110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0914 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_0914  hypothetical protein  100 
 
 
150 aa  308  2e-83  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02690  hypothetical protein  68.46 
 
 
143 aa  181  3e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.475561  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0300  hypothetical protein  52.76 
 
 
128 aa  135  2e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.226272  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5882  hypothetical protein  47.69 
 
 
121 aa  114  6e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6944  hypothetical protein  49.22 
 
 
131 aa  110  5e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5137  hypothetical protein  46.88 
 
 
130 aa  110  9e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0815248  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3326  hypothetical protein  48.78 
 
 
127 aa  108  3e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.443228 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1512  hypothetical protein  49.61 
 
 
125 aa  107  6e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0208888 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1466  hypothetical protein  49.61 
 
 
125 aa  105  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00213419 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22640  hypothetical protein  45.08 
 
 
119 aa  103  8e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0226  hypothetical protein  48.03 
 
 
127 aa  102  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4252  hypothetical protein  47.33 
 
 
129 aa  101  4e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25540  hypothetical protein  42.37 
 
 
119 aa  95.9  1e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1340  hypothetical protein  42.98 
 
 
120 aa  92.8  1e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4370  phosphoribosyltransferase  45.31 
 
 
335 aa  92  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.437912  normal  0.281198 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26170  hypothetical protein  42.52 
 
 
127 aa  81.6  0.000000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0450608  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4019  hypothetical protein  43.8 
 
 
116 aa  81.3  0.000000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4667  hypothetical protein  40.44 
 
 
137 aa  81.6  0.000000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0764382  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4094  hypothetical protein  43.8 
 
 
116 aa  81.3  0.000000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4249  hypothetical protein  43.8 
 
 
116 aa  80.5  0.000000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.605375  normal  0.0498111 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3971  hypothetical protein  42.74 
 
 
117 aa  77.8  0.00000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2176  hypothetical protein  40.98 
 
 
116 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0578435  normal  0.0672972 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3034  hypothetical protein  37.84 
 
 
153 aa  76.3  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0240001  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4521  hypothetical protein  39.34 
 
 
116 aa  75.1  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2066  hypothetical protein  37.41 
 
 
153 aa  72.4  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.592764 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0150  hypothetical protein  38.46 
 
 
132 aa  71.2  0.000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.371021  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3008  hypothetical protein  36.62 
 
 
141 aa  71.2  0.000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000261512  hitchhiker  0.000130504 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22500  hypothetical protein  41.27 
 
 
135 aa  71.2  0.000000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.831354  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3382  hypothetical protein  39.39 
 
 
121 aa  68.6  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000231795  hitchhiker  0.000471354 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5075  hypothetical protein  32.17 
 
 
142 aa  67.8  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.899338 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19060  hypothetical protein  36.84 
 
 
132 aa  67  0.00000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.265837  normal  0.18258 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3766  hypothetical protein  37.6 
 
 
117 aa  65.9  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.240872  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10816  hypothetical protein  39.02 
 
 
115 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.399339  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1040  hypothetical protein  38.28 
 
 
253 aa  65.1  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.371874 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6978  hypothetical protein  33.33 
 
 
153 aa  65.5  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5458  hypothetical protein  29.25 
 
 
146 aa  65.1  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.556785  normal  0.109001 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1922  hypothetical protein  48.57 
 
 
150 aa  65.1  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0447405  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4549  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.4 
 
 
115 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4637  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.4 
 
 
115 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4932  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.4 
 
 
115 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.682961 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1972  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.48 
 
 
125 aa  64.7  0.0000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.41866  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6280  hypothetical protein  36.89 
 
 
129 aa  63.9  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.896361 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5120  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.54 
 
 
113 aa  63.9  0.0000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.935862  normal  0.713637 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7567  hypothetical protein  35.07 
 
 
144 aa  63.9  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1629  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  36.36 
 
 
113 aa  63.5  0.0000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2836  hypothetical protein  33.57 
 
 
145 aa  62.4  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.936594  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1976  hypothetical protein  34.53 
 
 
144 aa  62.8  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0448  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.11 
 
 
125 aa  62.4  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.25753 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0347  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38.28 
 
 
126 aa  62  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2704  hypothetical protein  30.94 
 
