194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1022 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_1022  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  100 
 
 		 229 aa  456  1e-127  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.535258  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2161  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  87.73 
 
 		 228 aa  390  1e-107  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.149955 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2777  precorrin-8X methylmutase  86.94 
 
 		 224 aa  385  1e-106  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.066759 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3739  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  82.27 
 
 		 226 aa  362  2e-99  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0440  precorrin-8X methylmutase, precorrin isomerase  83.41 
 
 		 225 aa  344  5e-94  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.46496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0475  precorrin-8X methylmutase  83.41 
 
 		 225 aa  344  5e-94  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1691  precorrin-8X methylmutase  74.09 
 
 		 225 aa  335  3.9999999999999995e-91  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.188396 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0070  precorrin-8X methylmutase  80.5 
 
 		 239 aa  327  1.0000000000000001e-88  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.104216  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2298  precorrin-8X methylmutase  72 
 
 		 219 aa  286  2e-76  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.191284  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3134  precorrin-8X methylmutase  63.85 
 
 		 217 aa  265  5e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.688258 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2081  precorrin-8X methylmutase  50.95 
 
 		 218 aa  217  1e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1349  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  55.45 
 
 		 222 aa  198  5e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0477  precorrin-8X methylmutase  52.17 
 
 		 214 aa  192  5e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1553  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  52.02 
 
 		 215 aa  190  1e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.160219  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2613  Precorrin-8X methylmutase  52.36 
 
 		 215 aa  186  2e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2136  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  49.28 
 
 		 224 aa  184  7e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0350382 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2999  precorrin-8X methylmutase  50 
 
 		 213 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.540254  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0033  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  46.83 
 
 		 213 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0480  precorrin isomerase, CbiC-like  46.23 
 
 		 225 aa  164  9e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0567  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  47.25 
 
 		 222 aa  163  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1269  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  44.95 
 
 		 219 aa  161  9e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3545  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  44.66 
 
 		 214 aa  160  1e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0080  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  40.28 
 
 		 213 aa  161  1e-38  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.52758 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0642  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  46.12 
 
 		 222 aa  159  3e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3611  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  45.15 
 
 		 216 aa  159  4e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3654  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  47.57 
 
 		 228 aa  159  5e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0342  precorrin-8X methylmutase  43.41 
 
 		 220 aa  153  2e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.470855  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1298  precorrin-8X methylmutase  46.52 
 
 		 211 aa  149  3e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000022919  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0965  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  45.37 
 
 		 213 aa  149  4e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.519287  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1008  Precorrin-8X methylmutase  39.81 
 
 		 211 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1269  precorrin-8X methylmutase  44.78 
 
 		 214 aa  145  5e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0352716  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1303  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  42.18 
 
 		 212 aa  142  5e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1298  Precorrin-8X methylmutase  39.41 
 
 		 207 aa  140  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00456818 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1285  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  38.42 
 
 		 211 aa  140  9.999999999999999e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.808372  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1382  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  39.11 
 
 		 214 aa  140  1.9999999999999998e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0292  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  48.51 
 
 		 213 aa  136  2e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.599912 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1858  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  41.54 
 
 		 541 aa  135  4e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1097  precorrin-8X methylmutase  44.61 
 
 		 210 aa  129  4.0000000000000003e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0697  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  37.31 
 
 		 205 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03744  putative transmembrane protein  39.9 
 
 		 534 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.937216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2706  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  40.5 
 
 		 207 aa  125  6e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0197172  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1477  precorrin-8X methylmutase  37.93 
 
 		 201 aa  124  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1435  precorrin-8X methylmutase  35.12 
 
 		 209 aa  122  5e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.170002  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1241  precorrin-8X methylmutase  35.12 
 
 		 209 aa  122  5e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.189427  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2253  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  41.98 
 
 		 245 aa  121  8e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1332  precorrin-8X methylmutase  36.96 
 
 		 212 aa  120  9.999999999999999e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0538013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0015  precorrin-8X methylmutase  37.1 
 
 		 212 aa  119  3e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1504  precorrin-8X methylmutase  37.44 
 
 		 200 aa  119  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2893  precorrin-8X methylmutase  40.2 
 
 		 220 aa  119  4.9999999999999996e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17660  precorrin-8X methylmutase  41.75 
 
 		 221 aa  118  6e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0262485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0621  precorrin-8X methylmutase  37.16 
 
 		 210 aa  117  9.999999999999999e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.517297  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1343  precorrin-8X methylmutase  37.5 
 
 		 212 aa  116  3e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.212659  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5060  precorrin-8X methylmutase  34.12 
 
 		 211 aa  116  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.341493 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6020  precorrin-8X methylmutase  40.1 
 
