More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2355 on replicon NC_008010
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008010  Dgeo_2355  precorrin-3B C17-methyltransferase  100 
 
 
512 aa  1027    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0146728  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0618  bifunctional: precorrin-3 methyltransferase/precorrin-6X reductase oxidoreductase protein  58.01 
 
 
519 aa  526  1e-148  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.157389  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1296  precorrin-3B C17-methyltransferase  46.86 
 
 
240 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.021871 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3628  precorrin-3B C17-methyltransferase  44.22 
 
 
623 aa  210  4e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2485  precorrin-3B C17-methyltransferase  44.22 
 
 
623 aa  211  4e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0935  precorrin-3 methyltransferase  44.12 
 
 
238 aa  208  2e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0243766 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4366  precorrin-3 methyltransferase  43.27 
 
 
663 aa  207  3e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.216409 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2616  precorrin-3B C17-methyltransferase  43.72 
 
 
596 aa  207  4e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0379  precorrin-3B C17-methyltransferase  44.67 
 
 
631 aa  207  4e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1275  precorrin-3B C17-methyltransferase  41.49 
 
 
244 aa  205  2e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.158636  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0482  precorrin-3 C-17 methylase  42.21 
 
 
329 aa  204  2e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0447  precorrin-3 C-17 methylase  42.21 
 
 
329 aa  204  2e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.980014  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0315  precorrin-3B C17-methyltransferase  40.42 
 
 
243 aa  203  7e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1675  precorrin-3B C17-methyltransferase  44.26 
 
 
629 aa  202  9e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2086  precorrin-3B C(17)-methyltransferase  42.51 
 
 
287 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0637  precorrin-3B C17-methyltransferase  45.86 
 
 
837 aa  200  3.9999999999999996e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.647433 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2767  precorrin-3 methyltransferase / precorrin-6Y C5,15-methyltransferase (decarboxylating)  43.5 
 
 
331 aa  199  1.0000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.545278  normal  0.0717753 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1300  precorrin-3B C17-methyltransferase  41.91 
 
 
253 aa  198  2.0000000000000003e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2293  precorrin-3B C17-methyltransferase/conserved domain-containing protein  43.23 
 
 
458 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.671445  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3128  precorrin-3 methyltransferase  41.06 
 
 
423 aa  197  5.000000000000001e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1014  precorrin-3B C17-methyltransferase  42.8 
 
 
327 aa  196  6e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.4176  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0871  cobyric acid synthase CobQ  41.16 
 
 
777 aa  195  1e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.383971  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1549  precorrin-3B C17-methyltransferase  41.3 
 
 
520 aa  193  7e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000121512  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0643  precorrin-3 methyltransferase  48.75 
 
 
561 aa  191  2e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0184568  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1752  precorrin-3B C17-methyltransferase  38.71 
 
 
264 aa  191  2.9999999999999997e-47  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1264  precorrin-3B C17-methyltransferase  44.94 
 
 
778 aa  191  4e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2153  precorrin-3B C17-methyltransferase  43.07 
 
 
331 aa  190  5e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0918885 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0623  precorrin-3B C17-methyltransferase  38.66 
 
 
240 aa  189  1e-46  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0224111  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2709  precorrin-3B C17-methyltransferase  43.64 
 
 
236 aa  188  2e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.424335  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1685  precorrin-3 methyltransferase  41.96 
 
 
326 aa  187  4e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.169686  normal  0.632291 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2500  precorrin-3B C17-methyltransferase  44.18 
 
 
263 aa  187  5e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0572  precorrin-3B C17-methyltransferase  45.53 
 
 
800 aa  187  5e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1378  precorrin-3B C17-methyltransferase  39.5 
 
 
242 aa  186  1.0000000000000001e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3605  cobyric acid synthase CobQ  39.43 
 
 
772 aa  185  2.0000000000000003e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21210  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.87 
 
 
867 aa  184  3e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1015  precorrin-3B C17-methyltransferase  38.49 
 
 
240 aa  183  7e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3539  cobyric acid synthase CobQ  42.41 
 
 
776 aa  182  1e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.714834  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3744  precorrin-3B C17-methyltransferase  43.6 
 
 
328 aa  181  2e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1714  precorrin-3 methyltransferase  36.82 
 
 
241 aa  178  2e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2362  precorrin-3B C17-methyltransferase  41.25 
 
 
241 aa  177  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.860071  normal  0.738043 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2149  precorrin-3B C17-methyltransferase  40.83 
 
 
241 aa  177  6e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.482473  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2203  precorrin-3B C17-methyltransferase  40.83 
 
 
241 aa  176  6e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2249  precorrin-3B C17-methyltransferase  40.83 
 
 
241 aa  177  6e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.209455 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2196  precorrin-3B C17-methyltransferase  40.83 
 
 
241 aa  176  7e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0216  precorrin-3B C17-methyltransferase  44.81 
 
 
284 aa  176  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.546409  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0077  precorrin-3B C17-methyltransferase  39.62 
 
 
329 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0485  cobyric acid synthase CobQ:precorrin-3B C17-methyltransferase region  41.83 
 
 
797 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17041  bifunctional cbiH protein and precorrin-3B C17-methyltransferase  38.46 
 
 
604 aa  174  2.9999999999999996e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1428  precorrin-3B C17-methyltransferase  36.25 
 
 
240 aa  174  3.9999999999999995e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0114869  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1234  precorrin-3B C17-methyltransferase  36.25 
 
