195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3545 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3545  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  100 
 
 		 214 aa  438  9.999999999999999e-123  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3611  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  96.71 
 
 		 216 aa  422  1e-117  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0477  precorrin-8X methylmutase  70.89 
 
 		 214 aa  308  5.9999999999999995e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2999  precorrin-8X methylmutase  70 
 
 		 213 aa  300  1e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.540254  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0033  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  66.35 
 
 		 213 aa  297  9e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1269  precorrin-8X methylmutase  59.33 
 
 		 214 aa  247  9e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0352716  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1298  precorrin-8X methylmutase  62.05 
 
 		 211 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000022919  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0080  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  48.11 
 
 		 213 aa  196  3e-49  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.52758 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2613  Precorrin-8X methylmutase  49.48 
 
 		 215 aa  195  4.0000000000000005e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1553  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  47.96 
 
 		 215 aa  194  1e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.160219  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1435  precorrin-8X methylmutase  48.79 
 
 		 209 aa  191  6e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.170002  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1241  precorrin-8X methylmutase  48.79 
 
 		 209 aa  191  6e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.189427  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0308  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  45.89 
 
 		 207 aa  188  5e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1008  Precorrin-8X methylmutase  46.92 
 
 		 211 aa  186  2e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1285  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  45.15 
 
 		 211 aa  178  7e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.808372  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2081  precorrin-8X methylmutase  43.26 
 
 		 218 aa  174  6e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2136  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  48.74 
 
 		 224 aa  171  5e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0350382 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1691  precorrin-8X methylmutase  46.6 
 
 		 225 aa  170  2e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.188396 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1298  Precorrin-8X methylmutase  41.26 
 
 		 207 aa  169  4e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00456818 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1382  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  42.38 
 
 		 214 aa  168  4e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3739  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  46.12 
 
 		 226 aa  167  1e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0070  precorrin-8X methylmutase  47.67 
 
 		 239 aa  167  1e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.104216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0965  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  46.63 
 
 		 213 aa  164  6.9999999999999995e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.519287  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1720  cobalt-precorrin-8X methylmutase  42.72 
 
 		 227 aa  163  2.0000000000000002e-39  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0697  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  43.96 
 
 		 205 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2161  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  45.15 
 
 		 228 aa  159  2e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.149955 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21130  precorrin-8X methylmutase  45.41 
 
 		 219 aa  159  4e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2298  precorrin-8X methylmutase  45.55 
 
 		 219 aa  158  6e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.191284  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03744  putative transmembrane protein  44.71 
 
 		 534 aa  156  2e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.937216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0480  precorrin isomerase, CbiC-like  40.2 
 
 		 225 aa  156  3e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2777  precorrin-8X methylmutase  44.23 
 
 		 224 aa  156  3e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.066759 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3134  precorrin-8X methylmutase  43.07 
 
 		 217 aa  154  9e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.688258 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1303  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  41.67 
 
 		 212 aa  154  1e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0213  precorrin-3 methylase/precorrin-8X methylmutase  45.32 
 
 		 468 aa  151  8e-36  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1858  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  43.35 
 
 		 541 aa  151  8e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1022  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  44.66 
 
 		 229 aa  151  8.999999999999999e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.535258  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2555  precorrin-8X methylmutase  41.26 
 
 		 207 aa  150  2e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2360  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  40.09 
 
 		 520 aa  150  2e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3654  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  43.14 
 
 		 228 aa  150  2e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0440  precorrin-8X methylmutase, precorrin isomerase  42.11 
 
 		 225 aa  143  2e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.46496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0475  precorrin-8X methylmutase  42.11 
 
 		 225 aa  143  2e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2706  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  42.08 
 
 		 207 aa  143  2e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0197172  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0342  precorrin-8X methylmutase  40.67 
 
 		 220 aa  142  4e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.470855  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4475  precorrin-3B C17-methyltransferase  40.4 
 
 		 451 aa  140  9.999999999999999e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.253543  normal  0.0484497 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0027  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  40.3 
 
 		 230 aa  137  1e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.615155  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1269  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  42.16 
 
 		 219 aa  135  3.0000000000000003e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2253  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  41.26 
 
 		 245 aa  135  4e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5060  precorrin-8X methylmutase  37.88 
 
 		 211 aa  135  6.0000000000000005e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.341493 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2255  cobalt-precorrin-8X methylmutase  43.26 
 
 		 210 aa  134  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.463985 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2155  cobalt-precorrin-8X methylmutase  43.26 
 
 		 210 aa  134  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0642  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  41.75 
 
 		 222 aa  134  9.999999999999999e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2202  cobalt-precorrin-8X methylmutase  43.26 
 
 		 210 aa  134  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1290  precorrin-3B C17-methyltransferase  40.49 
 
