160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_1086 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_1086  sirohydrochlorin cobaltochelatase  100 
 
 
135 aa  273  7e-73  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0518  sirohydrochlorin cobaltochelatase  64.39 
 
 
143 aa  181  2.0000000000000003e-45  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.176481  normal  0.663742 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1731  sirohydrochlorin cobaltochelatase  59.54 
 
 
135 aa  152  1e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0668  sirohydrochlorin cobaltochelatase  53.03 
 
 
133 aa  148  3e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.420308  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0681  sirohydrochlorin cobaltochelatase  57.25 
 
 
133 aa  143  1e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.513055  normal  0.374369 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1417  sirohydrochlorin cobaltochelatase  54.2 
 
 
133 aa  140  4e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.158753 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1035  sirohydrochlorin cobaltochelatase  43.65 
 
 
131 aa  114  5e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.137953  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2400  sirohydrochlorin cobaltochelatase  41.54 
 
 
130 aa  111  3e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.317297 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0344  sirohydrochlorin cobaltochelatase  40 
 
 
130 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.922542 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0104  sirohydrochlorin cobaltochelatase  36.64 
 
 
129 aa  85.5  2e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1387  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  31.54 
 
 
128 aa  72.8  0.000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1381  sirohydrochlorin cobaltochelatase  28.67 
 
 
143 aa  68.6  0.00000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.109069  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0786  sirohydrochlorin cobaltochelatase  29.86 
 
 
146 aa  66.6  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1857  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  30.47 
 
 
159 aa  65.9  0.0000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1350  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  37.5 
 
 
274 aa  65.1  0.0000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1002  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  29.46 
 
 
122 aa  64.7  0.0000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2245  sirohydrochlorin cobaltochelatase  29.77 
 
 
143 aa  64.3  0.0000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.177211  hitchhiker  0.00554027 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1164  sirohydrochlorin cobaltochelatase  29.17 
 
 
146 aa  64.3  0.0000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.427239  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2740  hypothetical protein  27.64 
 
 
142 aa  62  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.410006  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1096  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  27.05 
 
 
127 aa  62.4  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2923  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  29.75 
 
 
233 aa  62.4  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0365477  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1169  sirohydrochlorin cobaltochelatase  25.87 
 
 
150 aa  62  0.000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1053  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  35.66 
 
 
299 aa  61.6  0.000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0938  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  30.95 
 
 
126 aa  61.2  0.000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0262  hypothetical protein  32.56 
 
 
289 aa  61.2  0.000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.437952  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0307  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  32.26 
 
 
121 aa  60.5  0.000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1511  sirohydrochlorin cobaltochelatase  28.47 
 
 
146 aa  60.5  0.000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.629773  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1281  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  29.13 
 
 
120 aa  60.5  0.000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.967515  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3546  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  33.73 
 
 
127 aa  59.7  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3212  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  34.62 
 
 
301 aa  59.7  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.338438  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5921  hypothetical protein  32.82 
 
 
250 aa  59.7  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.173399  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0820  CbiX  28.41 
 
 
128 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0928  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  31.36 
 
 
125 aa  59.3  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000175359 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2162  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  33.08 
 
 
321 aa  58.9  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.15406 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1023  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  35.63 
 
 
309 aa  58.5  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.381916  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_7707  predicted protein  26.89 
 
 
134 aa  58.5  0.00000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.095411  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2179  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  32.56 
 
 
291 aa  58.5  0.00000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3612  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  32.53 
 
 
127 aa  57.4  0.00000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3135  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  35.8 
 
 
279 aa  57.4  0.00000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.740034 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49508  predicted protein  29.85 
 
 
317 aa  57  0.00000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3731  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  24 
 
 
125 aa  56.6  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000108177  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1760  hypothetical protein  32.56 
 
 
514 aa  56.6  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7383  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  28.81 
 
 
253 aa  56.2  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.882429 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0032  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  28.92 
 
 
127 aa  55.5  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0566  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  33.33 
 
 
318 aa  55.8  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.119137 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1858  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  29.55 
 
 
127 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2469  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  29.55 
 
 
127 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1268  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  25.58 
 
