More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_2529 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008705  Mkms_2529  precorrin-4 C11-methyltransferase  100 
 
 
250 aa  493  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.527305 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2484  precorrin-4 C11-methyltransferase  100 
 
 
250 aa  493  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2521  precorrin-4 C11-methyltransferase  99.2 
 
 
250 aa  488  1e-137  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.14903 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12107  precorrin-4 C11-methyltransferase cobM  79.68 
 
 
251 aa  368  1e-101  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.182153  normal  0.885771 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2501  precorrin-4 C11-methyltransferase  70.45 
 
 
251 aa  309  2.9999999999999997e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.218572 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1523  precorrin-4 C11-methyltransferase  65.71 
 
 
280 aa  283  1.0000000000000001e-75  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00837984  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1779  precorrin-4 C11-methyltransferase  63.56 
 
 
250 aa  274  9e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.592244  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0564  precorrin-4 C11-methyltransferase  63.56 
 
 
246 aa  271  8.000000000000001e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.518716  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5598  Precorrin-4 C(11)-methyltransferase  60.73 
 
 
247 aa  269  2.9999999999999997e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.0099157  normal  0.596158 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3152  precorrin-4 C11-methyltransferase  56.4 
 
 
253 aa  264  1e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.422575  normal  0.404272 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2157  precorrin-4 C11-methyltransferase  58.8 
 
 
280 aa  259  4e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.107141  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3184  precorrin-4 C11-methyltransferase  57.37 
 
 
259 aa  258  7e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7180  precorrin-4 C11-methyltransferase  54.8 
 
 
252 aa  258  8e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.987588  normal  0.0970048 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1882  precorrin-4 C11-methyltransferase  57.2 
 
 
259 aa  257  1e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2179  precorrin-4 C11-methyltransferase  57.89 
 
 
252 aa  257  1e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0645183  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2374  precorrin-4 C11-methyltransferase  55.38 
 
 
259 aa  256  2e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2477  precorrin-4 C11-methyltransferase  58.1 
 
 
259 aa  252  3e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.143154  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0808  precorrin-4 C11-methyltransferase  52.8 
 
 
254 aa  249  3e-65  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3278  precorrin-4 C11-methyltransferase  57.2 
 
 
253 aa  248  5e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.696559  normal  0.9588 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2314  precorrin-4 C11-methyltransferase  57.76 
 
 
259 aa  248  9e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0491012  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2446  precorrin-4 C11-methyltransferase  56.4 
 
 
261 aa  247  1e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.130726  normal  0.124304 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1262  precorrin-4 C11-methyltransferase  56.39 
 
 
252 aa  246  2e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6025  precorrin-4 C11-methyltransferase  56 
 
 
252 aa  246  3e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0102106  normal  0.375652 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2812  precorrin-4 C11-methyltransferase  55.6 
 
 
266 aa  246  3e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.55111 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17680  precorrin-4 C11-methyltransferase  56.57 
 
 
262 aa  246  3e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00107277  normal  0.918127 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1885  precorrin-4 C11-methyltransferase  55.95 
 
 
261 aa  245  4e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.804703  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5685  precorrin-4 C11-methyltransferase  56.8 
 
 
260 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0876668  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2923  precorrin-4 C11-methyltransferase  50.4 
 
 
264 aa  244  9.999999999999999e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.680231  normal  0.0185874 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2540  precorrin-4 C11-methyltransferase  54.8 
 
 
257 aa  244  9.999999999999999e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.789222 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2635  precorrin-4 C11-methyltransferase  52.67 
 
 
263 aa  243  1.9999999999999999e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.231618  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1300  precorrin-4 C11-methyltransferase  55.95 
 
 
252 aa  243  1.9999999999999999e-63  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1525  precorrin-4 C11-methyltransferase  54.4 
 
 
260 aa  242  5e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.466887 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1039  precorrin-4 C11-methyltransferase  54.8 
 
 
266 aa  241  7e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0255255 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2821  precorrin-4 C11-methyltransferase  54 
 
 
260 aa  241  1e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1475  precorrin-4 C11-methyltransferase  53.6 
 
 
260 aa  240  2e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.429453  normal  0.609076 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1166  precorrin-4 C11-methyltransferase  54.4 
 
 
266 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.647626  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0969  precorrin-4 C11-methyltransferase  54.8 
 
 
262 aa  238  1e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3123  precorrin-4 C11-methyltransferase  56 
 
 
258 aa  236  2e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2218  precorrin-4 C11-methyltransferase  52 
 
 
264 aa  235  5.0000000000000005e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.352147  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3384  precorrin-4 C11-methyltransferase  52.28 
 
 
253 aa  232  4.0000000000000004e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.215023  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5844  precorrin-4 C11-methyltransferase  52.78 
 
 
292 aa  231  1e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.903403 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0157  precorrin-4 C11-methyltransferase  55.38 
 
 
253 aa  230  2e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3260  precorrin-4 C11-methyltransferase  53.2 
 
 
253 aa  229  4e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.280776 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3139  precorrin-4 C11-methyltransferase  54.73 
 
 
243 aa  227  1e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.103399  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1564  precorrin-4 C11-methyltransferase  55.51 
 
 
242 aa  226  2e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.253118  normal  0.214845 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2213  precorrin-3 methylase  55.74 
 
 
250 aa  226  3e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.578417  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1596  precorrin-4 C11-methyltransferase  55.33 
 
