More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1014 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_1014  precorrin-3B C17-methyltransferase  100 
 
 		 327 aa  668    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.4176  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2767  precorrin-3 methyltransferase / precorrin-6Y C5,15-methyltransferase (decarboxylating)  89.14 
 
 		 331 aa  572  1.0000000000000001e-162  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.545278  normal  0.0717753 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2153  precorrin-3B C17-methyltransferase  87.82 
 
 		 331 aa  538  9.999999999999999e-153  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0918885 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0447  precorrin-3 C-17 methylase  78.88 
 
 		 329 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.980014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0482  precorrin-3 C-17 methylase  78.88 
 
 		 329 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1685  precorrin-3 methyltransferase  75.95 
 
 		 326 aa  474  1e-133  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.169686  normal  0.632291 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0077  precorrin-3B C17-methyltransferase  76.75 
 
 		 329 aa  474  1e-133  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3744  precorrin-3B C17-methyltransferase  74.52 
 
 		 328 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2293  precorrin-3B C17-methyltransferase/conserved domain-containing protein  73.84 
 
 		 458 aa  421  1e-116  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.671445  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3128  precorrin-3 methyltransferase  65.23 
 
 		 423 aa  382  1e-105  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1549  precorrin-3B C17-methyltransferase  65.48 
 
 		 520 aa  340  2e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000121512  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2616  precorrin-3B C17-methyltransferase  65.48 
 
 		 596 aa  336  2.9999999999999997e-91  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1344  precorrin-3B C17-methyltransferase  58.75 
 
 		 435 aa  323  3e-87  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1752  precorrin-3B C17-methyltransferase  49.03 
 
 		 264 aa  286  2.9999999999999996e-76  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2485  precorrin-3B C17-methyltransferase  53.01 
 
 		 623 aa  262  6.999999999999999e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3628  precorrin-3B C17-methyltransferase  53.01 
 
 		 623 aa  261  8e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0315  precorrin-3B C17-methyltransferase  50.2 
 
 		 243 aa  258  9e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4366  precorrin-3 methyltransferase  51.63 
 
 		 663 aa  254  2.0000000000000002e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.216409 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1675  precorrin-3B C17-methyltransferase  53.06 
 
 		 629 aa  253  3e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0935  precorrin-3 methyltransferase  49.17 
 
 		 238 aa  249  4e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0243766 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2086  precorrin-3B C(17)-methyltransferase  47.04 
 
 		 287 aa  249  5e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1300  precorrin-3B C17-methyltransferase  52.85 
 
 		 253 aa  247  2e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0379  precorrin-3B C17-methyltransferase  51.84 
 
 		 631 aa  245  6.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1264  precorrin-3B C17-methyltransferase  52 
 
 		 778 aa  239  4e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0572  precorrin-3B C17-methyltransferase  52 
 
 		 800 aa  238  1e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1296  precorrin-3B C17-methyltransferase  50.42 
 
 		 240 aa  236  5.0000000000000005e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.021871 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1015  precorrin-3B C17-methyltransferase  50.21 
 
 		 240 aa  234  1.0000000000000001e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2500  precorrin-3B C17-methyltransferase  47.69 
 
 		 263 aa  233  4.0000000000000004e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0485  cobyric acid synthase CobQ:precorrin-3B C17-methyltransferase region  55.1 
 
 		 797 aa  233  5e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0623  precorrin-3B C17-methyltransferase  45.93 
 
 		 240 aa  232  6e-60  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0224111  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2709  precorrin-3B C17-methyltransferase  50.83 
 
 		 236 aa  230  2e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.424335  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0637  precorrin-3B C17-methyltransferase  50 
 
 		 837 aa  230  3e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.647433 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1714  precorrin-3 methyltransferase  46.25 
 
 		 241 aa  229  5e-59  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2249  precorrin-3B C17-methyltransferase  48.76 
 
 		 241 aa  229  6e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.209455 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2362  precorrin-3B C17-methyltransferase  48.35 
 
 		 241 aa  228  8e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.860071  normal  0.738043 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2203  precorrin-3B C17-methyltransferase  48.35 
 
 		 241 aa  228  9e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2149  precorrin-3B C17-methyltransferase  48.35 
 
 		 241 aa  228  9e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.482473  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2196  precorrin-3B C17-methyltransferase  48.35 
 
 		 241 aa  228  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3605  cobyric acid synthase CobQ  48.46 
 
 		 772 aa  224  1e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0871  cobyric acid synthase CobQ  46.25 
 
 		 777 aa  222  6e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.383971  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0936  precorrin-3B C17-methyltransferase  48.76 
 
 		 236 aa  221  9.999999999999999e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1234  precorrin-3B C17-methyltransferase  44.53 
 
 		 240 aa  219  3e-56  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0777573  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1428  precorrin-3B C17-methyltransferase  44.53 
 
 		 240 aa  219  3.9999999999999997e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0114869  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3539  cobyric acid synthase CobQ  49.03 
 
 		 776 aa  219  3.9999999999999997e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.714834  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4475  precorrin-3B C17-methyltransferase  47.13 
 
 		 451 aa  219  6e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.253543  normal  0.0484497 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1275  precorrin-3B C17-methyltransferase  46.5 
 
 		 244 aa  216  5e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.158636  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23501  bifunctional cbiH protein and precorrin-3B C17-methyltransferase  47.76 
 
 		 594 aa  214  1.9999999999999998e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.659645 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1997  precorrin-3B C17-methyltransferase region  46.34 
 
 		 537 aa  212  7e-54  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0124664  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1290  precorrin-3B C17-methyltransferase  42.62 
 
 		 469 aa  211  1e-53  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.954659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1012  precorrin-3B C17-methyltransferase  45.27 
 
