More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_1081 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1081  precorrin-3 methyltransferase  100 
 
 
593 aa  1216    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19561  bifunctional cbiH protein and precorrin-3B C17-methyltransferase  99.33 
 
 
593 aa  1206    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23501  bifunctional cbiH protein and precorrin-3B C17-methyltransferase  51.02 
 
 
594 aa  608  9.999999999999999e-173  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.659645 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1997  precorrin-3B C17-methyltransferase region  53.63 
 
 
537 aa  597  1e-169  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0124664  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16381  bifunctional cbiH protein and precorrin-3B C18-methyltransferace  49.32 
 
 
620 aa  590  1e-167  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0329  precorrin-3 methyltransferase  50.42 
 
 
579 aa  570  1e-161  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.189951 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17171  bifunctional cbiH protein and precorrin-3B C17-methyltransferase  46.88 
 
 
600 aa  549  1e-155  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17291  bifunctional cbiH protein and precorrin-3B C17-methyltransferase  46.46 
 
 
600 aa  546  1e-154  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.792145  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1617  precorrin-3 methyltransferase  46.48 
 
 
606 aa  535  1e-151  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.481163  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17041  bifunctional cbiH protein and precorrin-3B C17-methyltransferase  44.56 
 
 
604 aa  530  1e-149  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0379  precorrin-3B C17-methyltransferase  41.14 
 
 
631 aa  411  1e-113  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3628  precorrin-3B C17-methyltransferase  40.47 
 
 
623 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2485  precorrin-3B C17-methyltransferase  40 
 
 
623 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1675  precorrin-3B C17-methyltransferase  40.35 
 
 
629 aa  394  1e-108  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4366  precorrin-3 methyltransferase  38.28 
 
 
663 aa  385  1e-105  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.216409 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1264  precorrin-3B C17-methyltransferase  33.33 
 
 
778 aa  310  4e-83  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0572  precorrin-3B C17-methyltransferase  33.5 
 
 
800 aa  301  2e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2636  precorrin-3B C17-methyltransferase  33.8 
 
 
612 aa  288  1e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.168127  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0637  precorrin-3B C17-methyltransferase  30.69 
 
 
837 aa  282  1e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.647433 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0643  precorrin-3 methyltransferase  31.13 
 
 
561 aa  278  2e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0184568  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21210  precorrin-4 C11-methyltransferase  32.09 
 
 
867 aa  271  2e-71  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2702  precorrin-3B C17-methyltransferase  33.15 
 
 
574 aa  265  2e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000152397 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2520  precorrin-3B C17-methyltransferase  32.62 
 
 
577 aa  262  1e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3181  precorrin-3 methyltransferase  31.38 
 
 
655 aa  262  2e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1317  precorrin-3B C17-methyltransferase  31.94 
 
 
611 aa  241  2e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.161327  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1012  precorrin-3B C17-methyltransferase  46.12 
 
 
472 aa  231  3e-59  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2863  precorrin-3 methyltransferase  31.18 
 
 
574 aa  226  7e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4162  precorrin-4 C11-methyltransferase  30.32 
 
 
958 aa  226  1e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.329616  normal  0.542159 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0175  precorrin-3B C17-methyltransferase  30.93 
 
 
601 aa  226  1e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.120567  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0802  precorrin-3B C17-methyltransferase  30.28 
 
 
547 aa  222  9.999999999999999e-57  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0804272  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1290  precorrin-3B C17-methyltransferase  45.34 
 
 
469 aa  221  3.9999999999999997e-56  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.954659  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4475  precorrin-3B C17-methyltransferase  45.49 
 
 
451 aa  213  1e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.253543  normal  0.0484497 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0935  precorrin-3 methyltransferase  46.47 
 
 
238 aa  206  1e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0243766 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2149  precorrin-3B C17-methyltransferase  42.74 
 
 
241 aa  206  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.482473  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2203  precorrin-3B C17-methyltransferase  42.74 
 
 
241 aa  206  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1428  precorrin-3B C17-methyltransferase  43.62 
 
 
240 aa  206  1e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0114869  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1234  precorrin-3B C17-methyltransferase  43.62 
 
 
240 aa  206  1e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0777573  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2362  precorrin-3B C17-methyltransferase  42.74 
 
 
241 aa  205  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.860071  normal  0.738043 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2196  precorrin-3B C17-methyltransferase  42.74 
 
 
241 aa  205  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2249  precorrin-3B C17-methyltransferase  42.74 
 
 
241 aa  205  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.209455 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3128  precorrin-3 methyltransferase  42.86 
 
 
423 aa  204  3e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0213  precorrin-3 methylase/precorrin-8X methylmutase  43.09 
 
 
468 aa  202  9.999999999999999e-51  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1374  precorrin-3B C17-methyltransferase  45.28 
 
 
258 aa  201  1.9999999999999998e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0158588 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1854  precorrin-3 methyltransferase  44.98 
 
 
566 aa  200  5e-50  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.248757  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0871  cobyric acid synthase CobQ  43.55 
 
 
777 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.383971  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1714  precorrin-3 methyltransferase  38.93 
 
 
241 aa  198  2.0000000000000003e-49  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1015  precorrin-3B C17-methyltransferase  41.98 
 
 
240 aa  196  1e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2767  precorrin-3 methyltransferase / precorrin-6Y C5,15-methyltransferase (decarboxylating)  42.8 
 
 
331 aa  195  2e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.545278  normal  0.0717753 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0623  precorrin-3B C17-methyltransferase  39.67 
 
 
240 aa  194  4e-48  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0224111  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2293  precorrin-3B C17-methyltransferase/conserved domain-containing protein  41.7 
 
