96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0477 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_0477  hypothetical protein  100 
 
 
125 aa  256  5.0000000000000005e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2388  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  47.75 
 
 
118 aa  105  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0476612  normal  0.436091 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3180  hypothetical protein  32.82 
 
 
141 aa  90.5  6e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0871  hypothetical protein  43.64 
 
 
120 aa  89  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.325277  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0978  hypothetical protein  41.32 
 
 
129 aa  89.4  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0400568  normal  0.0270186 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0313  hypothetical protein  43.22 
 
 
161 aa  89  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.783426  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5923  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  45.54 
 
 
136 aa  87.4  6e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8404  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  40.52 
 
 
118 aa  87  8e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.97224  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3520  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  40.37 
 
 
121 aa  85.5  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1646  hypothetical protein  40.17 
 
 
138 aa  85.1  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.169388  normal  0.104787 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2887  hypothetical protein  32 
 
 
142 aa  85.1  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4353  hypothetical protein  43.93 
 
 
118 aa  83.6  7e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00239214  normal  0.103366 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1346  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.5 
 
 
128 aa  83.2  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.743338  normal  0.99956 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7081  hypothetical protein  36.04 
 
 
121 aa  81.3  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0254  hypothetical protein  39.25 
 
 
119 aa  80.5  0.000000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1038  hypothetical protein  33.63 
 
 
123 aa  79  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.658373 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1536  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38.98 
 
 
124 aa  77  0.00000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.354467  normal  0.0455127 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7787  hypothetical protein  35.4 
 
 
120 aa  76.6  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.955905  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2790  hypothetical protein  33.33 
 
 
237 aa  75.9  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0512113  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0140  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  42.11 
 
 
244 aa  74.7  0.0000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.193338  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6380  hypothetical protein  35.34 
 
 
135 aa  73.9  0.0000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.862709  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5278  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.04 
 
 
132 aa  73.9  0.0000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1802  hypothetical protein  38.05 
 
 
261 aa  71.2  0.000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0138028  normal  0.0191363 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0837  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.03 
 
 
122 aa  70.5  0.000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25140  hypothetical protein  33.62 
 
 
120 aa  70.5  0.000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0189  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.81 
 
 
137 aa  70.1  0.000000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.574477  hitchhiker  0.00262088 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0692  hypothetical protein  38.94 
 
 
123 aa  69.3  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5532  hypothetical protein  34.86 
 
 
130 aa  69.7  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.353133  normal  0.762952 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11910  hypothetical protein  34.48 
 
 
143 aa  68.9  0.00000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1113  hypothetical protein  33.62 
 
 
136 aa  68.6  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4615  hypothetical protein  35.29 
 
 
127 aa  66.6  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9281  hypothetical protein  35.34 
 
 
113 aa  65.5  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25510  Glyoxalase/Bleomycin resistance protein/Dioxygenase superfamily  34.82 
 
 
121 aa  64.3  0.0000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4637  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.54 
 
 
115 aa  61.6  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4549  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.54 
 
 
115 aa  61.6  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4932  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.54 
 
 
115 aa  61.6  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.682961 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0166  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.08 
 
 
134 aa  60.8  0.000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5120  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.75 
 
 
113 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.935862  normal  0.713637 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5848  hypothetical protein  32.23 
 
 
117 aa  58.5  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000947774  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5426  hypothetical protein  38.14 
 
 
134 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1629  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.61 
 
 
113 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22640  hypothetical protein  32.17 
 
 
119 aa  58.2  0.00000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3766  hypothetical protein  36.52 
 
 
117 aa  56.2  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.240872  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3305  hypothetical protein  30.7 
 
 
134 aa  56.6  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5213  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.19 
 
 
129 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5301  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.19 
 
 
129 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5593  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.19 
 
 
129 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.135924 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1768  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.76 
 
 
129 aa  54.7  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2488  hypothetical protein  33.61 
 
