194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6032 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_6032  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  100 
 
 
209 aa  400  1e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.343031  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2700  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  68.06 
 
 
196 aa  214  9e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.143987  hitchhiker  0.0000899582 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2518  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  67.22 
 
 
196 aa  206  1e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0645  precorrin-8X methylmutase  63.35 
 
 
199 aa  205  5e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000995367  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1319  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  67.02 
 
 
217 aa  199  1.9999999999999998e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0427832  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5593  Precorrin-8X methylmutase  46.97 
 
 
208 aa  147  8e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.179804  normal  0.278794 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2999  precorrin-8X methylmutase  48.24 
 
 
213 aa  146  2.0000000000000003e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.540254  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0477  precorrin-8X methylmutase  46.23 
 
 
214 aa  146  2.0000000000000003e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1269  precorrin-8X methylmutase  46.15 
 
 
214 aa  144  9e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0352716  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0575  Precorrin-8X methylmutase  46.88 
 
 
206 aa  143  2e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.204948  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1298  precorrin-8X methylmutase  43.88 
 
 
211 aa  141  6e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000022919  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3545  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  42.29 
 
 
214 aa  141  7e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0033  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  44.72 
 
 
213 aa  140  9.999999999999999e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1782  Precorrin-8X methylmutase  46.46 
 
 
208 aa  140  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.140584  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3611  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  42.29 
 
 
216 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03744  putative transmembrane protein  44.16 
 
 
534 aa  139  3.9999999999999997e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.937216  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0317  precorrin-8X methylmutase  44.44 
 
 
224 aa  138  7e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2360  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  39.2 
 
 
520 aa  137  1e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2555  precorrin-8X methylmutase  37.93 
 
 
207 aa  136  2e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3178  precorrin-8X methylmutase  46.19 
 
 
209 aa  136  2e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.333659  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1303  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  42.64 
 
 
212 aa  135  6.0000000000000005e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1720  cobalt-precorrin-8X methylmutase  40 
 
 
227 aa  134  9e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17660  precorrin-8X methylmutase  46.8 
 
 
221 aa  133  1.9999999999999998e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0262485  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1898  precorrin-8X methylmutase  44.16 
 
 
208 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.171358  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0308  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  37.44 
 
 
207 aa  132  3e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1287  precorrin-8X methylmutase  44.67 
 
 
208 aa  131  9e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2320  precorrin-8X methylmutase  46.23 
 
 
209 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.415646  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3117  precorrin-8X methylmutase  45.92 
 
 
230 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3284  precorrin-8X methylmutase  49.23 
 
 
211 aa  130  1.0000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.174863  normal  0.987458 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1341  precorrin-8X methylmutase  36.36 
 
 
210 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1097  precorrin-8X methylmutase  43.08 
 
 
210 aa  130  2.0000000000000002e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1888  precorrin-8X methylmutase  45.65 
 
 
209 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1250  precorrin-8X methylmutase  44.16 
 
 
208 aa  130  2.0000000000000002e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0554951  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3376  precorrin-8X methylmutase  42.56 
 
 
221 aa  129  3e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.218633 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2136  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  43.59 
 
 
224 aa  128  5.0000000000000004e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0350382 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1712  Precorrin-8X methylmutase  45.41 
 
 
210 aa  128  7.000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.61701  hitchhiker  0.00790463 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2817  precorrin-8X methylmutase  42.5 
 
 
210 aa  127  9.000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.603033 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6020  precorrin-8X methylmutase  43 
 
 
210 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00161417  normal  0.19604 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0642  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  46.73 
 
 
222 aa  127  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1298  Precorrin-8X methylmutase  38.78 
 
 
207 aa  126  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00456818 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1193  precorrin-8X methylmutase  43.92 
 
 
208 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0208289  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1646  precorrin-8X methylmutase  43.92 
 
 
208 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.996028  normal  0.344579 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1673  precorrin-8X methylmutase  43.92 
 
 
208 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0355413  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1285  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  37.95 
 
 
211 aa  126  2.0000000000000002e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.808372  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2399  precorrin-8X methylmutase  45.69 
 
 
208 aa  126  3e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.154427  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0621  precorrin-8X methylmutase  41.46 
 
 
210 aa  126  3e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.517297  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7175  precorrin-8X methylmutase  42 
 
 
210 aa  125  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.894546  normal  0.0915035 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1269  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  44.67 
 
 
219 aa  125  4.0000000000000003e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1343  precorrin-8X methylmutase  40.85 
 
 
212 aa  125  5e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.212659  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1437  precorrin-8X methylmutase  45.41 
 
 
210 aa  125  6e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.226548  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1434  Precorrin-8X methylmutase  45.41 
 