 
145 aa  61.6  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.034837  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1463  hypothetical protein  34.31 
 
 
144 aa  61.6  0.000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0019697 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3282  hypothetical protein  29.66 
 
 
146 aa  60.8  0.000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5426  hypothetical protein  33.59 
 
 
134 aa  60.8  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0366  hypothetical protein  34.96 
 
 
245 aa  60.8  0.000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5068  hypothetical protein  32.87 
 
 
150 aa  60.8  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.560594 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5848  hypothetical protein  35.9 
 
 
117 aa  60.5  0.000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000947774  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2315  hypothetical protein  33.61 
 
 
239 aa  60.5  0.000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.888825  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2260  hypothetical protein  35.29 
 
 
144 aa  60.5  0.000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0555  hypothetical protein  49.28 
 
 
141 aa  59.7  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.481999  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6347  hypothetical protein  32.31 
 
 
127 aa  59.7  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1240  hypothetical protein  43.84 
 
 
153 aa  58.2  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2488  hypothetical protein  34.81 
 
 
123 aa  57.8  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.383766  normal  0.943713 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25380  hypothetical protein  30.92 
 
 
144 aa  57.8  0.00000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.606308  normal  0.623605 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5700  hypothetical protein  34.68 
 
 
128 aa  57  0.00000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3076  hypothetical protein  30.07 
 
 
146 aa  56.6  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3931  hypothetical protein  34.56 
 
 
127 aa  56.2  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.935473 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3598  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.92 
 
 
124 aa  56.2  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3858  hypothetical protein  30.13 
 
 
151 aa  56.2  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0149643  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4247  hypothetical protein  38.21 
 
 
127 aa  55.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.06064 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7827  hypothetical protein  33.33 
 
 
241 aa  55.5  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19330  hypothetical protein  42.86 
 
 
151 aa  56.2  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.193262  normal  0.367636 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9281  hypothetical protein  31.97 
 
 
113 aa  55.5  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3812  hypothetical protein  33.81 
 
 
144 aa  54.7  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0380  hypothetical protein  31.29 
 
 
149 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.544251  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1410  hypothetical protein  50.68 
 
 
138 aa  54.3  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.406941  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5763  hypothetical protein  34.96 
 
 
228 aa  54.3  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00642959  normal  0.20928 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1956  hypothetical protein  30.82 
 
 
146 aa  54.3  0.0000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2585  hypothetical protein  32.61 
 
 
145 aa  53.9  0.0000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4665  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.6 
 
 
126 aa  52.8  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.692223  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1719  hypothetical protein  33.57 
 
 
147 aa  52.4  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3097  hypothetical protein  32.12 
 
 
144 aa  52  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2187  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.61 
 
 
118 aa  50.8  0.000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0642581 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10670  pterin-4a-carbinolamine dehydratase  33.63 
 
 
217 aa  49.7  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0658064 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5116  hypothetical protein  31.71 
 
 
240 aa  50.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.522329  normal  0.161919 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2587  hypothetical protein  30.6 
 
 
124 aa  48.9  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.869022  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1747  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.4 
 
 
111 aa  48.9  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.369781  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1116  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.65 
 
 
238 aa  48.1  0.00004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1768  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.51 
 
 
129 aa  47.8  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1261  hypothetical protein  33.05 
 
 
127 aa  47.4  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05900  hypothetical protein  42.03 
 
 
63 aa  47.4  0.00007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5109  hypothetical protein  33.33 
 
 
110 aa  47  0.00009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0532825  normal  0.118566 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2041  hypothetical protein  33.62 
 
 
123 aa  46.6  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7787  hypothetical protein  33.33 
 
 
120 aa  46.2  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.955905  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4061  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.11 
 
 
126 aa  47  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7424  hypothetical protein  30.33 
 
 
114 aa  45.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.498691 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4350  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.45 
 
 
136 aa  45.1  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06250  hypothetical protein  29.37 
 
 
242 aa  45.4  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.938865  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1188  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.45 
 
 
121 aa  44.7  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.249084 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0799  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  43.66 
 
 
395 aa  44.3  0.0006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3428  hypothetical protein  32.37 
 
 
218 aa  44.3  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>