More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_2635 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_2635  precorrin-4 C11-methyltransferase  100 
 
 		 263 aa  538  9.999999999999999e-153  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.231618  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1885  precorrin-4 C11-methyltransferase  66 
 
 		 261 aa  329  2e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.804703  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1262  precorrin-4 C11-methyltransferase  64.8 
 
 		 252 aa  321  8e-87  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0176  precorrin-4 C11-methyltransferase  62.75 
 
 		 258 aa  320  9.999999999999999e-87  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0121511  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1300  precorrin-4 C11-methyltransferase  64.4 
 
 		 252 aa  318  3.9999999999999996e-86  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3384  precorrin-4 C11-methyltransferase  59.6 
 
 		 253 aa  302  3.0000000000000004e-81  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.215023  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3152  precorrin-4 C11-methyltransferase  57.31 
 
 		 253 aa  300  1e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.422575  normal  0.404272 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2923  precorrin-4 C11-methyltransferase  57.83 
 
 		 264 aa  288  7e-77  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.680231  normal  0.0185874 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2446  precorrin-4 C11-methyltransferase  57.14 
 
 		 261 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.130726  normal  0.124304 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3260  precorrin-4 C11-methyltransferase  57.2 
 
 		 253 aa  281  8.000000000000001e-75  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.280776 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0808  precorrin-4 C11-methyltransferase  56.08 
 
 		 254 aa  281  1e-74  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2157  precorrin-4 C11-methyltransferase  56.35 
 
 		 280 aa  279  3e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.107141  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2501  precorrin-4 C11-methyltransferase  59.75 
 
 		 251 aa  278  9e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.218572 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3184  precorrin-4 C11-methyltransferase  57.43 
 
 		 259 aa  275  4e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2374  precorrin-4 C11-methyltransferase  55.69 
 
 		 259 aa  275  5e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5685  precorrin-4 C11-methyltransferase  56.75 
 
 		 260 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0876668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3139  precorrin-4 C11-methyltransferase  57.61 
 
 		 243 aa  272  3e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.103399  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1882  precorrin-4 C11-methyltransferase  55.6 
 
 		 259 aa  271  7e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2218  precorrin-4 C11-methyltransferase  55.42 
 
 		 264 aa  271  8.000000000000001e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.352147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2540  precorrin-4 C11-methyltransferase  54.37 
 
 		 257 aa  269  4e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.789222 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2821  precorrin-4 C11-methyltransferase  54.76 
 
 		 260 aa  268  5e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1475  precorrin-4 C11-methyltransferase  54.76 
 
 		 260 aa  268  5.9999999999999995e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.429453  normal  0.609076 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0969  precorrin-4 C11-methyltransferase  55.29 
 
 		 262 aa  268  7e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1525  precorrin-4 C11-methyltransferase  55.16 
 
 		 260 aa  267  1e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.466887 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5598  Precorrin-4 C(11)-methyltransferase  55.37 
 
 		 247 aa  267  1e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.0099157  normal  0.596158 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4589  precorrin-4 C11-methyltransferase  55.82 
 
 		 251 aa  266  2e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00000000120449  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3123  precorrin-4 C11-methyltransferase  56.47 
 
 		 258 aa  265  5.999999999999999e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1564  precorrin-4 C11-methyltransferase  58.02 
 
 		 242 aa  264  1e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.253118  normal  0.214845 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1198  precorrin-4 C11-methyltransferase  57.44 
 
 		 242 aa  264  1e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1039  precorrin-4 C11-methyltransferase  54.47 
 
 		 266 aa  264  1e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0255255 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1678  precorrin-4 C11-methyltransferase  57.44 
 
 		 242 aa  264  1e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0635313  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4829  precorrin-4 C11-methyltransferase  57.02 
 
 		 242 aa  263  2e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0449828 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1166  precorrin-4 C11-methyltransferase  54.9 
 
 		 266 aa  263  2e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.647626  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1651  precorrin-4 C11-methyltransferase  57.44 
 
 		 242 aa  263  2e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7180  precorrin-4 C11-methyltransferase  53.6 
 
 		 252 aa  261  6.999999999999999e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.987588  normal  0.0970048 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3154  precorrin-4 C11-methyltransferase  53.41 
 
 		 249 aa  261  8e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.134288  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3020  precorrin-4 C11-methyltransferase  53.39 
 
 		 249 aa  261  1e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.157987 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3103  precorrin-4 C11-methyltransferase  53.41 
 
 		 248 aa  261  1e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2314  precorrin-4 C11-methyltransferase  58.58 
 
 		 259 aa  260  2e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0491012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2530  precorrin-4 C11-methyltransferase  53.41 
 
 		 250 aa  259  3e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00855327 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3515  precorrin-4 C11-methyltransferase  54.37 
 
 		 257 aa  259  3e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.312418 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2394  precorrin-4 C11-methyltransferase  56.67 
 
 		 241 aa  259  4e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1972  precorrin-4 C11-methyltransferase  56.67 
 
 		 241 aa  258  5.0000000000000005e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2117  precorrin-4 C11-methyltransferase  56.67 
 
 		 241 aa  258  5.0000000000000005e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.105353  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1596  precorrin-4 C11-methyltransferase  57.02 
 
 		 242 aa  258  5.0000000000000005e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.727098  normal  0.416998 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1955  precorrin-4 C11-methyltransferase  56.67 
 
 		 241 aa  258  5.0000000000000005e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.132176  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1578  precorrin-4 C11-methyltransferase  56.61 
 
 		 242 aa  258  6e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00147705  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5844  precorrin-4 C11-methyltransferase  52.36 
 