 
210 aa  125  6e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.656935  normal  0.667092 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1591  precorrin-8X methylmutase  44.02 
 
 
208 aa  124  7e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.257981 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1573  precorrin-8X methylmutase  43.39 
 
 
208 aa  124  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.377269  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2493  precorrin-8X methylmutase  47.25 
 
 
213 aa  124  1e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.238721 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0567  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  45.18 
 
 
222 aa  124  1e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4823  precorrin-8X methylmutase  44.02 
 
 
208 aa  123  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.183427 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1435  precorrin-8X methylmutase  36.92 
 
 
209 aa  123  2e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.170002  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1241  precorrin-8X methylmutase  36.92 
 
 
209 aa  123  2e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.189427  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0015  precorrin-8X methylmutase  42.07 
 
 
212 aa  123  2e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2151  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  45.9 
 
 
210 aa  122  3e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0108715  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0697  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  37.11 
 
 
205 aa  122  3e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3509  precorrin-8X methylmutase  44.04 
 
 
209 aa  122  4e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.400984  normal  0.540092 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3144  precorrin-8X methylmutase  45.45 
 
 
212 aa  122  5e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2440  precorrin-8X methylmutase  45.36 
 
 
210 aa  121  6e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.341213  normal  0.0714057 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4475  precorrin-3B C17-methyltransferase  39.9 
 
 
451 aa  120  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.253543  normal  0.0484497 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1332  precorrin-8X methylmutase  40.85 
 
 
212 aa  120  9.999999999999999e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0538013  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1852  precorrin-8X methylmutase  40.22 
 
 
209 aa  120  1.9999999999999998e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.334862  normal  0.809538 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1553  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  38.83 
 
 
215 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.160219  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1569  precorrin-8X methylmutase  44.97 
 
 
208 aa  119  3e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0892973 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1382  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  39.8 
 
 
214 aa  119  3.9999999999999996e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3430  precorrin-8X methylmutase  42.93 
 
 
208 aa  119  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.193703  normal  0.583558 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1244  precorrin-8X methylmutase  44.02 
 
 
208 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0926514  normal  0.29626 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2706  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  41.24 
 
 
207 aa  119  4.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0197172  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2893  precorrin-8X methylmutase  39.8 
 
 
220 aa  118  6e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2639  precorrin isomerase  44.33 
 
 
499 aa  117  7.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0523957  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4876  precorrin-8X methylmutase  42.65 
 
 
208 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4416  precorrin-8X methylmutase  42.65 
 
 
208 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.416711 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2212  precorrin-8X methylmutase  43.08 
 
 
209 aa  117  9.999999999999999e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2534  precorrin-8X methylmutase  43.59 
 
 
209 aa  117  9.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.474036  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2613  Precorrin-8X methylmutase  40.54 
 
 
215 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3146  precorrin-8X methylmutase  43.52 
 
 
210 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.757727  normal  0.930234 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2991  precorrin-8X methylmutase  43.65 
 
 
208 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1008  Precorrin-8X methylmutase  33.16 
 
 
211 aa  115  6e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2380  precorrin-8X methylmutase  43.65 
 
 
209 aa  115  6e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5370  precorrin-8X methylmutase  43.48 
 
 
208 aa  115  6e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.218381  normal  0.626073 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2112  precorrin-8X methylmutase  45.11 
 
 
208 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.937061  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1949  precorrin-8X methylmutase  45.11 
 
 
208 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0695491  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1966  precorrin-8X methylmutase  45.11 
 
 
208 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.000701969  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21130  precorrin-8X methylmutase  40.4 
 
 
219 aa  114  1.0000000000000001e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0152  Precorrin-8X methylmutase  42.08 
 
 
215 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0080  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  35.12 
 
 
213 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.52758 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5060  precorrin-8X methylmutase  37.95 
 
 
211 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.341493 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2191  Precorrin-8X methylmutase  42.5 
 
 
211 aa  113  2.0000000000000002e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4884  precorrin-8X methylmutase  41.8 
 
 
208 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1477  precorrin-8X methylmutase  37.19 
 
 
201 aa  113  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5850  precorrin-8X methylmutase  40.72 
 
 
209 aa  112  3e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.917792 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1520  precorrin-8X methylmutase  42.93 
 
 
219 aa  112  3e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0548658  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4572  precorrin-8X methylmutase  43.07 
 
 
208 aa  112  3e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4828  precorrin-8X methylmutase  41.27 
 
 
208 aa  112  5e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.111052  normal  0.504707 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1670  precorrin-8X methylmutase  38.59 
 
 
209 aa  112  5e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.793368  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>