More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0704 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_0704  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  100 
 
 
235 aa  466  9.999999999999999e-131  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0315  precorrin-3B C17-methyltransferase  43.75 
 
 
243 aa  194  9e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0629  precorrin-3B C17-methyltransferase  43.85 
 
 
266 aa  191  6e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1752  precorrin-3B C17-methyltransferase  37.55 
 
 
264 aa  191  7e-48  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0935  precorrin-3 methyltransferase  40.17 
 
 
238 aa  186  2e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0243766 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1428  precorrin-3B C17-methyltransferase  40 
 
 
240 aa  182  3e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0114869  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1300  precorrin-3B C17-methyltransferase  38.59 
 
 
253 aa  182  6e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2356  precorrin-3 methyltransferase  38.93 
 
 
267 aa  181  7e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0433914  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1234  precorrin-3B C17-methyltransferase  40 
 
 
240 aa  180  1e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0777573  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0623  precorrin-3B C17-methyltransferase  40.85 
 
 
240 aa  179  4e-44  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0224111  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1296  precorrin-3B C17-methyltransferase  39.67 
 
 
240 aa  177  1e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.021871 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3128  precorrin-3 methyltransferase  40.57 
 
 
423 aa  177  1e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2362  precorrin-3B C17-methyltransferase  38.27 
 
 
241 aa  176  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.860071  normal  0.738043 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2249  precorrin-3B C17-methyltransferase  37.34 
 
 
241 aa  177  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.209455 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2203  precorrin-3B C17-methyltransferase  38.27 
 
 
241 aa  176  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2196  precorrin-3B C17-methyltransferase  38.27 
 
 
241 aa  176  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2293  precorrin-3B C17-methyltransferase/conserved domain-containing protein  40.57 
 
 
458 aa  176  4e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.671445  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2149  precorrin-3B C17-methyltransferase  38.27 
 
 
241 aa  175  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.482473  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2767  precorrin-3 methyltransferase / precorrin-6Y C5,15-methyltransferase (decarboxylating)  38.52 
 
 
331 aa  174  9.999999999999999e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.545278  normal  0.0717753 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2709  precorrin-3B C17-methyltransferase  39.83 
 
 
236 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.424335  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0379  precorrin-3B C17-methyltransferase  39.34 
 
 
631 aa  173  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2616  precorrin-3B C17-methyltransferase  38.27 
 
 
596 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3628  precorrin-3B C17-methyltransferase  39.67 
 
 
623 aa  173  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2485  precorrin-3B C17-methyltransferase  39.67 
 
 
623 aa  173  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1226  precorrin-3B C17-methyltransferase  39.59 
 
 
260 aa  172  3.9999999999999995e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.627427  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0871  cobyric acid synthase CobQ  36.33 
 
 
777 aa  172  5e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.383971  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1015  precorrin-3B C17-methyltransferase  41.18 
 
 
240 aa  171  5.999999999999999e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1549  precorrin-3B C17-methyltransferase  38.93 
 
 
520 aa  171  1e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000121512  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2355  precorrin-3B C17-methyltransferase  34.31 
 
 
512 aa  170  1e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0146728  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1275  precorrin-3B C17-methyltransferase  40.42 
 
 
244 aa  169  4e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.158636  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1014  precorrin-3B C17-methyltransferase  39.75 
 
 
327 aa  168  5e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.4176  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0482  precorrin-3 C-17 methylase  37.3 
 
 
329 aa  166  2e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0447  precorrin-3 C-17 methylase  37.3 
 
 
329 aa  166  2e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.980014  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1675  precorrin-3B C17-methyltransferase  38.11 
 
 
629 aa  166  4e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1344  precorrin-3B C17-methyltransferase  39.18 
 
 
435 aa  166  4e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1714  precorrin-3 methyltransferase  36.93 
 
 
241 aa  165  5e-40  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3539  cobyric acid synthase CobQ  38.21 
 
 
776 aa  165  5.9999999999999996e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.714834  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2153  precorrin-3B C17-methyltransferase  38.93 
 
 
331 aa  162  3e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0918885 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1378  precorrin-3B C17-methyltransferase  36.25 
 
 
242 aa  162  5.0000000000000005e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3605  cobyric acid synthase CobQ  37.4 
 
 
772 aa  160  1e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0216  precorrin-3B C17-methyltransferase  34.02 
 
 
284 aa  159  3e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.546409  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1012  precorrin-3B C17-methyltransferase  32.92 
 
 
472 aa  157  2e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0077  precorrin-3B C17-methyltransferase  36.11 
 
 
329 aa  156  2e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1869  precorrin-3B C17-methyltransferase  31.84 
 
 
320 aa  155  6e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.186861  normal  0.466196 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3213  precorrin-3B C17-methyltransferase  38.21 
 
 
266 aa  154  1e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4366  precorrin-3 methyltransferase  37.19 
 
 
663 aa  154  1e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.216409 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1685  precorrin-3 methyltransferase  37.7 
 
 
326 aa  153  2e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.169686  normal  0.632291 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3744  precorrin-3B C17-methyltransferase  36.69 
 
 
328 aa  153  2e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3473  precorrin-3B C17-methyltransferase  31.84 
 
 
331 aa  153  2.9999999999999998e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0485  cobyric acid synthase CobQ:precorrin-3B C17-methyltransferase region  37.66 
 
 
797 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2500  precorrin-3B C17-methyltransferase  31.56 
 
 
263 aa  152  5e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17041  bifunctional cbiH protein and precorrin-3B C17-methyltransferase  38.27 
 
