195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0965 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_0965  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  100 
 
 		 213 aa  427  1e-119  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.519287  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0342  precorrin-8X methylmutase  57.56 
 
 		 220 aa  241  5e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.470855  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0292  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  55.67 
 
 		 213 aa  197  1.0000000000000001e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.599912 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0027  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  50.48 
 
 		 230 aa  194  6e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.615155  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2253  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  51.83 
 
 		 245 aa  194  1e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2999  precorrin-8X methylmutase  51.17 
 
 		 213 aa  188  5e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.540254  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0033  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  49.3 
 
 		 213 aa  186  3e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0477  precorrin-8X methylmutase  52.8 
 
 		 214 aa  184  7e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1435  precorrin-8X methylmutase  48.76 
 
 		 209 aa  174  7e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.170002  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1241  precorrin-8X methylmutase  48.76 
 
 		 209 aa  174  7e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.189427  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2555  precorrin-8X methylmutase  45.71 
 
 		 207 aa  174  9.999999999999999e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1298  Precorrin-8X methylmutase  44.88 
 
 		 207 aa  172  2.9999999999999996e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00456818 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1269  precorrin-8X methylmutase  50 
 
 		 214 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0352716  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0697  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  42.16 
 
 		 205 aa  171  1e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3611  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  46.51 
 
 		 216 aa  170  2e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3545  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  46.63 
 
 		 214 aa  164  6.9999999999999995e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0308  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  42.72 
 
 		 207 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3134  precorrin-8X methylmutase  46.77 
 
 		 217 aa  162  2.0000000000000002e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.688258 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1298  precorrin-8X methylmutase  49.48 
 
 		 211 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000022919  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1269  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  47.2 
 
 		 219 aa  163  2.0000000000000002e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3739  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  48.78 
 
 		 226 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1008  Precorrin-8X methylmutase  41.83 
 
 		 211 aa  160  1e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2081  precorrin-8X methylmutase  44.28 
 
 		 218 aa  159  3e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2613  Precorrin-8X methylmutase  45.55 
 
 		 215 aa  158  4e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1553  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  43.81 
 
 		 215 aa  158  6e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.160219  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1382  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  43.27 
 
 		 214 aa  156  2e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1720  cobalt-precorrin-8X methylmutase  43.48 
 
 		 227 aa  156  2e-37  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1349  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  45.45 
 
 		 222 aa  154  7e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1285  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  43.28 
 
 		 211 aa  153  1e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.808372  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2777  precorrin-8X methylmutase  45.37 
 
 		 224 aa  152  2.9999999999999998e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.066759 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0480  precorrin isomerase, CbiC-like  45.41 
 
 		 225 aa  151  8e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2706  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  45.45 
 
 		 207 aa  151  8e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0197172  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2136  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  44.95 
 
 		 224 aa  151  8.999999999999999e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0350382 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2161  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  46.34 
 
 		 228 aa  149  2e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.149955 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0080  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  40.2 
 
 		 213 aa  150  2e-35  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.52758 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1691  precorrin-8X methylmutase  44.55 
 
 		 225 aa  149  3e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.188396 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0567  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  43.84 
 
 		 222 aa  148  7e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1898  precorrin-8X methylmutase  46.43 
 
 		 208 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.171358  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1250  precorrin-8X methylmutase  46.15 
 
 		 208 aa  146  2.0000000000000003e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0554951  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21130  precorrin-8X methylmutase  43.46 
 
 		 219 aa  145  5e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0642  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  43.35 
 
 		 222 aa  145  5e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0070  precorrin-8X methylmutase  47.37 
 
 		 239 aa  145  6e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.104216  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2298  precorrin-8X methylmutase  45.99 
 
 		 219 aa  144  1e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.191284  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1287  precorrin-8X methylmutase  45.64 
 
 		 208 aa  144  1e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1303  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  43.56 
 
 		 212 aa  144  1e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1022  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  45.37 
 
 		 229 aa  142  3e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.535258  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3117  precorrin-8X methylmutase  43.3 
 
 		 230 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3654  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  41.43 
 
 		 228 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3509  precorrin-8X methylmutase  43.08 
 
 		 209 aa  138  4.999999999999999e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.400984  normal  0.540092 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0317  precorrin-8X methylmutase  45.35 
 
 		 224 aa  137  2e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0440  precorrin-8X methylmutase, precorrin isomerase  44.44 
 
 		 225 aa  136  2e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.46496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0475  precorrin-8X methylmutase  44.44 
 
 		 225 aa  136  2e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1097  precorrin-8X methylmutase  42.29 
 
 		 210 aa  134  9.999999999999999e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0927  Precorrin-8X methylmutase  45.05 
 
 		 204 aa  134  9.999999999999999e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000290763 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2202  cobalt-precorrin-8X methylmutase  45.33 
 