 
123 aa  54.3  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.383766  normal  0.943713 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0366  hypothetical protein  31.5 
 
 
245 aa  54.3  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25540  hypothetical protein  30.43 
 
 
119 aa  54.3  0.0000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4094  hypothetical protein  31.03 
 
 
116 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4019  hypothetical protein  31.03 
 
 
116 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3382  hypothetical protein  32.77 
 
 
121 aa  52  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000231795  hitchhiker  0.000471354 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4249  hypothetical protein  31.03 
 
 
116 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.605375  normal  0.0498111 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2176  hypothetical protein  32.46 
 
 
116 aa  51.6  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0578435  normal  0.0672972 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3284  hypothetical protein  33.62 
 
 
234 aa  50.8  0.000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3971  hypothetical protein  32.71 
 
 
117 aa  49.7  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0150  hypothetical protein  31.4 
 
 
132 aa  49.7  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.371021  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2827  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.74 
 
 
140 aa  49.3  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000699293  normal  0.0178041 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2187  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.33 
 
 
118 aa  48.1  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0642581 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19060  hypothetical protein  31.97 
 
 
132 aa  48.1  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.265837  normal  0.18258 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6944  hypothetical protein  30.89 
 
 
131 aa  47.8  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4521  hypothetical protein  32.14 
 
 
116 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10816  hypothetical protein  31.09 
 
 
115 aa  47.4  0.00006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.399339  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7827  hypothetical protein  30.08 
 
 
241 aa  47.4  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1040  hypothetical protein  32.8 
 
 
253 aa  47.4  0.00007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.371874 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3326  hypothetical protein  29.75 
 
 
127 aa  46.6  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.443228 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7424  hypothetical protein  29.31 
 
 
114 aa  46.6  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.498691 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20850  Glyoxalase/Bleomycin resistance protein/Dioxygenase superfamily  27.21 
 
 
137 aa  46.2  0.0001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4295  hypothetical protein  33.33 
 
 
249 aa  45.8  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3616  hypothetical protein  30.89 
 
 
245 aa  46.2  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3298  hypothetical protein  26.72 
 
 
141 aa  45.8  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.908774  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2315  hypothetical protein  27.13 
 
 
239 aa  45.4  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.888825  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26170  hypothetical protein  33.04 
 
 
127 aa  44.7  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0450608  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1188  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.04 
 
 
121 aa  45.1  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.249084 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5116  hypothetical protein  25.42 
 
 
240 aa  44.7  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.522329  normal  0.161919 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3598  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.16 
 
 
124 aa  44.7  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5763  hypothetical protein  33.02 
 
 
228 aa  44.3  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00642959  normal  0.20928 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4549  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.79 
 
 
258 aa  43.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2203  hypothetical protein  30.17 
 
 
127 aa  43.1  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.530068  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0962  hypothetical protein  35.48 
 
 
248 aa  42.7  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.133255  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1526  hypothetical protein  27.34 
 
 
124 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.637677  normal  0.757551 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3672  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  24.6 
 
 
129 aa  42.4  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5109  hypothetical protein  31.25 
 
 
110 aa  42.4  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0532825  normal  0.118566 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3103  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.36 
 
 
136 aa  41.6  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.374445  normal  0.546363 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1852  hypothetical protein  30.28 
 
 
128 aa  41.6  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000761206  hitchhiker  0.00000227001 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1747  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.18 
 
 
111 aa  42  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.369781  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2587  hypothetical protein  28.23 
 
 
124 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.869022  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1261  hypothetical protein  28.97 
 
 
127 aa  41.6  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3323  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.27 
 
 
119 aa  41.2  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4350  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.72 
 
 
136 aa  41.2  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4665  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.45 
 
 
126 aa  41.2  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.692223  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0347  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.01 
 
 
126 aa  40.8  0.007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22500  hypothetical protein  29.01 
 
 
135 aa  40.4  0.009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.831354  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1684  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.83 
 
 
121 aa  40.4  0.009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.178699  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>