 		 292 aa  258  8e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.903403 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1779  precorrin-4 C11-methyltransferase  54.96 
 
 		 250 aa  258  9e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.592244  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1523  precorrin-4 C11-methyltransferase  56.38 
 
 		 280 aa  257  1e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00837984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1249  precorrin-4 C11-methyltransferase / precorrin-2 C20-methyltransferase  55.14 
 
 		 241 aa  257  1e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.230063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1375  precorrin-4 C11-methyltransferase  53.26 
 
 		 257 aa  256  3e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286247 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3278  precorrin-4 C11-methyltransferase  54.15 
 
 		 253 aa  256  3e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.696559  normal  0.9588 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2352  precorrin-4 C11-methyltransferase  52.21 
 
 		 250 aa  256  3e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1598  precorrin-4 C11-methyltransferase  56.25 
 
 		 241 aa  255  5e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00151458  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1157  precorrin-4 C11-methyltransferase  56.25 
 
 		 241 aa  255  5e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.917528  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0259  precorrin-4 C11-methyltransferase  56.25 
 
 		 241 aa  255  5e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0901  precorrin-4 C11-methyltransferase  56.25 
 
 		 241 aa  255  5e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.324814  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6025  precorrin-4 C11-methyltransferase  54.4 
 
 		 252 aa  255  6e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0102106  normal  0.375652 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25920  precorrin-3 methylase  54.22 
 
 		 250 aa  255  7e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0297541  normal  0.071417 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2213  precorrin-3 methylase  53.41 
 
 		 250 aa  254  9e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.578417  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5365  precorrin-4 C11-methyltransferase  55.14 
 
 		 241 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.973627 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3410  precorrin-4 C11-methyltransferase  51.81 
 
 		 250 aa  252  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.231837 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2812  precorrin-4 C11-methyltransferase  54.4 
 
 		 266 aa  252  4.0000000000000004e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.55111 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2779  precorrin-4 C11-methyltransferase  53.01 
 
 		 250 aa  252  5.000000000000001e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.545494  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0564  precorrin-4 C11-methyltransferase  53.72 
 
 		 246 aa  248  8e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.518716  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2087  precorrin-3 methylase  50.6 
 
 		 257 aa  244  6.999999999999999e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2484  precorrin-4 C11-methyltransferase  52.67 
 
 		 250 aa  242  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2529  precorrin-4 C11-methyltransferase  52.67 
 
 		 250 aa  242  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.527305 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0313  precorrin-4 C11-methyltransferase  48.39 
 
 		 251 aa  240  1e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0473  precorrin-4 C11-methyltransferase  49.01 
 
 		 252 aa  239  4e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2521  precorrin-4 C11-methyltransferase  52.26 
 
 		 250 aa  238  5e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.14903 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12107  precorrin-4 C11-methyltransferase cobM  52.89 
 
 		 251 aa  235  6e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.182153  normal  0.885771 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0620  precorrin-4 C11-methyltransferase protein  47.6 
 
 		 271 aa  230  2e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.263132  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0334  precorrin-4 C11-methyltransferase  53.41 
 
 		 261 aa  229  4e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1013  precorrin-4 C11-methyltransferase  45.97 
 
 		 253 aa  228  9e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2179  precorrin-4 C11-methyltransferase  48.76 
 
 		 252 aa  228  9e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0645183  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3650  precorrin-4 C11-methyltransferase  50 
 
 		 252 aa  227  1e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.796321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0315  precorrin-4 C11-methyltransferase  48.58 
 
 		 256 aa  224  8e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2711  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.76 
 
 		 248 aa  218  7.999999999999999e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00379668  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0702  precorrin-4 C11-methyltransferase  45.02 
 
 		 244 aa  217  1e-55  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1853  precorrin-4 C11-methyltransferase  51.97 
 
 		 247 aa  215  8e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1236  precorrin-4 C11-methyltransferase  45.16 
 
 		 251 aa  214  9.999999999999999e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0157  precorrin-4 C11-methyltransferase  48.18 
 
 		 253 aa  214  9.999999999999999e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1430  precorrin-4 C11-methyltransferase  45.16 
 
 		 251 aa  213  1.9999999999999998e-54  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0323621  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1342  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.22 
 
 		 254 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2477  precorrin-4 C11-methyltransferase  50.22 
 
 		 259 aa  212  5.999999999999999e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.143154  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1092  precorrin-4 C11-methyltransferase  47.01 
 
 		 254 aa  212  5.999999999999999e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17680  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.72 
 
 		 262 aa  209  5e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00107277  normal  0.918127 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0614  precorrin-4 C11-methyltransferase  45.06 
 
 		 249 aa  206  3e-52  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00328163  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1716  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.86 
 
 		 253 aa  206  4e-52  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1265  precorrin-4 C11-methyltransferase  47.66 
 
 		 267 aa  206  4e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2129  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.22 
 
 		 259 aa  206  4e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000738255 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0039  precorrin-4 C11-methyltransferase  48.03 
 
 		 258 aa  205  8e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4477  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.51 
 
 		 610 aa  204  2e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00717843  normal  0.120162 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1623  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.28 
 
 		 249 aa  203  3e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.18665  normal  0.817267 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0638  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.56 
 
 		 271 aa  202  3e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2357  precorrin-4 C11-methyltransferase  45.91 
 
 		 259 aa  202  4e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.342045  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0211  cobalamin biosynthesis protein CbiG/precorrin-4 C11-methyltransferase  41.94 
 
 		 614 aa  200  1.9999999999999998e-50  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1747  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.72 
 
 		 254 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.129763  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>