162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5848 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5848  hypothetical protein  100 
 
 		 117 aa  233  4e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000947774  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1629  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  54.7 
 
 		 113 aa  112  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5120  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  52.14 
 
 		 113 aa  107  6e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.935862  normal  0.713637 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4549  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  50.42 
 
 		 115 aa  106  9.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4637  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  50.42 
 
 		 115 aa  106  9.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4932  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  50.42 
 
 		 115 aa  106  9.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.682961 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2187  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  48.72 
 
 		 118 aa  102  2e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0642581 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10816  hypothetical protein  46.96 
 
 		 115 aa  95.5  2e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.399339  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1747  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  42.61 
 
 		 111 aa  95.5  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.369781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3382  hypothetical protein  43.59 
 
 		 121 aa  94.7  3e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000231795  hitchhiker  0.000471354 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1768  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  42.24 
 
 		 129 aa  84.3  5e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3971  hypothetical protein  42.15 
 
 		 117 aa  83.2  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5426  hypothetical protein  43.86 
 
 		 134 aa  80.1  0.000000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1261  hypothetical protein  42.73 
 
 		 127 aa  80.1  0.000000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4521  hypothetical protein  46.72 
 
 		 116 aa  78.6  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9281  hypothetical protein  42.98 
 
 		 113 aa  79.3  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3931  hypothetical protein  40 
 
 		 127 aa  79  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.935473 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2176  hypothetical protein  48.31 
 
 		 116 aa  77.8  0.00000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0578435  normal  0.0672972 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1340  hypothetical protein  45.54 
 
 		 120 aa  76.3  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3766  hypothetical protein  40.5 
 
 		 117 aa  75.5  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.240872  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1512  hypothetical protein  41.67 
 
 		 125 aa  75.9  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0208888 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6944  hypothetical protein  44.83 
 
 		 131 aa  75.9  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0300  hypothetical protein  37.07 
 
 		 128 aa  75.1  0.0000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.226272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4019  hypothetical protein  42.98 
 
 		 116 aa  74.3  0.0000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4094  hypothetical protein  42.98 
 
 		 116 aa  74.3  0.0000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5882  hypothetical protein  43.75 
 
 		 121 aa  74.3  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3326  hypothetical protein  43.75 
 
 		 127 aa  73.9  0.0000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.443228 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4249  hypothetical protein  42.98 
 
 		 116 aa  73.6  0.0000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.605375  normal  0.0498111 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1466  hypothetical protein  41.67 
 
 		 125 aa  72.8  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00213419 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0226  hypothetical protein  40.68 
 
 		 127 aa  73.2  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5137  hypothetical protein  40.91 
 
 		 130 aa  71.6  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0815248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6347  hypothetical protein  42.11 
 
 		 127 aa  70.9  0.000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25540  hypothetical protein  36.75 
 
 		 119 aa  70.5  0.000000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0366  hypothetical protein  42.59 
 
 		 245 aa  69.7  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26170  hypothetical protein  41.27 
 
 		 127 aa  69.3  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0450608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5763  hypothetical protein  44.44 
 
 		 228 aa  68.2  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00642959  normal  0.20928 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1526  hypothetical protein  39.5 
 
 		 124 aa  67.8  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.637677  normal  0.757551 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2488  hypothetical protein  40.68 
 
 		 123 aa  67.8  0.00000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.383766  normal  0.943713 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1188  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  42.73 
 
 		 121 aa  67  0.00000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.249084 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22640  hypothetical protein  35.9 
 
 		 119 aa  66.2  0.0000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19060  hypothetical protein  39.53 
 
 		 132 aa  66.2  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.265837  normal  0.18258 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2587  hypothetical protein  37.5 
 
 		 124 aa  65.9  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.869022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1346  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  39.32 
 
 		 128 aa  64.7  0.0000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.743338  normal  0.99956 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1040  hypothetical protein  42.99 
 
 		 253 aa  64.7  0.0000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.371874 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5075  hypothetical protein  30.99 
 
 		 142 aa  62.8  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.899338 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6182  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  41.38 
 
 		 123 aa  63.5  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3008  hypothetical protein  36.84 
 
 		 141 aa  62  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000261512  hitchhiker  0.000130504 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2585  hypothetical protein  39.46 
 
 		 145 aa  62.4  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4353  hypothetical protein  40.37 
 
 		 118 aa  61.6  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00239214  normal  0.103366 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3672  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.21 
 