 		 472 aa  211  1e-53  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0329  precorrin-3 methyltransferase  47.18 
 
 		 579 aa  210  3e-53  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.189951 
 
 
-
 
NC_002950  PG0213  precorrin-3 methylase/precorrin-8X methylmutase  43.31 
 
 		 468 aa  209  4e-53  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1378  precorrin-3B C17-methyltransferase  44.44 
 
 		 242 aa  209  4e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1525  precorrin-3B C17-methyltransferase  49.41 
 
 		 245 aa  207  2e-52  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00108788 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1094  precorrin-3 methyltransferase  52.08 
 
 		 241 aa  206  4e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2355  precorrin-3B C17-methyltransferase  42.8 
 
 		 512 aa  206  4e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0146728  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0643  precorrin-3 methyltransferase  46.99 
 
 		 561 aa  206  4e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0184568  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2356  precorrin-3 methyltransferase  43.19 
 
 		 267 aa  205  8e-52  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0433914  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21210  precorrin-4 C11-methyltransferase  45.42 
 
 		 867 aa  205  1e-51  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0216  precorrin-3B C17-methyltransferase  45.71 
 
 		 284 aa  204  2e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.546409  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6033  precorrin-3B C17-methyltransferase  44.49 
 
 		 810 aa  202  5e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.038685  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0629  precorrin-3B C17-methyltransferase  44.75 
 
 		 266 aa  201  9e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0118  precorrin-3B C17-methyltransferase  44.49 
 
 		 250 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0471  precorrin-3B methylase  48.75 
 
 		 238 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0041  cobyric acid synthase CobQ  50 
 
 		 787 aa  198  7.999999999999999e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1869  precorrin-3B C17-methyltransferase  43.92 
 
 		 320 aa  194  1e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.186861  normal  0.466196 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17171  bifunctional cbiH protein and precorrin-3B C17-methyltransferase  41.3 
 
 		 600 aa  194  2e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17041  bifunctional cbiH protein and precorrin-3B C17-methyltransferase  41.37 
 
 		 604 aa  194  2e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0991  precorrin-3B C17-methyltransferase  42.35 
 
 		 345 aa  193  3e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0124  precorrin-3B C17-methyltransferase  42.17 
 
 		 481 aa  194  3e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0297  precorrin-3B C17-methyltransferase  48.37 
 
 		 245 aa  192  7e-48  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.48516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19561  bifunctional cbiH protein and precorrin-3B C17-methyltransferase  41.63 
 
 		 593 aa  191  2e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1719  precorrin-3B C17-methyltransferase  45.02 
 
 		 250 aa  191  2e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1081  precorrin-3 methyltransferase  41.63 
 
 		 593 aa  191  2e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2636  precorrin-3B C17-methyltransferase  43.14 
 
 		 612 aa  190  2e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.168127  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3648  precorrin-3B C17-methyltransferase  47.56 
 
 		 222 aa  190  2.9999999999999997e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3181  precorrin-3 methyltransferase  44.13 
 
 		 655 aa  189  4e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0618  bifunctional: precorrin-3 methyltransferase/precorrin-6X reductase oxidoreductase protein  39.76 
 
 		 519 aa  189  5.999999999999999e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.157389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16381  bifunctional cbiH protein and precorrin-3B C18-methyltransferace  43.67 
 
 		 620 aa  189  5.999999999999999e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1226  precorrin-3B C17-methyltransferase  44.27 
 
 		 260 aa  189  7e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.627427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1617  precorrin-3 methyltransferase  40.64 
 
 		 606 aa  188  1e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.481163  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1374  precorrin-3B C17-methyltransferase  42.35 
 
 		 258 aa  187  2e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0158588 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17291  bifunctional cbiH protein and precorrin-3B C17-methyltransferase  40.89 
 
 		 600 aa  187  2e-46  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.792145  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2863  precorrin-3 methyltransferase  40.17 
 
 		 574 aa  185  7e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3473  precorrin-3B C17-methyltransferase  41.18 
 
 		 331 aa  184  2.0000000000000003e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0704  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  39.75 
 
 		 235 aa  181  1e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0512  precorrin-3B C17-methyltransferase  43.92 
 
 		 265 aa  181  1e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.215708  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0830  precorrin-3B C17-methyltransferase  37.15 
 
 		 251 aa  181  2e-44  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0437244  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0175  precorrin-3B C17-methyltransferase  45.77 
 
 		 601 aa  180  4e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.120567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1719  precorrin-3B C17-methyltransferase  44.71 
 
 		 265 aa  179  5.999999999999999e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1702  precorrin-3B C17-methyltransferase  36.61 
 
 		 250 aa  172  7.999999999999999e-42  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3511  precorrin-3B C17-methyltransferase  41.13 
 
 		 257 aa  171  2e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.487235  normal  0.723909 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4414  precorrin-3B C17-methyltransferase  38.1 
 
 		 567 aa  169  6e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.472889 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0802  precorrin-3B C17-methyltransferase  43.09 
 
 		 547 aa  169  7e-41  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0804272  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1854  precorrin-3 methyltransferase  43.2 
 
 		 566 aa  168  1e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.248757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0760  precorrin-3B C17-methyltransferase  35.83 
 
 		 250 aa  167  2e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.920637  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0200  precorrin-3B C17-methyltransferase  35.43 
 
 		 250 aa  167  2e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1624  precorrin-3B C17-methyltransferase  43.44 
 
 		 529 aa  166  4e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.226232  normal  0.692931 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3264  precorrin-3B C17-methyltransferase  41.83 
 
 		 259 aa  166  4e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.189691 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2520  precorrin-3B C17-methyltransferase  46.53 
 
 		 577 aa  166  5e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>