 		 469 aa  134  1.9999999999999998e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.954659  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2368  cobalt-precorrin-8X methylmutase  42.79 
 
 		 210 aa  132  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2209  cobalt-precorrin-8X methylmutase  42.79 
 
 		 210 aa  132  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.185251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0567  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  40.2 
 
 		 222 aa  131  7.999999999999999e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0927  Precorrin-8X methylmutase  39.9 
 
 		 204 aa  130  1.0000000000000001e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000290763 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1477  precorrin-8X methylmutase  36.32 
 
 		 201 aa  130  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1097  precorrin-8X methylmutase  39.8 
 
 		 210 aa  128  6e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0292  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  42.44 
 
 		 213 aa  128  6e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.599912 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1341  precorrin-8X methylmutase  34.5 
 
 		 210 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1012  precorrin-3B C17-methyltransferase  39.71 
 
 		 472 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17660  precorrin-8X methylmutase  39.22 
 
 		 221 aa  126  2.0000000000000002e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0262485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1504  precorrin-8X methylmutase  35.38 
 
 		 200 aa  126  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1287  precorrin-8X methylmutase  36.45 
 
 		 203 aa  125  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.01573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1349  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  39.38 
 
 		 222 aa  124  1e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0645  precorrin-8X methylmutase  39.06 
 
 		 199 aa  122  3e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000995367  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0015  precorrin-8X methylmutase  35.96 
 
 		 212 aa  122  3e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3376  precorrin-8X methylmutase  37.81 
 
 		 221 aa  119  3e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.218633 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1332  precorrin-8X methylmutase  37.63 
 
 		 212 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0538013  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3117  precorrin-8X methylmutase  37.62 
 
 		 230 aa  118  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1343  precorrin-8X methylmutase  35.42 
 
 		 212 aa  118  4.9999999999999996e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.212659  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0621  precorrin-8X methylmutase  35.94 
 
 		 210 aa  118  7e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.517297  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6032  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  42.02 
 
 		 209 aa  114  6.9999999999999995e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.343031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2817  precorrin-8X methylmutase  37.06 
 
 		 210 aa  114  7.999999999999999e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.603033 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2893  precorrin-8X methylmutase  35.78 
 
 		 220 aa  113  2.0000000000000002e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0317  precorrin-8X methylmutase  36.14 
 
 		 224 aa  112  3e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1852  precorrin-8X methylmutase  37.23 
 
 		 209 aa  112  3e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.334862  normal  0.809538 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1250  precorrin-8X methylmutase  37.25 
 
 		 208 aa  112  4.0000000000000004e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0554951  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3509  precorrin-8X methylmutase  36.87 
 
 		 209 aa  112  5e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.400984  normal  0.540092 
 
 
-
 
NC_004310  BR1287  precorrin-8X methylmutase  36.76 
 
 		 208 aa  110  2.0000000000000002e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3178  precorrin-8X methylmutase  36.59 
 
 		 209 aa  108  5e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.333659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2534  precorrin-8X methylmutase  35.47 
 
 		 209 aa  106  3e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.474036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3745  precorrin-8X methylmutase  34.5 
 
 		 208 aa  104  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.106474 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5593  Precorrin-8X methylmutase  35.35 
 
 		 208 aa  104  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.179804  normal  0.278794 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0152  Precorrin-8X methylmutase  36.9 
 
 		 215 aa  104  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1898  precorrin-8X methylmutase  35.29 
 
 		 208 aa  103  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.171358  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1670  precorrin-8X methylmutase  36.51 
 
 		 209 aa  103  3e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.793368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1573  precorrin-8X methylmutase  36.76 
 
 		 208 aa  103  3e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.377269  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4876  precorrin-8X methylmutase  35.78 
 
 		 208 aa  102  4e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6020  precorrin-8X methylmutase  34.67 
 
 		 210 aa  102  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00161417  normal  0.19604 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2320  precorrin-8X methylmutase  36.89 
 
 		 209 aa  102  4e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.415646  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4416  precorrin-8X methylmutase  35.78 
 
 		 208 aa  102  5e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.416711 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1712  Precorrin-8X methylmutase  38.12 
 
 		 210 aa  101  9e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.61701  hitchhiker  0.00790463 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4884  precorrin-8X methylmutase  38.1 
 
 		 208 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2440  precorrin-8X methylmutase  37.57 
 
 		 210 aa  100  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.341213  normal  0.0714057 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4618  precorrin-8X methylmutase  38.1 
 
 		 208 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.427711 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1434  Precorrin-8X methylmutase  37.62 
 
 		 210 aa  100  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.656935  normal  0.667092 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4828  precorrin-8X methylmutase  38.1 
 
 		 208 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.111052  normal  0.504707 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1319  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  39.29 
 
 		 217 aa  99.8  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0427832  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>