More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0559 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_0559  precorrin-4 C11-methyltransferase  100 
 
 		 262 aa  523  1e-147  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.628877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1177  precorrin-4 C11-methyltransferase  74.09 
 
 		 305 aa  339  2.9999999999999998e-92  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0801  precorrin-4 C11-methyltransferase  62.02 
 
 		 266 aa  302  4.0000000000000003e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1980  precorrin-4 C11-methyltransferase  65.06 
 
 		 287 aa  299  3e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1718  precorrin-4 C11-methyltransferase  56.92 
 
 		 598 aa  280  1e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.956767  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2129  precorrin-4 C11-methyltransferase  51.78 
 
 		 259 aa  246  2e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000738255 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1013  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.34 
 
 		 253 aa  219  3e-56  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0571  precorrin-4 C11-methyltransferase  49.22 
 
 		 272 aa  217  1e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.505536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0483  precorrin-4 C11-methyltransferase  48.21 
 
 		 258 aa  216  4e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0211  cobalamin biosynthesis protein CbiG/precorrin-4 C11-methyltransferase  43.97 
 
 		 614 aa  213  1.9999999999999998e-54  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1298  precorrin-4 C11-methyltransferase  45.6 
 
 		 261 aa  213  1.9999999999999998e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0039  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.64 
 
 		 258 aa  212  5.999999999999999e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1747  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.67 
 
 		 254 aa  211  9e-54  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.129763  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2994  precorrin-4 C11-methyltransferase  47.64 
 
 		 264 aa  210  2e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0934  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.67 
 
 		 254 aa  210  2e-53  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.23833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21210  precorrin-4 C11-methyltransferase  45.38 
 
 		 867 aa  206  2e-52  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0962  precorrin-4 C11-methyltransferase  40.56 
 
 		 254 aa  206  4e-52  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.6045  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1011  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.27 
 
 		 254 aa  206  4e-52  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.04114  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2711  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.8 
 
 		 248 aa  205  7e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00379668  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0638  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.88 
 
 		 271 aa  205  7e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1294  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.09 
 
 		 248 aa  204  9e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.04031 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2151  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.98 
 
 		 257 aa  204  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0163963  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1092  precorrin-4 C11-methyltransferase  45.31 
 
 		 254 aa  202  3e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2205  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.58 
 
 		 257 aa  202  6e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2198  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.58 
 
 		 257 aa  202  6e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.333099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0313  precorrin-4 C11-methyltransferase  39.27 
 
 		 251 aa  201  9e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1272  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.53 
 
 		 251 aa  201  9.999999999999999e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2364  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.18 
 
 		 257 aa  200  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3607  precorrin-4 C11-methyltransferase  45.7 
 
 		 261 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1288  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.62 
 
 		 626 aa  200  1.9999999999999998e-50  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2251  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.18 
 
 		 257 aa  199  5e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.476505  normal  0.353064 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0059  precorrin-4 C11-methyltransferase  39.44 
 
 		 256 aa  198  9e-50  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1351  precorrin-4 C11-methyltransferase  48.61 
 
 		 259 aa  196  2.0000000000000003e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1265  precorrin-4 C11-methyltransferase  45.06 
 
 		 267 aa  196  3e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1014  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.59 
 
 		 626 aa  196  4.0000000000000005e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0050  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.35 
 
 		 255 aa  195  6e-49  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0640  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.37 
 
 		 257 aa  194  8.000000000000001e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.194872  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1887  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.94 
 
 		 262 aa  194  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0177135  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3541  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.96 
 
 		 261 aa  194  2e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3231  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.87 
 
 		 258 aa  194  2e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00900029  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1968  precorrin-4 C11-methyltransferase  40.32 
 
 		 261 aa  193  3e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.264672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05151  putative precorrin-4 C11-methyltransferase  37.9 
 
 		 251 aa  192  4e-48  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.190612  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04841  putative precorrin-4 C11-methyltransferase  36.95 
 
 		 251 aa  192  6e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4477  precorrin-4 C11-methyltransferase  39.36 
 
 		 610 aa  192  7e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00717843  normal  0.120162 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1376  precorrin-4 C11-methyltransferase  39.44 
 
 		 252 aa  191  8e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0614  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.34 
 
 		 249 aa  190  2e-47  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00328163  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2300  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.88 
 
 		 273 aa  189  4e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.366203  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0459  precorrin-4 C11-methyltransferase  36.14 
 
 		 251 aa  187  2e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.20999  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2163  precorrin-4 C11-methyltransferase  45.7 
 
 		 274 aa  187  2e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.233438 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05231  putative precorrin-4 C11-methyltransferase  35.74 
 
