90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_3112 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_3112  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  100 
 
 		 271 aa  542  1e-153  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2338  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  46.64 
 
 		 234 aa  216  2.9999999999999998e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2287  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  46.64 
 
 		 234 aa  216  2.9999999999999998e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3493  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  38.06 
 
 		 245 aa  179  5.999999999999999e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3558  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  40.66 
 
 		 250 aa  176  3e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.807173  normal  0.331666 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4427  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  34.24 
 
 		 293 aa  175  6e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.367655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2921  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  39.1 
 
 		 237 aa  174  9.999999999999999e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.03619  normal  0.0371299 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2611  hypothetical protein  32.84 
 
 		 254 aa  83.6  0.000000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.975318  normal  0.0888228 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0439  sirohydrochlorin cobaltochelatase  25.96 
 
 		 298 aa  74.3  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.30181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0474  sirohydrochlorin cobaltochelatase  25.96 
 
 		 298 aa  74.3  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2778  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  24.91 
 
 		 298 aa  66.6  0.0000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.617519  normal  0.0351721 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2615  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  26.29 
 
 		 275 aa  65.5  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4741  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  22.97 
 
 		 347 aa  62.8  0.000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2421  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  22.55 
 
 		 258 aa  61.6  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1023  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  22.14 
 
 		 309 aa  60.5  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.381916  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1281  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  25.64 
 
 		 120 aa  56.2  0.0000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.967515  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2162  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  23.28 
 
 		 321 aa  55.1  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.15406 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1302  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  34.91 
 
 		 122 aa  54.3  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1350  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  26.64 
 
 		 274 aa  54.7  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2299  CbiX protein  22.89 
 
 		 283 aa  54.3  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.66626  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1550  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  21.86 
 
 		 277 aa  53.5  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000233242  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4371  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  25.45 
 
 		 241 aa  52.4  0.000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1149  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  24.52 
 
 		 250 aa  52.8  0.000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.427856  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2425  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  23.67 
 
 		 243 aa  51.6  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0985952  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2473  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  23.67 
 
 		 243 aa  51.6  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0617296  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4496  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  21.52 
 
 		 329 aa  51.6  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4163  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  24.73 
 
 		 357 aa  52  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.108946  normal  0.438631 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1299  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  28.97 
 
 		 127 aa  51.2  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000187367  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3862  cbiX domain protein  23.38 
 
 		 250 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.417558  hitchhiker  0.00000756549 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1268  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  29.09 
 
 		 127 aa  50.4  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0489933  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1692  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  26.63 
 
 		 303 aa  50.4  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.303188 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0406  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  24.86 
 
 		 248 aa  50.1  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3135  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  22.02 
 
 		 279 aa  50.1  0.00004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.740034 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6031  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  23.13 
 
 		 288 aa  49.7  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.321792  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1096  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  31.82 
 
 		 127 aa  49.3  0.00006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1987  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  25 
 
 		 236 aa  49.3  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0646  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  22.12 
 
 		 297 aa  48.9  0.00009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00275078  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3738  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  24.75 
 
 		 304 aa  48.9  0.00009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2517  uroporphyrin-III C-methyltransferase  24.29 
 
 		 553 aa  48.9  0.00009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.459561  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1289  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  24.02 
 
 		 248 aa  48.9  0.00009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1002  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  22.93 
 
 		 122 aa  48.9  0.00009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2290  cbiX domain protein  24.37 
 
 		 236 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1378  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  24.79 
 
 		 238 aa  48.1  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.365904  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2699  uroporphyrin-III C-methyltransferase  25.24 
 
 		 550 aa  48.5  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.2804  hitchhiker  0.000140912 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1310  cbiX protein  23.04 
 
 		 251 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.84622  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2708  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  29.09 
 
 		 124 aa  47.4  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1946  hypothetical protein  24.37 
 
 		 236 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2143  CbiX domain-containing protein  23.53 
 
 		 236 aa  48.1  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.458667  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1309  cbiX protein  23.04 
 
 		 251 aa  47.4  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1550  CbiX domain-containing protein  23.44 
 
 		 251 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.215105  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1518  cbiX domain protein  23.44 
 
 		 251 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.91734e-20 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1994  CbiX domain-containing protein  23.53 
 
 		 236 aa  48.1  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1967  hypothetical protein  23.53 
 
 		 236 aa  47.4  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.203988  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1336  CbiX domain-containing protein  22.92 
 
 		 251 aa  47.4  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1446  CbiX domain-containing protein  22.92 
 
 		 251 aa  47.4  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.340778  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2149  cbiX domain protein  22.22 
 
 		 236 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1615  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  23.39 
 
 		 248 aa  47  0.0003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.767556  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6698  sirohydrochlorin cobaltochelatase  22.58 
 
 		 253 aa  46.6  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.99079  normal  0.371849 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0205  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  25.6 
 
 		 247 aa  46.6  0.0005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3731  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  30.88 
 
 		 125 aa  46.2  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000108177  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2174  cbiX domain protein  23.53 
 
 		 236 aa  46.2  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2707  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  31.82 
 
 		 127 aa  46.2  0.0006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.079743  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2740  hypothetical protein  23.6 
 
 		 142 aa  46.2  0.0006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.410006  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1197  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  21.47 
 
 		 365 aa  46.2  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1588  cbiX domain protein  22.28 
 
 		 251 aa  45.8  0.0007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00133885  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0828  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  24.84 
 
 		 123 aa  45.8  0.0007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0171031 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1350  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  22.4 
 
 		 250 aa  45.8  0.0007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.145066  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1722  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  36.14 
 
 		 127 aa  45.8  0.0007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1482  cbiX domain protein  21.88 
 
 		 251 aa  45.8  0.0008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0833138  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0988  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  21.4 
 
 		 410 aa  45.4  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2727  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  37.74 
 
 		 124 aa  44.7  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.946245  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0032  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  24.55 
 
 		 127 aa  45.4  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3612  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  23.64 
 
 		 127 aa  44.7  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3165  cbiX domain protein  22.22 
 
 		 236 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0476  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  27.27 
 
 		 140 aa  44.7  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1866  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  22.54 
 
 		 410 aa  44.3  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.156211  normal  0.343639 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3546  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  26.36 
 
 		 127 aa  43.9  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2563  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  21.43 
 
 		 304 aa  43.9  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.523631  normal  0.848204 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1918  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  33.73 
 
 		 127 aa  43.5  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1086  sirohydrochlorin cobaltochelatase  38.71 
 
 		 135 aa  43.5  0.004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1271  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  23.87 
 
 		 465 aa  43.1  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1731  sirohydrochlorin cobaltochelatase  30.67 
 
 		 135 aa  43.1  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1857  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  28.7 
 
 		 159 aa  42.7  0.006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1417  sirohydrochlorin cobaltochelatase  36.76 
 
 		 133 aa  42.7  0.006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.158753 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1992  transcriptional regulator NirR  22.5 
 
 		 239 aa  42.4  0.008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3000  cbiX protein  25.24 
 
 		 127 aa  42.4  0.008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0529  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  28.05 
 
 		 157 aa  42.4  0.009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.584257  normal  0.194401 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0668  sirohydrochlorin cobaltochelatase  34.29 
 
 		 133 aa  42.4  0.009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.420308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0981  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  29.35 
 
 		 127 aa  42  0.009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2179  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  25.74 
 
 		 230 aa  42  0.01  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000198199  decreased coverage  0.000000457043 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>