More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_2086 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009831  Ssed_2086  precorrin-3B C(17)-methyltransferase  100 
 
 
287 aa  592  1e-168  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2616  precorrin-3B C17-methyltransferase  52.31 
 
 
596 aa  268  7e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0447  precorrin-3 C-17 methylase  49.25 
 
 
329 aa  262  4.999999999999999e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.980014  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0482  precorrin-3 C-17 methylase  49.25 
 
 
329 aa  262  4.999999999999999e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3128  precorrin-3 methyltransferase  48.31 
 
 
423 aa  262  6e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1549  precorrin-3B C17-methyltransferase  51.6 
 
 
520 aa  260  2e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000121512  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2293  precorrin-3B C17-methyltransferase/conserved domain-containing protein  47.96 
 
 
458 aa  259  3e-68  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.671445  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2767  precorrin-3 methyltransferase / precorrin-6Y C5,15-methyltransferase (decarboxylating)  45.72 
 
 
331 aa  253  2.0000000000000002e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.545278  normal  0.0717753 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1014  precorrin-3B C17-methyltransferase  47.04 
 
 
327 aa  246  2e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.4176  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2153  precorrin-3B C17-methyltransferase  46.47 
 
 
331 aa  245  6.999999999999999e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0918885 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1685  precorrin-3 methyltransferase  45.13 
 
 
326 aa  243  1.9999999999999999e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.169686  normal  0.632291 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1752  precorrin-3B C17-methyltransferase  45.1 
 
 
264 aa  239  2.9999999999999997e-62  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3744  precorrin-3B C17-methyltransferase  46.52 
 
 
328 aa  236  3e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2485  precorrin-3B C17-methyltransferase  47.22 
 
 
623 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3628  precorrin-3B C17-methyltransferase  47.22 
 
 
623 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1296  precorrin-3B C17-methyltransferase  47.3 
 
 
240 aa  232  4.0000000000000004e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.021871 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0077  precorrin-3B C17-methyltransferase  44.89 
 
 
329 aa  229  3e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2203  precorrin-3B C17-methyltransferase  47.74 
 
 
241 aa  226  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2362  precorrin-3B C17-methyltransferase  47.74 
 
 
241 aa  226  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.860071  normal  0.738043 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4475  precorrin-3B C17-methyltransferase  45.68 
 
 
451 aa  226  4e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.253543  normal  0.0484497 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2196  precorrin-3B C17-methyltransferase  47.74 
 
 
241 aa  226  4e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2249  precorrin-3B C17-methyltransferase  47.33 
 
 
241 aa  225  5.0000000000000005e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.209455 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2500  precorrin-3B C17-methyltransferase  45.75 
 
 
263 aa  224  9e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0379  precorrin-3B C17-methyltransferase  48.78 
 
 
631 aa  224  1e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2149  precorrin-3B C17-methyltransferase  47.33 
 
 
241 aa  224  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.482473  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1675  precorrin-3B C17-methyltransferase  48.37 
 
 
629 aa  224  1e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0935  precorrin-3 methyltransferase  44.21 
 
 
238 aa  224  2e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0243766 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0871  cobyric acid synthase CobQ  47.2 
 
 
777 aa  221  9.999999999999999e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.383971  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0216  precorrin-3B C17-methyltransferase  46.53 
 
 
284 aa  219  3.9999999999999997e-56  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.546409  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1714  precorrin-3 methyltransferase  45.75 
 
 
241 aa  219  5e-56  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1300  precorrin-3B C17-methyltransferase  43.67 
 
 
253 aa  218  7e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0315  precorrin-3B C17-methyltransferase  44.26 
 
 
243 aa  218  8.999999999999998e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0572  precorrin-3B C17-methyltransferase  46.4 
 
 
800 aa  218  8.999999999999998e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0637  precorrin-3B C17-methyltransferase  45 
 
 
837 aa  216  2.9999999999999998e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.647433 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1344  precorrin-3B C17-methyltransferase  44.94 
 
