136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_2587 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_2587  hypothetical protein  100 
 
 
124 aa  254  4e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.869022  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1526  hypothetical protein  82.26 
 
 
124 aa  222  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.637677  normal  0.757551 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6347  hypothetical protein  50.4 
 
 
127 aa  115  3e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3931  hypothetical protein  47.2 
 
 
127 aa  111  4.0000000000000004e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.935473 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5137  hypothetical protein  38.76 
 
 
130 aa  70.1  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0815248  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3766  hypothetical protein  37.9 
 
 
117 aa  69.7  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.240872  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26170  hypothetical protein  40 
 
 
127 aa  69.7  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0450608  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1261  hypothetical protein  37.01 
 
 
127 aa  69.3  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3382  hypothetical protein  34.68 
 
 
121 aa  69.3  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000231795  hitchhiker  0.000471354 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0503  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  40.46 
 
 
118 aa  68.6  0.00000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.012909  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5075  hypothetical protein  32.87 
 
 
142 aa  68.2  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.899338 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0555  hypothetical protein  35.92 
 
 
141 aa  67.8  0.00000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.481999  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3326  hypothetical protein  36.09 
 
 
127 aa  67.8  0.00000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.443228 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1466  hypothetical protein  37.5 
 
 
125 aa  67.8  0.00000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00213419 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10816  hypothetical protein  34.88 
 
 
115 aa  67  0.00000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.399339  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22500  hypothetical protein  39.2 
 
 
135 aa  66.2  0.0000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.831354  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1512  hypothetical protein  36.72 
 
 
125 aa  65.9  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0208888 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5848  hypothetical protein  37.5 
 
 
117 aa  65.9  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000947774  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3008  hypothetical protein  31.69 
 
 
141 aa  65.9  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000261512  hitchhiker  0.000130504 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2704  hypothetical protein  35.17 
 
 
145 aa  65.9  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.034837  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5458  hypothetical protein  31.97 
 
 
146 aa  65.1  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.556785  normal  0.109001 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5882  hypothetical protein  36.8 
 
 
121 aa  64.7  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3971  hypothetical protein  36.44 
 
 
117 aa  64.7  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0150  hypothetical protein  39.66 
 
 
132 aa  64.3  0.0000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.371021  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1340  hypothetical protein  34.65 
 
 
120 aa  63.5  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1747  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.8 
 
 
111 aa  62.8  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.369781  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9281  hypothetical protein  34.92 
 
 
113 aa  62.8  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0366  hypothetical protein  36.29 
 
 
245 aa  63.5  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4549  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.4 
 
 
115 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4637  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.4 
 
 
115 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4932  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.4 
 
 
115 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.682961 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3076  hypothetical protein  28.17 
 
 
146 aa  62  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1768  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.71 
 
 
129 aa  62.4  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22640  hypothetical protein  35.48 
 
 
119 aa  60.8  0.000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5763  hypothetical protein  34.68 
 
 
228 aa  60.5  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00642959  normal  0.20928 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4665  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.16 
 
 
126 aa  60.5  0.000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.692223  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4019  hypothetical protein  36.07 
 
 
116 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4094  hypothetical protein  36.07 
 
 
116 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3858  hypothetical protein  34.39 
 
 
151 aa  59.7  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0149643  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6944  hypothetical protein  34.11 
 
 
131 aa  59.7  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7424  hypothetical protein  35.66 
 
 
114 aa  60.1  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.498691 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2176  hypothetical protein  31.97 
 
 
116 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0578435  normal  0.0672972 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2530  hypothetical protein  35.07 
 
 
130 aa  59.3  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5116  hypothetical protein  34.45 
 
 
240 aa  58.9  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.522329  normal  0.161919 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4061  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.2 
 
 
126 aa  58.5  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3282  hypothetical protein  26.76 
 
 
146 aa  58.2  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5220  hypothetical protein  33.61 
 
 
127 aa  58.2  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8404  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.65 
 
 
118 aa  58.5  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.97224  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3598  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.88 
 
 
124 aa  58.2  0.00000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0226  hypothetical protein  34.13 
 
