137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6944 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6944  hypothetical protein  100 
 
 		 131 aa  266  1e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5882  hypothetical protein  60.16 
 
 		 121 aa  153  9e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5137  hypothetical protein  55.56 
 
 		 130 aa  149  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0815248  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3326  hypothetical protein  60.48 
 
 		 127 aa  138  1.9999999999999998e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.443228 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0226  hypothetical protein  52 
 
 		 127 aa  132  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1512  hypothetical protein  55.28 
 
 		 125 aa  130  7.999999999999999e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0208888 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4252  hypothetical protein  52.34 
 
 		 129 aa  128  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1340  hypothetical protein  54.7 
 
 		 120 aa  127  7.000000000000001e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1466  hypothetical protein  52.8 
 
 		 125 aa  124  4.0000000000000003e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00213419 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0300  hypothetical protein  48.82 
 
 		 128 aa  116  9.999999999999999e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.226272  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22640  hypothetical protein  49.58 
 
 		 119 aa  113  8.999999999999998e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4370  phosphoribosyltransferase  47.62 
 
 		 335 aa  111  3e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.437912  normal  0.281198 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0914  hypothetical protein  49.22 
 
 		 150 aa  110  5e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25540  hypothetical protein  46.22 
 
 		 119 aa  106  8.000000000000001e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02690  hypothetical protein  44.53 
 
 		 143 aa  103  6e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.475561  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26170  hypothetical protein  50.79 
 
 		 127 aa  102  1e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0450608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3971  hypothetical protein  46.67 
 
 		 117 aa  89.4  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1629  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  44.83 
 
 		 113 aa  84  6e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22500  hypothetical protein  41.79 
 
 		 135 aa  82.8  0.000000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.831354  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4549  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  43.1 
 
 		 115 aa  80.5  0.000000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4637  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  43.1 
 
 		 115 aa  80.5  0.000000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4932  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  43.1 
 
 		 115 aa  80.5  0.000000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.682961 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5120  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  43.97 
 
 		 113 aa  80.1  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.935862  normal  0.713637 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3766  hypothetical protein  39.84 
 
 		 117 aa  78.2  0.00000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.240872  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4667  hypothetical protein  44.36 
 
 		 137 aa  77  0.00000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0764382  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9281  hypothetical protein  43.59 
 
 		 113 aa  77  0.00000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4249  hypothetical protein  42.98 
 
 		 116 aa  76.6  0.00000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.605375  normal  0.0498111 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1972  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.7 
 
 		 125 aa  76.6  0.00000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.41866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2836  hypothetical protein  39.44 
 
 		 145 aa  75.5  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.936594  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5848  hypothetical protein  44.83 
 
 		 117 aa  75.9  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000947774  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2704  hypothetical protein  36.43 
 
 		 145 aa  75.1  0.0000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.034837  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4521  hypothetical protein  37.82 
 
 		 116 aa  74.7  0.0000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4019  hypothetical protein  42.11 
 
 		 116 aa  73.9  0.0000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4094  hypothetical protein  42.11 
 
 		 116 aa  73.9  0.0000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2176  hypothetical protein  39.84 
 
 		 116 aa  73.6  0.0000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0578435  normal  0.0672972 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10816  hypothetical protein  43.97 
 
 		 115 aa  73.6  0.000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.399339  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0347  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  39.52 
 
 		 126 aa  73.2  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1188  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  44.04 
 
 		 121 aa  72.8  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.249084 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0448  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  36.51 
 
 		 125 aa  72.8  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.25753 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3382  hypothetical protein  38.89 
 
 		 121 aa  71.2  0.000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000231795  hitchhiker  0.000471354 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0366  hypothetical protein  40.17 
 
 		 245 aa  71.2  0.000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0380  hypothetical protein  37.86 
 
 		 149 aa  70.9  0.000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.544251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3034  hypothetical protein  37.41 
 
 		 153 aa  70.5  0.000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0240001  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2066  hypothetical protein  36.84 
 
 		 153 aa  69.7  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.592764 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6280  hypothetical protein  38.76 
 
 		 129 aa  69.7  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.896361 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5763  hypothetical protein  42.24 
 
 		 228 aa  68.9  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00642959  normal  0.20928 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4665  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  39.52 
 
 		 126 aa  69.3  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.692223  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7567  hypothetical protein  39.86 
 
 		 144 aa  68.6  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3284  hypothetical protein  37.6 
 
