195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0480 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_0480  precorrin isomerase, CbiC-like  100 
 
 		 225 aa  462  1e-129  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3654  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  68.52 
 
 		 228 aa  308  2.9999999999999997e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1858  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  56.16 
 
 		 541 aa  234  8e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2298  precorrin-8X methylmutase  52.06 
 
 		 219 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.191284  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2999  precorrin-8X methylmutase  44.98 
 
 		 213 aa  179  2e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.540254  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1553  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  46.11 
 
 		 215 aa  179  2.9999999999999997e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.160219  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3134  precorrin-8X methylmutase  46.41 
 
 		 217 aa  177  8e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.688258 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2613  Precorrin-8X methylmutase  45.6 
 
 		 215 aa  175  4e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1691  precorrin-8X methylmutase  45.12 
 
 		 225 aa  173  1.9999999999999998e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.188396 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0033  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  43.75 
 
 		 213 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1435  precorrin-8X methylmutase  41.83 
 
 		 209 aa  172  2.9999999999999996e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.170002  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1241  precorrin-8X methylmutase  41.83 
 
 		 209 aa  172  2.9999999999999996e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.189427  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2136  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  45.02 
 
 		 224 aa  171  1e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0350382 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2081  precorrin-8X methylmutase  44.93 
 
 		 218 aa  170  1e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0070  precorrin-8X methylmutase  48.98 
 
 		 239 aa  169  4e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.104216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0477  precorrin-8X methylmutase  43.13 
 
 		 214 aa  168  5e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1269  precorrin-8X methylmutase  42.44 
 
 		 214 aa  167  1e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0352716  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3739  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  47.62 
 
 		 226 aa  166  2e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2161  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  44.81 
 
 		 228 aa  163  2.0000000000000002e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.149955 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1298  precorrin-8X methylmutase  46.6 
 
 		 211 aa  161  8.000000000000001e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000022919  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2777  precorrin-8X methylmutase  43.87 
 
 		 224 aa  159  3e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.066759 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0342  precorrin-8X methylmutase  41.94 
 
 		 220 aa  158  5e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.470855  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0080  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  37.91 
 
 		 213 aa  156  2e-37  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.52758 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5060  precorrin-8X methylmutase  39.44 
 
 		 211 aa  156  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.341493 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3545  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  40.2 
 
 		 214 aa  156  3e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3611  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  39.72 
 
 		 216 aa  155  6e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1008  Precorrin-8X methylmutase  41.71 
 
 		 211 aa  154  1e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0440  precorrin-8X methylmutase, precorrin isomerase  46.89 
 
 		 225 aa  154  1e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.46496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0475  precorrin-8X methylmutase  46.89 
 
 		 225 aa  154  1e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1382  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  41.62 
 
 		 214 aa  154  1e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1022  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  43.87 
 
 		 229 aa  152  2.9999999999999998e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.535258  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0965  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  45.41 
 
 		 213 aa  151  8.999999999999999e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.519287  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0697  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  39.23 
 
 		 205 aa  150  2e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1298  Precorrin-8X methylmutase  34.88 
 
 		 207 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00456818 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1285  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  37.81 
 
 		 211 aa  145  5e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.808372  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0308  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  34.17 
 
 		 207 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0642  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  41.12 
 
 		 222 aa  139  3e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2706  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  40.2 
 
 		 207 aa  139  3e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0197172  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1269  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  39.27 
 
 		 219 aa  138  6e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1720  cobalt-precorrin-8X methylmutase  38.24 
 
 		 227 aa  138  6e-32  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1332  precorrin-8X methylmutase  33.81 
 
 		 212 aa  136  2e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0538013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0027  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  39.81 
 
 		 230 aa  137  2e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.615155  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2355  precorrin-8X methylmutase  38.8 
 
 		 249 aa  137  2e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000155393  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0927  Precorrin-8X methylmutase  40 
 
 		 204 aa  136  3.0000000000000003e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000290763 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0567  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  42.18 
 
 		 222 aa  136  3.0000000000000003e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1303  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  36.99 
 
 		 212 aa  134  9e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1287  precorrin-8X methylmutase  40.38 
 
 		 203 aa  134  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.01573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1349  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  42.86 
 
 		 222 aa  131  7.999999999999999e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7175  precorrin-8X methylmutase  37.5 
 
 		 210 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.894546  normal  0.0915035 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0621  precorrin-8X methylmutase  33.33 
 
 		 210 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.517297  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21130  precorrin-8X methylmutase  41.04 
 
 		 219 aa  130  1.0000000000000001e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4475  precorrin-3B C17-methyltransferase  37.5 
 
 		 451 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.253543  normal  0.0484497 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1477  precorrin-8X methylmutase  34.72 
 