 
127 aa  54.3  0.0000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0489933  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2474  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  29.55 
 
 
127 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3000  cbiX protein  29.27 
 
 
127 aa  53.9  0.0000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1569  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  27.01 
 
 
307 aa  53.9  0.0000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07021  hypothetical protein  30.51 
 
 
400 aa  53.9  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0696  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  31.71 
 
 
112 aa  53.9  0.0000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06731  hypothetical protein  28.89 
 
 
401 aa  53.9  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1945  hypothetical protein  28.26 
 
 
127 aa  53.5  0.0000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.982544  normal  0.0685142 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1378  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  36.25 
 
 
238 aa  52.8  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.365904  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2641  hypothetical protein  27.08 
 
 
443 aa  53.1  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.597647  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0646  hypothetical protein  29.66 
 
 
379 aa  52.8  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0883  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  27.69 
 
 
220 aa  53.1  0.000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111412  hitchhiker  0.00000000224272 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4925  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  26.83 
 
 
127 aa  53.1  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2707  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  34.48 
 
 
127 aa  52.8  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.079743  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2299  CbiX protein  35.37 
 
 
283 aa  52  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.66626  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0669  cbiX protein  29.55 
 
 
128 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.145549  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1172  CbiX  29.55 
 
 
128 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0919733  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0843  hypothetical protein  25 
 
 
368 aa  52.8  0.000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0476  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  30.49 
 
 
140 aa  52.8  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1299  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  25.88 
 
 
127 aa  52.4  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000187367  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1136  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  31.03 
 
 
125 aa  52.8  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.295149  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2342  cbiX protein  29.55 
 
 
128 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07121  hypothetical protein  34.09 
 
 
375 aa  52.8  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2943  cbiX protein  29.55 
 
 
128 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1012  putative sirohydrochlorin cobaltochelatase CbiX  29.55 
 
 
128 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1019  putative sirohydrochlorin cobaltochelatase CbiX  29.55 
 
 
128 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1656  cbiX protein  29.55 
 
 
128 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3738  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  32.35 
 
 
304 aa  52  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2149  cbiX domain protein  23.44 
 
 
236 aa  52  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5800  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  27.27 
 
 
127 aa  51.2  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0726843 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3165  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  24.8 
 
 
134 aa  51.2  0.000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.232194  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0981  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  30.77 
 
 
127 aa  50.8  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1289  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  29.76 
 
 
248 aa  50.8  0.000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2810  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  25.88 
 
 
134 aa  50.4  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.249268  normal  0.91261 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2518  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  28.41 
 
 
127 aa  50.4  0.000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1550  CbiX domain-containing protein  32.91 
 
 
251 aa  50.4  0.000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.215105  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1518  cbiX domain protein  32.91 
 
 
251 aa  50.4  0.000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.91734e-20 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1309  cbiX protein  32.91 
 
 
251 aa  50.4  0.000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1310  cbiX protein  32.91 
 
 
251 aa  50.4  0.000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.84622  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1588  cbiX domain protein  32.91 
 
 
251 aa  50.4  0.000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00133885  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0205  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  31.46 
 
 
247 aa  50.1  0.000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1336  CbiX domain-containing protein  32.91 
 
 
251 aa  49.7  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1446  CbiX domain-containing protein  32.91 
 
 
251 aa  49.7  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.340778  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1149  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  32.04 
 
 
250 aa  50.1  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.427856  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0081  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  26.36 
 
 
250 aa  50.1  0.00001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.53662 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2727  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  28.57 
 
 
124 aa  49.3  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.946245  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2405  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  27.71 
 
 
127 aa  48.9  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0914796  normal  0.343263 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1131  hypothetical protein  27.91 
 
 
253 aa  49.3  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.470289  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2421  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  24.8 
 
 
258 aa  49.3  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1722  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  24.22 
 
 
127 aa  49.3  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3504  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  34.48 
 
 
244 aa  48.9  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.167189  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2143  CbiX domain-containing protein  23.44 
 
 
236 aa  48.5  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.458667  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2172  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  29.41 
 
 
125 aa  48.5  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.130516 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>