195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0645 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0645  precorrin-8X methylmutase  100 
 
 		 199 aa  378  1e-104  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000995367  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1319  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  67.89 
 
 		 217 aa  194  6e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0427832  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2700  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  63.69 
 
 		 196 aa  190  1e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.143987  hitchhiker  0.0000899582 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6032  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  63.02 
 
 		 209 aa  186  3e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.343031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2518  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  63.13 
 
 		 196 aa  181  6e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0477  precorrin-8X methylmutase  49.5 
 
 		 214 aa  160  1e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2999  precorrin-8X methylmutase  47.78 
 
 		 213 aa  152  2e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.540254  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0033  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  46.31 
 
 		 213 aa  150  2e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0621  precorrin-8X methylmutase  43.2 
 
 		 210 aa  145  3e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.517297  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1343  precorrin-8X methylmutase  41.42 
 
 		 212 aa  143  1e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.212659  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0308  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  37.93 
 
 		 207 aa  140  9.999999999999999e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1435  precorrin-8X methylmutase  39.9 
 
 		 209 aa  139  1.9999999999999998e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.170002  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1241  precorrin-8X methylmutase  39.9 
 
 		 209 aa  139  1.9999999999999998e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.189427  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1332  precorrin-8X methylmutase  41.42 
 
 		 212 aa  139  3e-32  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0538013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1303  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  43.5 
 
 		 212 aa  139  3e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1269  precorrin-8X methylmutase  44.22 
 
 		 214 aa  138  4.999999999999999e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0352716  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1341  precorrin-8X methylmutase  36.17 
 
 		 210 aa  138  4.999999999999999e-32  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2555  precorrin-8X methylmutase  37.13 
 
 		 207 aa  138  7e-32  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1285  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  39.3 
 
 		 211 aa  135  4e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.808372  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2360  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  40.89 
 
 		 520 aa  135  5e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3376  precorrin-8X methylmutase  42 
 
 		 221 aa  134  9.999999999999999e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.218633 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3611  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  40 
 
 		 216 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3545  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  39.51 
 
 		 214 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1298  precorrin-8X methylmutase  41.88 
 
 		 211 aa  131  5e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000022919  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03744  putative transmembrane protein  43.43 
 
 		 534 aa  131  6.999999999999999e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.937216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1382  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  39.9 
 
 		 214 aa  129  2.0000000000000002e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1298  Precorrin-8X methylmutase  37.13 
 
 		 207 aa  128  5.0000000000000004e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00456818 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1720  cobalt-precorrin-8X methylmutase  36.27 
 
 		 227 aa  128  5.0000000000000004e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2368  cobalt-precorrin-8X methylmutase  41.26 
 
 		 210 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2209  cobalt-precorrin-8X methylmutase  41.26 
 
 		 210 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.185251  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2255  cobalt-precorrin-8X methylmutase  41.26 
 
 		 210 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.463985 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2202  cobalt-precorrin-8X methylmutase  41.26 
 
 		 210 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2155  cobalt-precorrin-8X methylmutase  41.26 
 
 		 210 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0317  precorrin-8X methylmutase  43.81 
 
 		 224 aa  126  2.0000000000000002e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1097  precorrin-8X methylmutase  40.89 
 
 		 210 aa  126  2.0000000000000002e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2613  Precorrin-8X methylmutase  40 
 
 		 215 aa  125  3e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0567  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  46.23 
 
 		 222 aa  125  6e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0015  precorrin-8X methylmutase  36.69 
 
 		 212 aa  125  6e-28  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2706  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  38.69 
 
 		 207 aa  120  9e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0197172  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0642  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  44.72 
 
 		 222 aa  120  9.999999999999999e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1008  Precorrin-8X methylmutase  32.67 
 
 		 211 aa  119  3e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0073  putative precorrin-8X methylmutase CobH  42.79 
 
 		 215 aa  119  3.9999999999999996e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3178  precorrin-8X methylmutase  42.78 
 
 		 209 aa  118  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.333659  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0119  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  38.74 
 
 		 332 aa  117  7.999999999999999e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1553  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  38.42 
 
 		 215 aa  117  9e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.160219  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0575  Precorrin-8X methylmutase  41.49 
 
 		 206 aa  117  9.999999999999999e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.204948  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2355  precorrin-8X methylmutase  36.75 
 
 		 249 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000155393  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2817  precorrin-8X methylmutase  39.5 
 
 		 210 aa  116  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.603033 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1477  precorrin-8X methylmutase  33.82 
 
 		 201 aa  116  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1287  precorrin-8X methylmutase  40 
 
 		 208 aa  115  6e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0080  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  37.71 
 
 		 213 aa  114  8.999999999999998e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.52758 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0800  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  45.98 
 
 		 194 aa  114  1.0000000000000001e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00841  putative precorrin-8X methylmutase CobH  40.89 
 
