194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_2161 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_2161  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  100 
 
 		 228 aa  454  1e-127  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.149955 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2777  precorrin-8X methylmutase  90.58 
 
 		 224 aa  406  1.0000000000000001e-112  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.066759 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1022  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  87.73 
 
 		 229 aa  372  1e-102  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.535258  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3739  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  84.33 
 
 		 226 aa  369  1e-101  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0440  precorrin-8X methylmutase, precorrin isomerase  82.81 
 
 		 225 aa  345  3e-94  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.46496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0475  precorrin-8X methylmutase  82.81 
 
 		 225 aa  345  3e-94  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1691  precorrin-8X methylmutase  76.71 
 
 		 225 aa  344  8e-94  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.188396 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0070  precorrin-8X methylmutase  81.37 
 
 		 239 aa  338  5e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.104216  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2298  precorrin-8X methylmutase  69.5 
 
 		 219 aa  279  3e-74  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.191284  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3134  precorrin-8X methylmutase  62.09 
 
 		 217 aa  262  3e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.688258 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2081  precorrin-8X methylmutase  50.48 
 
 		 218 aa  211  4.9999999999999996e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1349  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  54.33 
 
 		 222 aa  205  6e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0477  precorrin-8X methylmutase  52.17 
 
 		 214 aa  190  2e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1553  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  52.79 
 
 		 215 aa  189  4e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.160219  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2613  Precorrin-8X methylmutase  52.04 
 
 		 215 aa  187  1e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2136  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  49.28 
 
 		 224 aa  185  5e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0350382 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2999  precorrin-8X methylmutase  47.57 
 
 		 213 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.540254  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1269  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  47 
 
 		 219 aa  169  3e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0567  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  49.29 
 
 		 222 aa  169  3e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0033  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  46.34 
 
 		 213 aa  169  4e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0642  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  48.11 
 
 		 222 aa  165  5.9999999999999996e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3654  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  46.98 
 
 		 228 aa  164  9e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0480  precorrin isomerase, CbiC-like  44.81 
 
 		 225 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0080  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  40.76 
 
 		 213 aa  161  8.000000000000001e-39  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.52758 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3611  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  45.89 
 
 		 216 aa  161  9e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0342  precorrin-8X methylmutase  44.76 
 
 		 220 aa  160  2e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.470855  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3545  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  45.15 
 
 		 214 aa  159  3e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0965  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  46.34 
 
 		 213 aa  149  3e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.519287  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1008  Precorrin-8X methylmutase  40.7 
 
 		 211 aa  149  3e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1298  precorrin-8X methylmutase  45.45 
 
 		 211 aa  148  6e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000022919  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1269  precorrin-8X methylmutase  45.27 
 
 		 214 aa  143  2e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0352716  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1298  Precorrin-8X methylmutase  41.87 
 
 		 207 aa  143  2e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00456818 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1285  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  39 
 
 		 211 aa  139  1.9999999999999998e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.808372  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1382  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  39.11 
 
 		 214 aa  140  1.9999999999999998e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1303  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  40.09 
 
 		 212 aa  139  3e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0697  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  38.92 
 
 		 205 aa  135  4e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2706  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  42 
 
 		 207 aa  135  6.0000000000000005e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0197172  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0292  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  45.07 
 
 		 213 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.599912 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1097  precorrin-8X methylmutase  45.67 
 
 		 210 aa  134  1.9999999999999998e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1858  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  40.51 
 
 		 541 aa  134  1.9999999999999998e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1332  precorrin-8X methylmutase  39.36 
 
 		 212 aa  128  6e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0538013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1477  precorrin-8X methylmutase  40 
 
 		 201 aa  128  8.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03744  putative transmembrane protein  38.89 
 
 		 534 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.937216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1435  precorrin-8X methylmutase  36.04 
 
 		 209 aa  125  6e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.170002  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1241  precorrin-8X methylmutase  36.04 
 
 		 209 aa  125  6e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.189427  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0015  precorrin-8X methylmutase  37.37 
 
 		 212 aa  125  6e-28  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1504  precorrin-8X methylmutase  39.41 
 
 		 200 aa  125  7e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0621  precorrin-8X methylmutase  39.36 
 
 		 210 aa  125  7e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.517297  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2253  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  43.66 
 
 		 245 aa  124  9e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1343  precorrin-8X methylmutase  38.83 
 
 		 212 aa  124  9e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.212659  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0308  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  36.18 
 
 		 207 aa  123  3e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5060  precorrin-8X methylmutase  34.74 
 
 		 211 aa  119  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.341493 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21130  precorrin-8X methylmutase  40.89 
 
 		 219 aa  119  4.9999999999999996e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2893  precorrin-8X methylmutase  40.38 
 