 
458 aa  192  1e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.671445  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1685  precorrin-3 methyltransferase  43.27 
 
 
326 aa  192  1e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.169686  normal  0.632291 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0482  precorrin-3 C-17 methylase  41.77 
 
 
329 aa  192  2e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1300  precorrin-3B C17-methyltransferase  40.24 
 
 
253 aa  191  2e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0447  precorrin-3 C-17 methylase  41.77 
 
 
329 aa  192  2e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.980014  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1549  precorrin-3B C17-methyltransferase  41.87 
 
 
520 aa  189  9e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000121512  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0315  precorrin-3B C17-methyltransferase  39.75 
 
 
243 aa  189  1e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1378  precorrin-3B C17-methyltransferase  40.91 
 
 
242 aa  189  1e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3744  precorrin-3B C17-methyltransferase  41.37 
 
 
328 aa  188  3e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2500  precorrin-3B C17-methyltransferase  39.52 
 
 
263 aa  187  3e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3605  cobyric acid synthase CobQ  40.56 
 
 
772 aa  187  6e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0124  precorrin-3B C17-methyltransferase  41.42 
 
 
481 aa  186  7e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3539  cobyric acid synthase CobQ  40.56 
 
 
776 aa  186  1.0000000000000001e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.714834  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0216  precorrin-3B C17-methyltransferase  40.42 
 
 
284 aa  186  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.546409  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0077  precorrin-3B C17-methyltransferase  40.87 
 
 
329 aa  185  2.0000000000000003e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6033  precorrin-3B C17-methyltransferase  42.86 
 
 
810 aa  184  5.0000000000000004e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.038685  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1275  precorrin-3B C17-methyltransferase  40.91 
 
 
244 aa  183  9.000000000000001e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.158636  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0485  cobyric acid synthase CobQ:precorrin-3B C17-methyltransferase region  44.03 
 
 
797 aa  182  1e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2616  precorrin-3B C17-methyltransferase  41.22 
 
 
596 aa  182  1e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1752  precorrin-3B C17-methyltransferase  41.6 
 
 
264 aa  182  2e-44  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1296  precorrin-3B C17-methyltransferase  40.17 
 
 
240 aa  181  2.9999999999999997e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.021871 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2153  precorrin-3B C17-methyltransferase  42.4 
 
 
331 aa  181  2.9999999999999997e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0918885 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2709  precorrin-3B C17-methyltransferase  39.75 
 
 
236 aa  180  5.999999999999999e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.424335  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1719  precorrin-3B C17-methyltransferase  43.44 
 
 
250 aa  180  8e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4821  precorrin-3 methyltransferase  27.67 
 
 
579 aa  179  2e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.645584 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3648  precorrin-3B C17-methyltransferase  43.69 
 
 
222 aa  177  4e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1014  precorrin-3B C17-methyltransferase  41.63 
 
 
327 aa  176  9.999999999999999e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.4176  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3264  precorrin-3B C17-methyltransferase  38.65 
 
 
259 aa  172  2e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.189691 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0607  precorrin-3 methyltransferase  28.28 
 
 
567 aa  171  3e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2355  precorrin-3B C17-methyltransferase  39.59 
 
 
512 aa  170  5e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0146728  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4477  precorrin-4 C11-methyltransferase  26.1 
 
 
610 aa  170  6e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00717843  normal  0.120162 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2496  precorrin-3B C17-methyltransferase  43.28 
 
 
495 aa  170  6e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.218921 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0041  cobyric acid synthase CobQ  43.8 
 
 
787 aa  169  9e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1344  precorrin-3B C17-methyltransferase  38.49 
 
 
435 aa  169  1e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1571  precorrin-3B C17-methyltransferase  37.27 
 
 
595 aa  169  1e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.53726  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1589  precorrin-3B C17-methyltransferase  36.9 
 
 
577 aa  169  2e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.76858  normal  0.647382 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3511  precorrin-3B C17-methyltransferase  39.3 
 
 
257 aa  168  2e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.487235  normal  0.723909 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0471  precorrin-3B methylase  41.42 
 
 
238 aa  168  2e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3119  precorrin-3B C17-methyltransferase  38.96 
 
 
253 aa  168  2e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.648234  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4704  precorrin-3B C17-methyltransferase  26.47 
 
 
560 aa  168  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4826  precorrin-3B C17-methyltransferase  26.08 
 
 
565 aa  167  5e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.595112 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1094  precorrin-3 methyltransferase  41 
 
 
241 aa  167  5e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2356  precorrin-3 methyltransferase  38.4 
 
 
267 aa  167  5e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0433914  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2086  precorrin-3B C(17)-methyltransferase  38.78 
 
 
287 aa  167  5.9999999999999996e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1896  precorrin-3B C17-methyltransferase  27.54 
 
 
572 aa  167  5.9999999999999996e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.392663  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1644  precorrin-3B C17-methyltransferase  27.82 
 
 
568 aa  167  6.9999999999999995e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.173043  normal  0.449752 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0574  precorrin-3B C17-methyltransferase  39.11 
 
 
523 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.42028  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1432  precorrin-3B C17-methyltransferase  39.76 
 
 
258 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.688222 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3473  precorrin-3B C17-methyltransferase  37.79 
 
 
331 aa  166  1.0000000000000001e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6022  precorrin-3B C17-methyltransferase  39.91 
 
 
254 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00898196  normal  0.131608 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3431  precorrin-3B C17-methyltransferase  39.2 
 
 
495 aa  165  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.201044  normal  0.761314 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>