 
240 aa  173  6.999999999999999e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0777573  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1012  precorrin-3B C17-methyltransferase  38.59 
 
 
472 aa  173  7.999999999999999e-42  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2356  precorrin-3 methyltransferase  39.52 
 
 
267 aa  172  9e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0433914  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0704  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  34.31 
 
 
235 aa  171  3e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23501  bifunctional cbiH protein and precorrin-3B C17-methyltransferase  41.39 
 
 
594 aa  171  3e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.659645 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1525  precorrin-3B C17-methyltransferase  43.85 
 
 
245 aa  171  3e-41  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00108788 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19561  bifunctional cbiH protein and precorrin-3B C17-methyltransferase  39.59 
 
 
593 aa  171  4e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1081  precorrin-3 methyltransferase  39.59 
 
 
593 aa  170  5e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1571  precorrin-3B C17-methyltransferase  42.97 
 
 
595 aa  170  5e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.53726  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1589  precorrin-3B C17-methyltransferase  42.57 
 
 
577 aa  170  6e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.76858  normal  0.647382 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1344  precorrin-3B C17-methyltransferase  43.09 
 
 
435 aa  169  1e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1719  precorrin-3B C17-methyltransferase  43.67 
 
 
250 aa  168  2e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1290  precorrin-3B C17-methyltransferase  37.35 
 
 
469 aa  168  2e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.954659  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0118  precorrin-3B C17-methyltransferase  39.34 
 
 
250 aa  167  5e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4475  precorrin-3B C17-methyltransferase  37.2 
 
 
451 aa  167  5.9999999999999996e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.253543  normal  0.0484497 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0041  cobyric acid synthase CobQ  41.8 
 
 
787 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1702  precorrin-3B C17-methyltransferase  38.46 
 
 
250 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6033  precorrin-3B C17-methyltransferase  40.89 
 
 
810 aa  165  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.038685  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1997  precorrin-3B C17-methyltransferase region  37.86 
 
 
537 aa  164  5.0000000000000005e-39  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0124664  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0329  precorrin-3 methyltransferase  40.65 
 
 
579 aa  163  8.000000000000001e-39  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.189951 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0629  precorrin-3B C17-methyltransferase  38.46 
 
 
266 aa  162  1e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2536  precorrin-3B C17-methyltransferase  41.74 
 
 
242 aa  162  2e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.770841 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1869  precorrin-3B C17-methyltransferase  38.96 
 
 
320 aa  160  4e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.186861  normal  0.466196 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0200  precorrin-3B C17-methyltransferase  37.25 
 
 
250 aa  160  4e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17171  bifunctional cbiH protein and precorrin-3B C17-methyltransferase  37.55 
 
 
600 aa  160  4e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1374  precorrin-3B C17-methyltransferase  38.89 
 
 
258 aa  160  5e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0158588 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0124  precorrin-3B C17-methyltransferase  36.95 
 
 
481 aa  160  6e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3213  precorrin-3B C17-methyltransferase  40.16 
 
 
266 aa  160  6e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0760  precorrin-3B C17-methyltransferase  37.25 
 
 
250 aa  160  7e-38  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.920637  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0830  precorrin-3B C17-methyltransferase  34.01 
 
 
251 aa  159  8e-38  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0437244  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17291  bifunctional cbiH protein and precorrin-3B C17-methyltransferase  37.14 
 
 
600 aa  159  1e-37  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.792145  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0236  precorrin-3B C17-methyltransferase  34.82 
 
 
249 aa  158  2e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.717324  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4874  CbiG protein/precorrin-3B C17-methyltransferase  38 
 
 
567 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2014  precorrin-3B C17-methyltransferase  43.62 
 
 
253 aa  157  5.0000000000000005e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000268316  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1301  precorrin-6x reductase  40.69 
 
 
261 aa  156  6e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1617  precorrin-3 methyltransferase  37.4 
 
 
606 aa  156  8e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.481163  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1851  precorrin-3B C17-methyltransferase  46.73 
 
 
220 aa  155  1e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2824  precorrin-3 methyltransferase  42.62 
 
 
244 aa  155  1e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.162645  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1471  precorrin-3B C17-methyltransferase  42.21 
 
 
244 aa  155  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.56995  normal  0.553019 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2190  precorrin-3B C17-methyltransferase  46.02 
 
 
490 aa  155  2e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.501177  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4414  precorrin-3B C17-methyltransferase  37.05 
 
 
567 aa  155  2e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.472889 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0471  precorrin-3B methylase  40.93 
 
 
238 aa  155  2e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1571  precorrin-3B C17-methyltransferase  41.37 
 
 
571 aa  155  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0485556 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3181  precorrin-3 methyltransferase  41.84 
 
 
655 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4574  precorrin-6Y C5,15-methyltransferase (decarboxylating) / precorrin-3 methyltransferase  41.43 
 
 
551 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0213  precorrin-3 methylase/precorrin-8X methylmutase  35.15 
 
 
468 aa  154  4e-36  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1080  precorrin-3 methyltransferase  39.52 
 
 
253 aa  154  4e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1521  precorrin-3B C17-methyltransferase  41.8 
 
 
244 aa  154  4e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.582404  normal  0.0426872 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2863  precorrin-3 methyltransferase  37.6 
 
 
574 aa  154  5e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1896  precorrin-3B C17-methyltransferase  40 
 
 
572 aa  153  5.9999999999999996e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.392663  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16381  bifunctional cbiH protein and precorrin-3B C18-methyltransferace  38.68 
 
 
620 aa  153  5.9999999999999996e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>