More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_1685 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_1685  precorrin-3 methyltransferase  100 
 
 
326 aa  668    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.169686  normal  0.632291 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3744  precorrin-3B C17-methyltransferase  83.39 
 
 
328 aa  520  1e-146  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2767  precorrin-3 methyltransferase / precorrin-6Y C5,15-methyltransferase (decarboxylating)  74.37 
 
 
331 aa  492  9.999999999999999e-139  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.545278  normal  0.0717753 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0482  precorrin-3 C-17 methylase  74.38 
 
 
329 aa  487  1e-136  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0447  precorrin-3 C-17 methylase  74.38 
 
 
329 aa  487  1e-136  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.980014  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2153  precorrin-3B C17-methyltransferase  74.77 
 
 
331 aa  478  1e-134  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0918885 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0077  precorrin-3B C17-methyltransferase  77.71 
 
 
329 aa  465  9.999999999999999e-131  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1014  precorrin-3B C17-methyltransferase  76.57 
 
 
327 aa  448  1e-125  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.4176  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2293  precorrin-3B C17-methyltransferase/conserved domain-containing protein  65.51 
 
 
458 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.671445  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3128  precorrin-3 methyltransferase  67.03 
 
 
423 aa  396  1e-109  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1549  precorrin-3B C17-methyltransferase  63.92 
 
 
520 aa  338  9.999999999999999e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000121512  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2616  precorrin-3B C17-methyltransferase  63.89 
 
 
596 aa  331  8e-90  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1344  precorrin-3B C17-methyltransferase  60.73 
 
 
435 aa  320  1.9999999999999998e-86  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1752  precorrin-3B C17-methyltransferase  49.21 
 
 
264 aa  277  2e-73  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3628  precorrin-3B C17-methyltransferase  50.2 
 
 
623 aa  261  8.999999999999999e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2485  precorrin-3B C17-methyltransferase  50.2 
 
 
623 aa  261  1e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4366  precorrin-3 methyltransferase  50.61 
 
 
663 aa  252  5.000000000000001e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.216409 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0935  precorrin-3 methyltransferase  49.17 
 
 
238 aa  246  4.9999999999999997e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0243766 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1675  precorrin-3B C17-methyltransferase  49.6 
 
 
629 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2086  precorrin-3B C(17)-methyltransferase  45.13 
 
 
287 aa  241  1e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1296  precorrin-3B C17-methyltransferase  51.67 
 
 
240 aa  239  4e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.021871 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0379  precorrin-3B C17-methyltransferase  49.4 
 
 
631 aa  239  4e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2500  precorrin-3B C17-methyltransferase  48.63 
 
 
263 aa  239  6.999999999999999e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0315  precorrin-3B C17-methyltransferase  45.71 
 
 
243 aa  238  6.999999999999999e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1300  precorrin-3B C17-methyltransferase  48.58 
 
 
253 aa  233  4.0000000000000004e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1264  precorrin-3B C17-methyltransferase  49.4 
 
 
778 aa  231  9e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0485  cobyric acid synthase CobQ:precorrin-3B C17-methyltransferase region  50.76 
 
 
797 aa  231  1e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0871  cobyric acid synthase CobQ  48.8 
 
 
777 aa  231  1e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.383971  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1015  precorrin-3B C17-methyltransferase  50.62 
 
 
240 aa  228  1e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0572  precorrin-3B C17-methyltransferase  47.6 
 
 
800 aa  224  1e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0623  precorrin-3B C17-methyltransferase  45.12 
 
 
240 aa  224  1e-57  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0224111  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1714  precorrin-3 methyltransferase  46.28 
 
 
241 aa  225  1e-57  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4475  precorrin-3B C17-methyltransferase  46.72 
 
 
451 aa  223  4e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.253543  normal  0.0484497 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0637  precorrin-3B C17-methyltransferase  47.06 
 
 
837 aa  223  4e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.647433 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0936  precorrin-3B C17-methyltransferase  48.76 
 
 
236 aa  222  6e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3539  cobyric acid synthase CobQ  47.49 
 
 
776 aa  220  3e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.714834  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3605  cobyric acid synthase CobQ  46.36 
 
 
772 aa  219  5e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2709  precorrin-3B C17-methyltransferase  47.3 
 
 
236 aa  216  2.9999999999999998e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.424335  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2249  precorrin-3B C17-methyltransferase  45.83 
 
 
241 aa  216  4e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.209455 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2149  precorrin-3B C17-methyltransferase  45.42 
 
 
241 aa  216  5e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.482473  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2362  precorrin-3B C17-methyltransferase  45.42 
 
 
241 aa  216  5.9999999999999996e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.860071  normal  0.738043 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2203  precorrin-3B C17-methyltransferase  45.42 
 
 
241 aa  215  7e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2196  precorrin-3B C17-methyltransferase  45.42 
 
 
241 aa  215  9e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1012  precorrin-3B C17-methyltransferase  44.22 
 
 
472 aa  213  2.9999999999999995e-54  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23501  bifunctional cbiH protein and precorrin-3B C17-methyltransferase  44.94 
 
 
594 aa  212  7e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.659645 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1234  precorrin-3B C17-methyltransferase  44.53 
 
 
240 aa  212  7e-54  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0777573  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1428  precorrin-3B C17-methyltransferase  44.53 
 
 
240 aa  212  7.999999999999999e-54  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0114869  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1275  precorrin-3B C17-methyltransferase  45.27 
 
 
244 aa  211  2e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.158636  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0329  precorrin-3 methyltransferase  44.76 
 
 
579 aa  207  3e-52  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.189951 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0643  precorrin-3 methyltransferase  47.79 
 
 
561 aa  207  3e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0184568  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1869  precorrin-3B C17-methyltransferase  41.98 
 
