126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2315 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_2315  hypothetical protein  100 
 
 
239 aa  485  1e-136  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.888825  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5116  hypothetical protein  83.12 
 
 
240 aa  399  9.999999999999999e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.522329  normal  0.161919 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7827  hypothetical protein  67.36 
 
 
241 aa  313  1.9999999999999998e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1116  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  54.39 
 
 
238 aa  231  1e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1108  hypothetical protein  47.86 
 
 
230 aa  195  7e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.950748  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0366  hypothetical protein  40.41 
 
 
245 aa  149  5e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5763  hypothetical protein  41.56 
 
 
228 aa  144  9e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00642959  normal  0.20928 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1040  hypothetical protein  38.46 
 
 
253 aa  120  9.999999999999999e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.371874 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3616  hypothetical protein  35.86 
 
 
245 aa  114  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4019  hypothetical protein  49.5 
 
 
116 aa  89.7  3e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4094  hypothetical protein  49.5 
 
 
116 aa  89.7  3e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4249  hypothetical protein  49.5 
 
 
116 aa  89  6e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.605375  normal  0.0498111 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3971  hypothetical protein  45.71 
 
 
117 aa  88.6  8e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2176  hypothetical protein  47.96 
 
 
116 aa  87.4  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0578435  normal  0.0672972 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19060  hypothetical protein  44.64 
 
 
132 aa  86.7  3e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.265837  normal  0.18258 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0150  hypothetical protein  40.32 
 
 
132 aa  86.3  4e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.371021  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4521  hypothetical protein  46.94 
 
 
116 aa  85.1  9e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2488  hypothetical protein  37.07 
 
 
123 aa  79  0.00000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.383766  normal  0.943713 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0300  hypothetical protein  38.02 
 
 
128 aa  78.6  0.00000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.226272  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22500  hypothetical protein  39.06 
 
 
135 aa  77.8  0.0000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.831354  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26170  hypothetical protein  40.17 
 
 
127 aa  77.8  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0450608  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02690  hypothetical protein  37.29 
 
 
143 aa  75.9  0.0000000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.475561  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0347  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  40.5 
 
 
126 aa  75.1  0.0000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1466  hypothetical protein  43.22 
 
 
125 aa  74.3  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00213419 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1410  hypothetical protein  45.83 
 
 
138 aa  74.3  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.406941  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1340  hypothetical protein  40 
 
 
120 aa  72.8  0.000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4061  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  44.14 
 
 
126 aa  72.4  0.000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06250  hypothetical protein  33.06 
 
 
242 aa  69.7  0.00000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.938865  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22640  hypothetical protein  36.19 
 
 
119 aa  69.7  0.00000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4665  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  40.5 
 
 
126 aa  69.7  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.692223  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3326  hypothetical protein  42.31 
 
 
127 aa  69.3  0.00000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.443228 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5137  hypothetical protein  42.73 
 
 
130 aa  68.6  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0815248  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1512  hypothetical protein  40.17 
 
 
125 aa  68.6  0.00000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0208888 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4667  hypothetical protein  44.71 
 
 
137 aa  67  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0764382  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1972  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.39 
 
 
125 aa  67  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.41866  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3598  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38.39 
 
 
124 aa  66.6  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6978  hypothetical protein  37.23 
 
 
153 aa  63.9  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2704  hypothetical protein  30.77 
 
 
145 aa  63.5  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.034837  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25540  hypothetical protein  33.88 
 
 
119 aa  63.5  0.000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3284  hypothetical protein  30.49 
 
 
234 aa  63.2  0.000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4370  phosphoribosyltransferase  39.29 
 
 
335 aa  63.2  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.437912  normal  0.281198 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0448  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  36.13 
 
 
125 aa  63.2  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.25753 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0226  hypothetical protein  37.72 
 
 
127 aa  62.8  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6944  hypothetical protein  37.84 
 
 
131 aa  62.4  0.000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6182  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.88 
 
 
123 aa  62  0.000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9281  hypothetical protein  35.04 
 
 
113 aa  61.2  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3766  hypothetical protein  36.52 
 
 
117 aa  60.8  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.240872  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0914  hypothetical protein  33.61 
 
 
150 aa  60.5  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3034  hypothetical protein  33.57 
 