 		 211 aa  114  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0644174 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1504  precorrin-8X methylmutase  34.34 
 
 		 200 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0697  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  33.33 
 
 		 205 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1250  precorrin-8X methylmutase  39.5 
 
 		 208 aa  113  2.0000000000000002e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0554951  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5593  Precorrin-8X methylmutase  42.27 
 
 		 208 aa  112  5e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.179804  normal  0.278794 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1888  precorrin-8X methylmutase  41.3 
 
 		 209 aa  112  5e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1898  precorrin-8X methylmutase  39.5 
 
 		 208 aa  111  6e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.171358  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1269  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  40.7 
 
 		 219 aa  111  7.000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3509  precorrin-8X methylmutase  41.27 
 
 		 209 aa  111  7.000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.400984  normal  0.540092 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2320  precorrin-8X methylmutase  40.72 
 
 		 209 aa  111  8.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.415646  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2399  precorrin-8X methylmutase  45.36 
 
 		 208 aa  111  9e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.154427  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2136  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  40 
 
 		 224 aa  111  9e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0350382 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21130  precorrin-8X methylmutase  39.05 
 
 		 219 aa  110  1.0000000000000001e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3117  precorrin-8X methylmutase  43.01 
 
 		 230 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17660  precorrin-8X methylmutase  41.71 
 
 		 221 aa  109  2.0000000000000002e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0262485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2893  precorrin-8X methylmutase  38.38 
 
 		 220 aa  108  5e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0152  Precorrin-8X methylmutase  39.34 
 
 		 215 aa  108  5e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5060  precorrin-8X methylmutase  33.85 
 
 		 211 aa  108  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.341493 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2081  precorrin-8X methylmutase  37.31 
 
 		 218 aa  107  1e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18361  putative precorrin-8X methylmutase CobH  31.94 
 
 		 207 aa  106  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1712  Precorrin-8X methylmutase  43.52 
 
 		 210 aa  106  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.61701  hitchhiker  0.00790463 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1782  Precorrin-8X methylmutase  40.53 
 
 		 208 aa  106  3e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.140584  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1244  precorrin-8X methylmutase  40 
 
 		 208 aa  103  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0926514  normal  0.29626 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3146  precorrin-8X methylmutase  39.38 
 
 		 210 aa  103  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.757727  normal  0.930234 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1434  Precorrin-8X methylmutase  43.52 
 
 		 210 aa  103  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.656935  normal  0.667092 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1437  precorrin-8X methylmutase  43.52 
 
 		 210 aa  103  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.226548  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2440  precorrin-8X methylmutase  43.01 
 
 		 210 aa  103  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.341213  normal  0.0714057 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18361  putative precorrin-8X methylmutase CobH  33.17 
 
 		 207 aa  103  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.644911  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2534  precorrin-8X methylmutase  38.66 
 
 		 209 aa  102  3e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.474036  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6020  precorrin-8X methylmutase  39 
 
 		 210 aa  102  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00161417  normal  0.19604 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4876  precorrin-8X methylmutase  38.5 
 
 		 208 aa  102  4e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1670  precorrin-8X methylmutase  38.22 
 
 		 209 aa  102  4e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.793368  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4416  precorrin-8X methylmutase  38.5 
 
 		 208 aa  102  5e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.416711 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7175  precorrin-8X methylmutase  38.5 
 
 		 210 aa  101  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.894546  normal  0.0915035 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2380  precorrin-8X methylmutase  41.24 
 
 		 209 aa  101  8e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3266  Precorrin-8X methylmutase  44.72 
 
 		 215 aa  101  8e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0444754 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3284  precorrin-8X methylmutase  40.72 
 
 		 211 aa  101  9e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.174863  normal  0.987458 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1573  precorrin-8X methylmutase  38.42 
 
 		 208 aa  101  9e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.377269  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1625  Precorrin-8X methylmutase  40.4 
 
 		 221 aa  100  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.72148  normal  0.823307 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2493  precorrin-8X methylmutase  43.41 
 
 		 213 aa  100  1e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.238721 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5850  precorrin-8X methylmutase  36.04 
 
 		 209 aa  100  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.917792 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2191  Precorrin-8X methylmutase  41.84 
 
 		 211 aa  99.8  2e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4475  precorrin-3B C17-methyltransferase  34.83 
 
 		 451 aa  99.8  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.253543  normal  0.0484497 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0027  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  42.6 
 
 		 230 aa  100  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.615155  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2151  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  42.62 
 
 		 210 aa  99.8  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0108715  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2212  precorrin-8X methylmutase  37.11 
 
 		 209 aa  100  2e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2639  precorrin isomerase  39 
 
 		 499 aa  100  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0523957  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0143  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  36.92 
 
 		 209 aa  99.4  3e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>