 
320 aa  206  4e-52  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.186861  normal  0.466196 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1290  precorrin-3B C17-methyltransferase  41.64 
 
 
469 aa  206  4e-52  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.954659  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0216  precorrin-3B C17-methyltransferase  45.31 
 
 
284 aa  206  6e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.546409  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1997  precorrin-3B C17-methyltransferase region  43.9 
 
 
537 aa  205  9e-52  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0124664  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2356  precorrin-3 methyltransferase  40.84 
 
 
267 aa  205  9e-52  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0433914  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1378  precorrin-3B C17-methyltransferase  43.62 
 
 
242 aa  203  4e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0471  precorrin-3B methylase  47.92 
 
 
238 aa  203  4e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3473  precorrin-3B C17-methyltransferase  41.73 
 
 
331 aa  200  1.9999999999999998e-50  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19561  bifunctional cbiH protein and precorrin-3B C17-methyltransferase  43.27 
 
 
593 aa  201  1.9999999999999998e-50  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1081  precorrin-3 methyltransferase  43.27 
 
 
593 aa  201  1.9999999999999998e-50  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1094  precorrin-3 methyltransferase  51.04 
 
 
241 aa  199  3.9999999999999996e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6033  precorrin-3B C17-methyltransferase  42.34 
 
 
810 aa  197  1.0000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.038685  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21210  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.15 
 
 
867 aa  198  1.0000000000000001e-49  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2355  precorrin-3B C17-methyltransferase  41.96 
 
 
512 aa  197  1.0000000000000001e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0146728  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0213  precorrin-3 methylase/precorrin-8X methylmutase  39.68 
 
 
468 aa  197  2.0000000000000003e-49  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0991  precorrin-3B C17-methyltransferase  41.34 
 
 
345 aa  196  4.0000000000000005e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0041  cobyric acid synthase CobQ  48.67 
 
 
787 aa  196  5.000000000000001e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0124  precorrin-3B C17-methyltransferase  42.86 
 
 
481 aa  195  9e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17041  bifunctional cbiH protein and precorrin-3B C17-methyltransferase  42.13 
 
 
604 aa  194  1e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0629  precorrin-3B C17-methyltransferase  41.48 
 
 
266 aa  194  2e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1374  precorrin-3B C17-methyltransferase  41.92 
 
 
258 aa  193  4e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0158588 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3648  precorrin-3B C17-methyltransferase  47.53 
 
 
222 aa  192  9e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16381  bifunctional cbiH protein and precorrin-3B C18-methyltransferace  43.67 
 
 
620 aa  191  2e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0118  precorrin-3B C17-methyltransferase  41.73 
 
 
250 aa  189  5.999999999999999e-47  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3181  precorrin-3 methyltransferase  44.53 
 
 
655 aa  189  5.999999999999999e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2863  precorrin-3 methyltransferase  39.74 
 
 
574 aa  189  8e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17171  bifunctional cbiH protein and precorrin-3B C17-methyltransferase  39.76 
 
 
600 aa  186  3e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1525  precorrin-3B C17-methyltransferase  43.43 
 
 
245 aa  186  3e-46  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00108788 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1617  precorrin-3 methyltransferase  41.18 
 
 
606 aa  186  5e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.481163  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1719  precorrin-3B C17-methyltransferase  42.57 
 
 
250 aa  183  3e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17291  bifunctional cbiH protein and precorrin-3B C17-methyltransferase  40.16 
 
 
600 aa  183  3e-45  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.792145  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2636  precorrin-3B C17-methyltransferase  39.53 
 
 
612 aa  183  4.0000000000000006e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.168127  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0618  bifunctional: precorrin-3 methyltransferase/precorrin-6X reductase oxidoreductase protein  38.46 
 
 
519 aa  182  5.0000000000000004e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.157389  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0175  precorrin-3B C17-methyltransferase  43.75 
 
 
601 aa  182  8.000000000000001e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.120567  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1226  precorrin-3B C17-methyltransferase  43.14 
 
 
260 aa  181  1e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.627427  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0297  precorrin-3B C17-methyltransferase  42.91 
 
 
245 aa  179  4.999999999999999e-44  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.48516  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4414  precorrin-3B C17-methyltransferase  38.49 
 
 
567 aa  177  2e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.472889 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2014  precorrin-3B C17-methyltransferase  42.63 
 
 
253 aa  177  2e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000268316  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1719  precorrin-3B C17-methyltransferase  43.14 
 
 
265 aa  175  9.999999999999999e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3511  precorrin-3B C17-methyltransferase  40.73 
 
 
257 aa  174  1.9999999999999998e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.487235  normal  0.723909 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4826  precorrin-3B C17-methyltransferase  38.43 
 
 
565 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.595112 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0512  precorrin-3B C17-methyltransferase  41.96 
 
 
265 aa  172  5e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.215708  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0830  precorrin-3B C17-methyltransferase  34.9 
 
 
251 aa  172  5e-42  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0437244  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4882  precorrin-3B C17-methyltransferase  37.45 
 
 
560 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4704  precorrin-3B C17-methyltransferase  37.05 
 
 
560 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0802  precorrin-3B C17-methyltransferase  41.87 
 
 
547 aa  171  2e-41  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0804272  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4616  precorrin-3B C17-methyltransferase  38.49 
 
 
563 aa  170  3e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.542511 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1854  precorrin-3 methyltransferase  43.78 
 
 
566 aa  169  7e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.248757  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4874  CbiG protein/precorrin-3B C17-methyltransferase  36.9 
 
 
567 aa  169  8e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1624  precorrin-3B C17-methyltransferase  41.13 
 
 
529 aa  167  2.9999999999999998e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.226232  normal  0.692931 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>