 
153 aa  60.5  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0240001  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5848  hypothetical protein  36.61 
 
 
117 aa  60.5  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000947774  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3858  hypothetical protein  34.03 
 
 
151 aa  60.5  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0149643  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1261  hypothetical protein  51.67 
 
 
127 aa  60.1  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1240  hypothetical protein  50 
 
 
153 aa  59.3  0.00000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2066  hypothetical protein  35.04 
 
 
153 aa  58.9  0.00000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.592764 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1188  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38.52 
 
 
121 aa  58.5  0.00000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.249084 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5109  hypothetical protein  33.64 
 
 
110 aa  58.5  0.00000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0532825  normal  0.118566 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3931  hypothetical protein  36.59 
 
 
127 aa  57.8  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.935473 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4247  hypothetical protein  36.44 
 
 
127 aa  57.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.06064 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3008  hypothetical protein  32.35 
 
 
141 aa  57.8  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000261512  hitchhiker  0.000130504 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2836  hypothetical protein  33.08 
 
 
145 aa  57  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.936594  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5700  hypothetical protein  33.07 
 
 
128 aa  57  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5882  hypothetical protein  39.47 
 
 
121 aa  56.6  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5068  hypothetical protein  56.14 
 
 
150 aa  57  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.560594 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7424  hypothetical protein  34.96 
 
 
114 aa  57  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.498691 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3103  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.9 
 
 
136 aa  56.2  0.0000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.374445  normal  0.546363 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2587  hypothetical protein  34.11 
 
 
124 aa  56.2  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.869022  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1976  hypothetical protein  32.14 
 
 
144 aa  56.2  0.0000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0380  hypothetical protein  32.41 
 
 
149 aa  55.8  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.544251  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19330  hypothetical protein  58.62 
 
 
151 aa  55.8  0.0000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.193262  normal  0.367636 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2585  hypothetical protein  32.61 
 
 
145 aa  55.5  0.0000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5923  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.34 
 
 
136 aa  55.1  0.0000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4252  hypothetical protein  33.63 
 
 
129 aa  55.1  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6347  hypothetical protein  36.92 
 
 
127 aa  53.9  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3672  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.37 
 
 
129 aa  53.5  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1629  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.04 
 
 
113 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6280  hypothetical protein  33.61 
 
 
129 aa  53.5  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.896361 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10816  hypothetical protein  35.48 
 
 
115 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.399339  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3812  hypothetical protein  33.33 
 
 
144 aa  52.8  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7567  hypothetical protein  31.82 
 
 
144 aa  53.1  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4549  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.91 
 
 
115 aa  52.8  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4637  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.91 
 
 
115 aa  52.8  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4932  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.91 
 
 
115 aa  52.8  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.682961 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1922  hypothetical protein  52.63 
 
 
150 aa  52.8  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0447405  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5075  hypothetical protein  39.77 
 
 
142 aa  52  0.000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.899338 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3097  hypothetical protein  31.06 
 
 
144 aa  51.6  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3323  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.65 
 
 
119 aa  51.6  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5458  hypothetical protein  41.76 
 
 
146 aa  51.6  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.556785  normal  0.109001 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5120  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.62 
 
 
113 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.935862  normal  0.713637 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1463  hypothetical protein  30.6 
 
 
144 aa  50.8  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0019697 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1719  hypothetical protein  33.09 
 
 
147 aa  50.8  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0555  hypothetical protein  49.12 
 
 
141 aa  50.8  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.481999  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3382  hypothetical protein  36.73 
 
 
121 aa  51.2  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000231795  hitchhiker  0.000471354 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4295  hypothetical protein  25.97 
 
 
249 aa  50.1  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10670  pterin-4a-carbinolamine dehydratase  36.45 
 
 
217 aa  50.4  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0658064 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7787  hypothetical protein  35.54 
 
 
120 aa  50.1  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.955905  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1526  hypothetical protein  32.23 
 
 
124 aa  48.9  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.637677  normal  0.757551 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1956  hypothetical protein  38.53 
 
 
146 aa  48.5  0.00009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4353  hypothetical protein  33.04 
 
 
118 aa  48.5  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00239214  normal  0.103366 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3520  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.33 
 
 
121 aa  47.4  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0799  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  36.61 
 
 
395 aa  47.4  0.0002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>