 		 234 aa  68.2  0.00000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19060  hypothetical protein  43.33 
 
 		 132 aa  67.8  0.00000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.265837  normal  0.18258 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0150  hypothetical protein  51.43 
 
 		 132 aa  67  0.00000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.371021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1240  hypothetical protein  52.78 
 
 		 153 aa  66.6  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1040  hypothetical protein  39.52 
 
 		 253 aa  66.2  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.371874 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0799  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  36.44 
 
 		 395 aa  66.2  0.0000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0503  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38.26 
 
 		 118 aa  66.6  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.012909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4061  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.5 
 
 		 126 aa  66.6  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8404  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.9 
 
 		 118 aa  65.9  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.97224  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3931  hypothetical protein  36.23 
 
 		 127 aa  65.1  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.935473 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3598  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.68 
 
 		 124 aa  64.3  0.0000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5116  hypothetical protein  36.97 
 
 		 240 aa  63.9  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.522329  normal  0.161919 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3008  hypothetical protein  33.82 
 
 		 141 aa  63.9  0.0000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000261512  hitchhiker  0.000130504 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6978  hypothetical protein  35.95 
 
 		 153 aa  63.9  0.0000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2315  hypothetical protein  37.84 
 
 		 239 aa  62.4  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.888825  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0555  hypothetical protein  33.82 
 
 		 141 aa  62.8  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.481999  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2488  hypothetical protein  37.9 
 
 		 123 aa  61.6  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.383766  normal  0.943713 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6347  hypothetical protein  38.4 
 
 		 127 aa  61.6  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1922  hypothetical protein  45.59 
 
 		 150 aa  61.6  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0447405  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5068  hypothetical protein  47.06 
 
 		 150 aa  61.2  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.560594 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7827  hypothetical protein  36.36 
 
 		 241 aa  61.2  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5700  hypothetical protein  34.17 
 
 		 128 aa  60.8  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3858  hypothetical protein  36.84 
 
 		 151 aa  60.1  0.000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0149643  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1116  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  39.64 
 
 		 238 aa  60.1  0.000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2585  hypothetical protein  38.3 
 
 		 145 aa  59.7  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2587  hypothetical protein  34.11 
 
 		 124 aa  59.7  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.869022  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5075  hypothetical protein  31.91 
 
 		 142 aa  58.9  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.899338 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1261  hypothetical protein  37.72 
 
 		 127 aa  58.9  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1768  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.77 
 
 		 129 aa  58.2  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4247  hypothetical protein  39.17 
 
 		 127 aa  58.2  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.06064 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5458  hypothetical protein  31.76 
 
 		 146 aa  57.4  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.556785  normal  0.109001 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25380  hypothetical protein  34.25 
 
 		 144 aa  57.4  0.00000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.606308  normal  0.623605 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1719  hypothetical protein  36.99 
 
 		 147 aa  57  0.00000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1956  hypothetical protein  34.04 
 
 		 146 aa  57  0.00000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1410  hypothetical protein  49.32 
 
 		 138 aa  57  0.00000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.406941  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3616  hypothetical protein  37.93 
 
 		 245 aa  56.2  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7424  hypothetical protein  33.33 
 
 		 114 aa  56.6  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.498691 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2260  hypothetical protein  35.97 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7787  hypothetical protein  34.78 
 
 		 120 aa  55.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.955905  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3097  hypothetical protein  31.69 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1976  hypothetical protein  34.27 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2530  hypothetical protein  33.85 
 
 		 130 aa  55.5  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1463  hypothetical protein  31.21 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0019697 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19330  hypothetical protein  38.82 
 
 		 151 aa  54.3  0.0000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.193262  normal  0.367636 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2827  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.33 
 
 		 140 aa  54.3  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000699293  normal  0.0178041 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2187  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.9 
 
 		 118 aa  53.9  0.0000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0642581 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3812  hypothetical protein  32.39 
 
 		 144 aa  53.9  0.0000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5426  hypothetical protein  37.4 
 
 		 134 aa  53.5  0.0000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4353  hypothetical protein  36.52 
 
 		 118 aa  53.5  0.0000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00239214  normal  0.103366 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06250  hypothetical protein  35 
 
 		 242 aa  53.5  0.0000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.938865  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4350  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.9 
 
 		 136 aa  52.8  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05900  hypothetical protein  49.23 
 
 		 63 aa  52.8  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>