 		 210 aa  132  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2155  cobalt-precorrin-8X methylmutase  45.33 
 
 		 210 aa  132  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2255  cobalt-precorrin-8X methylmutase  45.33 
 
 		 210 aa  132  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.463985 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2368  cobalt-precorrin-8X methylmutase  44.86 
 
 		 210 aa  130  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4475  precorrin-3B C17-methyltransferase  39.18 
 
 		 451 aa  130  1.0000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.253543  normal  0.0484497 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2209  cobalt-precorrin-8X methylmutase  44.86 
 
 		 210 aa  130  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.185251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17660  precorrin-8X methylmutase  44.63 
 
 		 221 aa  129  2.0000000000000002e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0262485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3376  precorrin-8X methylmutase  40.58 
 
 		 221 aa  129  3e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.218633 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0152  Precorrin-8X methylmutase  42.19 
 
 		 215 aa  128  6e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2320  precorrin-8X methylmutase  42.56 
 
 		 209 aa  128  6e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.415646  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2440  precorrin-8X methylmutase  43.48 
 
 		 210 aa  127  9.000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.341213  normal  0.0714057 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7175  precorrin-8X methylmutase  41.12 
 
 		 210 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.894546  normal  0.0915035 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1591  precorrin-8X methylmutase  44.39 
 
 		 208 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.257981 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3178  precorrin-8X methylmutase  43.08 
 
 		 209 aa  125  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.333659  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5593  Precorrin-8X methylmutase  39.8 
 
 		 208 aa  125  6e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.179804  normal  0.278794 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1782  Precorrin-8X methylmutase  41.71 
 
 		 208 aa  124  7e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.140584  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1573  precorrin-8X methylmutase  44.92 
 
 		 208 aa  124  7e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.377269  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4876  precorrin-8X methylmutase  41.12 
 
 		 208 aa  124  9e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4416  precorrin-8X methylmutase  41.12 
 
 		 208 aa  124  1e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.416711 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1519  precorrin-8X methylmutase  44.62 
 
 		 209 aa  124  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.197163  normal  0.023292 
 
 
-
 
NC_003296  RS03744  putative transmembrane protein  38.12 
 
 		 534 aa  123  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.937216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1290  precorrin-3B C17-methyltransferase  44.38 
 
 		 469 aa  123  2e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.954659  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6020  precorrin-8X methylmutase  40.61 
 
 		 210 aa  122  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00161417  normal  0.19604 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5060  precorrin-8X methylmutase  37.81 
 
 		 211 aa  122  4e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.341493 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4823  precorrin-8X methylmutase  43.85 
 
 		 208 aa  122  5e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.183427 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1646  precorrin-8X methylmutase  43.32 
 
 		 208 aa  122  6e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.996028  normal  0.344579 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1193  precorrin-8X methylmutase  43.32 
 
 		 208 aa  122  6e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0208289  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1673  precorrin-8X methylmutase  43.32 
 
 		 208 aa  122  6e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0355413  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1858  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  40.84 
 
 		 541 aa  121  7e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1504  precorrin-8X methylmutase  38.38 
 
 		 200 aa  121  7e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3146  precorrin-8X methylmutase  39.49 
 
 		 210 aa  121  7e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.757727  normal  0.930234 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6217  precorrin-8X methylmutase  44.1 
 
 		 209 aa  121  9e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0665101  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1469  precorrin-8X methylmutase  43.59 
 
 		 209 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3144  precorrin-8X methylmutase  42.25 
 
 		 212 aa  119  3e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0213  precorrin-3 methylase/precorrin-8X methylmutase  38.38 
 
 		 468 aa  119  3.9999999999999996e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1520  precorrin-8X methylmutase  41.33 
 
 		 219 aa  119  3.9999999999999996e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0548658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4572  precorrin-8X methylmutase  43.65 
 
 		 208 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1244  precorrin-8X methylmutase  43.62 
 
 		 208 aa  118  6e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0926514  normal  0.29626 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2817  precorrin-8X methylmutase  38.58 
 
 		 210 aa  118  7e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.603033 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1477  precorrin-8X methylmutase  37.07 
 
 		 201 aa  118  7.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00841  putative precorrin-8X methylmutase CobH  40.45 
 
 		 211 aa  117  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0644174 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2360  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  35.94 
 
 		 520 aa  116  1.9999999999999998e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1670  precorrin-8X methylmutase  40.74 
 
 		 209 aa  115  3e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.793368  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0122  precorrin-8X methylmutase  42.55 
 
 		 209 aa  116  3e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1712  Precorrin-8X methylmutase  41.24 
 
 		 210 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.61701  hitchhiker  0.00790463 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2399  precorrin-8X methylmutase  45.88 
 
 		 208 aa  115  5e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.154427  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>