 
127 aa  58.2  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4249  hypothetical protein  35.25 
 
 
116 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.605375  normal  0.0498111 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0347  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.16 
 
 
126 aa  57.4  0.00000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6280  hypothetical protein  35.25 
 
 
129 aa  57.4  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.896361 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19060  hypothetical protein  34.38 
 
 
132 aa  57.4  0.00000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.265837  normal  0.18258 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7787  hypothetical protein  35.16 
 
 
120 aa  57.4  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.955905  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0380  hypothetical protein  31.91 
 
 
149 aa  57  0.00000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.544251  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1972  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  36.22 
 
 
125 aa  57  0.00000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.41866  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1719  hypothetical protein  37.16 
 
 
147 aa  56.2  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4521  hypothetical protein  31.15 
 
 
116 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6978  hypothetical protein  30.32 
 
 
153 aa  56.6  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1922  hypothetical protein  36.89 
 
 
150 aa  56.2  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0447405  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25380  hypothetical protein  30.56 
 
 
144 aa  56.6  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.606308  normal  0.623605 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2315  hypothetical protein  34.11 
 
 
239 aa  56.2  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.888825  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0448  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.66 
 
 
125 aa  55.8  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.25753 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1463  hypothetical protein  35.66 
 
 
144 aa  56.2  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0019697 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1417  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.6 
 
 
125 aa  56.2  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0300  hypothetical protein  32.81 
 
 
128 aa  56.2  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.226272  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1825  hypothetical protein  36 
 
 
123 aa  56.2  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00267631  normal  0.075549 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4353  hypothetical protein  32.28 
 
 
118 aa  55.1  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00239214  normal  0.103366 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25540  hypothetical protein  33.06 
 
 
119 aa  55.5  0.0000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3284  hypothetical protein  33.6 
 
 
234 aa  55.5  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3672  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.66 
 
 
129 aa  54.7  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5120  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.33 
 
 
113 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.935862  normal  0.713637 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5883  hypothetical protein  34.13 
 
 
235 aa  54.3  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.908268 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7827  hypothetical protein  34.92 
 
 
241 aa  54.3  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7081  hypothetical protein  28.89 
 
 
121 aa  54.7  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3103  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.13 
 
 
136 aa  54.3  0.0000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.374445  normal  0.546363 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1629  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.6 
 
 
113 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19330  hypothetical protein  32.28 
 
 
151 aa  53.9  0.0000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.193262  normal  0.367636 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5700  hypothetical protein  32.58 
 
 
128 aa  53.9  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1040  hypothetical protein  35.71 
 
 
253 aa  52.8  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.371874 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1956  hypothetical protein  35.62 
 
 
146 aa  53.1  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4252  hypothetical protein  29.85 
 
 
129 aa  53.1  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3034  hypothetical protein  28.57 
 
 
153 aa  53.1  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0240001  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3323  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.54 
 
 
119 aa  52.4  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6182  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.85 
 
 
123 aa  52  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5162  hypothetical protein  33.77 
 
 
147 aa  52.4  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00674202 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25860  hypothetical protein  30.28 
 
 
142 aa  52.4  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1906  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  37.3 
 
 
218 aa  51.6  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.457322  normal  0.154626 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2836  hypothetical protein  29.66 
 
 
145 aa  52  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.936594  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2203  hypothetical protein  27.42 
 
 
127 aa  51.6  0.000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.530068  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1188  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  50.91 
 
 
121 aa  51.6  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.249084 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4247  hypothetical protein  34.85 
 
 
127 aa  51.2  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.06064 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0814  hypothetical protein  47.62 
 
 
127 aa  51.2  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4667  hypothetical protein  40.31 
 
 
137 aa  49.7  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0764382  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5068  hypothetical protein  32 
 
 
150 aa  50.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.560594 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0914  hypothetical protein  30.6 
 
 
150 aa  48.9  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7567  hypothetical protein  30.77 
 
 
144 aa  49.3  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2041  hypothetical protein  32.8 
 
 
123 aa  48.9  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1240  hypothetical protein  32.65 
 
 
153 aa  48.5  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>