 
242 aa  225  4e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.727098  normal  0.416998 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1578  precorrin-4 C11-methyltransferase  54.92 
 
 
242 aa  225  5.0000000000000005e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00147705  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0176  precorrin-4 C11-methyltransferase  51.74 
 
 
258 aa  225  6e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0121511  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1972  precorrin-4 C11-methyltransferase  55.56 
 
 
241 aa  224  7e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2117  precorrin-4 C11-methyltransferase  55.56 
 
 
241 aa  224  7e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.105353  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1955  precorrin-4 C11-methyltransferase  55.56 
 
 
241 aa  224  7e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.132176  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3515  precorrin-4 C11-methyltransferase  52.4 
 
 
257 aa  224  9e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.312418 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0315  precorrin-4 C11-methyltransferase  53.17 
 
 
256 aa  224  1e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4829  precorrin-4 C11-methyltransferase  55.56 
 
 
242 aa  224  1e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0449828 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0483  precorrin-4 C11-methyltransferase  49.39 
 
 
258 aa  224  1e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1198  precorrin-4 C11-methyltransferase  55.56 
 
 
242 aa  223  2e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1651  precorrin-4 C11-methyltransferase  55.56 
 
 
242 aa  223  2e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1678  precorrin-4 C11-methyltransferase  55.56 
 
 
242 aa  223  2e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0635313  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0039  precorrin-4 C11-methyltransferase  48.62 
 
 
258 aa  223  3e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0313  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.08 
 
 
251 aa  223  3e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3541  precorrin-4 C11-methyltransferase  49.8 
 
 
261 aa  222  4e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3607  precorrin-4 C11-methyltransferase  48.98 
 
 
261 aa  222  6e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2394  precorrin-4 C11-methyltransferase  55.33 
 
 
241 aa  221  6e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25920  precorrin-3 methylase  54.73 
 
 
250 aa  221  9e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0297541  normal  0.071417 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1157  precorrin-4 C11-methyltransferase  54.73 
 
 
241 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.917528  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1598  precorrin-4 C11-methyltransferase  54.73 
 
 
241 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00151458  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0901  precorrin-4 C11-methyltransferase  54.73 
 
 
241 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.324814  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0259  precorrin-4 C11-methyltransferase  54.73 
 
 
241 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0620  precorrin-4 C11-methyltransferase protein  48.36 
 
 
271 aa  219  3.9999999999999997e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.263132  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0352  precorrin-4 C11-methyltransferase  52.19 
 
 
256 aa  217  1e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.385908  normal  0.885711 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2994  precorrin-4 C11-methyltransferase  47.76 
 
 
264 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1249  precorrin-4 C11-methyltransferase / precorrin-2 C20-methyltransferase  51.85 
 
 
241 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.230063  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1716  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.7 
 
 
253 aa  213  2.9999999999999995e-54  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0473  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.8 
 
 
252 aa  212  3.9999999999999995e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2087  precorrin-3 methylase  46.46 
 
 
257 aa  212  4.9999999999999996e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1623  precorrin-4 C11-methyltransferase  51.42 
 
 
249 aa  211  5.999999999999999e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.18665  normal  0.817267 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5365  precorrin-4 C11-methyltransferase  51.85 
 
 
241 aa  211  7.999999999999999e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.973627 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0382  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  51 
 
 
257 aa  211  7.999999999999999e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.42795  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3103  precorrin-4 C11-methyltransferase  49.4 
 
 
248 aa  211  9e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2530  precorrin-4 C11-methyltransferase  50.2 
 
 
250 aa  211  1e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00855327 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2711  precorrin-4 C11-methyltransferase  45.23 
 
 
248 aa  209  2e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00379668  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2352  precorrin-4 C11-methyltransferase  49.39 
 
 
250 aa  209  3e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1092  precorrin-4 C11-methyltransferase  49.58 
 
 
254 aa  207  1e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3020  precorrin-4 C11-methyltransferase  48.4 
 
 
249 aa  206  2e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.157987 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2779  precorrin-4 C11-methyltransferase  50.81 
 
 
250 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.545494  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3154  precorrin-4 C11-methyltransferase  49.18 
 
 
249 aa  206  4e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.134288  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3410  precorrin-4 C11-methyltransferase  48 
 
 
250 aa  205  6e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.231837 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1236  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.49 
 
 
251 aa  205  7e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1853  precorrin-4 C11-methyltransferase  50 
 
 
247 aa  204  1e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1430  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.49 
 
 
251 aa  204  1e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0323621  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4589  precorrin-4 C11-methyltransferase  50.21 
 
 
251 aa  204  1e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00000000120449  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3231  precorrin-4 C11-methyltransferase  47.76 
 
 
258 aa  204  1e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00900029  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0059  precorrin-4 C11-methyltransferase  40.73 
 
 
256 aa  202  3e-51  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2891  precorrin-4 C11-methyltransferase  52.05 
 
 
261 aa  201  9.999999999999999e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2129  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.28 
 
 
259 aa  201  9.999999999999999e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000738255 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1314  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.32 
 
 
268 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0144548  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0334  precorrin-4 C11-methyltransferase  52.4 
 
 
261 aa  199  3.9999999999999996e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1013  precorrin-4 C11-methyltransferase  39.68 
 
 
253 aa  197  1.0000000000000001e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3408  precorrin-4 C11-methyltransferase  48.79 
 
 
257 aa  195  5.000000000000001e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>