 		 129 aa  61.2  0.000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4665  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  39.37 
 
 		 126 aa  60.8  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.692223  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2836  hypothetical protein  36.03 
 
 		 145 aa  60.8  0.000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.936594  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0555  hypothetical protein  36.09 
 
 		 141 aa  60.5  0.000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.481999  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0914  hypothetical protein  35.9 
 
 		 150 aa  60.5  0.000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2530  hypothetical protein  39.64 
 
 		 130 aa  60.5  0.000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0150  hypothetical protein  34.88 
 
 		 132 aa  60.5  0.000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.371021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2315  hypothetical protein  36.61 
 
 		 239 aa  60.5  0.000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.888825  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2704  hypothetical protein  35.71 
 
 		 145 aa  59.7  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.034837  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3858  hypothetical protein  34.97 
 
 		 151 aa  59.7  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0149643  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5458  hypothetical protein  31.51 
 
 		 146 aa  59.7  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.556785  normal  0.109001 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19330  hypothetical protein  47.89 
 
 		 151 aa  60.1  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.193262  normal  0.367636 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1240  hypothetical protein  34.27 
 
 		 153 aa  59.3  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22500  hypothetical protein  35.66 
 
 		 135 aa  59.3  0.00000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.831354  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0477  hypothetical protein  32.23 
 
 		 125 aa  58.5  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1116  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  36.89 
 
 		 238 aa  58.2  0.00000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0503  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.65 
 
 		 118 aa  57.8  0.00000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.012909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8404  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.6 
 
 		 118 aa  57.4  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.97224  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5116  hypothetical protein  35.45 
 
 		 240 aa  57  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.522329  normal  0.161919 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4061  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38.4 
 
 		 126 aa  57  0.00000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1972  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.6 
 
 		 125 aa  56.2  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.41866  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1719  hypothetical protein  35.33 
 
 		 147 aa  56.6  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4370  phosphoribosyltransferase  36.29 
 
 		 335 aa  56.6  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.437912  normal  0.281198 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0448  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.34 
 
 		 125 aa  56.6  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.25753 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1825  hypothetical protein  41.49 
 
 		 123 aa  56.6  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00267631  normal  0.075549 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25380  hypothetical protein  33.79 
 
 		 144 aa  55.5  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.606308  normal  0.623605 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2388  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.63 
 
 		 118 aa  55.8  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0476612  normal  0.436091 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6978  hypothetical protein  33.11 
 
 		 153 aa  54.7  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1417  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  36.46 
 
 		 125 aa  54.7  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02690  hypothetical protein  33.33 
 
 		 143 aa  54.3  0.0000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.475561  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2066  hypothetical protein  33.1 
 
 		 153 aa  54.3  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.592764 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3616  hypothetical protein  38.53 
 
 		 245 aa  53.1  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3323  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38.95 
 
 		 119 aa  53.1  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4252  hypothetical protein  34.75 
 
 		 129 aa  52.8  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1113  hypothetical protein  32.03 
 
 		 136 aa  53.1  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0799  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  36.84 
 
 		 395 aa  53.5  0.000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7827  hypothetical protein  34.68 
 
 		 241 aa  53.1  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3103  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.9 
 
 		 136 aa  52.4  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.374445  normal  0.546363 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5068  hypothetical protein  30.46 
 
 		 150 aa  52  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.560594 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5700  hypothetical protein  36.36 
 
 		 128 aa  52.8  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06250  hypothetical protein  37.04 
 
 		 242 aa  52  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.938865  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3966  hypothetical protein  34.23 
 
 		 136 aa  52  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0978  hypothetical protein  36.8 
 
 		 129 aa  52  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0400568  normal  0.0270186 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5109  hypothetical protein  38.26 
 
 		 110 aa  51.6  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0532825  normal  0.118566 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7424  hypothetical protein  32.46 
 
 		 114 aa  52  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.498691 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6380  hypothetical protein  31.4 
 
 		 135 aa  52  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.862709  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0347  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.59 
 
 		 126 aa  51.6  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1646  hypothetical protein  35.71 
 
 		 138 aa  51.2  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.169388  normal  0.104787 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3034  hypothetical protein  37.7 
 
 		 153 aa  51.6  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0240001  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1906  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  33.64 
 
 		 218 aa  50.8  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.457322  normal  0.154626 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4350  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.33 
 
 		 136 aa  50.8  0.000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>