More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_3020 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007005  Psyr_3020  precorrin-4 C11-methyltransferase  100 
 
 
249 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.157987 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3154  precorrin-4 C11-methyltransferase  95.16 
 
 
249 aa  462  1e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.134288  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3103  precorrin-4 C11-methyltransferase  86.29 
 
 
248 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2779  precorrin-4 C11-methyltransferase  77.82 
 
 
250 aa  378  1e-104  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.545494  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3410  precorrin-4 C11-methyltransferase  76.61 
 
 
250 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.231837 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2213  precorrin-3 methylase  76.92 
 
 
250 aa  372  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.578417  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2530  precorrin-4 C11-methyltransferase  76.21 
 
 
250 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00855327 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2352  precorrin-4 C11-methyltransferase  76.52 
 
 
250 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25920  precorrin-3 methylase  76.21 
 
 
250 aa  370  1e-101  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0297541  normal  0.071417 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4589  precorrin-4 C11-methyltransferase  76.52 
 
 
251 aa  367  1e-100  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00000000120449  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3139  precorrin-4 C11-methyltransferase  72.69 
 
 
243 aa  355  3.9999999999999996e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.103399  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1249  precorrin-4 C11-methyltransferase / precorrin-2 C20-methyltransferase  75.21 
 
 
241 aa  351  5e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.230063  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2117  precorrin-4 C11-methyltransferase  73.11 
 
 
241 aa  347  1e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.105353  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1972  precorrin-4 C11-methyltransferase  73.11 
 
 
241 aa  347  1e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1955  precorrin-4 C11-methyltransferase  73.11 
 
 
241 aa  347  1e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.132176  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5365  precorrin-4 C11-methyltransferase  74.37 
 
 
241 aa  346  2e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.973627 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1651  precorrin-4 C11-methyltransferase  72.27 
 
 
242 aa  345  5e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4829  precorrin-4 C11-methyltransferase  72.69 
 
 
242 aa  344  7e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0449828 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1198  precorrin-4 C11-methyltransferase  72.27 
 
 
242 aa  344  7e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1678  precorrin-4 C11-methyltransferase  72.27 
 
 
242 aa  344  7e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0635313  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1578  precorrin-4 C11-methyltransferase  71.37 
 
 
242 aa  342  2e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00147705  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2394  precorrin-4 C11-methyltransferase  72.61 
 
 
241 aa  342  2.9999999999999997e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1596  precorrin-4 C11-methyltransferase  71.78 
 
 
242 aa  342  2.9999999999999997e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.727098  normal  0.416998 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1157  precorrin-4 C11-methyltransferase  72.27 
 
 
241 aa  341  5.999999999999999e-93  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.917528  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0259  precorrin-4 C11-methyltransferase  72.27 
 
 
241 aa  341  5.999999999999999e-93  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0901  precorrin-4 C11-methyltransferase  72.27 
 
 
241 aa  341  5.999999999999999e-93  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.324814  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1598  precorrin-4 C11-methyltransferase  72.27 
 
 
241 aa  341  5.999999999999999e-93  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00151458  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1564  precorrin-4 C11-methyltransferase  71.43 
 
 
242 aa  339  2e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.253118  normal  0.214845 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1375  precorrin-4 C11-methyltransferase  56.18 
 
 
257 aa  278  5e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0286247 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3384  precorrin-4 C11-methyltransferase  57.03 
 
 
253 aa  269  2.9999999999999997e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.215023  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0176  precorrin-4 C11-methyltransferase  59.36 
 
 
258 aa  268  5.9999999999999995e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0121511  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2635  precorrin-4 C11-methyltransferase  53.39 
 
 
263 aa  262  3e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.231618  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1885  precorrin-4 C11-methyltransferase  53.41 
 
 
261 aa  256  2e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.804703  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0808  precorrin-4 C11-methyltransferase  52.61 
 
 
254 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1262  precorrin-4 C11-methyltransferase  53.01 
 
 
252 aa  254  1.0000000000000001e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2540  precorrin-4 C11-methyltransferase  55.56 
 
 
257 aa  252  5.000000000000001e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.789222 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0313  precorrin-4 C11-methyltransferase  49.19 
 
 
251 aa  251  8.000000000000001e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1300  precorrin-4 C11-methyltransferase  52.61 
 
 
252 aa  251  1e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2821  precorrin-4 C11-methyltransferase  53.78 
 
 
260 aa  249  3e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1475  precorrin-4 C11-methyltransferase  53.39 
 
 
260 aa  248  5e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.429453  normal  0.609076 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2501  precorrin-4 C11-methyltransferase  55.83 
 
 
251 aa  247  2e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.218572 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2157  precorrin-4 C11-methyltransferase  52.8 
 
 
280 aa  246  2e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.107141  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2923  precorrin-4 C11-methyltransferase  51.2 
 
 
264 aa  246  2e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.680231  normal  0.0185874 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3152  precorrin-4 C11-methyltransferase  51.41 
 
 
253 aa  244  6e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.422575  normal  0.404272 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1525  precorrin-4 C11-methyltransferase  53.39 
 
 
260 aa  244  6.999999999999999e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.466887 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2218  precorrin-4 C11-methyltransferase  53.39 
 
 
264 aa  243  3e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.352147  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0702  precorrin-4 C11-methyltransferase  49.4 
 
