 259 aa  241  7e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2821  precorrin-4 C11-methyltransferase  55.2 
 
 		 260 aa  241  7.999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3515  precorrin-4 C11-methyltransferase  54.98 
 
 		 257 aa  241  9e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.312418 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2446  precorrin-4 C11-methyltransferase  57.6 
 
 		 261 aa  241  9e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.130726  normal  0.124304 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6025  precorrin-4 C11-methyltransferase  54.1 
 
 		 252 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0102106  normal  0.375652 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1475  precorrin-4 C11-methyltransferase  54.4 
 
 		 260 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.429453  normal  0.609076 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2540  precorrin-4 C11-methyltransferase  56 
 
 		 257 aa  239  2.9999999999999997e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.789222 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1525  precorrin-4 C11-methyltransferase  55.6 
 
 		 260 aa  239  4e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.466887 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5844  precorrin-4 C11-methyltransferase  53.6 
 
 		 292 aa  238  9e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.903403 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3184  precorrin-4 C11-methyltransferase  54 
 
 		 259 aa  237  1e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3260  precorrin-4 C11-methyltransferase  56.77 
 
 		 253 aa  237  1e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.280776 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1262  precorrin-4 C11-methyltransferase  54.15 
 
 		 252 aa  236  2e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2179  precorrin-4 C11-methyltransferase  54.4 
 
 		 252 aa  236  4e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0645183  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1885  precorrin-4 C11-methyltransferase  49.8 
 
 		 261 aa  235  6e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.804703  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2812  precorrin-4 C11-methyltransferase  54.92 
 
 		 266 aa  234  7e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.55111 
 
 
-
 
NC_004310  BR1300  precorrin-4 C11-methyltransferase  53.71 
 
 		 252 aa  233  2.0000000000000002e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2484  precorrin-4 C11-methyltransferase  55.38 
 
 		 250 aa  231  1e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2529  precorrin-4 C11-methyltransferase  55.38 
 
 		 250 aa  231  1e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.527305 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2314  precorrin-4 C11-methyltransferase  56.96 
 
 		 259 aa  229  5e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0491012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2521  precorrin-4 C11-methyltransferase  54.98 
 
 		 250 aa  228  7e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.14903 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0176  precorrin-4 C11-methyltransferase  53.91 
 
 		 258 aa  226  4e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0121511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3278  precorrin-4 C11-methyltransferase  54 
 
 		 253 aa  224  1e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.696559  normal  0.9588 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3384  precorrin-4 C11-methyltransferase  49.39 
 
 		 253 aa  222  4.9999999999999996e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.215023  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2635  precorrin-4 C11-methyltransferase  48.18 
 
 		 263 aa  215  5e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.231618  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2477  precorrin-4 C11-methyltransferase  51.21 
 
 		 259 aa  211  7e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.143154  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12107  precorrin-4 C11-methyltransferase cobM  52.61 
 
 		 251 aa  211  1e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.182153  normal  0.885771 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0334  precorrin-4 C11-methyltransferase  53.06 
 
 		 261 aa  198  9e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3103  precorrin-4 C11-methyltransferase  48.39 
 
 		 248 aa  194  2e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0473  precorrin-4 C11-methyltransferase  45.22 
 
 		 252 aa  193  2e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1236  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.78 
 
 		 251 aa  193  3e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3139  precorrin-4 C11-methyltransferase  48.7 
 
 		 243 aa  192  5e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.103399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1430  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.23 
 
 		 251 aa  192  5e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0323621  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2087  precorrin-3 methylase  42.21 
 
 		 257 aa  191  7e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1972  precorrin-4 C11-methyltransferase  49.6 
 
 		 241 aa  190  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3020  precorrin-4 C11-methyltransferase  47.15 
 
 		 249 aa  190  2e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.157987 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2117  precorrin-4 C11-methyltransferase  49.6 
 
 		 241 aa  190  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.105353  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3650  precorrin-4 C11-methyltransferase  47.56 
 
 		 252 aa  190  2e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.796321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1955  precorrin-4 C11-methyltransferase  49.6 
 
 		 241 aa  190  2e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.132176  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2213  precorrin-3 methylase  47.2 
 
 		 250 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.578417  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25920  precorrin-3 methylase  47.37 
 
 		 250 aa  189  4e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0297541  normal  0.071417 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0620  precorrin-4 C11-methyltransferase protein  44.31 
 
 		 271 aa  189  5e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.263132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4589  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.37 
 
 		 251 aa  188  5.999999999999999e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00000000120449  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2779  precorrin-4 C11-methyltransferase  48.8 
 
 		 250 aa  188  5.999999999999999e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.545494  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3154  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.75 
 
 		 249 aa  188  7e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.134288  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2198  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.68 
 
 		 257 aa  188  9e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.333099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2394  precorrin-4 C11-methyltransferase  49.19 
 
 		 241 aa  188  9e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2205  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.68 
 
 		 257 aa  187  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2352  precorrin-4 C11-methyltransferase  47.77 
 
 		 250 aa  186  2e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2530  precorrin-4 C11-methyltransferase  48.18 
 
 		 250 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00855327 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0259  precorrin-4 C11-methyltransferase  48.79 
 
 		 241 aa  186  3e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1157  precorrin-4 C11-methyltransferase  48.79 
 
 		 241 aa  186  3e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.917528  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1598  precorrin-4 C11-methyltransferase  48.79 
 
 		 241 aa  186  3e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00151458  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2364  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.28 
 
 		 257 aa  186  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0901  precorrin-4 C11-methyltransferase  48.79 
 
 		 241 aa  186  3e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.324814  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2151  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.87 
 
 		 257 aa  186  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0163963  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1198  precorrin-4 C11-methyltransferase  47.84 
 
 		 242 aa  185  6e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1678  precorrin-4 C11-methyltransferase  47.84 
 
 		 242 aa  185  6e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0635313  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1651  precorrin-4 C11-methyltransferase  47.84 
 
 		 242 aa  185  6e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4829  precorrin-4 C11-methyltransferase  47.41 
 
 		 242 aa  184  9e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0449828 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1716  precorrin-4 C11-methyltransferase  40.41 
 
 		 253 aa  183  2.0000000000000003e-45  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2251  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.28 
 
 		 257 aa  183  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.476505  normal  0.353064 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3410  precorrin-4 C11-methyltransferase  47.37 
 
 		 250 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.231837 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0313  precorrin-4 C11-methyltransferase  36.33 
 
 		 251 aa  182  5.0000000000000004e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1853  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.8 
 
 		 247 aa  181  7e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0039  precorrin-4 C11-methyltransferase  45.61 
 
 		 258 aa  181  8.000000000000001e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1013  precorrin-4 C11-methyltransferase  38.39 
 
 		 253 aa  181  8.000000000000001e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1564  precorrin-4 C11-methyltransferase  45.02 
 
 		 242 aa  180  2e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.253118  normal  0.214845 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0571  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.67 
 
 		 272 aa  180  2e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.505536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3231  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.54 
 
 		 258 aa  180  2e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00900029  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2711  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.73 
 
 		 248 aa  178  5.999999999999999e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00379668  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1578  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.12 
 
 		 242 aa  177  1e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00147705  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1596  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.55 
 
 		 242 aa  177  1e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.727098  normal  0.416998 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3541  precorrin-4 C11-methyltransferase  45.11 
 
 		 261 aa  176  3e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3607  precorrin-4 C11-methyltransferase  45.85 
 
 		 261 aa  176  3e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1249  precorrin-4 C11-methyltransferase / precorrin-2 C20-methyltransferase  45.89 
 
 		 241 aa  175  7e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.230063  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>