 		 251 aa  187  2e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1229  precorrin-4 C11-methyltransferase  40.49 
 
 		 264 aa  186  3e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0594011 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3650  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.22 
 
 		 252 aa  185  7e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.796321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1716  precorrin-4 C11-methyltransferase  37.25 
 
 		 253 aa  184  9e-46  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0702  precorrin-4 C11-methyltransferase  36.65 
 
 		 244 aa  184  9e-46  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1557  precorrin-4 C11-methyltransferase  38.58 
 
 		 256 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1236  precorrin-4 C11-methyltransferase  37.25 
 
 		 251 aa  184  1.0000000000000001e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0473  precorrin-4 C11-methyltransferase  38.65 
 
 		 252 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0933  precorrin-4 C11-methyltransferase  36.76 
 
 		 260 aa  184  2.0000000000000003e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00452437 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1430  precorrin-4 C11-methyltransferase  37.25 
 
 		 251 aa  183  2.0000000000000003e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0323621  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1024  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.53 
 
 		 281 aa  183  3e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.249462  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2779  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.09 
 
 		 284 aa  183  3e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.25946  normal  0.0736251 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4243  precorrin-4 C11-methyltransferase  38.25 
 
 		 257 aa  183  3e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0905  precorrin-4 C11-methyltransferase  38.62 
 
 		 269 aa  183  3e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1342  precorrin-4 C11-methyltransferase  37.7 
 
 		 254 aa  181  9.000000000000001e-45  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1552  precorrin-4 C11-methyltransferase  39.76 
 
 		 283 aa  181  1e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.886587 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2609  precorrin-4 C11-methyltransferase  40.55 
 
 		 257 aa  179  4.999999999999999e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6035  precorrin-4 C11-methyltransferase  40.96 
 
 		 275 aa  178  5.999999999999999e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1314  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.2 
 
 		 268 aa  177  1e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0144548  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0934  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.06 
 
 		 250 aa  177  1e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4344  precorrin-4 C11-methyltransferase  36.69 
 
 		 264 aa  176  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3136  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.58 
 
 		 272 aa  177  2e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.749873 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0176  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.98 
 
 		 258 aa  176  5e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0121511  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4305  precorrin-4 C11-methyltransferase  38.25 
 
 		 257 aa  175  7e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.118024 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4162  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.63 
 
 		 958 aa  174  9.999999999999999e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.329616  normal  0.542159 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2357  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.13 
 
 		 259 aa  174  1.9999999999999998e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.342045  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1853  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.19 
 
 		 247 aa  171  1e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2530  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.15 
 
 		 250 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00855327 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1375  precorrin-4 C11-methyltransferase  40.16 
 
 		 257 aa  171  2e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286247 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3211  precorrin-4 C11-methyltransferase  40.18 
 
 		 238 aa  169  4e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2523  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.18 
 
 		 298 aa  169  6e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0144072  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1596  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.84 
 
 		 242 aa  168  7e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.727098  normal  0.416998 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1578  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.39 
 
 		 242 aa  168  8e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00147705  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3737  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.5 
 
 		 275 aa  168  1e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1693  precorrin-4 C11-methyltransferase  38.58 
 
 		 269 aa  167  1e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.301759 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1564  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.95 
 
 		 242 aa  167  1e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.253118  normal  0.214845 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2705  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.49 
 
 		 308 aa  166  4e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.309557  hitchhiker  0.000105231 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3410  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.53 
 
 		 250 aa  166  5e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.231837 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3020  precorrin-4 C11-methyltransferase  40.16 
 
 		 249 aa  165  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.157987 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2352  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.53 
 
 		 250 aa  165  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0620  precorrin-4 C11-methyltransferase protein  40.71 
 
 		 271 aa  165  6.9999999999999995e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.263132  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0114  precorrin-4 C11-methyltransferase  34.52 
 
 		 262 aa  165  8e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.177043  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4589  precorrin-4 C11-methyltransferase  42 
 
 		 251 aa  165  8e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00000000120449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25920  precorrin-3 methylase  43.5 
 
 		 250 aa  164  9e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0297541  normal  0.071417 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2635  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.43 
 
 		 263 aa  163  2.0000000000000002e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.231618  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0806  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  41.6 
 
 		 273 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2213  precorrin-3 methylase  43.75 
 
 		 250 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.578417  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3103  precorrin-4 C11-methyltransferase  40.8 
 
 		 248 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2087  precorrin-3 methylase  36.4 
 
 		 257 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2779  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.13 
 
 		 250 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.545494  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1198  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.5 
 
 		 242 aa  159  3e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>