 
604 aa  152  5e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0936  precorrin-3B C17-methyltransferase  34.32 
 
 
236 aa  150  1e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1719  precorrin-3B C17-methyltransferase  34.43 
 
 
265 aa  150  2e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1525  precorrin-3B C17-methyltransferase  35.42 
 
 
245 aa  150  2e-35  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00108788 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1094  precorrin-3 methyltransferase  37.34 
 
 
241 aa  149  5e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21210  precorrin-4 C11-methyltransferase  33.2 
 
 
867 aa  148  9e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2636  precorrin-3B C17-methyltransferase  31.85 
 
 
612 aa  146  2.0000000000000003e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.168127  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0572  precorrin-3B C17-methyltransferase  34.55 
 
 
800 aa  146  3e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0760  precorrin-3B C17-methyltransferase  36.69 
 
 
250 aa  146  3e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.920637  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1290  precorrin-3B C17-methyltransferase  34.16 
 
 
469 aa  145  4.0000000000000006e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.954659  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1264  precorrin-3B C17-methyltransferase  37.14 
 
 
778 aa  145  4.0000000000000006e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0643  precorrin-3 methyltransferase  32.2 
 
 
561 aa  145  4.0000000000000006e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0184568  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1702  precorrin-3B C17-methyltransferase  37.1 
 
 
250 aa  145  6e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1589  precorrin-3B C17-methyltransferase  31.6 
 
 
577 aa  144  9e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.76858  normal  0.647382 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1997  precorrin-3B C17-methyltransferase region  33.33 
 
 
537 aa  144  1e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0124664  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1080  precorrin-3 methyltransferase  33.61 
 
 
253 aa  144  1e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6033  precorrin-3B C17-methyltransferase  33.33 
 
 
810 aa  143  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.038685  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0637  precorrin-3B C17-methyltransferase  35.37 
 
 
837 aa  144  2e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.647433 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1571  precorrin-3B C17-methyltransferase  31.2 
 
 
595 aa  143  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.53726  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0991  precorrin-3B C17-methyltransferase  31.02 
 
 
345 aa  143  2e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0144  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  36.44 
 
 
464 aa  142  5e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.856588  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0297  precorrin-3B C17-methyltransferase  34.3 
 
 
245 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.48516  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0618  bifunctional: precorrin-3 methyltransferase/precorrin-6X reductase oxidoreductase protein  32.07 
 
 
519 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.157389  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0041  cobyric acid synthase CobQ  36.67 
 
 
787 aa  139  3e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0802  precorrin-3B C17-methyltransferase  33.61 
 
 
547 aa  139  3e-32  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0804272  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0512  precorrin-3B C17-methyltransferase  30.56 
 
 
265 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.215708  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0200  precorrin-3B C17-methyltransferase  35.89 
 
 
250 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16381  bifunctional cbiH protein and precorrin-3B C18-methyltransferace  33.74 
 
 
620 aa  139  4.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4874  CbiG protein/precorrin-3B C17-methyltransferase  31.73 
 
 
567 aa  138  6e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0471  precorrin-3B methylase  35.15 
 
 
238 aa  138  6e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3146  precorrin-3B C17-methyltransferase  32.68 
 
 
572 aa  138  6e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.173567  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19561  bifunctional cbiH protein and precorrin-3B C17-methyltransferase  32.92 
 
 
593 aa  138  7e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4414  precorrin-3B C17-methyltransferase  31.73 
 
 
567 aa  138  7.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.472889 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2086  precorrin-3B C(17)-methyltransferase  34.68 
 
 
287 aa  138  7.999999999999999e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0118  precorrin-3B C17-methyltransferase  36.93 
 
 
250 aa  138  8.999999999999999e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1081  precorrin-3 methyltransferase  32.51 
 
 
593 aa  137  1e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0236  precorrin-3B C17-methyltransferase  36.29 
 
 
249 aa  137  1e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.717324  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4826  precorrin-3B C17-methyltransferase  31.33 
 
 
565 aa  136  2e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.595112 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0124  precorrin-3B C17-methyltransferase  33.6 
 
 
481 aa  136  2e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0213  precorrin-3 methylase/precorrin-8X methylmutase  31.95 
 
 
468 aa  135  4e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4616  precorrin-3B C17-methyltransferase  30.28 
 
 
563 aa  135  4e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.542511 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4475  precorrin-3B C17-methyltransferase  34.3 
 
 
451 aa  135  5e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.253543  normal  0.0484497 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1644  precorrin-3B C17-methyltransferase  31.2 
 
 
568 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.173043  normal  0.449752 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2524  precorrin-3 methyltransferase / precorrin-2 C20-methyltransferase / cobalt-factor II C20-methyltransferase  30.86 
 
 
495 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.564882  normal  0.0996134 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0830  precorrin-3B C17-methyltransferase  36.69 
 
 
251 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0437244  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0329  precorrin-3 methyltransferase  31.69 
 
 
579 aa  134  9.999999999999999e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.189951 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2487  precorrin-3 methyltransferase / precorrin-2 C20-methyltransferase / cobalt-factor II C20-methyltransferase  30.86 
 
 
495 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.710411  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1571  precorrin-3B C17-methyltransferase  31.2 
 
 
571 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0485556 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2532  cobalt-factor II C20-methyltransferase / precorrin-2 C20-methyltransferase / precorrin-3 methyltransferase  30.86 
 
 
495 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.735838  normal  0.502246 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>