More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_2530 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_2530  precorrin-4 C11-methyltransferase  100 
 
 		 250 aa  501  1e-141  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00855327 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3410  precorrin-4 C11-methyltransferase  96 
 
 		 250 aa  464  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.231837 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2352  precorrin-4 C11-methyltransferase  96 
 
 		 250 aa  463  1e-129  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2779  precorrin-4 C11-methyltransferase  89.96 
 
 		 250 aa  433  1e-120  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.545494  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3103  precorrin-4 C11-methyltransferase  77.42 
 
 		 248 aa  376  1e-103  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3020  precorrin-4 C11-methyltransferase  76.21 
 
 		 249 aa  370  1e-102  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.157987 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25920  precorrin-3 methylase  76 
 
 		 250 aa  373  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0297541  normal  0.071417 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2213  precorrin-3 methylase  74.8 
 
 		 250 aa  369  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.578417  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3154  precorrin-4 C11-methyltransferase  74.6 
 
 		 249 aa  362  4e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.134288  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4589  precorrin-4 C11-methyltransferase  74.8 
 
 		 251 aa  358  5e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00000000120449  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5365  precorrin-4 C11-methyltransferase  70.17 
 
 		 241 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.973627 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1249  precorrin-4 C11-methyltransferase / precorrin-2 C20-methyltransferase  69.75 
 
 		 241 aa  331  9e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.230063  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3139  precorrin-4 C11-methyltransferase  68.07 
 
 		 243 aa  329  2e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.103399  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1651  precorrin-4 C11-methyltransferase  71.01 
 
 		 242 aa  328  6e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1198  precorrin-4 C11-methyltransferase  71.01 
 
 		 242 aa  327  8e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1678  precorrin-4 C11-methyltransferase  71.01 
 
 		 242 aa  327  8e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0635313  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4829  precorrin-4 C11-methyltransferase  71.01 
 
 		 242 aa  326  2.0000000000000001e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0449828 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1955  precorrin-4 C11-methyltransferase  69.75 
 
 		 241 aa  325  5e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.132176  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2117  precorrin-4 C11-methyltransferase  69.75 
 
 		 241 aa  325  5e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.105353  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1972  precorrin-4 C11-methyltransferase  69.75 
 
 		 241 aa  325  5e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2394  precorrin-4 C11-methyltransferase  69.71 
 
 		 241 aa  323  1e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1596  precorrin-4 C11-methyltransferase  69.71 
 
 		 242 aa  322  3e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.727098  normal  0.416998 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1578  precorrin-4 C11-methyltransferase  69.29 
 
 		 242 aa  322  3e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00147705  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1564  precorrin-4 C11-methyltransferase  69.33 
 
 		 242 aa  322  4e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.253118  normal  0.214845 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1157  precorrin-4 C11-methyltransferase  68.91 
 
 		 241 aa  319  3e-86  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.917528  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0259  precorrin-4 C11-methyltransferase  68.91 
 
 		 241 aa  319  3e-86  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0901  precorrin-4 C11-methyltransferase  68.91 
 
 		 241 aa  319  3e-86  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.324814  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1598  precorrin-4 C11-methyltransferase  68.91 
 
 		 241 aa  319  3e-86  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00151458  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1375  precorrin-4 C11-methyltransferase  56.63 
 
 		 257 aa  277  1e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286247 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3384  precorrin-4 C11-methyltransferase  59.44 
 
 		 253 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.215023  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1885  precorrin-4 C11-methyltransferase  55.02 
 
 		 261 aa  262  4.999999999999999e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.804703  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2635  precorrin-4 C11-methyltransferase  53.41 
 
 		 263 aa  261  8e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.231618  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0176  precorrin-4 C11-methyltransferase  58.96 
 
 		 258 aa  259  2e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0121511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1262  precorrin-4 C11-methyltransferase  54.62 
 
 		 252 aa  257  1e-67  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2446  precorrin-4 C11-methyltransferase  55.38 
 
 		 261 aa  256  2e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.130726  normal  0.124304 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2923  precorrin-4 C11-methyltransferase  54.15 
 
 		 264 aa  255  6e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.680231  normal  0.0185874 
 
 
-
 
NC_004310  BR1300  precorrin-4 C11-methyltransferase  54.22 
 
 		 252 aa  254  7e-67  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0313  precorrin-4 C11-methyltransferase  49.8 
 
 		 251 aa  253  3e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0808  precorrin-4 C11-methyltransferase  53.36 
 
 		 254 aa  251  8.000000000000001e-66  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2157  precorrin-4 C11-methyltransferase  52.59 
 
 		 280 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.107141  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2821  precorrin-4 C11-methyltransferase  55.78 
 
 		 260 aa  241  7e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1475  precorrin-4 C11-methyltransferase  55.38 
 
 		 260 aa  241  7e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.429453  normal  0.609076 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1882  precorrin-4 C11-methyltransferase  54.98 
 
 		 259 aa  241  9e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2218  precorrin-4 C11-methyltransferase  54.98 
 
 		 264 aa  239  2.9999999999999997e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.352147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2087  precorrin-3 methylase  45.97 
 
 		 257 aa  239  4e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2374  precorrin-4 C11-methyltransferase  53.01 
 
 		 259 aa  239  4e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3152  precorrin-4 C11-methyltransferase  51.41 
 
 		 253 aa  238  9e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.422575  normal  0.404272 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0473  precorrin-4 C11-methyltransferase  49.8 
 
