82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_4427 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_4427  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  100 
 
 		 293 aa  605  9.999999999999999e-173  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.367655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2921  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  39.27 
 
 		 237 aa  201  9e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.03619  normal  0.0371299 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3493  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  39.78 
 
 		 245 aa  196  5.000000000000001e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3112  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  34.24 
 
 		 271 aa  175  6e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3558  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  37.05 
 
 		 250 aa  169  6e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.807173  normal  0.331666 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2287  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  36.5 
 
 		 234 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2338  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  36.5 
 
 		 234 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2611  hypothetical protein  30 
 
 		 254 aa  75.9  0.0000000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.975318  normal  0.0888228 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0646  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  21.74 
 
 		 297 aa  67  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00275078  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2615  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  24.48 
 
 		 275 aa  60.8  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1281  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  29.66 
 
 		 120 aa  60.5  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.967515  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03744  putative transmembrane protein  22.27 
 
 		 534 aa  60.1  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.937216  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3000  cbiX protein  25.64 
 
 		 127 aa  58.9  0.00000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1550  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  25 
 
 		 277 aa  58.5  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000233242  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6031  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  21.79 
 
 		 288 aa  57.4  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.321792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1378  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  22.22 
 
 		 418 aa  57  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.149908  normal  0.20426 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3470  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  23.25 
 
 		 408 aa  56.6  0.0000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1866  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  21.63 
 
 		 410 aa  56.2  0.0000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.156211  normal  0.343639 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0171  sirohydrochlorin cobaltochelatase  22.27 
 
 		 416 aa  56.2  0.0000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.189717  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1722  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  28.46 
 
 		 127 aa  56.2  0.0000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1918  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  29.51 
 
 		 127 aa  55.5  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07571  hypothetical protein  23.13 
 
 		 349 aa  54.3  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.746447  hitchhiker  0.00609734 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0938  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  29.84 
 
 		 126 aa  55.1  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3546  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  24.79 
 
 		 127 aa  54.7  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2778  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  22.84 
 
 		 298 aa  54.7  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.617519  normal  0.0351721 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0988  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  22.54 
 
 		 410 aa  53.9  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2699  uroporphyrin-III C-methyltransferase  25 
 
 		 550 aa  53.1  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.2804  hitchhiker  0.000140912 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0032  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  24.79 
 
 		 127 aa  53.1  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1023  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  25 
 
 		 309 aa  53.1  0.000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.381916  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0476  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  25.23 
 
 		 140 aa  52.8  0.000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1302  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  28.1 
 
 		 122 aa  52.8  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3612  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  23.93 
 
 		 127 aa  52.4  0.000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0439  sirohydrochlorin cobaltochelatase  22.6 
 
 		 298 aa  52.4  0.000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.30181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0474  sirohydrochlorin cobaltochelatase  22.6 
 
 		 298 aa  52.4  0.000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0565  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  22.01 
 
 		 471 aa  52.4  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4473  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  23.26 
 
 		 309 aa  52  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0278734 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2517  uroporphyrin-III C-methyltransferase  24.15 
 
 		 553 aa  52  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.459561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06731  hypothetical protein  24.54 
 
 		 401 aa  52  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2360  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  21.43 
 
 		 520 aa  52  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1268  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  28.57 
 
 		 127 aa  52  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0489933  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2299  CbiX protein  24.21 
 
 		 283 aa  50.8  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.66626  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07021  hypothetical protein  25.27 
 
 		 400 aa  50.1  0.00004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2563  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  23.17 
 
 		 304 aa  50.1  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.523631  normal  0.848204 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0646  hypothetical protein  25.45 
 
 		 379 aa  50.1  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3135  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  22.59 
 
 		 279 aa  49.7  0.00006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.740034 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0843  hypothetical protein  21.56 
 
 		 368 aa  48.9  0.0001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3731  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  28.1 
 
 		 125 aa  48.1  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000108177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4163  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  20.85 
 
 		 357 aa  47.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.108946  normal  0.438631 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7366  putative transmembrane protein  23.42 
 
 		 275 aa  48.1  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0247614  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1692  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  24.1 
 
 		 303 aa  47.4  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.303188 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07121  hypothetical protein  23.19 
 
 		 375 aa  47  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0928  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  24.37 
 
 		 125 aa  47  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000175359 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_7707  predicted protein  24.24 
 
 		 134 aa  46.6  0.0005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.095411  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2421  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  18.63 
 
 		 258 aa  46.6  0.0006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3539  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  22.02 
 
 		 234 aa  46.2  0.0007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.226804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1299  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  22.43 
 
 		 127 aa  46.2  0.0007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000187367  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1320  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  23.45 
 
 		 326 aa  46.2  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0423235  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3476  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  22.02 
 
 		 234 aa  46.2  0.0007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.934772  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1731  sirohydrochlorin cobaltochelatase  32.65 
 
 		 135 aa  46.2  0.0007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1350  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  22.26 
 
 		 274 aa  45.8  0.0008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2162  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  29.13 
 
 		 321 aa  45.1  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.15406 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1002  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  27.88 
 
 		 122 aa  45.4  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2727  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  26.61 
 
 		 124 aa  45.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.946245  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2903  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  26.96 
 
 		 132 aa  45.4  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3489  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  21.74 
 
 		 234 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2708  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  26.05 
 
 		 124 aa  44.3  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1992  transcriptional regulator NirR  23.08 
 
 		 239 aa  44.7  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7383  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  24.21 
 
 		 253 aa  44.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.882429 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1096  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  23.97 
 
 		 127 aa  44.7  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0406  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  25 
 
 		 248 aa  44.3  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3738  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  23.7 
 
 		 304 aa  44.7  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07101  hypothetical protein  20.52 
 
 		 337 aa  44.3  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.129916  normal  0.330282 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0086  hypothetical protein  20.15 
 
 		 337 aa  43.9  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.639157  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2473  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  20.41 
 
 		 243 aa  43.5  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0617296  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2425  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  20.41 
 
 		 243 aa  43.5  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0985952  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0344  sirohydrochlorin cobaltochelatase  28.26 
 
 		 130 aa  43.1  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.922542 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4925  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  30.28 
 
 		 127 aa  43.1  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2740  hypothetical protein  28.18 
 
 		 142 aa  43.1  0.006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.410006  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2641  hypothetical protein  19.8 
 
 		 443 aa  42.7  0.008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.597647  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2923  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  35.82 
 
 		 233 aa  42.4  0.008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0365477  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0467  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  23.14 
 
 		 122 aa  42.4  0.01  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.220306  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2684  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  24.62 
 
 		 234 aa  42.4  0.01  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.55876  normal  0.318359 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>