86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_06250 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_06250  hypothetical protein  100 
 
 
242 aa  475  1e-133  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.938865  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0366  hypothetical protein  40.91 
 
 
245 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5763  hypothetical protein  41.48 
 
 
228 aa  145  8.000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00642959  normal  0.20928 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1040  hypothetical protein  40.41 
 
 
253 aa  130  1.0000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.371874 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3616  hypothetical protein  37.19 
 
 
245 aa  126  3e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2315  hypothetical protein  33.47 
 
 
239 aa  73.2  0.000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.888825  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3971  hypothetical protein  37.04 
 
 
117 aa  71.2  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1116  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.56 
 
 
238 aa  69.7  0.00000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3284  hypothetical protein  30.74 
 
 
234 aa  70.5  0.00000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26170  hypothetical protein  40.32 
 
 
127 aa  66.6  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0450608  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2176  hypothetical protein  36.94 
 
 
116 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0578435  normal  0.0672972 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4019  hypothetical protein  34.15 
 
 
116 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4094  hypothetical protein  34.15 
 
 
116 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4249  hypothetical protein  34.15 
 
 
116 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.605375  normal  0.0498111 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7827  hypothetical protein  31.35 
 
 
241 aa  63.2  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0300  hypothetical protein  32.17 
 
 
128 aa  62.4  0.000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.226272  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4521  hypothetical protein  35.14 
 
 
116 aa  62.4  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5137  hypothetical protein  34.65 
 
 
130 aa  62  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0815248  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5116  hypothetical protein  31.62 
 
 
240 aa  60.8  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.522329  normal  0.161919 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22640  hypothetical protein  35.04 
 
 
119 aa  60.1  0.00000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25540  hypothetical protein  35.04 
 
 
119 aa  59.7  0.00000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19060  hypothetical protein  38.52 
 
 
132 aa  58.9  0.00000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.265837  normal  0.18258 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1410  hypothetical protein  39.02 
 
 
138 aa  58.9  0.00000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.406941  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22500  hypothetical protein  35.43 
 
 
135 aa  58.2  0.0000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.831354  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1629  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.21 
 
 
113 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4549  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.33 
 
 
115 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4932  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.33 
 
 
115 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.682961 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4637  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.33 
 
 
115 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0448  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.59 
 
 
125 aa  56.6  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.25753 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5120  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.71 
 
 
113 aa  56.2  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.935862  normal  0.713637 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10816  hypothetical protein  36.84 
 
 
115 aa  55.5  0.0000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.399339  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5882  hypothetical protein  34.68 
 
 
121 aa  54.7  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2488  hypothetical protein  37.39 
 
 
123 aa  54.3  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.383766  normal  0.943713 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6944  hypothetical protein  35 
 
 
131 aa  53.5  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0150  hypothetical protein  44.29 
 
 
132 aa  52.4  0.000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.371021  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5848  hypothetical protein  37.04 
 
 
117 aa  52.4  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000947774  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3931  hypothetical protein  33.08 
 
 
127 aa  51.6  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.935473 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0347  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.83 
 
 
126 aa  51.6  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0226  hypothetical protein  32.56 
 
 
127 aa  49.7  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1466  hypothetical protein  33.88 
 
 
125 aa  49.7  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00213419 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4665  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.59 
 
 
126 aa  49.7  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.692223  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4350  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.74 
 
 
136 aa  49.7  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3282  hypothetical protein  34.09 
 
 
146 aa  50.1  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3382  hypothetical protein  31.97 
 
 
121 aa  49.7  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000231795  hitchhiker  0.000471354 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1512  hypothetical protein  36.36 
 
 
125 aa  49.3  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0208888 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4667  hypothetical protein  34.38 
 
 
137 aa  49.3  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0764382  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3326  hypothetical protein  35.77 
 
 
127 aa  49.3  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.443228 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3766  hypothetical protein  31.3 
 
 
117 aa  49.3  0.00006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.240872  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9281  hypothetical protein  32.11 
 
 
113 aa  48.9  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25380  hypothetical protein  43.48 
 
 
144 aa  48.5  0.00009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.606308  normal  0.623605 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1976  hypothetical protein  32.85 
 
 
144 aa  48.1  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1972  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.76 
 
 
125 aa  48.1  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.41866  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02690  hypothetical protein  28.1 
 
 
143 aa  47.8  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.475561  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0555  hypothetical protein  40 
 
 
141 aa  47  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.481999  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4295  hypothetical protein  27.35 
 
 
249 aa  47.4  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4252  hypothetical protein  29.03 
 
 
129 aa  47.4  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1261  hypothetical protein  33.62 
 
 
127 aa  47  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1747  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.09 
 
 
111 aa  46.2  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.369781  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5458  hypothetical protein  31.21 
 
 
146 aa  46.2  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.556785  normal  0.109001 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3008  hypothetical protein  28.06 
 
 
141 aa  46.2  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000261512  hitchhiker  0.000130504 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2790  hypothetical protein  26.09 
 
 
237 aa  46.2  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0512113  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4370  phosphoribosyltransferase  29.17 
 
 
335 aa  46.2  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.437912  normal  0.281198 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5075  hypothetical protein  28.68 
 
 
142 aa  46.2  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.899338 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7567  hypothetical protein  30.71 
 
 
144 aa  46.2  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0914  hypothetical protein  29.37 
 
 
150 aa  45.8  0.0006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3598  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.9 
 
 
124 aa  45.4  0.0008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4247  hypothetical protein  34.17 
 
 
127 aa  45.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.06064 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0503  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.34 
 
 
118 aa  45.1  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.012909  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0799  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  33.04 
 
 
395 aa  44.3  0.002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7787  hypothetical protein  31.4 
 
 
120 aa  43.9  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.955905  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1463  hypothetical protein  31.39 
 
 
144 aa  44.3  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0019697 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5700  hypothetical protein  31.4 
 
 
128 aa  43.9  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8404  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.93 
 
 
118 aa  43.9  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.97224  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4061  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.62 
 
 
126 aa  43.9  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1188  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.94 
 
 
121 aa  43.1  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.249084 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10670  pterin-4a-carbinolamine dehydratase  31.86 
 
 
217 aa  43.5  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0658064 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1340  hypothetical protein  36.44 
 
 
120 aa  43.5  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3567  hypothetical protein  35.45 
 
 
210 aa  43.5  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3672  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.91 
 
 
129 aa  42.4  0.007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3103  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.95 
 
 
136 aa  42.4  0.007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.374445  normal  0.546363 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6280  hypothetical protein  31.97 
 
 
129 aa  42.4  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.896361 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5426  hypothetical protein  29.91 
 
 
134 aa  42  0.009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3966  hypothetical protein  30.09 
 
 
136 aa  42  0.009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2260  hypothetical protein  34.06 
 
 
144 aa  42  0.009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1108  hypothetical protein  34.41 
 
 
230 aa  42  0.009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.950748  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1240  hypothetical protein  41.18 
 
 
153 aa  42  0.009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>