 		 252 aa  236  4e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3260  precorrin-4 C11-methyltransferase  51.39 
 
 		 253 aa  234  9e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.280776 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1525  precorrin-4 C11-methyltransferase  54.58 
 
 		 260 aa  234  9e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.466887 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2501  precorrin-4 C11-methyltransferase  53.75 
 
 		 251 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.218572 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2540  precorrin-4 C11-methyltransferase  53.78 
 
 		 257 aa  234  1.0000000000000001e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.789222 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0702  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.75 
 
 		 244 aa  231  1e-59  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5844  precorrin-4 C11-methyltransferase  51.2 
 
 		 292 aa  230  2e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.903403 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0039  precorrin-4 C11-methyltransferase  48.81 
 
 		 258 aa  229  4e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7180  precorrin-4 C11-methyltransferase  48.59 
 
 		 252 aa  229  4e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.987588  normal  0.0970048 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3184  precorrin-4 C11-methyltransferase  52.21 
 
 		 259 aa  229  5e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1013  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.37 
 
 		 253 aa  228  9e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0638  precorrin-4 C11-methyltransferase  51.16 
 
 		 271 aa  228  9e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3650  precorrin-4 C11-methyltransferase  52.21 
 
 		 252 aa  226  3e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.796321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0571  precorrin-4 C11-methyltransferase  51.72 
 
 		 272 aa  226  4e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.505536  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3515  precorrin-4 C11-methyltransferase  52.21 
 
 		 257 aa  224  1e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.312418 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1853  precorrin-4 C11-methyltransferase  53.51 
 
 		 247 aa  223  2e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0564  precorrin-4 C11-methyltransferase  50 
 
 		 246 aa  221  6e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.518716  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2314  precorrin-4 C11-methyltransferase  53.97 
 
 		 259 aa  221  7e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0491012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2812  precorrin-4 C11-methyltransferase  50.4 
 
 		 266 aa  221  8e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.55111 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0334  precorrin-4 C11-methyltransferase  53.97 
 
 		 261 aa  221  9e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6025  precorrin-4 C11-methyltransferase  49 
 
 		 252 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0102106  normal  0.375652 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0620  precorrin-4 C11-methyltransferase protein  47.01 
 
 		 271 aa  221  9.999999999999999e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.263132  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5598  Precorrin-4 C(11)-methyltransferase  49.59 
 
 		 247 aa  221  9.999999999999999e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.0099157  normal  0.596158 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2198  precorrin-4 C11-methyltransferase  47.77 
 
 		 257 aa  219  3.9999999999999997e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.333099  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2205  precorrin-4 C11-methyltransferase  47.77 
 
 		 257 aa  219  5e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2151  precorrin-4 C11-methyltransferase  47.37 
 
 		 257 aa  219  5e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0163963  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0933  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.98 
 
 		 260 aa  218  6e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00452437 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3123  precorrin-4 C11-methyltransferase  50.6 
 
 		 258 aa  218  7.999999999999999e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5685  precorrin-4 C11-methyltransferase  50.2 
 
 		 260 aa  218  8.999999999999998e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0876668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2364  precorrin-4 C11-methyltransferase  47.37 
 
 		 257 aa  217  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1092  precorrin-4 C11-methyltransferase  49.4 
 
 		 254 aa  217  1e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0934  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.94 
 
 		 254 aa  217  1e-55  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.23833  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0969  precorrin-4 C11-methyltransferase  50 
 
 		 262 aa  217  2e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1523  precorrin-4 C11-methyltransferase  51.67 
 
 		 280 aa  216  2e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00837984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2711  precorrin-4 C11-methyltransferase  47.56 
 
 		 248 aa  216  2e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00379668  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2251  precorrin-4 C11-methyltransferase  47.37 
 
 		 257 aa  216  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.476505  normal  0.353064 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1342  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.78 
 
 		 254 aa  215  5e-55  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2994  precorrin-4 C11-methyltransferase  47.62 
 
 		 264 aa  215  5.9999999999999996e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12107  precorrin-4 C11-methyltransferase cobM  51.87 
 
 		 251 aa  215  7e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.182153  normal  0.885771 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0483  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.83 
 
 		 258 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1265  precorrin-4 C11-methyltransferase  47.24 
 
 		 267 aa  213  1.9999999999999998e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2129  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.18 
 
 		 259 aa  213  1.9999999999999998e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000738255 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1747  precorrin-4 C11-methyltransferase  45.71 
 
 		 254 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.129763  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2179  precorrin-4 C11-methyltransferase  49 
 
 		 252 aa  212  3.9999999999999995e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0645183  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2529  precorrin-4 C11-methyltransferase  49.6 
 
 		 250 aa  212  4.9999999999999996e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.527305 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2484  precorrin-4 C11-methyltransferase  49.6 
 
 		 250 aa  212  4.9999999999999996e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3278  precorrin-4 C11-methyltransferase  49 
 
 		 253 aa  211  1e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.696559  normal  0.9588 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1011  precorrin-4 C11-methyltransferase  45.78 
 
 		 254 aa  210  1e-53  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.04114  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0059  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.87 
 
 		 256 aa  211  1e-53  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0962  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.49 
 
 		 254 aa  210  2e-53  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.6045  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1779  precorrin-4 C11-methyltransferase  48.77 
 
 		 250 aa  209  4e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.592244  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3607  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.03 
 
 		 261 aa  207  2e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3541  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.03 
 
 		 261 aa  206  2e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>