 		 201 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1888  precorrin-8X methylmutase  40.1 
 
 		 209 aa  129  3e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5850  precorrin-8X methylmutase  39.6 
 
 		 209 aa  128  6e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.917792 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3509  precorrin-8X methylmutase  36.82 
 
 		 209 aa  128  6e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.400984  normal  0.540092 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1343  precorrin-8X methylmutase  32.38 
 
 		 212 aa  128  6e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.212659  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2253  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  39.91 
 
 		 245 aa  128  9.000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2555  precorrin-8X methylmutase  35.68 
 
 		 207 aa  127  2.0000000000000002e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03744  putative transmembrane protein  38.19 
 
 		 534 aa  125  4.0000000000000003e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.937216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6020  precorrin-8X methylmutase  35.47 
 
 		 210 aa  125  5e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00161417  normal  0.19604 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1504  precorrin-8X methylmutase  36.74 
 
 		 200 aa  125  6e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1341  precorrin-8X methylmutase  30.95 
 
 		 210 aa  125  7e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17660  precorrin-8X methylmutase  35.89 
 
 		 221 aa  124  1e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0262485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0292  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  41.95 
 
 		 213 aa  124  2e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.599912 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0152  Precorrin-8X methylmutase  37.17 
 
 		 215 aa  124  2e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1250  precorrin-8X methylmutase  35.64 
 
 		 208 aa  121  8e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0554951  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2817  precorrin-8X methylmutase  34.78 
 
 		 210 aa  121  9e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.603033 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0630  precorrin-8X methylmutase  35.82 
 
 		 245 aa  121  9.999999999999999e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.872392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5593  Precorrin-8X methylmutase  34.16 
 
 		 208 aa  120  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.179804  normal  0.278794 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1852  precorrin-8X methylmutase  36.27 
 
 		 209 aa  120  1.9999999999999998e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.334862  normal  0.809538 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2360  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  37.86 
 
 		 520 aa  120  1.9999999999999998e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1287  precorrin-8X methylmutase  35.15 
 
 		 208 aa  119  3e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1782  Precorrin-8X methylmutase  34.65 
 
 		 208 aa  119  3.9999999999999996e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.140584  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1898  precorrin-8X methylmutase  35.64 
 
 		 208 aa  118  6e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.171358  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2929  precorrin-8X methylmutase  35.75 
 
 		 209 aa  118  6e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.451647  hitchhiker  0.00280569 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1097  precorrin-8X methylmutase  32.7 
 
 		 210 aa  118  9e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2212  precorrin-8X methylmutase  37.13 
 
 		 209 aa  117  9.999999999999999e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0015  precorrin-8X methylmutase  29.52 
 
 		 212 aa  117  9.999999999999999e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4876  precorrin-8X methylmutase  35.64 
 
 		 208 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4416  precorrin-8X methylmutase  35.64 
 
 		 208 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.416711 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0317  precorrin-8X methylmutase  35.32 
 
 		 224 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3376  precorrin-8X methylmutase  35.89 
 
 		 221 aa  117  1.9999999999999998e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.218633 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2534  precorrin-8X methylmutase  36.63 
 
 		 209 aa  115  5e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.474036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3214  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  39.52 
 
 		 211 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0575  Precorrin-8X methylmutase  33 
 
 		 206 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.204948  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1290  precorrin-3B C17-methyltransferase  37.57 
 
 		 469 aa  114  1.0000000000000001e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.954659  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2991  precorrin-8X methylmutase  36.36 
 
 		 208 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3178  precorrin-8X methylmutase  33.99 
 
 		 209 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.333659  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1244  precorrin-8X methylmutase  35.68 
 
 		 208 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0926514  normal  0.29626 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1591  precorrin-8X methylmutase  35.68 
 
 		 208 aa  112  3e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.257981 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1573  precorrin-8X methylmutase  35.68 
 
 		 208 aa  113  3e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.377269  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2893  precorrin-8X methylmutase  31.82 
 
 		 220 aa  112  5e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3144  precorrin-8X methylmutase  34.83 
 
 		 212 aa  112  5e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1670  precorrin-8X methylmutase  34.2 
 
 		 209 aa  111  8.000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.793368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4572  precorrin-8X methylmutase  34.93 
 
 		 208 aa  111  9e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6217  precorrin-8X methylmutase  37.62 
 
 		 209 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0665101  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1646  precorrin-8X methylmutase  35.18 
 
 		 208 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.996028  normal  0.344579 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1193  precorrin-8X methylmutase  35.18 
 
 		 208 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0208289  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1673  precorrin-8X methylmutase  35.18 
 
 		 208 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0355413  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>