 
244 aa  241  6e-63  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3260  precorrin-4 C11-methyltransferase  51.41 
 
 
253 aa  239  4e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.280776 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2087  precorrin-3 methylase  47.18 
 
 
257 aa  239  4e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2446  precorrin-4 C11-methyltransferase  52 
 
 
261 aa  238  5e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.130726  normal  0.124304 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5844  precorrin-4 C11-methyltransferase  49.8 
 
 
292 aa  232  3e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.903403 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3515  precorrin-4 C11-methyltransferase  51.81 
 
 
257 aa  230  2e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.312418 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1882  precorrin-4 C11-methyltransferase  52 
 
 
259 aa  230  2e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1013  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.34 
 
 
253 aa  230  2e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0473  precorrin-4 C11-methyltransferase  49.19 
 
 
252 aa  229  3e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1779  precorrin-4 C11-methyltransferase  51.24 
 
 
250 aa  229  4e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.592244  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0334  precorrin-4 C11-methyltransferase  56 
 
 
261 aa  229  4e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5598  Precorrin-4 C(11)-methyltransferase  50.81 
 
 
247 aa  228  6e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.0099157  normal  0.596158 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5685  precorrin-4 C11-methyltransferase  51 
 
 
260 aa  228  7e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0876668  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0039  precorrin-4 C11-methyltransferase  50 
 
 
258 aa  228  9e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7180  precorrin-4 C11-methyltransferase  48.59 
 
 
252 aa  228  1e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.987588  normal  0.0970048 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1011  precorrin-4 C11-methyltransferase  48.16 
 
 
254 aa  226  2e-58  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.04114  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1747  precorrin-4 C11-methyltransferase  47.35 
 
 
254 aa  225  4e-58  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.129763  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0620  precorrin-4 C11-methyltransferase protein  47.79 
 
 
271 aa  224  1e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.263132  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0934  precorrin-4 C11-methyltransferase  48.16 
 
 
254 aa  223  2e-57  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.23833  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3278  precorrin-4 C11-methyltransferase  49.4 
 
 
253 aa  223  2e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.696559  normal  0.9588 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1092  precorrin-4 C11-methyltransferase  50 
 
 
254 aa  223  2e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2374  precorrin-4 C11-methyltransferase  49.8 
 
 
259 aa  223  2e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1853  precorrin-4 C11-methyltransferase  53.25 
 
 
247 aa  223  3e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6025  precorrin-4 C11-methyltransferase  49.4 
 
 
252 aa  221  6e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0102106  normal  0.375652 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0638  precorrin-4 C11-methyltransferase  49.21 
 
 
271 aa  221  9.999999999999999e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2711  precorrin-4 C11-methyltransferase  45.93 
 
 
248 aa  220  9.999999999999999e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00379668  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0962  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.15 
 
 
254 aa  221  9.999999999999999e-57  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.6045  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1265  precorrin-4 C11-methyltransferase  47.24 
 
 
267 aa  220  1.9999999999999999e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3123  precorrin-4 C11-methyltransferase  50 
 
 
258 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2357  precorrin-4 C11-methyltransferase  49.61 
 
 
259 aa  220  1.9999999999999999e-56  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.342045  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1166  precorrin-4 C11-methyltransferase  49.2 
 
 
266 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.647626  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0969  precorrin-4 C11-methyltransferase  48.8 
 
 
262 aa  219  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0571  precorrin-4 C11-methyltransferase  49.41 
 
 
272 aa  219  3e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.505536  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2129  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.99 
 
 
259 aa  219  3e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000738255 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1039  precorrin-4 C11-methyltransferase  48.8 
 
 
266 aa  218  5e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0255255 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1523  precorrin-4 C11-methyltransferase  51.25 
 
 
280 aa  216  2e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00837984  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2994  precorrin-4 C11-methyltransferase  48.4 
 
 
264 aa  216  2.9999999999999998e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2198  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.56 
 
 
257 aa  216  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.333099  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2812  precorrin-4 C11-methyltransferase  48.59 
 
 
266 aa  216  4e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.55111 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2205  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.56 
 
 
257 aa  215  4e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2151  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.15 
 
 
257 aa  215  5e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0163963  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4243  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.18 
 
 
257 aa  215  5.9999999999999996e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3184  precorrin-4 C11-methyltransferase  48.59 
 
 
259 aa  215  5.9999999999999996e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1430  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.72 
 
 
251 aa  214  9.999999999999999e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0323621  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1236  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.72 
 
 
251 aa  214  9.999999999999999e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2364  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.15 
 
 
257 aa  213  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1342  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.5 
 
 
254 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0564  precorrin-4 C11-methyltransferase  49.19 
 
 
246 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.518716  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2251  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.15 
 
 
257 aa  212  3.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.476505  normal  0.353064 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1294  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.94 
 
 
248 aa  211  5.999999999999999e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.04031 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2314  precorrin-4 C11-methyltransferase  51.05 
 
 
259 aa  211  7.999999999999999e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0491012  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0933  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.13 
 
 
260 aa  209  2e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00452437 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1716  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.51 
 
 
253 aa  210  2e-53  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0614  precorrin-4 C11-methyltransferase  45.97 
 
 
249 aa  209  3e-53  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00328163  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>