 		 210 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00161417  normal  0.19604 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0308  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  33.17 
 
 		 207 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2320  precorrin-8X methylmutase  38.73 
 
 		 209 aa  113  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.415646  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1287  precorrin-8X methylmutase  37.81 
 
 		 203 aa  113  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.01573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21130  precorrin-8X methylmutase  38.92 
 
 		 219 aa  112  5e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2817  precorrin-8X methylmutase  37.81 
 
 		 210 aa  110  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.603033 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3117  precorrin-8X methylmutase  38.31 
 
 		 230 aa  109  3e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0317  precorrin-8X methylmutase  39.18 
 
 		 224 aa  107  1e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7175  precorrin-8X methylmutase  39.51 
 
 		 210 aa  107  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.894546  normal  0.0915035 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1341  precorrin-8X methylmutase  31.34 
 
 		 210 aa  107  1e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3178  precorrin-8X methylmutase  39.22 
 
 		 209 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.333659  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1287  precorrin-8X methylmutase  39 
 
 		 208 aa  106  3e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1782  Precorrin-8X methylmutase  40.8 
 
 		 208 aa  106  3e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.140584  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1720  cobalt-precorrin-8X methylmutase  36.87 
 
 		 227 aa  106  3e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2555  precorrin-8X methylmutase  32.35 
 
 		 207 aa  105  8e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1250  precorrin-8X methylmutase  38.5 
 
 		 208 aa  105  8e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0554951  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1290  precorrin-3B C17-methyltransferase  34.12 
 
 		 469 aa  104  1e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.954659  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2380  precorrin-8X methylmutase  38.42 
 
 		 209 aa  104  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4475  precorrin-3B C17-methyltransferase  34.15 
 
 		 451 aa  103  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.253543  normal  0.0484497 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1519  precorrin-8X methylmutase  38.42 
 
 		 209 aa  103  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.197163  normal  0.023292 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3376  precorrin-8X methylmutase  34.65 
 
 		 221 aa  102  4e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.218633 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2440  precorrin-8X methylmutase  39.68 
 
 		 210 aa  102  4e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.341213  normal  0.0714057 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5850  precorrin-8X methylmutase  38.24 
 
 		 209 aa  102  5e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.917792 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4572  precorrin-8X methylmutase  37.44 
 
 		 208 aa  102  5e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2212  precorrin-8X methylmutase  38.28 
 
 		 209 aa  102  6e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0340  precorrin-8X methylmutase  38.54 
 
 		 209 aa  102  7e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1898  precorrin-8X methylmutase  37.44 
 
 		 208 aa  101  8e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.171358  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1469  precorrin-8X methylmutase  36.63 
 
 		 209 aa  101  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3284  precorrin-8X methylmutase  39.41 
 
 		 211 aa  100  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.174863  normal  0.987458 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0927  Precorrin-8X methylmutase  38.31 
 
 		 204 aa  100  2e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000290763 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0027  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  33.98 
 
 		 230 aa  100  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.615155  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6217  precorrin-8X methylmutase  36.14 
 
 		 209 aa  100  2e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0665101  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1625  Precorrin-8X methylmutase  38.73 
 
 		 221 aa  99.4  4e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.72148  normal  0.823307 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3509  precorrin-8X methylmutase  35.47 
 
 		 209 aa  99.4  4e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.400984  normal  0.540092 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2534  precorrin-8X methylmutase  39.23 
 
 		 209 aa  99  5e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.474036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5593  Precorrin-8X methylmutase  37 
 
 		 208 aa  98.6  7e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.179804  normal  0.278794 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1712  Precorrin-8X methylmutase  38.05 
 
 		 210 aa  97.8  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.61701  hitchhiker  0.00790463 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1434  Precorrin-8X methylmutase  37.5 
 
 		 210 aa  97.8  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.656935  normal  0.667092 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2929  precorrin-8X methylmutase  37.38 
 
 		 209 aa  98.2  1e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.451647  hitchhiker  0.00280569 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1437  precorrin-8X methylmutase  37.56 
 
 		 210 aa  97.1  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.226548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3146  precorrin-8X methylmutase  33.97 
 
 		 210 aa  97.1  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.757727  normal  0.930234 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0152  Precorrin-8X methylmutase  37.31 
 
 		 215 aa  96.3  3e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2991  precorrin-8X methylmutase  37.5 
 
 		 208 aa  95.5  6e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0213  precorrin-3 methylase/precorrin-8X methylmutase  32.21 
 
 		 468 aa  95.1  8e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2399  precorrin-8X methylmutase  36.71 
 
 		 208 aa  95.1  8e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.154427  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0055  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  33.99 
 
 		 208 aa  95.1  9e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2151  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  39.15 
 
 		 210 aa  94.4  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0108715  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>