 		 220 aa  117  9.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3117  precorrin-8X methylmutase  40.2 
 
 		 230 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2320  precorrin-8X methylmutase  39.41 
 
 		 209 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.415646  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17660  precorrin-8X methylmutase  39.81 
 
 		 221 aa  113  3e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0262485  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1287  precorrin-8X methylmutase  40.89 
 
 		 208 aa  112  5e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1341  precorrin-8X methylmutase  32.68 
 
 		 210 aa  112  5e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1469  precorrin-8X methylmutase  39.22 
 
 		 209 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1519  precorrin-8X methylmutase  39.71 
 
 		 209 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.197163  normal  0.023292 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1250  precorrin-8X methylmutase  40.39 
 
 		 208 aa  110  1.0000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0554951  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6217  precorrin-8X methylmutase  38.73 
 
 		 209 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0665101  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6020  precorrin-8X methylmutase  40.89 
 
 		 210 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00161417  normal  0.19604 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7175  precorrin-8X methylmutase  41.98 
 
 		 210 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.894546  normal  0.0915035 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2817  precorrin-8X methylmutase  38.12 
 
 		 210 aa  109  4.0000000000000004e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.603033 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1290  precorrin-3B C17-methyltransferase  37.04 
 
 		 469 aa  108  5e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.954659  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1287  precorrin-8X methylmutase  36 
 
 		 203 aa  109  5e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.01573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5850  precorrin-8X methylmutase  38.05 
 
 		 209 aa  108  9.000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.917792 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0927  Precorrin-8X methylmutase  39.3 
 
 		 204 aa  107  2e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000290763 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4475  precorrin-3B C17-methyltransferase  34.63 
 
 		 451 aa  107  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.253543  normal  0.0484497 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1720  cobalt-precorrin-8X methylmutase  34.85 
 
 		 227 aa  106  2e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4572  precorrin-8X methylmutase  38.42 
 
 		 208 aa  106  3e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3376  precorrin-8X methylmutase  34.16 
 
 		 221 aa  105  4e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.218633 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3178  precorrin-8X methylmutase  38.42 
 
 		 209 aa  105  5e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.333659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1898  precorrin-8X methylmutase  38.42 
 
 		 208 aa  105  6e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.171358  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2555  precorrin-8X methylmutase  32.35 
 
 		 207 aa  105  8e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0027  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  35.21 
 
 		 230 aa  104  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.615155  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0317  precorrin-8X methylmutase  38.66 
 
 		 224 aa  103  2e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2929  precorrin-8X methylmutase  37.98 
 
 		 209 aa  103  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.451647  hitchhiker  0.00280569 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3509  precorrin-8X methylmutase  35.78 
 
 		 209 aa  103  3e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.400984  normal  0.540092 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2212  precorrin-8X methylmutase  37.02 
 
 		 209 aa  102  3e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0340  precorrin-8X methylmutase  38.54 
 
 		 209 aa  101  7e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0152  Precorrin-8X methylmutase  36.45 
 
 		 215 aa  101  8e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2360  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  35.35 
 
 		 520 aa  100  1e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3745  precorrin-8X methylmutase  34.34 
 
 		 208 aa  101  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.106474 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1625  Precorrin-8X methylmutase  38.24 
 
 		 221 aa  100  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.72148  normal  0.823307 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2991  precorrin-8X methylmutase  38.81 
 
 		 208 aa  100  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2380  precorrin-8X methylmutase  37.93 
 
 		 209 aa  99.8  3e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2440  precorrin-8X methylmutase  38.62 
 
 		 210 aa  99.8  4e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.341213  normal  0.0714057 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4876  precorrin-8X methylmutase  36.1 
 
 		 208 aa  99  5e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4416  precorrin-8X methylmutase  36.1 
 
 		 208 aa  99  5e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.416711 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3146  precorrin-8X methylmutase  34.93 
 
 		 210 aa  99  6e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.757727  normal  0.930234 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1012  precorrin-3B C17-methyltransferase  36.41 
 
 		 472 aa  98.2  8e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1434  Precorrin-8X methylmutase  38.46 
 
 		 210 aa  98.2  9e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.656935  normal  0.667092 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1782  Precorrin-8X methylmutase  38.81 
 
 		 208 aa  97.8  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.140584  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1712  Precorrin-8X methylmutase  38.54 
 
 		 210 aa  97.8  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.61701  hitchhiker  0.00790463 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1437  precorrin-8X methylmutase  38.05 
 
 		 210 aa  97.1  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.226548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3284  precorrin-8X methylmutase  36.95 
 
 		 211 aa  96.7  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.174863  normal  0.987458 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2534  precorrin-8X methylmutase  35.71 
 
 		 209 aa  94  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.474036  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>