 
435 aa  216  2.9999999999999998e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1012  precorrin-3B C17-methyltransferase  45.68 
 
 
472 aa  215  7e-55  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4366  precorrin-3 methyltransferase  45.71 
 
 
663 aa  214  9e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.216409 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2356  precorrin-3 methyltransferase  43.8 
 
 
267 aa  212  5.999999999999999e-54  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0433914  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1275  precorrin-3B C17-methyltransferase  44.63 
 
 
244 aa  211  9e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.158636  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1264  precorrin-3B C17-methyltransferase  46.18 
 
 
778 aa  209  3e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1290  precorrin-3B C17-methyltransferase  43.68 
 
 
469 aa  208  6e-53  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.954659  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0643  precorrin-3 methyltransferase  43.55 
 
 
561 aa  208  8e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0184568  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2355  precorrin-3B C17-methyltransferase  42.51 
 
 
512 aa  208  9e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0146728  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0213  precorrin-3 methylase/precorrin-8X methylmutase  43.55 
 
 
468 aa  208  1e-52  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2709  precorrin-3B C17-methyltransferase  46.67 
 
 
236 aa  207  1e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.424335  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1015  precorrin-3B C17-methyltransferase  44.21 
 
 
240 aa  206  5e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0485  cobyric acid synthase CobQ:precorrin-3B C17-methyltransferase region  47.95 
 
 
797 aa  205  9e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0618  bifunctional: precorrin-3 methyltransferase/precorrin-6X reductase oxidoreductase protein  43.82 
 
 
519 aa  204  1e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.157389  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1234  precorrin-3B C17-methyltransferase  43.32 
 
 
240 aa  203  2e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0777573  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1428  precorrin-3B C17-methyltransferase  43.32 
 
 
240 aa  203  3e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0114869  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0623  precorrin-3B C17-methyltransferase  42.86 
 
 
240 aa  201  9.999999999999999e-51  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0224111  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1869  precorrin-3B C17-methyltransferase  41.13 
 
 
320 aa  200  1.9999999999999998e-50  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.186861  normal  0.466196 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3181  precorrin-3 methyltransferase  43.68 
 
 
655 aa  198  7.999999999999999e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3539  cobyric acid synthase CobQ  44.44 
 
 
776 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.714834  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2863  precorrin-3 methyltransferase  39.6 
 
 
574 aa  195  6e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0936  precorrin-3B C17-methyltransferase  45.45 
 
 
236 aa  195  8.000000000000001e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1374  precorrin-3B C17-methyltransferase  41.63 
 
 
258 aa  194  1e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0158588 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3605  cobyric acid synthase CobQ  44.06 
 
 
772 aa  194  1e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2636  precorrin-3B C17-methyltransferase  43.92 
 
 
612 aa  193  3e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.168127  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1094  precorrin-3 methyltransferase  47.5 
 
 
241 aa  192  7e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6033  precorrin-3B C17-methyltransferase  42.68 
 
 
810 aa  191  2e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.038685  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0991  precorrin-3B C17-methyltransferase  39.62 
 
 
345 aa  190  2.9999999999999997e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2524  precorrin-3 methyltransferase / precorrin-2 C20-methyltransferase / cobalt-factor II C20-methyltransferase  40.8 
 
 
495 aa  189  5.999999999999999e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.564882  normal  0.0996134 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2989  precorrin-6Y C5,15-methyltransferase (decarboxylating) / precorrin-3 methyltransferase  42 
 
 
258 aa  189  5.999999999999999e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.258814  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0629  precorrin-3B C17-methyltransferase  39.56 
 
 
266 aa  188  7e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2487  precorrin-3 methyltransferase / precorrin-2 C20-methyltransferase / cobalt-factor II C20-methyltransferase  40.8 
 
 
495 aa  188  9e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.710411  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2532  cobalt-factor II C20-methyltransferase / precorrin-2 C20-methyltransferase / precorrin-3 methyltransferase  40.8 
 
 
495 aa  188  9e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.735838  normal  0.502246 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1226  precorrin-3B C17-methyltransferase  45.31 
 
 
260 aa  187  1e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.627427  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3473  precorrin-3B C17-methyltransferase  38.58 
 
 
331 aa  187  1e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1997  precorrin-3B C17-methyltransferase region  41.22 
 
 
537 aa  187  2e-46  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0124664  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1080  precorrin-3 methyltransferase  43.97 
 
 
253 aa  185  7e-46  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0124  precorrin-3B C17-methyltransferase  38.82 
 
 
481 aa  185  7e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0118  precorrin-3B C17-methyltransferase  43.53 
 
 
250 aa  184  1.0000000000000001e-45  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1719  precorrin-3B C17-methyltransferase  43.03 
 
 
250 aa  183  2.0000000000000003e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4874  CbiG protein/precorrin-3B C17-methyltransferase  38.89 
 
 
567 aa  183  3e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21210  precorrin-4 C11-methyltransferase  40.48 
 
 
867 aa  183  3e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3264  precorrin-3B C17-methyltransferase  43.03 
 
 
259 aa  183  3e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.189691 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1719  precorrin-3B C17-methyltransferase  42.86 
 
 
265 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0297  precorrin-3B C17-methyltransferase  44.18 
 
 
245 aa  182  5.0000000000000004e-45  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.48516  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0175  precorrin-3B C17-methyltransferase  44.79 
 
 
601 aa  181  9.000000000000001e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.120567  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1378  precorrin-3B C17-methyltransferase  38.84 
 
 
242 aa  181  9.000000000000001e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3511  precorrin-3B C17-methyltransferase  41.67 
 
 
257 aa  181  1e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.487235  normal  0.723909 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1854  precorrin-3 methyltransferase  43.37 
 
 
566 aa  180  2e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.248757  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4414  precorrin-3B C17-methyltransferase  38.49 
 
 
567 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.472889 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1081  precorrin-3 methyltransferase  38.78 
 
 
593 aa  180  2.9999999999999997e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3213  precorrin-3B C17-methyltransferase  40.59 
 
 
266 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4826  precorrin-3B C17-methyltransferase  37.3 
 
 
565 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.595112 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19561  bifunctional cbiH protein and precorrin-3B C17-methyltransferase  37.96 
 
 
593 aa  179  4.999999999999999e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0329  precorrin-3 methyltransferase  40.89 
 
 
579 aa  179  5.999999999999999e-44  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.189951 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1589  precorrin-3B C17-methyltransferase  41.2 
 
 
577 aa  178  9e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.76858  normal  0.647382 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3431  precorrin-3B C17-methyltransferase  40.24 
 
 
495 aa  178  9e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.201044  normal  0.761314 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1242  precorrin-3 methyltransferase  40.4 
 
 
604 aa  177  1e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.38212 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17291  bifunctional cbiH protein and precorrin-3B C17-methyltransferase  39.11 
 
 
600 aa  178  1e-43  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.792145  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1571  precorrin-3B C17-methyltransferase  41.2 
 
 
595 aa  177  2e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.53726  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0041  cobyric acid synthase CobQ  42.42 
 
 
787 aa  177  3e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1289  cbiG protein/precorrin-3B C17-methyltransferase  40.16 
 
 
581 aa  176  3e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17041  bifunctional cbiH protein and precorrin-3B C17-methyltransferase  38.87 
 
 
604 aa  176  3e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1252  cbiG protein/precorrin-3B C17-methyltransferase  40.16 
 
 
564 aa  176  4e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0680839  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4704  precorrin-3B C17-methyltransferase  36.95 
 
 
560 aa  175  8e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1521  precorrin-2 C20-methyltransferase / cobalt-factor II C20-methyltransferase / precorrin-3 methyltransferase  44.98 
 
 
526 aa  174  9.999999999999999e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0252228  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>